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Association of VIPR-1 gene polymorphisms and haplotypes with egg production in laying quails 被引量:4
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作者 Yue-jin PU Yan WU +2 位作者 Xiao-juan XU Jin-ping DU Yan-zhang GONG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2016年第8期591-596,共6页
The laying quail is a worldwide breed which exhibits high economic value. In our current study, the vas- oactive intestinal peptide receptor-1 (VIPR-1) was selected as the candidate gene for identifying traits of eg... The laying quail is a worldwide breed which exhibits high economic value. In our current study, the vas- oactive intestinal peptide receptor-1 (VIPR-1) was selected as the candidate gene for identifying traits of egg produc- tion. A single nucleotide polymorphism (SNP) detection was performed in 443 individual quails, including 196 quails from the H line, 202 quails from the L line, and 45 wild quails. The SNPs were genotyped using a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Two mutations (G373T, A313G) were detected in all the tested quail populations. The associated analysis showed that the SNP genotypes of the VIPR-1 gene were sig- nificantly linked with the egg weight of G373T and A313G in 398 quails. The quails with the genotype GG always exhibited the largest egg weight for the two mutations in the H and L lines. Linkage disequilibrium (LD) analysis in- dicated that G373T and A313G loci showed the weakest LD. Seven main diplotypes from the four main reconstructed haplotypes were observed, indicating a significant association of diplotypes with egg weight. Quails with the hlh2 (GGGT) diplotype always exhibited the smallest egg weight and largest egg number at 20 weeks of age. The overall results suggest that the alterations in quails may be linked with potential major loci or genes affecting reproductive traits. 展开更多
关键词 Laying quail Haplotypes vipr-1 gene Egg production traits
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An ancient super allele of the Vrs1 gene driving the recent success in modern barley improvement through optimising spike architecture
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作者 Jingye Cheng Rui Pan +2 位作者 Wenying Zhang Tianhua He Chengdao Li 《Journal of Integrative Agriculture》 2026年第2期602-609,共8页
Improved yield potential is the goal of barley domestication and cultivation.During this process,two-and six-rowed barley types emerged and have been utilised in breeding and production.The six-rowed type could produc... Improved yield potential is the goal of barley domestication and cultivation.During this process,two-and six-rowed barley types emerged and have been utilised in breeding and production.The six-rowed type could produce three times as many grains as its ancestral two-rowed forms,thus dominating barley cultivation for thousands of years.The deficiens form of the two-rowed type,characterised by extremely suppressed lateral spikelets,has gained dominance over the past few decades in barley-growing regions worldwide.We hypothesised that the absence of lateral spikelets in deficiens barley affects spike architecture and spike-related traits,contributing to its superior yield potential of deficiens barley cultivation.Currently,a deficiens barley variety,RGT Planet,is the most popular barley variety in the world.In this study,we used two F_(2) populations derived from crossing RGT Planet with two canonical two-rowed barley and identified the functional allele Vrs1.t1 associated with deficiens morphology.We observed that the Vrs1.t1 allele may contribute to high yield potential by optimising spike architecture through increased spikelet length,grain number,and grain size.Phylogenetic analysis suggests that the deficiens mutation was likely present from the early stages of barley cultivation in the Fertile Crescent and spread to Ethiopia and beyond with agricultural expansion.We conclude that the ancient deficiens allele Vrs1.t1 has been a critical driver for the recent success of modern barley improvement by optimising spike architecture. 展开更多
关键词 deficiens barley ne mapping Vrs1 gene row types spike architecture yield potential
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油棕中果皮酵母单杂交文库构建及EgWRI1-1上游调控因子筛选
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作者 周丽霞 曹红星 +5 位作者 李睿 吴秋妃 李启黉 付登强 刘小玉 杨耀东 《分子植物育种》 北大核心 2026年第3期740-745,共6页
EgWRI1-1在油棕中果皮(非种子组织)脂肪酸合成与积累过程中起着关键的调控作用,为了筛选EgWRI1-1的上游调控因子,本研究构建油棕中果皮核系统酵母单杂交文库,并利用该文库对与EgWRI1-1互作的蛋白进行筛选。检测结果表明该文库的库容是1.... EgWRI1-1在油棕中果皮(非种子组织)脂肪酸合成与积累过程中起着关键的调控作用,为了筛选EgWRI1-1的上游调控因子,本研究构建油棕中果皮核系统酵母单杂交文库,并利用该文库对与EgWRI1-1互作的蛋白进行筛选。检测结果表明该文库的库容是1.15×10^(7)CFU,平均插入片段大于1200 bp,阳性率为100%。转录自激活发现100 mmol/L 3-AT即可抑制诱饵载体的转录自激活,并利用酵母单杂交技术筛选获得与EgWRI1-1启动子互作的蛋白EgNF-YA3。本试验构建了油棕中果皮酵母单杂交文库,并获得与EgWRI1-1上游启动子互作的EgNF-YA3蛋白,该结果为深入解析EgWRI1-1在油棕中果皮脂肪酸合成积累过程中的调控机理提供参考。 展开更多
关键词 油棕 WRI1-1基因 酵母单杂交文库 上游调控因子
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2022-2024年四川省自贡市新报告HIV-1感染者基因亚型及治疗前耐药特征分析
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作者 张英 万晓宇 +4 位作者 肖丽 贺月 邓建平 袁丹 周玚 《疾病监测》 北大核心 2026年第1期47-53,共7页
目的了解四川省自贡市新报告HIV-1感染者基因亚型的流行特征及治疗前耐药情况,为制定个体化治疗方案和有效的干预措施提供科学依据。方法收集2022—2024年自贡市新报告HIV-1感染者血浆样本及人口学信息,扩增pol区获取基因序列,构建进化... 目的了解四川省自贡市新报告HIV-1感染者基因亚型的流行特征及治疗前耐药情况,为制定个体化治疗方案和有效的干预措施提供科学依据。方法收集2022—2024年自贡市新报告HIV-1感染者血浆样本及人口学信息,扩增pol区获取基因序列,构建进化树判定基因亚型,并上传序列至美国斯坦福大学HIV耐药数据库,分析耐药情况。以0.5%基因距离作为阈值构建分子传播网络,分析耐药传播特点及网络关联情况。结果共获得pol区基因序列1523条,基因亚型主要为CRF07_BC(52.26%)、CRF01_AE(22.72%)、CRF08_BC(16.41%)、CRF85_BC(4.01%);不同基因亚型的HIV-1感染者在年龄(χ^(2)=39.665,P<0.001)、文化程度(χ^(2)=10.657,P=0.031)、传播途径(χ^(2)=21.403,P=0.006)和耐药状态方面(χ^(2)=52.520,P<0.001)比较差异均有统计学意义。对1523例HIV样本进行的耐药性监测显示,共有173例样本出现不同程度的耐药,总耐药率为11.35%(173/1523)。非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药率为7.81%(119/1523),核苷类反转录酶抑制剂耐药率为1.31%(20/1523),蛋白酶抑制剂耐药率为1.51%(23/1523)。NNRTIs耐药突变位点以K103和E138为主,K103N/KN/KNRS、E138A/EA/EG/EK/K在出现的组合突变位点中占比较高;按照0.5%基因距离计算,有705条序列入网(入网率46.29%),共形成150个分子簇,CRF07_BC亚型成簇率最高,存在2个耐药传播簇,Q58E和M46I为主要突变位点。此外,还监测到CRF85_BC亚型中存在的1个大型耐药传播簇有13个节点,E138A为主要突变位点。结论自贡市HIV-1感染者病毒基因亚型流行种类复杂,应关注重点传播分子簇,采取必要的干预措施,阻止HIV-1疫情的传播。同时,HIV-1感染者抗病毒治疗前耐药率达到中等水平,应把治疗前耐药监测纳入监测管理,通过对耐药突变位点的分析,明确不同亚型的耐药特点及其对治疗的影响。 展开更多
关键词 HIV-1感染者 治疗前耐药 基因亚型 分子网络
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食管癌患者肠道菌群分布特征与ERCC1基因rs3212986多态性的相关性研究
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作者 刘鑫 沈锋 +4 位作者 刘静 周莹 邓玉兰 余忠林 丁凤娇 《现代检验医学杂志》 2026年第2期105-110,共6页
目的分析食管癌患者肠道菌群分布特征与切除修复交叉互补基因1(ERCC1)基因rs3212986多态性的相关性研究。方法选取安康市中心医院2021年4月~2024年4月收治的93例食管癌患者为观察组,同期70例健康志愿者为对照组,采用16S核糖体DNA(16S rD... 目的分析食管癌患者肠道菌群分布特征与切除修复交叉互补基因1(ERCC1)基因rs3212986多态性的相关性研究。方法选取安康市中心医院2021年4月~2024年4月收治的93例食管癌患者为观察组,同期70例健康志愿者为对照组,采用16S核糖体DNA(16S rDNA)鉴定技术检测肠道菌群,分析肠道菌群Beta、Alpha多样性、物种组成及组件丰度的变化,对比ERCC1 rs3212986位点分布状况;Spearman相关分析肠道菌群与ERCC1 rs3212986多态性的关系。结果与对照组相比,观察组基于丰度的覆盖估计值(ACE)指数、肠球菌属、酵母菌属、大肠埃希菌升高(t=2.475~12.188),覆盖率(Goods_coverage)指数、香农(Shannon)指数、Chao1丰富度(Chaol)指数、辛普森(Simpson)指数、乳杆菌属、双歧杆菌属、消化球菌属和葡萄球菌属降低(t=2.689~27.899),差异具有统计学意义(均P<0.05)。主坐标分析(PCoA)图显示,观察组与对照组样本整体相距较远,群落结构存在差异,相比对照组属水平,观察组栖粪杆菌属、双歧杆菌属比例降低,从门水平分析观察组放线菌门、拟杆菌门比例提升,疣微菌门、厚壁菌门丰度降低(χ^(2)=42.363、25.494,均P<0.05)。且与对照组相比,观察组ERCC1 rs3212986位点AA基因型、等位基因A频率升高,差异具有统计学意义(χ^(2)=33.951、27.866,均P<0.05);Spearman秩相关性分析显示ERCC1 rs3212986 A等位基因与放线菌、梭杆菌属、变形菌门呈正相关(r=0.173、0.407、0.202,均P<0.05)。与拟杆菌门、厚壁菌门呈负相关(r=-0.337、-0.219,均P<0.05)。结论在食管癌患者中肠道菌群分布特征异常表达,并发现部分肠道菌群分布特征可能与食管癌ERCC1 rs3212986多态性有关。 展开更多
关键词 食管癌 肠道菌群 切除修复交叉互补基因1 基因多态性
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急性呼吸窘迫综合征患儿血清ELK1、RUNX1水平与病情严重程度及预后的关系
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作者 张迎旭 赵媛媛 张孝兴 《检验医学与临床》 2026年第3期296-302,共7页
目的探讨急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患儿血清红细胞转化特异性转录因子样基因1(ELK1)、Runt相关转录因子1(RUNX1)水平与病情严重程度及预后的关系。方法选取2021年1月至2023年1月该院收治的205例ARDS患儿作为ARDS组,另选取同期在该院体检... 目的探讨急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患儿血清红细胞转化特异性转录因子样基因1(ELK1)、Runt相关转录因子1(RUNX1)水平与病情严重程度及预后的关系。方法选取2021年1月至2023年1月该院收治的205例ARDS患儿作为ARDS组,另选取同期在该院体检的112例健康儿童作为对照组。根据病情严重程度将ARDS患儿分为轻度ARDS组(53例)、中度ARDS组(83例)、重度ARDS组(69例)。根据入院后28 d内是否发生死亡,将ARDS患儿分为预后不良组和预后良好组。采用酶联免疫吸附试验检测血清ELK1、RUNX1水平。采用Spearman相关分析ARDS患儿血清ELK1、RUNX1水平与病情严重程度的相关性。采用多因素Logistic回归分析ARDS患儿预后不良的影响因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清ELK1、RUNX1对ARDS患儿预后不良的预测价值。结果ARDS组血清ELK1水平高于对照组,RUNX1水平低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。重度ARDS组血清ELK1水平高于轻度ARDS组、中度ARDS组,且中度ARDS组高于轻度ARDS组,差异均有统计学意义(P<0.05)。重度ARDS组血清RUNX1水平低于轻度ARDS组、中度ARDS组,且中度ARDS组低于轻度ARDS组,差异均有统计学意义(P<0.05)。Spearman相关分析结果显示,ARDS患儿血清ELK1水平与病情严重程度呈正相关(r_(s)=0.797,P<0.001),血清RUNX1水平与病情严重程度呈负相关(r_(s)=-0.783,P<0.001)。预后不良组呼气末正压、ELK1水平高于预后良好组,氧合指数、清蛋白、RUNX1水平低于预后良好组,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,氧合指数、清蛋白和RUNX1水平升高是ARDS患儿预后不良的保护因素(P<0.05),血清ELK1水平升高是ARDS患儿预后不良的危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清ELK1、RUNX1联合预测ARDS患儿预后不良的曲线下面积(AUC)为0.875,大于血清ELK1、RUNX1单独预测的AUC(Z=3.215、3.376,P=0.001、0.001)。结论ARDS患儿血清ELK1水平升高,RUNX1水平降低,二者水平与病情严重程度和预后有关,血清ELK1、RUNX1联合检测对ARDS患儿预后不良有较高的预测价值。 展开更多
关键词 急性呼吸窘迫综合征 红细胞转化特异性转录因子样基因1 Runt相关转录因子1 病情严重程度 预后
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PD-L1基因多态性对晚期胃癌患者接受PD-1抑制剂治疗的疗效影响的探索性研究
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作者 王豪勋 万文娟 +4 位作者 刘小小 李慧霞 周雪艳 赵蓉爽 韩娜 《胃肠病学和肝病学杂志》 2026年第3期374-380,共7页
目的探讨PD-L1基因多态性对晚期胃癌患者接受PD-1抑制剂单药治疗后疗效的影响。方法回顾性纳入晚期胃癌患者(n=88)在临床实践中接受PD-1抑制剂(替雷利珠单抗、信迪利单抗和帕博利珠单抗)二线及以上单药治疗的临床资料,并收集具有代表性... 目的探讨PD-L1基因多态性对晚期胃癌患者接受PD-1抑制剂单药治疗后疗效的影响。方法回顾性纳入晚期胃癌患者(n=88)在临床实践中接受PD-1抑制剂(替雷利珠单抗、信迪利单抗和帕博利珠单抗)二线及以上单药治疗的临床资料,并收集具有代表性的晚期胃腺癌患者样本,提取外周血基因组DNA并针对PD-L1基因的多态性位点进行基因分型。通过实时定量PCR测定患者外周血单核细胞中PD-L1 mRNA的相对表达水平。根据实体瘤疗效评价标准(RECIST 1.1)评估肿瘤疗效并计算客观缓解率(objective response rate,ORR)和疾病控制率(disease control rate,DCR),随访患者以绘制生存曲线计算无进展生存期(progression-free survival,PFS)和总生存期(overall survival,OS)。采用χ^(2)检验或非参数检验比较不同基因型患者的疗效指标和PD-L1的mRNA表达差异,Kaplan-Meier法绘制生存曲线并以对数秩检验比较生存差异,Cox回归模型评估多因素对生存的影响。结果PD-L1基因rs2297136位点在患者中的基因型分布频率分别为AA型58例(约65.9%)、AG型27例(30.7%)、GG型3例(3.4%),各基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡(P=0.998)。基于PD-1抑制剂免疫单药治疗的疗效结果提示总体人群的ORR为13.6%,DCR为45.5%,中位PFS为2.9个月(95%CI:2.5~3.3个月),中位OS为8.9个月(95%CI:6.3~11.5个月)。根据PD-L1基因rs2297136位点的基因型结果提示AG/GG基因型患者的ORR高于AA基因型(23.3%vs 8.6%),差异具有边缘的统计学意义(χ^(2)=3.631,P=0.057),另外两组患者的DCR分别为66.7%和34.5%,差异具有显著的统计学意义(χ^(2)=8.262,P=0.004)。生存分析结果提示携带变异等位基因AG/GG患者和AA纯合野生型患者的中位PFS分别为3.3个月和2.8个月(χ^(2)=2.893,P=0.214),中位OS分别为12.2个月和6.8个月,差异具有显著的统计学意义(χ^(2)=6.611,P=0.010)。在机制探索方面,不同基因型患者外周血中的PD-L1 mRNA表达存在显著差异:AG/GG基因型患者PD-L1基因mRNA平均表达水平高于AA基因型(P<0.01)。结论PD-L1通路基因多态性与晚期胃癌免疫治疗疗效密切相关。PD-L1基因rs2297136位点变异可导致PD-L1的mRNA表达上调,进而影响患者对PD-1抑制剂治疗的反应。携带该位点变异的胃癌患者接受PD-1抑制剂治疗具有较好的疗效及预后。PD-L1基因rs2297136多态性有望作为晚期胃癌免疫治疗疗效的预测生物标志物。 展开更多
关键词 胃癌 PD-1抑制剂 PD-L1基因多态性 疗效 预后
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丝氨酸蛋白酶抑制剂A1和核受体亚家族1组I成员2基因多态性与缺血性脑血管病患者阿托伐他汀降脂治疗的关系研究
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作者 蒋召芹 穆永芳 +1 位作者 张彤彤 齐梦 《陕西医学杂志》 2026年第4期517-523,共7页
目的:探究丝氨酸蛋白酶抑制剂A1(SERPINA1)和核受体亚家族1组I成员2(NR1I2)基因多态性与缺血性脑血管病患者阿托伐他汀降脂治疗的关系。方法:收集136例缺血性脑血管病患者资料进行回顾性队列研究,所有患者均给予阿托伐他汀20 mg/次,1次/... 目的:探究丝氨酸蛋白酶抑制剂A1(SERPINA1)和核受体亚家族1组I成员2(NR1I2)基因多态性与缺血性脑血管病患者阿托伐他汀降脂治疗的关系。方法:收集136例缺血性脑血管病患者资料进行回顾性队列研究,所有患者均给予阿托伐他汀20 mg/次,1次/d。采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)联合测序法测定SERPINA1 rs6647位点和NR1I2 rs13059232位点的基因型。比较治疗前及治疗1个月后不同基因型患者血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL-C)、低密度脂蛋白(LDL-C)水平变化;比较SERPINA1基因rs6647和NR1I2基因rs13059232位点不同表型患者治疗有效率的差异并记录药品不良反应发生情况;二元Logistic回归多因素分析SERPINA1和NR1I2基因多态性与降脂治疗疗效的关系。结果:治疗后,rs6647和rs13059232位点不同基因型患者血清TC、TG、LDL-C水平较治疗前降低,HDL-C水平较治疗前升高(均P<0.05);rs6647位点AA基因型患者LDL-C水平明显低于GG型(P<0.05),血清TC,LDL-C变化率明显高于GG基因型(均P<0.05);rs13059232位点TT基因型患者血清TC变化率明显高于CC基因型(P<0.05)。SERPINA1 rs6647位点和NR1I2 rs13059232位点不同基因型均与治疗疗效显著相关(均P<0.05);rs6647位点AA基因型治疗有效率明显高于GG基因型(P<0.05);rs13059232位点TT基因型治疗有效率明显高于CC基因型(P<0.05)。rs6647位点AA基因型患者降脂有效率显著高于GG型(OR=4.001,P=0.004),rs13059232位点CC基因型患者降脂有效率显著低于TT型(OR=0.354,P=0.034)。治疗期间,SERPINA1 rs6647位点和NR1I2 rs13059232位点不同基因型患者不良反应发生率比较,差异无统计学意义(均P>0.05)。结论:SERPINA1 rs6647位点AA基因型患者降脂幅度及降脂有效率高于AG基因型和GG基因型;NR1I2 rs13059232位点TT基因型患者降脂幅度及降脂有效率高于TC基因型和CC基因型,检测SERPINA1和NR1I2基因多态性对缺血性脑血管病患者应用他汀类药物降脂治疗具有一定临床指导意义。 展开更多
关键词 缺血性脑血管病 基因多态性 丝氨酸蛋白酶抑制剂A1 核受体亚家族1组I成员2 阿托伐他汀 降脂治疗
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星状神经节阻滞通过lncRNA TUG1-NLRP3轴调节体外脑缺血再灌注细胞中炎症反应和自噬溶酶体形成
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作者 杜健华 袁应川 +2 位作者 许宜珍 苏娟 王晶华 《脑与神经疾病杂志》 2026年第1期50-56,共7页
目的探讨星状神经节阻滞(SGB)通过长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)-NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)轴在体外脑缺血再灌注模型中对炎症反应和自噬溶酶体形成的调节作用。方法培养大鼠海马神经元细胞系H19-7,并将细... 目的探讨星状神经节阻滞(SGB)通过长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)-NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NLRP3)轴在体外脑缺血再灌注模型中对炎症反应和自噬溶酶体形成的调节作用。方法培养大鼠海马神经元细胞系H19-7,并将细胞分为8组:(i)正常对照组:正常培养的神经元细胞;(ii)氧-糖剥夺/复氧(OGD/R)组:采用氧-糖剥夺/复氧法模拟脑缺血再灌注损伤;(iii)OGD/R+SGB组:OGD/R联合麻醉药0.5%布比卡因用于体外模拟SGB;(iv)OGD/R+SGB+TUG1过表达阴性对照组:OGD/R联合布比卡因并联合TUG1过表达阴性对照质粒转染细胞;(v)OGD/R+SGB+TUG1过表达组:OGD/R联合布比卡因并联合TUG1过表达质粒转染细胞;(vi)OGD/R+SGB+TUG1过表达+MCC950组:OGD/R联合布比卡因、TUG1过表达质粒转染及NLRP3抑制剂MCC950处理细胞;(vii)OGD/R+TUG1过表达组:OGD/R联合TUG1过表达质粒转染细胞;(viii)OGD/R+MCC950组:OGD/R联合NLRP3抑制剂MCC950处理细胞。进一步通过实时定量PCR(Quantitative Real Time PCR,qRTPCR)实验检测细胞中lncRNATUG1的表达;利用Western blot法检测细胞中NLRP3、微管相关蛋白1轻链3(LC3)-I、LC3-II、自噬相关基因5(Atg5)、苄氯素1(beclin1)、自噬接头蛋白(p62)、溶酶体相关膜蛋白1(LAMP1)的表达水平;利用透射电镜(TEM)检测自噬溶酶体的数量;并用酶联免疫吸附测定(ELISA)法检测细胞培养上清中白细胞介素(IL)-1β、IL-6、IL-18、肿瘤坏死因子(TNF)-α的含量。结果与正常对照组相比,OGD/R组lncRNA TUG1、NLRP3、Atg5、beclin1、p62、LAMP1的表达水平以及LC3-II/I比值均显著上调(^(均)P<0.05),自噬溶酶体数量增加(P<0.05),IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α的含量显著升高(^(均)P<0.05)。与OGD/R组相比,OGD/R+SGB组的上述指标均显著下调(P<0.05)。与OGD/R+SGB+TUG1过表达阴性对照组相比,OGD/R+SGB+TUG1过表达组的lncRNA TUG1、NLRP3、Atg5、beclin1、p62、LAMP1的表达水平以及LC3-II/I比值均显著上调(^(均)P<0.05),自噬溶酶体数量增加(P<0.05),IL-1β、IL-6、IL-18、TNF-α的含量显著升高(^(均)P<0.05),然而,加入NLRP3的抑制剂MCC950后,除lncRNA TUG1外其余指标均显著下调(^(均)P<0.05)。另外,与OGD/R组比,OGD/R+TUG1过表达组的上述指标进一步上调(^(均)P<0.05)。与OGD/R组比,OGD/R+MCC950组则抑制了除lncRNA TUG1外的其余指标(^(均)P<0.05)。结论星状神经节阻滞通过调节lncRNA TUG1-NLRP3轴有效减轻体外脑缺血再灌注损伤引起的炎症反应和自噬溶酶体形成,提示其可能作为治疗缺血性脑损伤的潜在策略。 展开更多
关键词 星状神经节阻滞 长链非编码RNA牛磺酸上调基因1 NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3 氧-糖剥夺/复氧 炎症反应 自噬溶酶体
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头颈部1型神经纤维瘤病相关丛状神经纤维瘤的治疗进展与挑战
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作者 陈伟良 《口腔疾病防治》 2026年第1期1-14,共14页
1型神经纤维瘤病(neurofibromatosis type 1,NF1)是由染色体17q11.2中的NF1基因突变所致的常染色体显性遗传病。丛状神经纤维瘤(plexiform neurofibromas,PN)是NF1的常见临床表现之一,称之为NF1相关丛状神经纤维瘤(NF1-related plexifor... 1型神经纤维瘤病(neurofibromatosis type 1,NF1)是由染色体17q11.2中的NF1基因突变所致的常染色体显性遗传病。丛状神经纤维瘤(plexiform neurofibromas,PN)是NF1的常见临床表现之一,称之为NF1相关丛状神经纤维瘤(NF1-related plexiform neurofibromas,NF1-PN)。头面颈部NF1-PN占全身的42.9%。肿瘤在儿童及青春发育期生长快,可呈广泛性生长,造成严重的头面颈部畸形、器官功能障碍,甚至功能丧失。本病有转化成恶性周围神经鞘膜瘤(malignant peripheral nerve sheath tumor,MPNST)的可能,称为NF1相关MPNST。组织病理学是诊断NF1-PN的金标准,核磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)是首选的NF1-PN影像学检查项目,PET/CT检查是早期发现和诊断NF1-MPNST的可靠方法。基因检测对肿瘤早期诊断、监测肿瘤进展、遗传咨询以及为在分子水平上治疗和管控该疾病有重要作用。本文提出了治疗头颈部NF1-PN目标和原则;阐述了目前主要治疗手段为手术和药物治疗,手术治疗包括手术切除、手术切除后组织瓣修复或复合组织同种异体移植;丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase inhibitors,MEK)抑制剂司美替尼(selumetinib)是用于治疗3岁及3岁以上伴有症状且无法手术的NF1-PN患者的有效药物;MEK1/2小分子抑制剂米达美替尼(mirdametinib)已完成成人和儿童Ⅱb期临床试验,在成人和儿童中耐受性良好;CRISPR/Cas9技术有望成为NF1-PN基因治疗的有效手段。NF1相关MPNST的治疗方法与软组织肉瘤相似。然而,特大型肿瘤完全切除的安全性、手术过程中重要组织和器官的保护、术中出血的有效控制、头颈部软硬组织缺损的重建、如何进行MEK抑制剂的前瞻性多中心随机双盲对照临床试验,以及利用CRISPR/Cas9技术对NF1-PN进行基因治疗等都是目前面临的具有挑战性的临床和基础研究课题。笔者对头颈部NF1-PN的治疗进展与挑战进行总结,为同行提供参考。 展开更多
关键词 1型神经纤维瘤病 1型神经纤维瘤病相关丛状神经纤维瘤 恶性周围神经鞘膜瘤 头颈部 外科治疗 组织瓣修复 复合组织同种异体移植 MEK抑制剂 司美替尼 NF1基因
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Genome-wide identification of ARID-HMG related genes in citrus and functional analysis of FhARID1 in apomixis and axillary bud development 被引量:1
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作者 Xietian Song Yin Zhou +6 位作者 Zhen Cao Nan Wang Xiaoyu Tian Lijun Chai Zongzhou Xie Junli Ye Xiuxin Deng 《Horticultural Plant Journal》 2025年第3期999-1011,共13页
Polyembryony has posed a significant impediment to the advancement of citrus hybrid breeding.FhRWP is widely regarded as a pivotal factor governing asexual reproduction in citrus,and prior research has demonstrated th... Polyembryony has posed a significant impediment to the advancement of citrus hybrid breeding.FhRWP is widely regarded as a pivotal factor governing asexual reproduction in citrus,and prior research has demonstrated that FhARID1,acting as an upstream regulator,modulates FhRWP expression.In this study,we performed a genome-wide characterization of the ARID-HMG-related genes using the short juvenile minicitrus Fortunella hindsii.A total of 20 ARID-HMG-related genes were identified.Protein interaction network and enrichment analysis suggested that ARID-HMG-related proteins might might be involved in chromatin remodeling complexes.Knockout of FhARID1 in F.hindsii did not induce the conversion from polyembryony to monoembryony.However,fharid1 plants in T1 generation exhibited abnormal proliferation at axillary buds,which is similar to phenotype of fhrwp plants.Expression analysis of fharid1 ovary tissues revealed the downregulation of FhRWP.The results indicated that FhARID1,as an upstream regulator of FhRWP,has an effect on the development of citrus axillary buds.Expression analysis of overexpressed leaves of FhARID1 lines showed that no significant up-regulation of FhRWP,indicating that FhARID1 is not the sole upstream regulatory factor of FhRWP.Only FhARID2 showed a correlation in expression with FhARID1 among the ARID-related genes,further supporting the notion that this gene may be involved in complex formation rather than acting alone.Yeast two-hybrid and MS/MS spectra further indicated that FhARID1 function requires casein kinase II-mediated post-transcriptional phosphorylation.This study elucidated the function of FhARID1 in citrus apomixis and axillary bud development,providing a fundamental basis for understanding the role of ARID-HMG-related genes. 展开更多
关键词 CITRUS Fortunella hindsii FhARID1 ARID-HMG-related gene Casein Kinase II Chromatin remodeling
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WFS1 gene mutation associated with pediatric diabetes mellitus and congenital deafness:A case report 被引量:1
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作者 Ai-Min Gao Wan-Ling Deng +3 位作者 Xin-Ping Yang Wan-Yue Wu Chun-Yuan Ma Yu Liu 《World Journal of Diabetes》 2025年第8期331-338,共8页
BACKGROUND Wolfram syndrome is a rare autosomal recessive genetic disorder characterized by early-onset diabetes and progressive neurodegeneration,most notably sensorineural hearing loss and optic atrophy.Because its ... BACKGROUND Wolfram syndrome is a rare autosomal recessive genetic disorder characterized by early-onset diabetes and progressive neurodegeneration,most notably sensorineural hearing loss and optic atrophy.Because its initial manifestations are usually similar to those of type 1 diabetes,the diagnosis may be delayed until other manifestations appear.Pathogenic variations of the WFS1 gene can disrupt endoplasmic reticulum function and cellular homeostasis,but the complete mutation spectrum of WFS1 has not been fully determined.Early identification of monogenic diabetes caused by Wolfram syndrome is of vital importance,as it enables the provision of targeted multidisciplinary care and genetic counseling for affected families.CASE SUMMARY A 2-year-old Han Chinese girl was admitted with a 1-month history of polydipsia,polyuria,and polyphagia,and was diagnosed with diabetic ketoacidosis and impaired insulin secretion.Sensorineural hearing loss was also detected.Wholeexome sequencing identified a previously unreported heterozygous mutation,WFS1 c.986T>C(p.Phe329Ser),in the patient and her father,confirming the diagnosis of Wolfram syndrome.Bioinformatic analysis supported the likely pathogenicity of this mutation.In silico pathogenicity predictors(REVEL,SIFT,Poly-Phen-2,MutationTaster,and GERP+)supported a deleterious effect on wolframin structure and function.The patient was initially treated with intravenous insulin and fluid resuscitation,then transitioned to a basal–bolus insulin regimen.Glycemic control was subsequently maintained with continuous subcutaneous insulin infusion and intermittent subcutaneous injections.At the 1-and 6-month follow-ups,blood glucose remained well controlled(hemoglobin A1c:5.89%and 6.58%,respectively),with no evidence of organ dysfunction or further complications.CONCLUSION This case identifies WFS1 c.986T>C(p.Phe329Ser)as a novel pathogenic variant causing Wolfram syndrome.It highlights the importance of early genetic testing in pediatric patients with atypical diabetes presentations to enable timely diagnosis,individualized therapy,and comprehensive family support. 展开更多
关键词 Childhood diabetes mellitus Congenital deafness WFS1 gene Wolfram syndrome Monogenic diabetes Case report
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水稻PR1基因响应生物胁迫的表达模式
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作者 程雨果 魏炳峥 +1 位作者 李春霞 陶均 《分子植物育种》 北大核心 2026年第5期1418-1429,共12页
本研究通过同源比对和结构域分析预测了水稻中38个PR1基因的理化性质、细胞定位和启动子结构特征,然后根据已有基因表达信息分析了PR1基因在生物胁迫中的响应表达情况,最后分析了这38个基因在水稻感染白叶枯病菌后的表达水平。结果发现3... 本研究通过同源比对和结构域分析预测了水稻中38个PR1基因的理化性质、细胞定位和启动子结构特征,然后根据已有基因表达信息分析了PR1基因在生物胁迫中的响应表达情况,最后分析了这38个基因在水稻感染白叶枯病菌后的表达水平。结果发现38个PR蛋白中有35个蛋白的长度约为160 aa,有26个为酸性蛋白,32个为亲水性蛋白,27个可分泌到胞外。启动子顺式作用元件预测发现PR1基因启动子普遍含有MYB和茉莉酸响应结合元件。有20个PR1基因定位于7号染色体上,且多数PR1基因在染色体上呈现串联重复样排列。有37个PR基因含有CAP结构域。白叶枯病菌侵染水稻后,前3 d PR1-13未有表达,但3 d后表达显著提高;PR1-33在接种后持续性高表达;PR1-2、PR1-3、PR1-8、PR1-32、PR1-34、PR1-35、PR1-37的表达受病原菌抑制。以上结果暗示PR1基因在染色体上的串联排列可能有助于水稻快速响应病原菌的侵染,但PR1基因响应生物胁迫的表达与染色体定位无关,可能主要受启动子的顺式作用元件调控。本研究为分析PR1在抗病中的作用及机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 水稻 病程相关蛋白1 生物胁迫 响应表达
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AAV2-PDE6B restores retinal structure and function in the retinal degeneration 10 mouse model of retinitis pigmentosa by promoting phototransduction and inhibiting apoptosis
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作者 Ruiqi Qiu Mingzhu Yang +5 位作者 Xiuxiu Jin Jingyang Liu Weiping Wang Xiaoli Zhang Jinfeng Han Bo Lei 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第8期2408-2419,共12页
Retinitis pigmentosa is a group of inherited diseases that lead to retinal degeneration and photoreceptor cell death.However,there is no effective treatment for retinitis pigmentosa caused by PDE6B mutation.Adeno-asso... Retinitis pigmentosa is a group of inherited diseases that lead to retinal degeneration and photoreceptor cell death.However,there is no effective treatment for retinitis pigmentosa caused by PDE6B mutation.Adeno-associated virus(AAV)-mediated gene therapy is a promising strategy for treating retinitis pigmentosa.The aim of this study was to explore the molecular mechanisms by which AAV2-PDE6B rescues retinal function.To do this,we injected retinal degeneration 10(rd10)mice subretinally with AAV2-PDE6B and assessed the therapeutic effects on retinal function and structure using dark-and light-adapted electroretinogram,optical coherence tomography,and immunofluorescence.Data-independent acquisition-mass spectrometry-based proteomic analysis was conducted to investigate protein expression levels and pathway enrichment,and the results from this analysis were verified by real-time polymerase chain reaction and western blotting.AAV2-PDE6B injection significantly upregulated PDE6βexpression,preserved electroretinogram responses,and preserved outer nuclear layer thickness in rd10 mice.Differentially expressed proteins between wild-type and rd10 mice were closely related to visual perception,and treating rd10 mice with AAV2-PDE6B restored differentially expressed protein expression to levels similar to those seen in wild-type mice.Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome analysis showed that the differentially expressed proteins whose expression was most significantly altered by AAV2-PDE6B injection were enriched in phototransduction pathways.Furthermore,the phototransductionrelated proteins Pde6α,Rom1,Rho,Aldh1a1,and Rbp1 exhibited opposite expression patterns in rd10 mice with or without AAV2-PDE6B treatment.Finally,Bax/Bcl-2,p-ERK/ERK,and p-c-Fos/c-Fos expression levels decreased in rd10 mice following AAV2-PDE6B treatment.Our data suggest that AAV2-PDE6B-mediated gene therapy promotes phototransduction and inhibits apoptosis by inhibiting the ERK signaling pathway and upregulating Bcl-2/Bax expression in retinitis pigmentosa. 展开更多
关键词 APOPTOSIS AAV2-PDE6B ERK1/2 gene therapy PHOTOTRANSDUCTION proteomics rd10 retinitis pigmentosa
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暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交F_(1)代的荧光PCR鉴定技术的建立
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作者 赵昕 车帅 +4 位作者 王焕 孙侦龙 尤颖哲 柳淑芳 庄志猛 《渔业科学进展》 北大核心 2026年第1期37-47,共11页
暗纹东方鲀(Takifugu obscurus♀)×红鳍东方鲀(T.rubripes♂)的杂交F_(1)代具备双亲诸多优良性状,市场前景较好。但杂交F_(1)代的形态特征与其亲本难以区分,为河鲀种质资源保护和开发利用带来了困扰,迫切需要开发有效的分子鉴定方... 暗纹东方鲀(Takifugu obscurus♀)×红鳍东方鲀(T.rubripes♂)的杂交F_(1)代具备双亲诸多优良性状,市场前景较好。但杂交F_(1)代的形态特征与其亲本难以区分,为河鲀种质资源保护和开发利用带来了困扰,迫切需要开发有效的分子鉴定方法对杂交F_(1)代及其亲本进行精准判别。为实现杂交F_(1)代及其亲本的快速准确鉴定,本研究根据核基因SH3PX3多态性SNP位点,设计荧光PCR扩增引物及探针,优化了荧光PCR参数,建立了暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交F_(1)代的荧光PCR鉴定方法,并对该方法进行了验证。结果显示:杂交F_(1)代的COI序列与母本暗纹东方鲀的序列相似度为100%,在NJ进化树中聚为一支,无法实现杂交F_(1)代和母本的区分;SH3PX3基因荧光PCR体系最佳退火温度为48℃;荧光PCR扩增后,暗纹东方鲀仅FAM通道有Ct值,ΔCt值大于20,红鳍东方鲀FAM信号通道比HEX通道的Ct值高2~5,杂交F_(1)代的FAM通道与HEX通道的Ct值接近,二者之差小于2;基于上述方法对17份暗纹东方鲀、21份红鳍东方鲀和53份杂交F_(1)代样品进行验证,鉴定准确率为100%。本研究建立的荧光PCR鉴定方法不仅具有结果准确、易判读等优点,还避免了测序等繁琐流程,可实现高通量检测,显著提高了检测效率,为河鲀种质资源鉴定与保护、杂交育种和遗传多样性研究提供了技术支持。 展开更多
关键词 暗纹东方鲀 红鳍东方鲀 杂交F_(1)代 SH3PX3基因 荧光PCR 物种鉴定
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Heat stress affects expression levels of circadian clock gene Bmal1 and cyclins in rat thoracic aortic endothelial cells
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作者 CHANG Xiaoyu ZHANG Hanwen +5 位作者 CAO Hongting HOU Ling MENG Xin TAO Hong LUO Yan LI Guanghua 《南方医科大学学报》 北大核心 2025年第7期1353-1362,共10页
Objective To investigate the structural changes of rat thoracic aorta and changes in expression levels of Bmal1 and cyclins in thoracic aorta endothelial cells following heat stress.Methods Twenty male SD rats were ra... Objective To investigate the structural changes of rat thoracic aorta and changes in expression levels of Bmal1 and cyclins in thoracic aorta endothelial cells following heat stress.Methods Twenty male SD rats were randomized equally into control group and heat stress group.After exposure to 32℃for 2 weeks in the latter group,the rats were examined for histopathological changes and Bmal1 expression in the thoracic aorta using HE staining and immunohistochemistry.In the cell experiments,cultured rat thoracic aortic endothelial cells(RTAECs)were incubated at 40℃for 12 h with or without prior transfection with a Bmal1-specific small interfering RNA(si-Bmal1)or a negative sequence.In both rat thoracic aorta and RTAECs,the expressions of Bmal1,the cell cycle proteins CDK1,CDK4,CDK6,and cyclin B1,and apoptosis-related proteins Bax and Bcl-2 were detected using Western blotting.TUNEL staining was used to detect cell apoptosis in rat thoracic aorta,and the changes in cell cycle distribution and apoptosis in RTAECs were analyzed with flow cytometry.Results Compared with the control rats,the rats exposed to heat stress showed significantly increased blood pressures and lowered heart rate with elastic fiber disruption and increased expressions of Bmal1,cyclin B1 and CDK1 in the thoracic aorta(P<0.05).In cultured RTAECs,heat stress caused significant increase of Bmal1,cyclin B1 and CDK1 protein expression levels,which were obviously lowered in cells with prior si-Bmal1 transfection.Bmal1 knockdown also inhibited heat stress-induced increase of apoptosis in RTAECs as evidenced by decreased expression of Bax and increased expression of Bcl-2.Conclusion Heat stress upregulates Bmal1 expression and causes alterations in expressions of cyclins to trigger apoptosis of rat thoracic aorta endothelial cells,which can be partly alleviated by suppressing Bmal1 expression. 展开更多
关键词 heat stress circadian clock genes BMAL1 thoracic aortic endothelial cells CYCLINS APOPTOSIS
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杜撒×大长撒F_(1)代猪PCK1基因多态性及其与生长性状的关联研究
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作者 赖金花 王孝义 +5 位作者 朱怡轩 鲁绍雄 杨永立 王江田 王淑燕 李明丽 《畜牧与兽医》 北大核心 2026年第1期1-7,共7页
旨在探究杜撒×大长撒F_(1)代猪磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(PCK1)基因第二外显子的多态性及其对生长性状的影响。以326头杜撒×大长撒F_(1)代猪为研究对象,对其PCK1基因第二外显子区域进行PCR扩增和一代测序检测单核苷酸多态性(S... 旨在探究杜撒×大长撒F_(1)代猪磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(PCK1)基因第二外显子的多态性及其对生长性状的影响。以326头杜撒×大长撒F_(1)代猪为研究对象,对其PCK1基因第二外显子区域进行PCR扩增和一代测序检测单核苷酸多态性(SNP)位点,在此基础上,通过最小二乘模型将检测到的各SNP位点不同基因型及其单倍型组合与5个生长性状进行关联分析。结果:在杜撒×大长撒F_(1)代猪PCK1基因第二外显子区域检测到5个SNP位点,其中g.57930894A>G、g.57930906G>A和g.57930912G>A位于5′-UTR区域,g.57931021C>T和g.57931090C>T为同义突变。5个位点分别以AG、GG、GG、CC、CC基因型和A、G、G、C、C等位基因频率最高;除g.57930894A>G位点外,其余位点均符合哈迪-温伯格平衡(P<0.05)。关联研究结果显示,g.57930894A>G和g.57930906G>A位点GG基因型与同位点的其他基因型相比能显著降低达100 kg体重日龄(P<0.01);g.57930906G>A位点GG基因型个体达60 kg体重日龄也显著低于同位点其他基因型(P<0.01),且该基因型个体30~60 kg体重阶段的日增重显著高于AA和GA基因型个体(P<0.05);g.57931090C>T位点CT基因型30~100 kg体重阶段的日增重显著高于CC基因型个体(P<0.05)。单倍型组合与生长性状关联结果显示,AGGCC/GGGTC组合单倍型个体达60 kg体重日龄和达100 kg体重的日龄最长,而以GGGCC/GGGTC和GGGCC/GGGCC组合的日龄最短;30~60 kg和30~100 kg体重阶段的日增重均以AGGCT/GGGCC组合最高。具有GGGCC单倍型个体的各生长性状均处于较优水平。研究结果初步揭示了杜撒×大长撒F_(1)代猪PCK1基因第二外显子存在与生长性状显著关联的SNP位点,GGGCC单倍型可作为影响生长性状潜在的遗传标记进行后续研究。 展开更多
关键词 杜撒×大长撒F_(1)代猪 PCK1基因 单核苷酸多态性 生长性状
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eya1基因多态性与非综合征型唇腭裂相关性研究
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作者 杨登兰 马晓芳 +3 位作者 黄永清 马坚 杨英 马睿 《实用口腔医学杂志》 北大核心 2026年第1期88-95,共8页
目的:研究旨在探讨eya1基因多态性与NSCL/P的相关性。方法:从504名患有非综合征型的病患和455名健康的新生儿中采集他们的外周静脉血液样本,然后对这些样本中的基因组DNA进行了提取;接着选择覆盖eya1基因上144种SNP位点作为基因分型,并... 目的:研究旨在探讨eya1基因多态性与NSCL/P的相关性。方法:从504名患有非综合征型的病患和455名健康的新生儿中采集他们的外周静脉血液样本,然后对这些样本中的基因组DNA进行了提取;接着选择覆盖eya1基因上144种SNP位点作为基因分型,并使用Hardy-Weinberg平衡检验来确认其有效性;运用Haploview软件完成了病例-对照分析。利用连锁和单倍型分析、3DSNP2.0数据库进行病例对照研究筛选出具有统计学差异的SNP位点的及转录因子结合位点,通过NCBI数据库对转录因子进行分析。结果:Hardy-Weinberg平衡检验的结果显示,在144个筛选出的SNP位点里,其中4个位点不符合H-W平衡。通过等位基因与基因相关性的检验分析,我们找到了16个SNP位点,它们的统计学差别显著。通过连锁与单倍型分析,140个SNP位点形成21个block,其中6个block的10个单倍型组合有显著性差异。这些区域的差异在病例组与对照组之间都是显著的。结论:eya1基因与NSCL/P的发生可能存在相关性,其中rs76870348、rs13260349、rs6999609、rs1445411、rs1445412、rs7006296、rs13439789、rs7829411、rs2380716、rs1445406位点可能更具有研究意义。 展开更多
关键词 唇裂伴或不伴腭裂 eya1基因 基因多态性 相关性研究
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上皮钠通道1β亚单位(SCNN1B)基因突变致Liddle综合征1例并文献复习
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作者 罗晶 刘梨娟 +2 位作者 康哲曦 郑泽琪 康婷 《中华高血压杂志(中英文)》 北大核心 2026年第2期196-199,共4页
Liddle综合征是一种罕见的常染色体显性、单基因遗传性疾病,典型症状包括早发高血压、低钾血症、代谢性碱中毒、低醛固酮、低肾素以及对盐皮质激素受体拮抗剂无反应。本文报道1例14岁青少年男性患者,早发严重高血压伴靶器官损害,低血钾... Liddle综合征是一种罕见的常染色体显性、单基因遗传性疾病,典型症状包括早发高血压、低钾血症、代谢性碱中毒、低醛固酮、低肾素以及对盐皮质激素受体拮抗剂无反应。本文报道1例14岁青少年男性患者,早发严重高血压伴靶器官损害,低血钾、低肾素,基因检测结果提示上皮钠通道1β亚单位(SCNN1B)基因有2个位点发生错义突变,确诊为Liddle综合征。 展开更多
关键词 LIDDLE综合征 上皮钠通道1β亚单位(SCNN1B)基因 高血压 基因检测
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