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应用ABEEMσπ方法研究喜树碱类药物与Top1cc的相互作用
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作者 邹惠园 赵东霞 杨忠志 《分子科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期353-357,共5页
应用ABEEM/MM分子力场结合ABEEMσπ/GB/SA方法,分别研究了内酯和羧酸盐形式喜树碱以及不含内酯结构的S39625与Top1-DNA复合物相互作用的结合自由能.从计算得到的结合自由能以及相互作用的结构分析上来看,羧酸盐形式的喜树碱与Top1cc结... 应用ABEEM/MM分子力场结合ABEEMσπ/GB/SA方法,分别研究了内酯和羧酸盐形式喜树碱以及不含内酯结构的S39625与Top1-DNA复合物相互作用的结合自由能.从计算得到的结合自由能以及相互作用的结构分析上来看,羧酸盐形式的喜树碱与Top1cc结合的更稳定,不含内酯结构的S39625也表现出和喜树碱相类似的结合Top1cc的能力.由此看来,内酯结构并非是喜树碱捕获DNA拓扑异构酶的必要条件,羧酸盐形式的喜树碱由于带一个负电荷而具有更强的结合能力.研究从分子水平上揭示了喜树碱的结构对抗癌活性的影响,将有助于设计和发展该类抗癌药物的合成. 展开更多
关键词 喜树碱S39625 toplcc ABEEMσπ 抗癌药物
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