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基于VisionMaster与Modbus TCP协议的工业协作机器人视觉调试系统设计
1
作者 邱旋 吴创 +3 位作者 谢昕 柳驰 王伟 黄熙宁 《电子制作》 2026年第2期107-111,共5页
本文设计了一种基于机器视觉与PLC协同控制的饮料自动识别系统。本系统分三个板块实现,即VisionMaster视觉调试方案设计、PLC系统调试方案设计和HMI系统调试方案设计。视觉系统采用海康威视MV-CU060-10G工业相机,通过VisionMaster平台... 本文设计了一种基于机器视觉与PLC协同控制的饮料自动识别系统。本系统分三个板块实现,即VisionMaster视觉调试方案设计、PLC系统调试方案设计和HMI系统调试方案设计。视觉系统采用海康威视MV-CU060-10G工业相机,通过VisionMaster平台完成图像采集与处理:配置SOFTWARE软触发模式、12,000μs曝光时间及Mono8灰度输出;建立TCP服务端,基于字节匹配规则(0-1位置字符串“pz”)实现拍照指令响应;利用高精度特征匹配模块构建各类饮料模板库(旋转容差±180°),通过格式化模块输出“模板编号,角度”数据。PLC端基于西门子S7-1200开发,在TIA Portal V16中创建非优化DB数据块(含相机通信结构体Array[0..7]of Char发送指令、Array[0..63]of Char接收缓冲区),通过TSEND_C/TRCV_C模块实现与视觉系统的TCP通信,HMI面板集成拍照触发与结果显示功能。测试表明,该系统识别准确率达99.2%,指令响应延迟<50ms,成功解决了传统生产线中旋转物体识别稳定性差、多设备协同效率低的问题,为柔性制造提供了可靠的技术方案。 展开更多
关键词 机器视觉 PLC控制 软触发 字节匹配 饮料识别 tcp/IP协议 工业自动化
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菜薹TCP家族基因鉴定及其对腋芽性状的影响
2
作者 朱彩烁 李建忠 +8 位作者 张倩男 徐丽杰 张淑江 章时蕃 李菲 张慧 徐进 宋子涵 李国亮 《园艺学报》 北大核心 2026年第1期82-98,共17页
解析TCP基因家族调控菜薹腋芽形成的机制,对于改良菜薹株型具有重要意义。基于拟南芥TCP家族成员与菜薹基因组的同源关系,筛选并鉴定出菜薹TCP家族成员,进行理化性质、系统发育关系、基因结构、染色体定位、共线性分析,同时对不同品种... 解析TCP基因家族调控菜薹腋芽形成的机制,对于改良菜薹株型具有重要意义。基于拟南芥TCP家族成员与菜薹基因组的同源关系,筛选并鉴定出菜薹TCP家族成员,进行理化性质、系统发育关系、基因结构、染色体定位、共线性分析,同时对不同品种的菜薹材料中TCP家族基因的表达量进行分析,进一步筛选出与菜薹腋芽发育相关的关键基因进行亚细胞定位分析。结果表明,在菜薹中共鉴定出39个TCP家族成员,均包含保守的TCP结构域。TCP家族基因在染色体上分布不均匀。通过选择腋芽数量不同的4种菜薹材料进行实时荧光定量分析,发现TCP家族中的BraA05g005380.3C、BraA07g034590.3C、BraA03g048240.3C、BraA02g018710.3C、BraA03g038400.3C和BraA01g034360.3C具有明显的表达量差异,推测这些基因是正向调控菜薹腋芽发育的关键候选基因。对上述6个基因进行亚细胞定位分析发现,BraA07g034590.3C基因定位在细胞核膜上,其余基因均定位在细胞核中。 展开更多
关键词 菜薹 tcp 基因家族 腋芽 调控基因
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牡丹TCP基因家族鉴定及TCP15a功能分析
3
作者 韩新蕊 袁欣 +5 位作者 高杰 王亮生 王晓晖 贾文庆 符真珠 张和臣 《植物学报》 北大核心 2026年第1期37-52,共16页
为探明TCP转录因子家族在牡丹(Paeonia×suffruticosa)花瓣呈色过程中的作用,为牡丹花色改良和分子育种提供候选基因,对牡丹TCP家族基因进行鉴定和生物信息学分析,并对可能参与花色调控的基因TCP13和TCP15a进行功能分析。结果表明,... 为探明TCP转录因子家族在牡丹(Paeonia×suffruticosa)花瓣呈色过程中的作用,为牡丹花色改良和分子育种提供候选基因,对牡丹TCP家族基因进行鉴定和生物信息学分析,并对可能参与花色调控的基因TCP13和TCP15a进行功能分析。结果表明,在3个牡丹基因组中共鉴定出26个TCP家族成员,分为2个亚族3个亚类,不规则分布在5条染色体上;不同成员的理化性质和基因结构存在差异,但均含有TCP保守结构域。在矮牵牛(Petunia hybrida)花瓣中瞬时表达TCP13和TCP15a,发现TCP13对MYB57诱导的紫色表型无明显作用,而TCP15a可显著抑制该表型;荧光定量PCR分析表明,TCP15a可以显著抑制MYB57诱导浸染的花瓣组织内花青素苷合成酶基因CHSa、DFR和ANS的表达。进一步通过蛋白互作鉴定发现,TCP15a与MBW蛋白复合体成员WD40-1和WD40-2互作。TCP15a通过与MYB57竞争与WD40的相互作用,影响MBW复合体的形成,进而抑制MYB57对花青素苷合成酶基因的调控作用。研究结果为阐明牡丹TCP家族基因功能奠定理论基础,为牡丹花色定向育种提供了有价值的线索。 展开更多
关键词 牡丹 花色 tcp转录因子家族 功能分析
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岩白菜TCP基因家族的表达模式及代谢关联分析
4
作者 陈靖彧 王文庆 +4 位作者 罗诗语 杨路祥 汪慧骏 吴天宇 朱乾坤 《植物学报》 北大核心 2026年第1期26-36,共11页
TCP蛋白家族是植物特有的一类转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应过程中发挥重要作用。为阐明岩白菜(Bergenia purpurascens) BpTCP基因家族的功能,基于转录组测序数据,利用生物信息学方法对岩白菜BpTCP基因家族进行系统鉴定与分析... TCP蛋白家族是植物特有的一类转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应过程中发挥重要作用。为阐明岩白菜(Bergenia purpurascens) BpTCP基因家族的功能,基于转录组测序数据,利用生物信息学方法对岩白菜BpTCP基因家族进行系统鉴定与分析。共鉴定出16个BpTCP基因,可分为2大类,所有BpTCP基因均含有保守的TCP结构域,相同进化枝的BpTCP蛋白所含基序类型相似。表达模式分析表明,不同BpTCP基因在不同组织中的表达水平存在差异。低温胁迫条件下,BpTCP10、BpTCP1和BpTCP12的表达出现显著变化。BpTCP基因家族表达水平与次级代谢物含量的相关性分析显示,部分BpTCP基因的表达与黄酮类和酚类等多种代谢物含量间显著相关。研究结果为深入探究BpTCP基因在岩白菜生长发育、低温胁迫响应及次生代谢合成途径中的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 岩白菜 tcp基因家族 基因家族鉴定 生物信息学
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计算机网络TCP拥塞控制算法的实现与调优
5
作者 张媛 《计算机应用文摘》 2026年第3期182-184,共3页
随着网络带宽和应用场景日益复杂,传统TCP拥塞控制算法在高带宽延迟积(BDP)和动态网络环境中面临显著性能瓶颈。文章提出一种基于网络状态感知的参数动态优化方法,并结合强化学习驱动的自适应调优机制对传统算法进行改进。实验结果表明... 随着网络带宽和应用场景日益复杂,传统TCP拥塞控制算法在高带宽延迟积(BDP)和动态网络环境中面临显著性能瓶颈。文章提出一种基于网络状态感知的参数动态优化方法,并结合强化学习驱动的自适应调优机制对传统算法进行改进。实验结果表明,优化后的算法在高带宽环境下吞吐量提升12.7%,在高延迟场景下延迟降低25%,且在面对丢包率波动时表现出更强的鲁棒性。研究表明,该优化方案为TCP拥塞控制在复杂网络环境中的应用提供了有效的改进路径。 展开更多
关键词 tcp拥塞控制 算法实现 参数优化 自适应调优 网络仿真
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杨树TCP基因家族生物信息学与盐胁迫应答表达分析
6
作者 刘德麒 何家劲 +1 位作者 程紫涵 张雪梅 《西北林学院学报》 北大核心 2026年第1期93-106,118,共15页
TCPs是植物所特有的转录因子,本研究旨在探究杨树TCP基因家族的结构特征及其在盐胁迫下的表达特性,以期为杨树优良基因选育工作提供思路。通过生物信息学手段,分析杨树TCP基因家族的理化性质、基因结构、顺式作用元件、蛋白相互作用以... TCPs是植物所特有的转录因子,本研究旨在探究杨树TCP基因家族的结构特征及其在盐胁迫下的表达特性,以期为杨树优良基因选育工作提供思路。通过生物信息学手段,分析杨树TCP基因家族的理化性质、基因结构、顺式作用元件、蛋白相互作用以及物种内和物种间的共线性,并通过RNA-seq数据分析其在高盐胁迫下的表达模式。杨树中共有37个非冗余的TCP家族成员,其中20个属于ClassⅠ亚家族,17个属于ClassⅡ亚家族(CYC和CIN 2个亚类分别包含7和10个);同一亚族的TCP基因结构、保守基序分布、保守结构域以及蛋白三级结构高度相似;TCPs基因启动子序列中含有各种激素响应元件、胁迫响应元件、发育过程特定元件等;互作蛋白分析表明,37个TCP成员中存在26个关键枢纽蛋白,其中Potri.008G115800.1、Potri.003 G120200.1、Potri.001G111800.1在细胞内起中心调控作用;共线性分析表明,物种内共存在8对共线性关系,相互有共线的2个基因在不同的染色体上具有相似的基因序列;通过转录组数据分析发现,杨树的叶、茎、根中分别有6、1、7个TCPs基因在盐胁迫处理后显著差异表达,并通过qRT-PCR得以验证。本研究系统分析了杨树TCP基因家族的结构特征和表达特性,为后期研究杨树TCP转录因子在高盐胁迫下的调控机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 杨树 tcp 生物信息学 盐胁迫
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陆地棉和海岛棉种间TCP转录因子比较分析
7
作者 塞米热·斯来依曼 彭幼珊 +2 位作者 刘家璇 欧阳乐军 沈超 《安徽农业科学》 2026年第2期1-12,20,共13页
[目的]比较陆地棉和海岛棉种间TCP基因家族成员特征。[方法]利用生物信息学方法对陆地棉和海岛棉TCP基因家族进行全基因组鉴定,并对其理化性质、染色体定位、系统进化和组织表达等方面进行比较分析。[结果]在陆地棉和海岛棉中分别鉴定... [目的]比较陆地棉和海岛棉种间TCP基因家族成员特征。[方法]利用生物信息学方法对陆地棉和海岛棉TCP基因家族进行全基因组鉴定,并对其理化性质、染色体定位、系统进化和组织表达等方面进行比较分析。[结果]在陆地棉和海岛棉中分别鉴定到69和70个TCP基因,分别具有31对和34对同源基因分布在22和21条染色体上,均为亲水性蛋白。陆地棉和海岛棉之间鉴定到59对同源基因。系统进化关系显示其分为CIN、CYC/TB1和PCF共3个亚族。陆地棉和海岛棉中同亚族的TCP基因家族成员具有相似的基因结构。基因组织表达特异性分析发现,基因Ghir_D13G006190在陆地棉各组织都有表达,其同源基因Gbar_D13G006010在海岛棉各组织都没有表达,属于PCF亚类。Ghir_A09G000900仅在陆地棉花瓣中较高表达,其同源基因Gbar_A09G000980在海岛棉花瓣、花药、花柱中表达量较高,属于CIN亚类。Ghir_A12G023760在陆地棉叶中表达量最高,其同源基因Gbar_A12G023880在海岛棉茎中表达量最高,属于PCF亚类。顺式作用元件分析表明,陆地棉和海岛棉TCP基因家族启动子包含许多与植物光响应、生理响应、激素响应、胁迫响应相关的调控元件。[结论]该研究为进一步探究陆地棉和海岛棉TCP转录因子的功能差异提供重要的理论依据。 展开更多
关键词 陆地棉 海岛棉 tcp转录因子 生物信息学 基因组鉴定 系统进化 组织表达
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花苜蓿TCP基因家族的鉴定及其在干旱胁迫下的表达模式分析
8
作者 王苗苗 赵相龙 +2 位作者 王召明 刘志鹏 闫龙凤 《生物技术通报》 北大核心 2025年第6期179-190,共12页
【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供... 【目的】TCP(Teosinte branched 1/Cincinnata/Proliferating cell factor)是调控植物生长发育和胁迫响应的一类转录因子。解析花苜蓿TCP基因家族成员的序列结构和理化性质,了解花苜蓿MruTCP基因在干旱胁迫下的作用,为牧草分子育种提供基因资源。【方法】基于全基因组水平鉴定花苜蓿TCP基因,对其进行生物信息学分析和干旱胁迫下的表达模式分析。【结果】在花苜蓿中共鉴定到20个TCP基因,分布在7条染色体上。系统进化分析结果表明,MruTCP蛋白分为3个亚家族:PCF、CIN和CYC/TB1,各类蛋白的Motif种类和排列顺序有所差异,均含有一个共同的保守基序Motif 1,家族成员间的结构较为简单。共线性分析结果表明,花苜蓿TCP家族内存在2个片段重复事件,且与大豆之间的亲缘关系最近。启动子顺式作用元件分析的结果表明,MruTCP家族成员功能较为复杂,在信号传递、响应非生物胁迫、光信号响应、激素调节等方面均发挥作用。干旱胁迫下的转录组数据和RT-qPCR的结果表明,花苜蓿TCP基因家族成员在不同时间点和不同浓度干旱处理下的表达模式不同。其中,MruTCP05和MruTCP09包含了丰富的激素响应元件和胁迫响应元件,并且受干旱胁迫的强烈诱导。【结论】结合TCP基因家族的生物信息学分析和表达模式分析结果,推测MruTCP05和MruTCP09是调控花苜蓿耐旱性的候选基因。 展开更多
关键词 花苜蓿 tcp基因 干旱胁迫 转录表达分析
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沙棘TCP基因家族鉴定与HrTCP12的功能初探
9
作者 王婷 秦德彬 安新民 《中国细胞生物学学报》 2025年第8期1795-1811,共17页
沙棘(Hippophae rhamnoides L.)作为药食同源的重要植物,其果实在多个领域都有极高的利用价值。近年来,对经济树种的分枝进行改良是提高果实产量的一个重要途径。而TCP基因家族在调控生长发育及逆境响应中具有关键作用,其家族成员在植... 沙棘(Hippophae rhamnoides L.)作为药食同源的重要植物,其果实在多个领域都有极高的利用价值。近年来,对经济树种的分枝进行改良是提高果实产量的一个重要途径。而TCP基因家族在调控生长发育及逆境响应中具有关键作用,其家族成员在植物分枝发育中有着重要作用。该研究通过生物信息学结合实验验证,系统鉴定了沙棘的TCP基因家族,并解析了其功能特性。该研究基于基因组数据筛选出29个沙棘TCP基因,并通过进化分析将其分为Class Ⅰ(PCF亚族)和Class Ⅱ(CYC/TB1亚族及CIN亚族)。研究发现,Class Ⅱ亚族的TCP结构域碱性区比Class Ⅰ亚族多4个保守氨基酸。染色体定位显示,沙棘TCP家族成员在染色体上分布不均,理化性质分析表明沙棘TCP家族多数蛋白呈亲水性且定位于细胞核。启动子分析发现了在沙棘TCP家族成员的启动子中,光响应、激素(如ABA)及胁迫相关顺式元件富集,暗示了沙棘TCP家族参与多重调控网络。共线性分析揭示了沙棘TCP基因与拟南芥、枣存在广泛进化保守性,且家族扩张主要由全基因组复制/片段复制驱动的跨染色体重复主导。组织特异性表达显示,CYC/TB1亚族基因Hr TCP12在刺和侧芽中高表达,在其余部位表达量较低,暗示其调控分枝发育的功能。亚细胞定位证实Hr TCP12和Hr TCP18主要定位于细胞核,符合转录因子特性。在84k杨中过表达Hr TCP12显著抑制杨树分生组织活性基因Pag WUS1/2的表达,初步验证了其通过抑制侧芽生长调控植物分枝的保守机制。该研究在全基因组范围内鉴定了沙棘TCP基因家族成员,并对CYC/TB1亚族基因进行了表达模式分析,发现了其成员具有明显的组织特异性表达特征,同时发现了Hr TCP12抑制杨树分生组织活性基因表达,为利用基因工程改良沙棘分枝特性提供了候选基因。 展开更多
关键词 沙棘 tcp基因家族 生物信息学 共线性分析 表达模式分析
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薄壳山核桃TCP基因家族鉴定及表达模式分析 被引量：1
10
作者 魏璐 朱凯凯 +4 位作者 赵娟 牛牧歌 马文娟 谭鹏鹏 彭方仁 《植物资源与环境学报》 北大核心 2025年第4期9-22,共14页
为探究TCP转录因子在薄壳山核桃[Carya illinoinensis(Wangenh.) K. Koch]生长发育和响应干旱胁迫过程中的作用,基于薄壳山核桃全基因组数据,采用生物信息学方法对其TCP基因家族成员进行了鉴定,并对其序列特征、时空表达模式和干旱胁迫... 为探究TCP转录因子在薄壳山核桃[Carya illinoinensis(Wangenh.) K. Koch]生长发育和响应干旱胁迫过程中的作用,基于薄壳山核桃全基因组数据,采用生物信息学方法对其TCP基因家族成员进行了鉴定,并对其序列特征、时空表达模式和干旱胁迫下的表达特征以及TCP进化关系等进行了分析。结果表明:从薄壳山核桃全基因组中共鉴定出33个TCP基因,命名为CiTCP1至CiTCP33,编码193~537个氨基酸,理论等电点为pI 5.85至pI 9.78;CiTCP29定位于叶绿体,其余CiTCP定位于细胞核;所有CiTCP的二级结构以无规卷曲为主。CiTCP在染色体上分布不均匀,5号、6号和11号染色体上分布的基因最多(均为4个);CiTCP间存在28对共线性关系,说明这些基因扩张主要来源于片段复制。所有CiTCP均包含保守的b-HLH结构域;33个CiTCP可分为ClassⅠ(PCF)和ClassⅡ亚族,后者进一步分为CIN和CYC/TB1亚类,并且,同一分支成员具有相似的基因结构和蛋白保守基序。CiTCP基因的启动子区域含有丰富的植物激素响应、胁迫响应和生长发育调控顺式作用元件。CIN亚类基因CiTCP5、CiTCP8、CiTCP17、CiTCP21、CiTCP25和CiTCP28为miR319的靶基因,说明这些基因的表达可能受miRNA调控。CiTCP基因在不同组织和果实发育阶段的表达模式差异明显,其中,CIN亚类大部分基因在叶中的表达量较高。与干旱胁迫0 d相比,胁迫3~15 d时CiTCP5和CiTCP23表达总体上显著下调,其余基因的表达变化各异。研究结果显示:CiTCP基因具有高度保守性和时空表达特性,且对薄壳山核桃响应干旱胁迫有一定的调控作用。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 tcp基因 生物信息学分析 表达模式 干旱胁迫
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云南栘[木衣]TCP基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量：2
11
作者 张宝月 刘国平 +1 位作者 田金红 王大玮 《生物工程学报》 北大核心 2025年第2期809-824,共16页
云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.)Schneid.)作为一种经济林果树,具有较高药用和食用价值。TCP(Teosinte branched1/Cycloidea/Proliferating cell factor)基因家族在植物整个生长发育过程中发挥着重要的作用。为探讨云南栘[木衣]... 云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.)Schneid.)作为一种经济林果树,具有较高药用和食用价值。TCP(Teosinte branched1/Cycloidea/Proliferating cell factor)基因家族在植物整个生长发育过程中发挥着重要的作用。为探讨云南栘[木衣]TCP基因家族在其生长发育过程中的作用,本研究利用生物信息学方法对云南栘[木衣]TCP基因家族进行了全基因组鉴定,并分析了其在种子萌发和果实发育不同时期的表达水平。结果显示,云南栘[木衣]共有18个DdeTCP基因,不均匀地分布在11条染色体上。系统进化分析结果显示,DdeTCP在ClassⅠ中有3个成员,ClassⅡ类有15个成员,表明DdeTCP家族成员间出现了功能分化。基因表达模式分析显示,AtTCP14同源基因DdeTCP11在种子萌发前期具有较高的表达水平,表明其可能在种子萌发时期发挥重要作用。此外,聚类在ClassⅠ中的DdeTCP16在果实成熟期表达量较高,推测其可能与果实成熟有关。本研究为进一步探索DdeTCP基因家族在云南栘[木衣]生长发育过程中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 云南栘[木衣] 转录组 tcp基因家族 生物信息学 表达分析
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花魔芋AkTCP家族基因鉴定及表达分析 被引量：1
12
作者 何斐 汤鑫塬 +1 位作者 李竹梅 褚洪龙 《华北农学报》 北大核心 2025年第5期35-46,共12页
TCP家族成员是植物特有的转录因子,在植物生长、代谢活动及逆境应答等关键生物过程中发挥不可或缺的作用。为了解TCP基因家族在花魔芋基因组中的数量、分布和表达等情况,利用生物信息学技术对AkTCP家族基因进行鉴定,分析该家族成员的理... TCP家族成员是植物特有的转录因子,在植物生长、代谢活动及逆境应答等关键生物过程中发挥不可或缺的作用。为了解TCP基因家族在花魔芋基因组中的数量、分布和表达等情况,利用生物信息学技术对AkTCP家族基因进行鉴定,分析该家族成员的理化性质、亚细胞定位、共线性、基因结构及进化关系,采用qRT-PCR技术分析响应生物、非生物胁迫的基因表达情况。结果表明,花魔芋全基因组中鉴定出30个TCP家族成员,其蛋白包含135~562个氨基酸残基,分子质量为15.08~57.20 ku,等电点为4.96~11.49,大部分为碱性蛋白,均为不稳定的亲水性蛋白,主要分布在细胞核上,其基因在染色体上不均匀分布。AkTCP共线性基因仅在花魔芋8条染色体中分布,包含4个染色体间共线性事件和5个染色体内共线性事件。AkTCP基因结构较为简单,大部分不含内含子,均含有高度保守的TCP结构域,可分为ClassⅠ和ClassⅡ2个组别,ClassⅡ又分为CIN和CYC/TB1 2个亚类。启动子顺式作用元件分析结果显示,AkTCP启动子上含有多个生理响应、光响应、植物激素和逆境胁迫响应等元件。qRT-PCR分析结果表明,AkTCP家族成员参与了干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯和软腐病原菌侵染应答过程并作出积极响应。 展开更多
关键词 花魔芋 tcp基因家族 转录因子 表达分析
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甜瓜TCP基因家族全基因组的鉴定与表达分析
13
作者 李海伦 高宁宁 +7 位作者 郭姚淼 孙东玲 王月玲 谢夔熙 李鹏飞 段世享 赵卫星 杨森 《河南农业科学》 北大核心 2025年第9期127-140,共14页
TCP基因家族是植物体内特有的、与植物生长发育的不同阶段密切相关的一类转录因子,在甜瓜中的研究鲜见报道。利用生物信息学方法对甜瓜TCP基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、染色体定位、基因结构、保守基序... TCP基因家族是植物体内特有的、与植物生长发育的不同阶段密切相关的一类转录因子,在甜瓜中的研究鲜见报道。利用生物信息学方法对甜瓜TCP基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、系统进化、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式元件、miRNA及基因表达模式进行分析。结果表明,鉴定出29个含有TCP结构域的TCP基因家族成员,不均等地分布在9条染色体上。甜瓜TCP转录因子家族蛋白的氨基酸数在61~600 aa,分子质量在7115.16~65469.20 u,理论等电点在5.62~10.06。亚细胞定位预测分析表明,28个TCP蛋白定位在细胞核。根据系统发育分析可将家族成员划分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚家族,进一步细分为PCF、CYC/TB1、CIN 3个亚组。CmTCP基因结构都比较简单,均含有1或2个外显子,极少数基因含有内含子,29个基因都含有Motif 1,不同亚组成员含有的Motif存在差异。顺式元件预测分析显示,甜瓜TCP基因家族启动子序列以光响应、激素响应、生长发育调控等相关元件为主。miRNA预测分析得出25个miRNA与13个CmTCP基因相互作用。甜瓜基因组数据库RNASeq分析显示,26个CmTCP基因在甜瓜组织中既有明确的组织分工表达,又有特定的组织部位表达;qRT-PCR结果表明,CmTCP-CYC/TB1基因成员在甜瓜不同组织中的相对表达量差异显著。 展开更多
关键词 甜瓜 tcp基因家族 生物信息学分析 全基因组鉴定 表达分析
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垂穗披碱草TCP转录因子家族鉴定及激素响应模式分析
14
作者 彭晓梅 孟晨 +3 位作者 GARC A-CAPARR S Pedro 张宇 杨永平 孙旭东 《广西植物》 北大核心 2025年第5期916-930,共15页
垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究... 垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究利用单分子实时(SMRT)测序技术获得了垂穗披碱草全长转录组数据,并对4种激素处理后的垂穗披碱草叶片进行Illumina测序,以探究EnTCP s基因在不同激素处理下的表达模式。结果表明:(1)垂穗披碱草全长转录组测序共获得90956条非冗余转录本。(2)基于全长转录组数据共鉴定到26个EnTCP s,氨基酸数为186~575 aa,亚细胞定位预测显示TCP蛋白均位于细胞核。(3)根据进化树的分支情况可将26个EnTCP s分为Class I、ClassⅡ-a(CIN)和ClassⅡ-b(CYC/TB1)3个亚家族,保守结构域分析表明EnTCPs均含有TCP结构域。(4)不同激素处理后的表达模式分析显示,7个EnTCP s家族成员(En108950、En35573、En10347、En16325、En128790、En10346和En14028)在激素处理后上调/下调表达,它们可能参与了激素合成与信号转导通路;qRT-PCR分析结果显示,En35573和En14028参与生长素响应,En108950、En10347、En128790、En10346和En14028均参与细胞分裂素响应,En14028参与脱落酸响应,En108950参与茉莉酸响应,而En16325可能参与多种激素信号转导通路。该研究结果为后续EnTCP s基因功能研究奠定了基础,为研究EnTCP s对激素响应的分子机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 垂穗披碱草 tcp转录因子家族 全长转录组 外源植物激素 表达模式
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枫香树TCP基因家族鉴定与表达分析 被引量：1
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作者 赵金涛 叶兴状 +3 位作者 王安邦 陈志云 翁慧莹 张国防 《亚热带植物科学》 2025年第2期109-120,共12页
枫香树Liquidambar formosana是蕈树科落叶型代表树种,具有较高的经济价值和生态价值。TCP基因家族在植物生长发育及逆境适应中扮演着关键角色。基于枫香树基因组数据和转录组数据,利用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定LfTCP基因家... 枫香树Liquidambar formosana是蕈树科落叶型代表树种,具有较高的经济价值和生态价值。TCP基因家族在植物生长发育及逆境适应中扮演着关键角色。基于枫香树基因组数据和转录组数据,利用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定LfTCP基因家族,并对其蛋白质理化性质、基因位置、系统发育进化关系、种内种间共线性关系、启动子顺式作用元件以及组织表达量进行分析。结果表明,枫香树TCP基因家族共有22个成员,编码蛋白长度介于197~552 AA之间;22个LfTCPs基因非均匀分布于12条染色体;LfTCPs在Class Ⅰ中有12个成员,在Class Ⅱ中有10个成员,其中CIN亚家族有7个成员,CYC/TB1亚家族有3个成员。LfTCP基因家族启动子顺式元件可能与光、激素和胁迫响应有关。LfTCPs基因具有组织表达特异性,LfTCP6、LfTCP7和LfTCP17在叶中特异性高表达,可作为研究枫香树叶片生长和形态建成的重要候选基因。该研究结果可为枫香树TCP家族基因的功能及调控机制提供参考。 展开更多
关键词 枫香树 tcp基因家族 生物信息学 组织表达
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罗汉果SgTCP6基因克隆、生物信息学分析及转录激活研究
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作者 林孝东 莫长明 +7 位作者 穆德添 赵欢 黄华学 邵瑛瑛 陈文强 刘代 梁任繁 唐其 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期33-41,共9页
基于罗汉果基因组和转录组信息,筛选得到罗汉果TCP转录因子家族SgTCP6基因,对其进行生物信息学分析,并结合酵母单杂交实验验证其是否参与罗汉果甜苷合成关键酶基因SgUGT94的调控。结果显示:SgTCP6基因编码序列(CDS)全长为618 bp,编码20... 基于罗汉果基因组和转录组信息,筛选得到罗汉果TCP转录因子家族SgTCP6基因,对其进行生物信息学分析,并结合酵母单杂交实验验证其是否参与罗汉果甜苷合成关键酶基因SgUGT94的调控。结果显示:SgTCP6基因编码序列(CDS)全长为618 bp,编码205个氨基酸残基,相对分子质量为21 942,定位于细胞核中,是一种不稳定的亲水蛋白,且不含信号肽和跨膜区,为非分泌蛋白。多序列比对结果显示该基因与葫芦科苦瓜TCP基因的亲缘关系较近。罗汉果不同时期果实基因共表达关联分析结果显示,SgTCP6与SgUGT94表达存在极显著相关性。SgUGT94上游2 000 bp启动子区域含有4个TCP顺式作用元件。酵母单杂交结果表明,SgTCP6可能参与罗汉果甜苷V合成关键酶基因SgUGT94的调控。 展开更多
关键词 罗汉果 tcp转录因子 生物信息学 酵母单杂交 葡萄糖基转移酶
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文冠果TCP基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析 被引量：2
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作者 陈玉金 于涵 +6 位作者 朱华利 姜涛 刘博 李伟 赵永军 鲁仪增 解孝满 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期441-451,共11页
【目的】对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)TCP基因家族进行鉴定,分析其在盐胁迫下的表达情况,探究文冠果的盐胁迫响应机制,为文冠果耐盐种质的选育提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对文冠果TCP基因家族进行鉴定,并进行蛋白... 【目的】对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)TCP基因家族进行鉴定,分析其在盐胁迫下的表达情况,探究文冠果的盐胁迫响应机制,为文冠果耐盐种质的选育提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法对文冠果TCP基因家族进行鉴定,并进行蛋白理化性质、系统发育进化和保守基序分析,以及基因结构、染色体定位和启动子顺式作用元件分析。采用实时荧光定量PCR检测盐胁迫下文冠果TCP基因(XsTCPs)在叶片和根部的表达情况。【结果】共鉴定出24个文冠果TCP基因家族成员(XsTCP1~XsTCP24),编码的氨基酸残基数量为185~576个,蛋白分子量为20576.21~63366.92 kD,理论等电点为4.62~10.25,均属于亲水性蛋白且定位于细胞核。基于系统发育进化分析结果,可将24个XsTCPs蛋白划分到3个亚家族,其中PCF亚家族包含14个成员、CIN亚家族包含6个成员、CYC/TB1亚家族包含4个成员。除XsTCP23和XsTCP24基因无法定位到染色体外,其余文冠果TCP基因家族成员以单个基因或基因簇的形式不均匀地分布在11条染色体上。在24个XsTCPs蛋白中共发现10个保守基序,其中Motif 1为所有蛋白共有。文冠果TCP基因家族成员含有光响应元件、激素反应元件、应激反应元件和植物生长发育作用元件,其中XsTCP4、XsTCP6、XsTCP7、XsTCP10、XsTCP12、XsTCP13、XsTCP21和XsTCP22基因含有干旱诱导的MYB结合元件;实时荧光定量PCR检测结果表明,盐胁迫下上述基因在文冠果叶片和根部的表达情况均发生明显变化,推测上述8个XsTCPs基因参与盐胁迫响应过程。【结论】XsTCPs蛋白可能通过调控涉及生长发育、新陈代谢和应激反应的多种靶基因参与生物学过程,推测含有干旱诱导的MYB结合元件的8个XsTCPs基因有助于提高文冠果对盐胁迫的抵御能力。 展开更多
关键词 文冠果 tcp基因家族 盐胁迫 表达分析
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铁皮石斛DoTCP2基因克隆及非生物胁迫下的表达分析
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作者 刘羽佳 卓来凤 +5 位作者 马立钦 黄秋妮 张勇 张颖智 李翔 刘博婷 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第3期588-598,共11页
TCP转录因子是植物特有的一类调控生长发育和逆境胁迫反应的重要调控因子。为探究铁皮石斛(Dendrobium officinale)TCP2基因(DoTCP2)的表达特性和抗逆响应能力,通过同源克隆技术从广东丹霞铁皮石斛品种的叶组织中成功分离出DoTCP2基因,... TCP转录因子是植物特有的一类调控生长发育和逆境胁迫反应的重要调控因子。为探究铁皮石斛(Dendrobium officinale)TCP2基因(DoTCP2)的表达特性和抗逆响应能力,通过同源克隆技术从广东丹霞铁皮石斛品种的叶组织中成功分离出DoTCP2基因,并对该基因序列进行生物信息学分析及表达模式探究。结果显示,DoTCP2(GenBank登录号:PP534463)cDNA全长1 122 bp,位于第7号染色体,含有4个外显子和3个内含子,编码长度为373个氨基酸的多肽链,与参考序列(序列号:LOC110114709)进行比对分析,发现存在4个碱基差异,其中3个为同义替换。DoTCP2蛋白理论相对分子量为40 600,理论等电点为8.94,为亲水性稳定蛋白质,具有TCP保守结构域,定位于细胞核,无信号肽和跨膜结构域,含有46个磷酸化位点。DoTCP2与鼓槌石斛(Dendrobium chrysotoxum)TCP蛋白序列同源性高达97.87%,且遗传距离最近。DoTCP2基因具有组织表达特异性,在根组织中的相对表达量极显著高于其他组织,可能在根发育和营养物质的吸收以及运输等过程中发挥作用。DoTCP2基因在低温胁迫处理6 h时的相对表达量极显著上调(P<0.01),暗示DoTCP2可能在低温胁迫响应中发挥重要作用;在模拟干旱和外源脱落酸(ABA)处理下,DoTCP2基因的相对表达量呈现下降趋势,且在处理24 h后相对表达量最低,与处理前差异达到极显著水平(P<0.01),推测该基因可能通过ABA信号通路在调控铁皮石斛应答干旱胁迫中发挥负调控作用。本研究结果可为深入探究DoTCP2基因的抗逆功能及其在植物应对非生物胁迫响应中的潜在作用机制提供前期研究基础。 展开更多
关键词 铁皮石斛 tcp转录因子 Dotcp2基因 非生物胁迫 表达模式
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‘红阳’猕猴桃TCP基因家族鉴定及其在果实中的表达分析 被引量：1
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作者 宋姝熠 蒋开秀 +2 位作者 刘欢艳 黄亚成 刘林娅 《生物技术通报》 北大核心 2025年第3期190-201,共12页
【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’... 【目的】基于全基因组鉴定‘红阳’猕猴桃TCP基因(AcTCPs)家族成员,分析各成员的分类进化关系,研究其组织、果实发育过程和激素处理的表达特性,为深入揭示猕猴桃果实中TCP基因的功能奠定基础。【方法】利用生物信息学方法分析‘红阳’猕猴桃TCP转录因子的理化性质、基因结构、保守基序、顺式作用元件及物种间共线性关系等。利用转录组数据和RT-qPCR分析‘红阳’猕猴桃中AcTCPs在果实不同发育时期、不同组织中和激素处理下的表达模式。【结果】在‘红阳’猕猴桃中鉴定出分布于19条染色体上的40个含有完整TCP结构域的AcTCPs基因,分别命名为AcTCP1-AcTCP40。系统发育分析、保守基序和基因结构分析将它们分为PCF(21)、CIN(12)和CYC/TB1(7),且全基因复制或片段复制在‘红阳’猕猴桃TCP基因家族的扩展中发挥了重要作用。组织特异性分析表明,6个候选基因在雄花和果实中高表达,果实不同发育时期RT-qRCR结果显示,AcTCP1在果实发育后期高表达,AcTCP11、AcTCP1、AcTCP35、AcTCP10和AcTCP32在果实发育前期高表达,且表达模式与转录组结果一致。对果实进行外源激素处理结果表明,脱落酸(ABA)和乙烯(ET)处理下调了6个候选AcTCPs的表达;赤霉素(GA_(3))处理初期上调了AcTCP1、AcTCP35和AcTCP32的表达,氯吡苯脲(CPPU)处理初期上调了Ac TCP35和AcTCP32的表达,其余AcTCPs的表达均被GA_(3)和CPPU下调。【结论】从‘红阳’猕猴桃全基因组中系统鉴定出40个TCP基因,6个候选基因在果实和雄花中高表达。在果实中AcTCP35、AcTCP32、AcTCP1、AcTCP10、AcTCP11和AcTCP20的表达与果实发育密切相关且受到外源激素(ABA、ET、GA_(3)和CPPU)的调控。 展开更多
关键词 ‘红阳’猕猴桃 tcp转录因子 全基因组鉴定 生物信息学 组织差异 表达模式分析 激素处理
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兰科植物TCP转录因子研究进展
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作者 陈嘉忆 黄婷婷 +3 位作者 熊龙伟 黎鹏 郭丽婷 艾叶 《亚热带植物科学》 2025年第2期229-238,共10页
TCP转录因子家族含有一个由59个氨基酸组成的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基序,在植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应等方面存在广泛调控作用。兰科植物因其花型奇特、花色多样、叶艺丰富等特点,具有重要的观赏、文化和经济价值。本文概括... TCP转录因子家族含有一个由59个氨基酸组成的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基序,在植物生长发育、形态建成、逆境胁迫响应等方面存在广泛调控作用。兰科植物因其花型奇特、花色多样、叶艺丰富等特点,具有重要的观赏、文化和经济价值。本文概括TCP转录因子的结构以及分类,并对其在兰科植物花、叶等器官形态建成中的功能进行综述,为兰科植物TCP基因功能研究提供理论依据。 展开更多
关键词 兰科植物 tcp转录因子 器官形态 细胞分化 MIRNA
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