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三维氨基酸结构描述子矢量SVRDF及其在肽QSAR中的应用
被引量：
4
1
作者
仝建波
张生万
+1 位作者
成素丽
李改仙
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期40-46,共7页
为了建立一种新型氨基酸结构描述子并用于多肽定量构效关系研究,本研究从天然氨基酸150个radialdistributionfunction(RDF)指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子-SVRDF(principalcomponentscoresvectorofradialdistributionfunctio...
为了建立一种新型氨基酸结构描述子并用于多肽定量构效关系研究,本研究从天然氨基酸150个radialdistributionfunction(RDF)指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子-SVRDF(principalcomponentscoresvectorofradialdistributionfunction),应用该描述子并通过偏最小二乘(PLS)对苦味二肽、催产素及促凝血酶原激酶抑制剂3个体系建立定量构效关系模型。对3个体系建模复相关系数(R2cum)与交互检验复相关系数(Qc2um)分别为0.766和0.724;0.941和0.811;0.996和0.919。研究结果表明,SVRDF描述子能够系统地表征肽与生物活性相关的结构信息,有望成为多肽定量构效关系研究中一种有效的结构表征方法。
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关键词
氨基酸
肽
svrdf
描述子
定量构效关系
偏最小二乘
暂未订购
题名
三维氨基酸结构描述子矢量SVRDF及其在肽QSAR中的应用
被引量：
4
1
作者
仝建波
张生万
成素丽
李改仙
机构
山西大学化学化工学院
晋中学院化学化工系
晋中学院化学化工系
出处
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第1期40-46,共7页
基金
山西省工业攻关项目
山西省首届青年拔尖创新人才专项基金资助项目(2006031204).
文摘
为了建立一种新型氨基酸结构描述子并用于多肽定量构效关系研究,本研究从天然氨基酸150个radialdistributionfunction(RDF)指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子-SVRDF(principalcomponentscoresvectorofradialdistributionfunction),应用该描述子并通过偏最小二乘(PLS)对苦味二肽、催产素及促凝血酶原激酶抑制剂3个体系建立定量构效关系模型。对3个体系建模复相关系数(R2cum)与交互检验复相关系数(Qc2um)分别为0.766和0.724;0.941和0.811;0.996和0.919。研究结果表明,SVRDF描述子能够系统地表征肽与生物活性相关的结构信息,有望成为多肽定量构效关系研究中一种有效的结构表征方法。
关键词
氨基酸
肽
svrdf
描述子
定量构效关系
偏最小二乘
Keywords
amino acids
peptide
svrdf
quantitative structure activity relationship
partial least squares
分类号
R916 [医药卫生—药学]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三维氨基酸结构描述子矢量SVRDF及其在肽QSAR中的应用
仝建波
张生万
成素丽
李改仙
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
4
暂未订购
已选择
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