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三点自交法和两点最大似然法构建水稻F_2群体分子标记连锁图谱的比较
被引量:
2
1
作者
谭军
薛庆中
《生物数学学报》
CSCD
2003年第4期448-456,共9页
根据连锁遗传的原理,列出了三点自交法和两点自交最大似然(ML)法估算显性标记遗传距离的具体步骤和算法,将水稻F_2群体含香味基因Aro及其连锁的RFLP数据转变为显性标记数据后,用上述两种方法构建的连锁图谱与用MAPMAKER软件计算共显性...
根据连锁遗传的原理,列出了三点自交法和两点自交最大似然(ML)法估算显性标记遗传距离的具体步骤和算法,将水稻F_2群体含香味基因Aro及其连锁的RFLP数据转变为显性标记数据后,用上述两种方法构建的连锁图谱与用MAPMAKER软件计算共显性数据得到的图谱排序相同、标记间距离相近.但是标记数据存在较大程度偏分离时,由三点自交法构建的图谱中标记间图距有增大趋势.作者为提高作图精确性,简化计算过程,讨论了三点自交法对估算重组值的影响及其在分子标记作图中的应用价值,并建议书共显性标记转变为显性标记时进行两次自交ML法估算.
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关键词
三点自交法
最大似然法
分子标记连锁图谱
水稻
偏分离
连锁遗传
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题名
三点自交法和两点最大似然法构建水稻F_2群体分子标记连锁图谱的比较
被引量:
2
1
作者
谭军
薛庆中
机构
浙江大学农业与生物技术学院农学系
出处
《生物数学学报》
CSCD
2003年第4期448-456,共9页
基金
国家"863"计划(101-01-01-3)
国家自然科学基金(39870421)
浙江省重点课题(C22007)
文摘
根据连锁遗传的原理,列出了三点自交法和两点自交最大似然(ML)法估算显性标记遗传距离的具体步骤和算法,将水稻F_2群体含香味基因Aro及其连锁的RFLP数据转变为显性标记数据后,用上述两种方法构建的连锁图谱与用MAPMAKER软件计算共显性数据得到的图谱排序相同、标记间距离相近.但是标记数据存在较大程度偏分离时,由三点自交法构建的图谱中标记间图距有增大趋势.作者为提高作图精确性,简化计算过程,讨论了三点自交法对估算重组值的影响及其在分子标记作图中的应用价值,并建议书共显性标记转变为显性标记时进行两次自交ML法估算.
关键词
三点自交法
最大似然法
分子标记连锁图谱
水稻
偏分离
连锁遗传
Keywords
Three-point
selfcross
method
two-point selfcross ml method
Linkage map of molecular markers
Rice
Segregation distortion
分类号
S511 [农业科学—作物学]
Q343.17 [生物学—遗传学]
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作者
出处
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1
三点自交法和两点最大似然法构建水稻F_2群体分子标记连锁图谱的比较
谭军
薛庆中
《生物数学学报》
CSCD
2003
2
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