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新疆双相情感障碍患儿体内拉莫三嗪血药浓度与UGT2B7-161C>T基因多态性的相关性研究
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作者 赵婷 张惠兰 +4 位作者 冯杰 王婷婷 吴宛焰 于鲁海 李红健 《中国现代应用药学》 北大核心 2025年第11期1928-1932,共5页
目的探讨新疆双相情感障碍患儿体内拉莫三嗪血药浓度与UDP葡萄糖醛酸转移酶2家族多肽B7(UDP glucuronosyltransferase 2 family polypeptide B7,UGT2B7)-161C>T基因多态性的相关性。方法收集82例因双相情感障碍服用拉莫三嗪治疗≥21 ... 目的探讨新疆双相情感障碍患儿体内拉莫三嗪血药浓度与UDP葡萄糖醛酸转移酶2家族多肽B7(UDP glucuronosyltransferase 2 family polypeptide B7,UGT2B7)-161C>T基因多态性的相关性。方法收集82例因双相情感障碍服用拉莫三嗪治疗≥21 d的患儿血样,采用超高效液相色谱法测定拉莫三嗪血浆药物浓度。采用第1代测序技术检测患儿UGT2B7-161C>T基因型,分析患儿UGT2B7-161C>T基因多态性与拉莫三嗪血药浓度的相关性。结果41例患儿服用拉莫三嗪作为单药治疗,而其他41例患儿同时服用其他双相情感障碍药物,合并富马酸喹硫平组和氟西汀组患儿浓度/剂量比(concentration-to-dose ratio,CDR)值显著高于拉莫三嗪单药治疗组(P<0.05)。UGT2B7-161C>T的不同基因型组患儿的拉莫三嗪血浆药物浓度和CDR值均差异均具有统计学意义(P<0.05)。其中,UGT2B7-161C>T CT和TT基因型患儿的血药浓度和CDR结果均显著低于CC型患儿(P<0.05)。结论UGT2B7-161C>T基因突变影响拉莫三嗪的血药浓度,在为双相情感障碍患者开具拉莫三嗪处方时,建议检测UGT2B7-161C>T的基因型。 展开更多
关键词 新疆 患儿 拉莫三嗪 血药浓度 ugt2B7
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续断UGT基因家族的全基因组鉴定及原核表达
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作者 田梅 尹彦棚 +4 位作者 王双宜 朱泽宇 谭友莉 侯飞侠 高继海 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2025年第7期2035-2049,共15页
目的对续断中UGT基因进行全基因组鉴定、组学联合分析及原核表达,以期解析续断三萜皂苷的生物合成。方法采用实验室自测的续断基因组蛋白序列文件,利用BLASTP和hmmsearch,对续断UGT基因序列保守域进行验证。采用Prot-Param、SOMPA、MAGA... 目的对续断中UGT基因进行全基因组鉴定、组学联合分析及原核表达,以期解析续断三萜皂苷的生物合成。方法采用实验室自测的续断基因组蛋白序列文件,利用BLASTP和hmmsearch,对续断UGT基因序列保守域进行验证。采用Prot-Param、SOMPA、MAGA7.0、Tbtools等工具,对续断UGT基因家族进行蛋白理化性质、蛋白结构、共线性分析等进行分析,并利用转录组数据和代谢组学数据联合分析,筛选出两条可能与三萜皂苷生物合成相关的糖基转移酶,构建其表达载体进行原核表达。结果本研究从续断基因组中鉴定出44个续断UGT基因,续断UGT蛋白长度为49-1083氨基酸,平均分子量为24.86 kDa,等电点为4.31-8.59,续断UGT基因家族共分布在8条染色体上。根据续断、拟南芥和已经鉴定的UGT序列构建的系统发育树表明,续断中的糖基转移酶基因家族主要分布在UGT73、UGT81、UGT85、UGT80家族。顺式作用元件分析表明,光响应元件是UGT基因家族成员启动子区域最普遍存在的元件。利用转录组学和代谢组学联合分析筛选出两条可能与三萜皂苷生物合成相关的糖基转移酶,成功进行了原核表达。结论本研究利用多组学联合筛选出与续断三萜皂苷生物合成相关的两个候选基因进行原核表达,为进一步验证该基因的功能提供参考。 展开更多
关键词 续断 三萜皂苷 ugt 基因表达分析
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UGT1A1多态性与UGT1A1抑制药物相关药物性肝损伤的关系
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作者 陆雨佳 区可滢 +4 位作者 马越洋 袁传溯 刘斌 杨永峰 熊清芳 《实用医学杂志》 北大核心 2025年第4期588-593,共6页
目的基于药物基因组学探讨UGT1A1抑制药物相关药物性肝损伤(DILI)与其基因多态性的关系。方法收集2022年6月至2024年6月诊断为DILI的住院患者可能导致肝损伤的相关药物信息、血常规、肝功能等结果,查找相关数据库把DILI患者相关药物分为... 目的基于药物基因组学探讨UGT1A1抑制药物相关药物性肝损伤(DILI)与其基因多态性的关系。方法收集2022年6月至2024年6月诊断为DILI的住院患者可能导致肝损伤的相关药物信息、血常规、肝功能等结果,查找相关数据库把DILI患者相关药物分为UGT1A1抑制药物和非UGT1A1药物;并采用Sanger测序或MassARRAY SNP分型技术对UGT1A1基因进行检测与分型。结果共纳入219例DILI患者,男性98例,平均年龄(46.32±14.95)岁,查找相关数据库DILI患者有20个药物(16.26%,20/123)对UGT1A1酶有抑制作用。UGT1A1抑制药物相关DILI占60.73%(133/219)。UGT1A1抑制药物组的ALT、AST、ALP、GGT高于非UGT1A1药物组(P<0.05);而年龄、性别、TBIL、IBIL、WBC、Hb、Plt、损伤类型、损伤分级差异均无统计学意义(P>0.05)。UGT1A1抑制药物组的UGT1A1多态性位点占比(68.42%)高于非UGT1A1药物组[51.16%,OR(95%CI):2.068(1.183~3.617),χ^(2)=6.58,P=0.01]。UGT1A1抑制药物组与非UGT1A1药物组基因分类占比差异有统计学意义(χ^(2)=9.60,P=0.022)。在logistic单因素分析中ALT和UGT1A1*6与UGT1A1抑制药物相关DILI相关,多因素分析中UGT1A1*6[OR(95%CI):3.143(1.398~7.067),P=0.006]与UGT1A1抑制药物相关DILI显著相关。结论UGT1A1*6增加UGT1A1抑制药物相关DILI的发生。 展开更多
关键词 药物性肝损伤 基因多态性 ugt1A1 药物 抑制剂
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“小黄人”——UGT1A1变异相关疾病患者的生活及用药指导
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作者 班婷婷 王建设 《肝博士》 2025年第2期47-49,共3页
俗话说“十个宝宝九个黄”,可见黄疸(图1)在新生儿中十分常见。然而,如果黄疸太严重,例如血清总胆红素大于25 mg/d L,或持续时间超过2周,那就不正常了,这种情况被称为病理性黄疸。尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(UGT1A1)基因发生变异是... 俗话说“十个宝宝九个黄”,可见黄疸(图1)在新生儿中十分常见。然而,如果黄疸太严重,例如血清总胆红素大于25 mg/d L,或持续时间超过2周,那就不正常了,这种情况被称为病理性黄疸。尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(UGT1A1)基因发生变异是导致新生儿非溶血性病理性黄疸的重要原因之一。那么,UGT1A1变异后如何引起黄疸?面对这一疾病,家长们又该如何应对? 展开更多
关键词 生活指导 ugt1A1变异 病理性黄疸 新生儿
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野菊中三个黄酮苷合成UGT基因克隆及原核表达
5
作者 秦志伟 廖家豪 +3 位作者 张景景 刘义飞 胡志刚 刘晶晶 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2025年第1期56-64,共9页
目的克隆野菊中三个黄酮苷合成UGT基因,利用原核系统融合表达,为进一步研究这些基因在黄酮苷类物质合成中的功能提供了依据。方法从湖北二倍体野菊(Chrysanthemum indicum L.)的花组织cDNA中成功克隆了3个候选糖基转移酶(UDP-glycosyltr... 目的克隆野菊中三个黄酮苷合成UGT基因,利用原核系统融合表达,为进一步研究这些基因在黄酮苷类物质合成中的功能提供了依据。方法从湖北二倍体野菊(Chrysanthemum indicum L.)的花组织cDNA中成功克隆了3个候选糖基转移酶(UDP-glycosyltransferase,UGT)家族基因:即:CiUGT1(1425 bp)、CiUGT2(1311 bp)和CiUGT3(1314 bp),其编码的蛋白质分子量分别为51.72、48.08和48.28 kDa。经蛋白理化性质分析后,利用无缝克隆技术构建了重组质粒,其中CiUGT2与CiUGT3的重组蛋白在大肠杆菌系统中成功表达。结果SDS-PAGE分析显示,纯化后的CiUGT2和CiUGT3蛋白样品浓度分别约为0.2 mg·mL^(-1)和1.4 mg·mL^(-1)。结论获得了两个野菊中参与催化黄酮-7-O-葡萄糖苷合成的候选UGTs,为解析野菊头状花序中黄酮苷类物质生物合成的分子机制提供理论依据。 展开更多
关键词 野菊 ugt 原核表达 黄酮
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UGT8对结直肠癌生长迁移的影响及与SOX9相关性研究
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作者 庞一心 李文清 +2 位作者 姚奇隆 王宇 张秀梅 《中国肿瘤临床》 北大核心 2025年第12期595-602,共8页
目的:探讨尿苷二磷酸半乳糖转移酶(UDP galactosyltransferase 8,UGT8)对结直肠癌细胞生长迁移的影响及可能的机制,以及性别决定区Y框蛋白9(SRY-box transcription factor 9,SOX9)对UGT8可能的调控作用。方法:基于GEPIA2、UALCAN和TIMER... 目的:探讨尿苷二磷酸半乳糖转移酶(UDP galactosyltransferase 8,UGT8)对结直肠癌细胞生长迁移的影响及可能的机制,以及性别决定区Y框蛋白9(SRY-box transcription factor 9,SOX9)对UGT8可能的调控作用。方法:基于GEPIA2、UALCAN和TIMER 2.0在线数据库分析结直肠癌组织中UGT8和SOX9的表达水平及两者表达水平的相关性。通过免疫组织化学法检测结直肠癌及其癌旁组织的UGT8和SOX9的蛋白表达情况并分析其与临床病理特征的关系及两者表达水平相关性;在结直肠癌细胞中沉默UGT8后,CCK-8实验检测细胞的增殖能力;Transwell和划痕实验检测细胞的迁移能力;Western blot实验检测EMT标志物(E-cadherin和ZEB1)蛋白表达情况;RT-qPCR和Western blot法检测沉默SOX9后UGT8的mRNA和蛋白表达情况;JASPER在线网站预测SOX9是否与UGT8的启动子结合。结果:生物信息学结果显示,与正常组织相比较,UGT8和SOX9的mRNA表达水平异常升高,而且两者表达水平呈正相关。免疫组织化学结果显示,UGT8、SOX9在结直肠癌组织中的表达水平明显高于癌旁组织;UGT8的蛋白表达水平与N分期相关;SOX9的表达水平与T分期相关;UGT8和SOX9在结直肠癌组织中的表达存在正相关。沉默UGT8后细胞的增殖能力减弱;细胞的迁移能力降低;E-cadherin蛋白表达增加,ZEB1蛋白表达降低。沉默SOX9后,UGT8的mRNA和蛋白水平显著降低;JASPER网站预测SOX9可以和UGT8的启动子特异序列结合。结论:UGT8和SOX9在结直肠癌病理组织中均高表达,与临床病理特征相关,而且两者表达水平呈正相关;UGT8通过促进上皮间质转化促进结直肠癌细胞的增殖和迁移;SOX9促进UGT8的mRNA和蛋白表达,并可能与UGT8启动子结合。 展开更多
关键词 ugt8 SOX9 结直肠癌 增殖 迁移
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Huachansu injection enhances anti-colorectal cancer efficacy of irinotecan and alleviates its induced intestinal toxicity through upregulating UGT1A1-OATP1B3 expression in vitro and in vivo
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作者 Bo Jiang Zhao-yang Meng +6 位作者 Yu-jie Hu Jun-jun Chen Ling Zong Ling-yan Xu Xiang-qi Zhang Jing-xian Zhang Yong-long Han 《Journal of Integrative Medicine》 2025年第5期576-590,共15页
Objective:Huachansu injection(HCSI),a promising anti-cancer Chinese medicine injection,has been reported to have the potential for reducing the toxicity of chemotherapy and improving the quality of life for colorectal... Objective:Huachansu injection(HCSI),a promising anti-cancer Chinese medicine injection,has been reported to have the potential for reducing the toxicity of chemotherapy and improving the quality of life for colorectal cancer(CRC)patients.The objective of this study is to explore the synergistic and detoxifying effects of HCSI when used in combination with irinotecan(CPT-11).Methods:To investigate the effect of HCSI on anti-CRC efficacy and intestinal toxicity of CPT-11,we measured changes in the biological behavior of LoV o cells in vitro,and anti-tumor effects in LoV o cell xenograft nude mice models in vivo.Meanwhile,the effect of HCSI on intestinal toxicity and the uridine diphosphateglucuronosyltransferase 1A1(UGT1A1)expression was investigated in the CPT-11-induced colitis mouse model.Subsequently,we measured the effect of HCSI and its 13 constituent bufadienolides on the expression of UGT1A1 and organic anion transporting polypeptides 1B3(OATP1B3)in HepG 2 cells.Results:The combination index(CI)results showed that the combination of HCSI and CPT-11 exhibited a synergistic effect(CI<1),which significantly suppressing the LoV o cell migration,enhancing G2/M and S phase arrest,and inhibiting tumor growth in vivo.Additionally,the damage to intestinal tissues was attenuated by HCSI in CPT-11-induced colitis model,while the increased expression of UGT1A1 in HepG 2 cells and in mouse was observed.Conclusion:The co-therapy with HCSI alleviated the intestinal toxicity induced by CPT-11 and exerted an enhanced anti-CRC effect.The detoxifying mechanism may be related to the increased expression of UGT1A1 and OATP1B3 by HCSI and its bufadienolides components.The findings of this study may serve as a theoretical insights and strategies to improve CRC patient outcomes. 展开更多
关键词 Huachansu injection BUFADIENOLIDES ugt1A1 IRINOTECAN Colorectal cancer
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云南地区53例先天性高胆红素血症临床特征及UGT1A1基因多态性分析 被引量:1
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作者 李娟 邓成俊 +2 位作者 何舒丽 李英 王美芬 《昆明医科大学学报》 CAS 2024年第5期136-143,共8页
目的探讨云南地区53例UGT1A1基因突变所致的先天性高胆红素血症(Gilbert综合征、Crigler-Najjar综合征)的临床特征及UGT1A1基因突变特点。方法选取2017年1月至2022年12月间昆明市儿童医院消化内科53例Gilbert综合征(GS组)、Crigler-Naj... 目的探讨云南地区53例UGT1A1基因突变所致的先天性高胆红素血症(Gilbert综合征、Crigler-Najjar综合征)的临床特征及UGT1A1基因突变特点。方法选取2017年1月至2022年12月间昆明市儿童医院消化内科53例Gilbert综合征(GS组)、Crigler-NajjarⅡ型综合征(CN-2组)患儿的临床数据、UGT1A1基因突变结果,回顾性分析患儿的临床特征、实验室检查结果和基因多态性。结果少数民族患儿均在2组中发病率较高,CN-2组中女性比例比GS高。肝脏系统方面,CN-2组TBil、IDB水平较GS组更高,差异均有统计学意义(P<0.05),GS组肝脏结构正常,CN-2组有3例患者肝胆结构有异常。肝外系统方面,血液系统、糖代谢无异常,血脂、甲状腺功能代谢有异常,GS组有维生素D不足,CN-2组存在维生素A、D缺乏及维生素E水平下降。2组患儿均存在心脏结构异常,但CN-2组较GS组发病率高。在所有患者中,突变频率最高的为发生在5号外显子上的c.1456T>G(32例,60.37%),其次为c.1091C>T(14例,26.42%)、1号外显子c.211G>A(6例,11.32%)和c.1198A>C(4例,7.55%)。c.1456T>G位点突变在GS组和CN-2组的频率分别为69.23%和57.5%(9例和23例),2组间差异无统计学意义(P>0.05)。2组中,其次突变频率较高的为c.1091C>T(4例和10例),2组间差异无统计学意义(P>0.05)。UGT1A1基因单倍型1、3、4在GS组和CN-2组间的频率差异均有统计学意义(P<0.05)。UGT1A1基因的4种主要突变形式,在性别和不同民族间,差异无统计学意义(P>0.05)。结论GS组和CN-2组在肝脏系统、肝外系统的临床表现存在不同,UGT1A1基因突变频率最高的为发生在5号外显子上的c.1456T>G。 展开更多
关键词 GILBERT综合征 Crigler-Najjar综合征 血清总胆红素 ugt1A1 基因型
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UGT1A1遗传多态性与非遗传因素对伊立替康不良反应影响的回顾分析 被引量:1
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作者 李娟 陈冰 张伟霞 《中国医院药学杂志》 北大核心 2024年第24期2863-2867,2880,共6页
目的:探讨尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(uridine diphosphate-glucuronosy1transferase1A1,UGT1A1)遗传多态性和非遗传因素对伊立替康所致不良反应影响,提高伊立替康临床应用安全性。方法:收集2018年1月至2020年9月期间以伊立替康为... 目的:探讨尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶1A1(uridine diphosphate-glucuronosy1transferase1A1,UGT1A1)遗传多态性和非遗传因素对伊立替康所致不良反应影响,提高伊立替康临床应用安全性。方法:收集2018年1月至2020年9月期间以伊立替康为基础化疗的178例肿瘤患者信息,分析患者UGT1A1基因型和表型及临床生理、合并用药等非遗传因素与严重腹泻和中性粒细胞减少发生的相关性。结果:178例使用含伊立替康方案化疗患者中,UGT1A1*6野生型(GG)110例,杂合型(GA)61例,纯合型(AA)患者7例;UGT1A1*28野生型(TA6TA6)患者148例,杂合型(TA6TA7)27例,纯合型突变(TA7TA7)3例。快代谢型(EM)患者87人,中间代谢型(IM)74人,慢代谢性型(PM)患者17人。UGT1A1*6杂合型(GA+AA)显著增加严重中性粒细胞减少的发生风险(P=0.021)。表型结果显示,IM和PM患者发生严重中性粒细胞减少的风险显著高于EM患者(P=0.004)。患者基础总胆红素水平是严重中性粒细胞减少的危险因素(P=0.001),化疗方案与严重腹泻具有显著相关性(P=0.004)。结论:UGT1A1*6遗传多态性和患者基础总胆红素水平可预测伊立替康骨髓抑制风险,患者肿瘤治疗方案与伊立替康严重腹泻明显有关。 展开更多
关键词 伊立替康 非遗传因素 ugt1A1基因多态性 不良反应 回顾分析
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UGT1A4-142T>G基因多态性与双相情感障碍患儿体内拉莫三嗪血药浓度的相关性 被引量:1
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作者 张惠兰 赵婷 +1 位作者 李红健 于鲁海 《临床药物治疗杂志》 2024年第10期33-37,共5页
目的 分析评估UGT1A4-142T>G基因多态性对双相情感障碍患儿拉莫三嗪血浆浓度的影响.方法 收集2019年1月至2024年5月就诊于新疆维吾尔自治区人民医院的因双相情感障碍服用拉莫三嗪治疗至少21 d患儿的血样,采用超高效液相色谱法测定拉... 目的 分析评估UGT1A4-142T>G基因多态性对双相情感障碍患儿拉莫三嗪血浆浓度的影响.方法 收集2019年1月至2024年5月就诊于新疆维吾尔自治区人民医院的因双相情感障碍服用拉莫三嗪治疗至少21 d患儿的血样,采用超高效液相色谱法测定拉莫三嗪血浆药物浓度,采用第一代Sanger测序方法检测患儿UGT1A4-142T>G基因型,分析患儿UGT1A4-142T>G基因多态性与拉莫三嗪血药浓度的相关性.结果 共收集82例患儿,男14例,女68例,平均年龄为(15.51±1.72)岁,拉莫三嗪平均给药剂量为(196.54±90.25)mg/d,平均血药浓度为(4.66±2.64)μg/mL,平均浓度剂量比(CDR)为(1.44±1.22)μg·kg/(mL·mg).患儿拉莫三嗪血药浓度与给药剂量呈正相关(r=0.541,P<0.05).UGT1A4-142T>G基因分型分别为TT基因型(52例)、GT基因型(25例)和GG基因型(5例).UGT1A4-142T>G不同基因型患儿的性别、年龄、BMI、拉莫三嗪给药剂量、拉莫三嗪血药浓度和CDR比较,差异均有统计学意义(P<0.05).其中,GG基因型组患儿的年龄大于TT基因型组[(16.34±1.19)岁比(15.77±1.54)岁],BMI低于TT基因型组[(18.69±2.34)kg/m^(2) 比(20.72±3.53)kg/m^(2) ],拉莫三嗪血药浓度高于TT基因型组[(5.63±1.48)μg/mL和(4.56±2.82)μg/mL],差异均有统计学意义(P<0.05);GT基因型组患儿的BMI、拉莫三嗪给药剂量低于TT基因型组[(19.87±5.01)kg/m^(2) 比(20.72±3.53)kg/m^(2) ,(164.79±77.95)mg/d和(208.26±86.95)mg/d],CDR高于TT基因型组[(1.78±1.24)μg·kg/(mL·mg)和(1.33±1.15)μg·kg/(mL·mg)],差异均有统计学意义(P<0.05).结论 UGT1A4-142T>G基因突变影响拉莫三嗪血药浓度,双相情感障碍患儿如需使用拉莫三嗪建议检测UGT1A4-142T>G的遗传表型. 展开更多
关键词 ugt1A4 双相情感障碍 拉莫三嗪 血药浓度
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两种花色绿绒蒿MiUGT79B1和MpUGT79B1基因的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 周麟 李拓键 屈燕 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期102-109,共8页
为探究尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)在不同花色绿绒蒿中的序列特征及其与绿绒蒿花色的关系,以黄色花的全缘叶绿绒蒿和红色花的红花绿绒蒿为研究材料,从2种花色绿绒蒿的全长转录组数据中各筛选1个UGT基因,根据转录组KEGG注释结果,将这2个... 为探究尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)在不同花色绿绒蒿中的序列特征及其与绿绒蒿花色的关系,以黄色花的全缘叶绿绒蒿和红色花的红花绿绒蒿为研究材料,从2种花色绿绒蒿的全长转录组数据中各筛选1个UGT基因,根据转录组KEGG注释结果,将这2个基因分别命名为MiUGT79B1和MpUGT79B1,并对其进行克隆、生物信息学及RT-qPCR分析。结果表明:MiUGT79B1和MpUGT79B1基因ORF长度为1314,编码437个氨基酸。MiUGT79B1和MpUGT79B1蛋白的结构均主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,属于亲水性稳定蛋白。系统进化树和多序列比对分析发现,MiUGT79B1和MpUGT79B1与鸦片罂粟、火罂粟、野罂粟和博落回的亲缘关系最近。RT-qPCR分析显示,MiUGT79B1和MpUGT79B1均在花蕾期高表达,MiUGT79B1表达趋势为先降低后升高,MpUGT79B1表达趋势为先降低后保持平缓。2种花色绿绒蒿UGT基因表达水平与总黄酮累积模式均呈显著正相关。结果为进一步深入研究MiUGT79B1和MpUGT79B1基因在绿绒蒿花瓣呈色中的功能及其花色分子育种提供理论基础。 展开更多
关键词 全缘叶绿绒蒿 红花绿绒蒿 ugt79B 基因克隆 花色
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野菊尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)基因家族的全基因组鉴定和表达分析 被引量:8
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作者 廖家豪 陈诗 +2 位作者 刘迪 张景景 刘义飞 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期702-716,共15页
尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)在植物体内参与多种次生代谢产物的糖基化修饰,在植物生长发育与次生代谢调节中具有重要作用。该研究基于二倍体野菊Chrysanthemum indicum基因组,利用生物信息学方法对野菊UGT基因家族进行鉴定,并对UGT蛋白... 尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)在植物体内参与多种次生代谢产物的糖基化修饰,在植物生长发育与次生代谢调节中具有重要作用。该研究基于二倍体野菊Chrysanthemum indicum基因组,利用生物信息学方法对野菊UGT基因家族进行鉴定,并对UGT蛋白的理化性质、亚细胞定位预测、保守基序、系统发育、染色体定位、基因结构以及基因复制事件进行分析,利用转录组与实时荧光定量PCR分析野菊UGT基因在花和叶组织中的表达模式,利用类靶向代谢组分析花和叶中差异代谢物。结果显示,在二倍体野菊基因组中共鉴定出279个UGT基因,系统发育分析显示这些UGT基因分为了8个亚家族,同一亚家族成员在染色体上呈簇状分布,串联重复是野菊UGT基因家族扩张的主要驱动力。结构域分析显示,262个UGT基因具有完整的植物次生代谢信号序列(PSPG box)。顺式作用元件分析表明,光响应元件是UGT基因家族成员启动子区域最普遍存在的元件。花和叶组织的类靶向代谢组分析显示,木犀草素-7-O-葡萄糖苷、山柰酚-7-O-葡萄糖苷等多种黄酮类代谢物在花中具有更高的积累水平。花和叶组织的比较转录组分析显示,差异表达的UGT基因有72个,其中29个基因是在花中上调,43个基因在叶中上调。相关性网络与系统发育分析显示CindChr9G00614970.1、CindChr2G00092510.1、CindChr2G00092490.1可能参与了野菊中7-O-黄酮苷的合成。实时荧光定量PCR分析证实了转录组数据的可靠性。该研究结果有助于了解野菊UGT基因家族的功能,为深入研究野菊黄酮苷合成的分子调控机制提供数据参考和理论依据。 展开更多
关键词 野菊 尿苷二磷酸糖基转移酶(ugt) 代谢组分析 转录组分析
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UGT1A4^(*)3基因多态性对恶性血液病患者泊沙康唑血药浓度及侵袭性真菌病预防疗效的影响
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作者 张飞雨 张瑞霞 +3 位作者 魏晓晨 赵佳 张弋 朱明辉 《中国医院药学杂志》 CAS 北大核心 2024年第22期2628-2632,共5页
目的:分析恶性血液病患者UGT1A4^(*)3基因多态性对泊沙康唑血药浓度及侵袭性真菌病预防疗效的影响,探讨泊沙康唑血药浓度不达标的危险因素,为临床个体化用药提供参考。方法:收集2020年10月至2022年6月服用泊沙康唑的恶性血液病患者临床... 目的:分析恶性血液病患者UGT1A4^(*)3基因多态性对泊沙康唑血药浓度及侵袭性真菌病预防疗效的影响,探讨泊沙康唑血药浓度不达标的危险因素,为临床个体化用药提供参考。方法:收集2020年10月至2022年6月服用泊沙康唑的恶性血液病患者临床资料,测定患者泊沙康唑血药浓度及其UGT1A4基因型,记录患者侵袭性真菌病预防疗效并分析基因型对其影响,探讨基因多态性、年龄、性别、体质量指数(BMI)、肝肾功能等因素对泊沙康唑血药浓度的影响。结果:共纳入121例患者,监测泊沙康唑血药浓度279例次。携带UGT1A4^(*)3突变基因患者的泊沙康唑血药浓度显著低于野生型(P=0.009),但基因多态性对最终侵袭性真菌病的预防疗效并无显著影响(P>0.05)。UGT1A4^(*)3基因多态性、性别、BMI、腹泻呕吐为泊沙康唑血药浓度不达标的独立危险因素(P<0.05)。结论:影响泊沙康唑血药浓度不达标的危险因素较多,用药过程建议密切监测,临床应结合患者UGT1A4^(*)3基因型、性别、BMI、是否合并腹泻呕吐等因素及时调整泊沙康唑的给药剂量或剂型,以保障用药的安全性和有效性。 展开更多
关键词 泊沙康唑 ugt1A4^(*)3 基因多态性 治疗药物监测
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尖萼耧斗菜UGT基因家族成员鉴定及表达分析 被引量:2
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作者 司文 孟缘 +4 位作者 李卓林 樊川钰 苑一超 周蕴薇 白云 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1690-1704,共15页
【目的】明确尖萼耧斗菜和黄花尖萼耧斗菜中UGT家族成员的结构特性,挖掘合成花青素的关键UGT基因。【方法】基于尖萼耧斗菜花色转录组,筛选与鉴定UGT家族基因成员并分析其理化性质、保守基序、系统进化和顺式作用元件等,结合UGT基因在2... 【目的】明确尖萼耧斗菜和黄花尖萼耧斗菜中UGT家族成员的结构特性,挖掘合成花青素的关键UGT基因。【方法】基于尖萼耧斗菜花色转录组,筛选与鉴定UGT家族基因成员并分析其理化性质、保守基序、系统进化和顺式作用元件等,结合UGT基因在2种尖萼耧斗菜萼片中不同时期的表达模式,筛选出合成花青素的候选基因。【结果】共鉴定出154个AoUGT基因成员,编码蛋白质含有52~1293个氨基酸,相对分子量为5.897~144.174 kDa,其理论等电点范围为3.21~7.14之间,偏酸性蛋白较多,均为亲水性蛋白;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,均具有UGT保守结构域。尖萼耧斗菜UGT基因家族成员共分为14个亚家族,A组UGT基因成员数量最多,G和J组的UGT基因成员数量最少。MEME保守基序分析显示UGT基因家族均含有2个高度保守的基序Motif 1和Motif 4,这2个保守基序共同组成UGT基因家族的PSPG保守结构域。启动子顺式作用元件分析发现,AoUGT家族成员启动子的顺式作用元件涉及光响应、激素、胁迫及MYB结合位点等。AoUGT147/127/45/143在尖萼耧斗菜的开花前期(S2)中处于高表达水平,而在黄花尖萼耧斗菜中始终处于低表达水平。【结论】AoUGT147/127/45/143是尖萼耧斗菜花色差异的关键基因,在花色的形成过程中发挥重要作用,为后续花色研究提供了重要线索。 展开更多
关键词 尖萼耧斗菜 ugt 基因家族 生物信息学分析 表达分析
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杨树UGT198基因的生物信息学分析、基因克隆及功能初探 被引量:2
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作者 杨改霞 王春雨 +2 位作者 龙连香 王世杰 顾丽姣 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期14-22,共9页
【目的】研究UGT198基因是否参与调控烟草抗虫性,为未来探索其参与调控杨树抗虫性奠定基础。【方法】前期通过分析公共转录组数据发现PtrUGT198基因在杨树响应虫害的转录组中高调表达,对其进行生物信息学及进化分析。以107杨为材料,克隆... 【目的】研究UGT198基因是否参与调控烟草抗虫性,为未来探索其参与调控杨树抗虫性奠定基础。【方法】前期通过分析公共转录组数据发现PtrUGT198基因在杨树响应虫害的转录组中高调表达,对其进行生物信息学及进化分析。以107杨为材料,克隆UGT198基因,构建过量表达载体,利用农杆菌介导法转化烟草获得过量表达转基因株系。通过棉铃虫饲虫试验初步验证UGT198基因是否参与调控抗虫性,分析UGT198基因在调控抗虫性中发挥的功能。【结果】PtrUGT198基因完整的ORF区为1440 bp,编码479个氨基酸,理论分子量为53.14 kDa,等电点为5.92,编码不稳定疏水性蛋白。PtrUGT198蛋白的二级结构α⁃螺旋占41.75%,β⁃折叠占14.61%,β⁃转角占7.10%,无规卷曲占6.53%。PtrUGT198蛋白不存在跨膜区,预测其不属于膜蛋白,为非分泌性蛋白,该蛋白的磷酸化修饰以丝氨酸为主。同源序列对比结果显示PtrUGT198蛋白的C末端存在高度保守的植物次生产物糖基转移酶(Plant secondary product glycosyltransferase,PSPG)基序。系统进化树分析发现,PtrUGT198蛋白与同属植物毛白杨、银白杨和胡杨亲缘关系最近,其次和模式植物烟草有较近的亲缘关系。成功克隆杨树UGT198基因,构建pNC⁃UGT198基因过量表达载体,并转化烟草获得过量表达转基因株系,进行饲虫实验,得到高表达量烟草相对抗虫。【结论】首次成功克隆了UGT198基因,并初步解析其调控抗虫性的功能,为深入了解UGT198基因调控杨树抗虫机理提供参考价值。 展开更多
关键词 杨树 ugt198 生物信息学 基因克隆 过表达转基因株系
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UGT1A1*28和UGT1A1*6基因多态性在结直肠癌患者中的分布调查 被引量:1
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作者 蔡贞 温淑娟 郑磊 《实用检验医师杂志》 2013年第2期72-75,共4页
目的调查结直肠癌患者UGT1A1基因UGT1A1*28和UGT1A1*6基因多态性的分布频率。方法收集我院80例结直肠癌患者外周血标本,提取基因组DNA.PCR扩增UGT1A1基因启动子和第1外显子基因片段,直接测序确定基因型。结果80例结直肠癌患者中.U... 目的调查结直肠癌患者UGT1A1基因UGT1A1*28和UGT1A1*6基因多态性的分布频率。方法收集我院80例结直肠癌患者外周血标本,提取基因组DNA.PCR扩增UGT1A1基因启动子和第1外显子基因片段,直接测序确定基因型。结果80例结直肠癌患者中.UGT1A1六28位点野生型TA6/6为55例(68.75%),杂合突变型TA6/7基因型22例(27.50%),纯和突变型TA7/7有3例(3.75%);UGT1A1*6位点突变型211GG基因型57例(71.25%),211GA基因型22例(27.50%),211AA基因型1例(1.25%)。等位基因出现频率分别为TA6为82.50%.TA7为17.50%.211G为85.00%.211A为15.00%。同时携带TA7和211A等位基因共6例(7.50%)。结论结直肠癌患者中UGT1A1*6和UGT1A1*28分布频率均较高,在测定UGT1A1基因多态性时应同时检测这两个突变位点。 展开更多
关键词 结直肠癌 ugt1A1 基因多态性 ugt1A1*28 ugt1A1*6
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烟草UGT92A1基因的全基因组鉴定和表达分析
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作者 张梦真 邱宇姗 +6 位作者 黄赟 周遵华 马敏伦 陈德慧 马玉玺 赵会彦 李彩斌 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第14期46-53,共8页
为探究尿苷二磷酸(uridine diphosphate,UDP)-依赖性糖基转移酶(UGT)在烟叶适应环境中的作用,以拟南芥UGT92A1基因为参考,对烟草、番茄、马铃薯的UGT92A1基因进行全基因组鉴定,随后对鉴定到的候选基因进行蛋白理化性质、系统进化、染色... 为探究尿苷二磷酸(uridine diphosphate,UDP)-依赖性糖基转移酶(UGT)在烟叶适应环境中的作用,以拟南芥UGT92A1基因为参考,对烟草、番茄、马铃薯的UGT92A1基因进行全基因组鉴定,随后对鉴定到的候选基因进行蛋白理化性质、系统进化、染色体定位、基因结构的分析。此外,通过顺式作用元件分析,以及对云烟87、韭菜坪2号这2个烟草品种的UGT92A1基因在达依、可乐、铁匠这3个烟叶产区的基因表达差异分析,预测烟草UGT92A1基因家族的关键基因成员。结果显示,从烟草、番茄、马铃薯中分别鉴定到9、2、7个同源基因,系统发育树将其按亲缘关系分为3组;基因结构分析显示,4个物种中19个UGT92A1基因都具有UDPGT结构域,但结构域的结构和长度差异较大;顺式作用元件分析显示,烟草UGT92A1基因启动子区域含有大量光响应元件,此外还包含低温响应、缺氧诱导、干旱、创伤反应等非生物胁迫相关元件;转录组测序结果表明,NtUGT92A1-2、NtUGT92A1-7、NtUGT92A1-8这3个基因的表达量相对较高,且其表达均显著受烟叶产区的影响。综上,本研究在烟草中共鉴定到9个UGT92A1基因,其中NtUGT92A1-2、NtUGT92A1-7、NtUGT92A1-8这3个基因可能是烟草适应不同环境的关键基因,后续可进行深入研究。 展开更多
关键词 烟草 ugt92A1 生物信息学 系统进化 表达分析
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UGT1A1杂合突变与伊立替康所致不良反应的真实世界研究 被引量:1
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作者 左靖 孟珺 +4 位作者 李超 夏铮铮 唐浩淳 李安娜 马晓芙 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2024年第1期35-45,共11页
为了研究某三甲肿瘤专科医院患者UGT1A1基因型分布,探索真实世界中患者UGT1A1基因多态性与服用伊立替康后的不良反应的相关性,我们回顾性分析2017年5月至2021年12月该院42例接受UGT1A1基因检测的患者资料,总结其中31例服用伊立替康后其... 为了研究某三甲肿瘤专科医院患者UGT1A1基因型分布,探索真实世界中患者UGT1A1基因多态性与服用伊立替康后的不良反应的相关性,我们回顾性分析2017年5月至2021年12月该院42例接受UGT1A1基因检测的患者资料,总结其中31例服用伊立替康后其血液学以及非血液学不良反应的发生情况。结果表明:UGT1A128基因杂合突变率为21.9%,纯合突变率为4.9%,UGT1A16基因杂合突变率为31.5%,未检测到纯合突变型;本研究中UGT1A16及28杂合突变的患者较野生型患者血液学和非血液学不良反应未见显著性差异,血液学不良反应包括中性粒细胞减少、白细胞减少、血小板减少、血红蛋白减少,非血液学不良反应包括ALT/AST增高、ALP/GGT增高、胆红素增高、乏力、恶心、呕吐、迟发型腹泻;UGT1A16和28双位点突变的患者出现迟发性腹泻的发生率为100%。研究表明,UGT1A16和28双位点杂合突变的患者出现迟发性腹泻风险较高,需引起关注;UGT1A1杂合突变患者应用伊立替康后出现血液学及非血液学不良反应无显著性差异,但需进一步增加样本量证实这一结论。 展开更多
关键词 伊立替康 ugt1A1 尿苷二磷酸葡萄糖糖醛酸转移酶 基因多态性 不良反应
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结直肠癌患者UGT1A1基因多态性与伊立替康不良反应的相关性研究进展
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作者 李兰 田绍东 周卫华 《临床医学进展》 2024年第2期3662-3666,共5页
结直肠癌(CRC)是消化系统中常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率在全球恶性肿瘤中均位列前位。FOLFRIL方案即以伊立替康(CPT-11)为基础的联合化疗方案是晚期结直肠癌患者的标准一线治疗方案,但伊立替康治疗常伴有明显的不良反应,也正是因... 结直肠癌(CRC)是消化系统中常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率在全球恶性肿瘤中均位列前位。FOLFRIL方案即以伊立替康(CPT-11)为基础的联合化疗方案是晚期结直肠癌患者的标准一线治疗方案,但伊立替康治疗常伴有明显的不良反应,也正是因为这样才导致没有得到大范围的临床应用。通过进一步了解后得到出现这一现象的主要原因在于伊立替康存在活性产物7-乙基10-羟基喜树碱(SN-38)。在人体内,SN-38被尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶(UGTs)催化形成其无活性代谢物葡萄糖醛酸苷(SN-38G),通过肾脏和肠道排出体外,以达到解毒的目的。目前已经有相关研究证实UGT1A1基因多态性与伊立替康化疗毒性有关,存在UGT1A1基因突变的患者,其UGTs酶活性减弱,导致SN-38代谢延迟,在患者体内蓄积引发不良反应,影响患者生活质量,更有可能导致抗癌治疗中断和临床死亡。因此在接受伊立替康治疗的患者中,将UGT1A1基因型视为毒性预测因子,并实施个体化治疗策略,避开相关风险,是临床亟待解决的问题。本文将对晚期结直肠癌患者UGT1A1基因多态性与伊立替康不良反应之间的关系进行研究,对国内外文献进行综述。 展开更多
关键词 结直肠癌 伊立替康 ugt1A1基因多态性 腹泻 中性粒细胞减少
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