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SWI/SNF复合体缺失的鼻腔鼻窦癌10例临床病理分析
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作者 盛晴宇 李玲 +4 位作者 袁梦丹 严丹 陈新玉 袁静萍 赵丽娜 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第12期1632-1637,共6页
目的探讨SWI/SNF复合体缺失的鼻腔鼻窦癌(SWI/SNF complex-deficient sinonasal carcinoma,SCDSC)的临床病理学特征、免疫表型、诊断、鉴别诊断及预后。方法收集10例SCDSC,观察其临床特征、组织学形态、免疫表型、临床诊疗经过及预后,... 目的探讨SWI/SNF复合体缺失的鼻腔鼻窦癌(SWI/SNF complex-deficient sinonasal carcinoma,SCDSC)的临床病理学特征、免疫表型、诊断、鉴别诊断及预后。方法收集10例SCDSC,观察其临床特征、组织学形态、免疫表型、临床诊疗经过及预后,并文献复习。结果10例患者中,伴SMARCB1/INI1缺失6例,伴SMARCA4/BRG1缺失4例;男性7例,女性3例,年龄21~71岁(平均50.1岁);临床首发症状主要为鼻塞伴胀痛、鼻出血、头晕、头痛等。镜检:肿瘤细胞排列呈巢片状,中央可见坏死,部分呈基底细胞样,细胞圆形或多角形,细胞核大、泡状核,核仁明显,病理性核分裂象易见。免疫表型:伴SMARCB1缺失6例:CKpan、EMA均弥漫阳性,不同程度表达鳞状上皮标志物CK5/6、p63和p40,INI1表达缺失,其中1例同时伴SMARCA2/BRM表达缺失;伴SMARCA4缺失4例:CKpan灶状阳性或阴性,其中1例p16弥漫强阳性,灶状表达神经内分泌标志物CD56、Syn,BRG1表达缺失;所有病例S-100、SOX10、NUT、CD45、HMB45、CD99、NKX2.2、Calretinin均阴性,Ki67增殖指数30%~90%。EBER原位杂交呈阴性。10例患者均行内镜下鼻腔鼻窦及颅底病损切除术,术后辅以放、化疗,其中1例同时行PD1免疫治疗。结论SCDSC是一类少见的恶性肿瘤,病程发展快,临床分期高、预后差。SWI/SNF复合体亚单位蛋白水平的检测对该肿瘤的诊断、鉴别诊断、预后评估及治疗有重要的价值。 展开更多
关键词 鼻窦肿瘤 SMARCB1 SMARCA4 SWI/snf复合体缺失
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SWI/SNF染色质重塑复合物在肿瘤耐药中的作用 被引量:1
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作者 朱桂珍 叶巧 +7 位作者 罗渊 彭洁 王璐 杨昭婷 段峰森 郭丙乾 梅竹松 王广云 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第1期20-31,共12页
肿瘤耐药是化疗和靶向药物治疗面临的重要问题,它是一个涉及染色质重塑的复杂过程。SWI/SNF是肿瘤发生中研究最多的ATP依赖性染色质重塑复合物之一,在染色质结构稳定性、基因表达和翻译后修饰的协调过程中起着重要作用,但其调控肿瘤耐... 肿瘤耐药是化疗和靶向药物治疗面临的重要问题,它是一个涉及染色质重塑的复杂过程。SWI/SNF是肿瘤发生中研究最多的ATP依赖性染色质重塑复合物之一,在染色质结构稳定性、基因表达和翻译后修饰的协调过程中起着重要作用,但其调控肿瘤耐药的机制尚未被系统梳理。SWI/SNF按其亚基组成可分为BAF、PBAF和ncBAF 3种,这3种亚型均包含ATP酶催化亚基、核心亚基和调节亚基,可以通过调控染色质结构来控制基因表达。SWI/SNF复合物亚基的改变是调控肿瘤耐药和进展的重要因素之一,充分了解该复合物在肿瘤耐药中的分子机制可以改善癌症的治疗。本文总结了SWI/SNF复合物的组成、引起肿瘤耐药的突变或异常表达亚基类型、主要的耐药机制以及肿瘤耐药的克服方法等,为临床上SWI/SNF亚基突变或异常表达引起的肿瘤预后不良的诊断和治疗提供了思路。 展开更多
关键词 SWI/snf染色质重塑复合物 亚基突变 肿瘤耐药
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SNF1与MetK1共表达促进酵母S-腺苷-L-甲硫氨酸合成
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作者 陈海龙 戴佳良 +4 位作者 邓晶 高新星 朱官兴 何清明 朱年青 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2025年第10期84-94,共11页
S-腺苷-L-甲硫氨酸(S-adenosyl-L-methionine,SAM)是生物体内重要的生理活性物质。通过调控酿酒酵母的葡萄糖效应而将碳通量定向到SAM合成是细胞工厂的挑战。以酿酒酵母CGMCC 2842(2842)为出发菌,过表达SNF1基因调控葡萄糖效应并引入利... S-腺苷-L-甲硫氨酸(S-adenosyl-L-methionine,SAM)是生物体内重要的生理活性物质。通过调控酿酒酵母的葡萄糖效应而将碳通量定向到SAM合成是细胞工厂的挑战。以酿酒酵母CGMCC 2842(2842)为出发菌,过表达SNF1基因调控葡萄糖效应并引入利士曼原虫(Leishmania infantum)SAM合成酶基因MetK1。结果发现,SNF1过表达可提高糖酵解相关基因表达水平和葡萄糖利用率,进而改善糖酵解中间体水平;提高ACS1、ALD6表达及乙醇脱氢酶2(alcoholdehy drogenase 2,ADH2)活性,可促进发酵液中的乙醇转化为乙酰辅酶A;还增强了SAM前体氨基酸及含硫氨基酸代谢相关基因表达水平。异源MetK1引入可有效定向碳代谢到SAM合成。重组菌YPSNF1-MetK1菌株的SAM产量达1.90 g·L^(-1),较出发菌株2842产量提高251.85%。以上研究结果为酵母葡萄糖效应调控及其应用奠定理论基础。 展开更多
关键词 酿酒酵母 葡萄糖效应 S-腺苷甲硫氨酸 snf1 MetK1
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SNF472抑制冠状动脉钙化的相关机制及临床试验
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作者 王锐 贾凌梅 陈亚丽 《国际心血管病杂志》 2025年第4期221-225,共5页
SNF472属于肌醇六磷酸的静脉注射制剂,是新型血管钙化抑制剂。SNF472通过与正在生成或已存在的羟基磷灰石晶体结合,有效阻止晶体的生成和进一步增长,从而减少血管内钙离子的沉积,预防心血管钙化的发生并减缓其进程。目前,SNF472在终末... SNF472属于肌醇六磷酸的静脉注射制剂,是新型血管钙化抑制剂。SNF472通过与正在生成或已存在的羟基磷灰石晶体结合,有效阻止晶体的生成和进一步增长,从而减少血管内钙离子的沉积,预防心血管钙化的发生并减缓其进程。目前,SNF472在终末期肾功能不全患者中抑制血管钙化的临床效果显著,近期临床试验发现,其在抑制冠状动脉钙化方面有良好的安全性和有效性。该文介绍SNF472抑制冠状动脉钙化的相关机制及其临床试验的最新进展。 展开更多
关键词 snf472 血管钙化 冠状动脉钙化 羟基磷灰石
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消化系统SWI/SNF复合物缺失性癌31例临床病理学分析
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作者 卓帅帅 方海生 +3 位作者 龚予希 陈刚 白茹梦 张智弘 《南京医科大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第12期1775-1783,共9页
目的:探讨消化系统酵母交配型转换/蔗糖不发酵(switch/sucrose non-fermentable complex,SWI/SNF)染色质重塑复合物缺失性癌的临床病理学特征、免疫表型、分子遗传学改变特点,并分析其诊断及鉴别诊断要点。方法:收集31例消化系统SWI/SN... 目的:探讨消化系统酵母交配型转换/蔗糖不发酵(switch/sucrose non-fermentable complex,SWI/SNF)染色质重塑复合物缺失性癌的临床病理学特征、免疫表型、分子遗传学改变特点,并分析其诊断及鉴别诊断要点。方法:收集31例消化系统SWI/SNF复合物缺失性癌患者的临床资料,观察其组织学形态,总结免疫组织化学结果和分子改变特点,并复习相关文献进行分析。结果:31例患者中,男19例,女12例,年龄43~80岁,中位年龄66岁。病灶位于食管下段(胃食管交界处)1例,胃7例,右半结肠3例,胰腺18例,肝胰壶腹部2例。病灶最大径1.5~18.0 cm(中位数3.5 cm)。组织学上,15例肿瘤呈未分化癌形态,16例为低到中分化胰腺导管腺癌、腺鳞癌或导管内乳头状黏液性肿瘤(intraductal papillary mucinous neoplasm,IPMN)伴相关浸润性癌。免疫表型上,15例未分化癌中14例显示BRG1失表达,1例胰腺未分化癌出现INI1部分缺失性表达,而BRG1保留表达;4例肿瘤细胞CK-pan表达阴性或仅散在表达,其他上皮性标志物仅见个别肿瘤细胞阳性或多为阴性;7例部分肿瘤细胞Syn表达弱到中等阳性,其中2例分别见散在的CD56或INSM1弱阳性,CgA全部为阴性。16例胰腺/壶腹部癌BRG1保留表达,8例INI1部分失表达或表达减弱,8例保留表达;分子病理显示,14例出现了SMARCB1基因突变,2例出现SMARCA4基因突变,所有病例均可见KRAS基因突变,14例出现TP53基因突变。结论:消化系统SWI/SNF复合物缺失性癌部分为未分化癌,没有特定的分化特征,胃肠道外SWI/SNF复合物缺失性癌可能更多出现不同分化程度的腺癌形态,提示行BRG1和INI1等SWI/SNF蛋白检测可减少漏诊和误诊。胰腺癌中SWI/SNF相关基因突变与KRAS和TP53基因突变具有相关性。 展开更多
关键词 消化系统肿瘤 SWI/snf复合物 临床病理学特征 KRAS突变
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PIH1D1对染色质重塑复合物SNF5亚基降解的影响 被引量:1
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作者 翟妞 张业 沈珝琲 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期756-759,共4页
目的探讨PIH1D1对其结合蛋白SNF5的稳定性的影响。方法通过蛋白合成抑制剂环己酰亚胺(CHX)和蛋白酶体抑制剂MG132抑制作用找到SNF5的降解路径,而后转染PIH1D1真核表达质粒,探讨其对SNF5稳定性的影响。结果得到CHX和MG132的最佳作用浓度;... 目的探讨PIH1D1对其结合蛋白SNF5的稳定性的影响。方法通过蛋白合成抑制剂环己酰亚胺(CHX)和蛋白酶体抑制剂MG132抑制作用找到SNF5的降解路径,而后转染PIH1D1真核表达质粒,探讨其对SNF5稳定性的影响。结果得到CHX和MG132的最佳作用浓度;SNF5通过蛋白酶体依赖的途径降解;PIH1D1抑制SNF5的降解,从而稳定SNF5。结论PIH1D1可能通过阻断蛋白酶体依赖途径,抑制SWI/SNF染色质重塑复合物SNF5亚基的降解,从而起到稳定SNF5的作用。 展开更多
关键词 SWI/snf染色质重塑复合物 snf5 PIH1D1 蛋白酶体依赖降解
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酿酒酵母SNF4基因敲除缺失菌株的构建 被引量:8
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作者 林晓华 柯崇榕 +4 位作者 吴毕莎 郑永标 李力 陈由强 黄建忠 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期572-578,共7页
构建一株酿酒酵母SNF4基因缺失菌株并研究其对乙醇产量的影响。扩增带有SNF4基因上下游同源序列和Kanr筛选标记的SNF4基因敲除组件,转化到酿酒酵母YS2获得阳性克隆子,然后将质粒pSH65转到阳性克隆子中,半乳糖诱导pSH65表达Cre酶切除Kan... 构建一株酿酒酵母SNF4基因缺失菌株并研究其对乙醇产量的影响。扩增带有SNF4基因上下游同源序列和Kanr筛选标记的SNF4基因敲除组件,转化到酿酒酵母YS2获得阳性克隆子,然后将质粒pSH65转到阳性克隆子中,半乳糖诱导pSH65表达Cre酶切除Kanr筛选标记,获得SNF4等位基因完全缺失菌株YS2-△SNF4。发酵实验结果表明,缺失菌株YS2-△SNF4乙醇产量较出发菌株提高了7.57%。利用Cre-LoxP系统,成功构建了SNF4等位基因完全缺失菌株并提高乙醇产生量。 展开更多
关键词 酿酒酵母 snf4 基因敲除
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SNF2家族新成员Ercc6l的cDNA克隆与表达分析(英文) 被引量:6
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作者 陈祥贵 李勇 +3 位作者 臧明玺 裴新荣 许雅君 高丽芳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第5期443-448,共6页
SNF2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用 .报道了SNF2家族新成员Ercc6l (excisionrepaircross complementingrodentrepairdeficiency,complementationgroup 6 like)的cDNA克隆、特性与表达分析 .通过表达序列标签 (EST)... SNF2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用 .报道了SNF2家族新成员Ercc6l (excisionrepaircross complementingrodentrepairdeficiency,complementationgroup 6 like)的cDNA克隆、特性与表达分析 .通过表达序列标签 (EST)搜索和组装 ,获得了cDNA全长 4 0 0 2bp的新基因Ercc6l (GenBankAcc .NoAY172 6 88) ,然后通过RT PCR在小鼠胚胎心脏成功克隆了该基因 .Ercc6l在小鼠基因组中由两个外显子和一个内含子组成 ,定位于X染色体 ,最大开放阅读框 (ORF)编码一个含 12 4 0个氨基酸的假定蛋白质 .该假定蛋白质含有SNF2蛋白的 8个保守基序 (SNF2结构域 ) .通过与SNF2家族各亚家族的成员进行多重比对 ,初步确认Ercc6l属于ERCC6亚家族成员 .将Ercc6l编码区克隆到pEGFP C3然后转染HeLa ,3T3和B16细胞 ,融合蛋白主要定位于胞浆 .BLAST搜索检索出 6 9条小鼠EST与Ercc6l同源 ,这些EST主要来自胚胎和肿瘤组织 .对小鼠不同发育时期的多种组织进行RT PCR ,发现Ercc6l在胚胎期强表达 ,出生产后表达显著下调 . 展开更多
关键词 Ercc6l 基因克隆 snf2蛋白 表达谱 亚细胞定位
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SWI/SNF染色质重塑在肿瘤中的研究进展 被引量:5
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作者 张记 吴玉章 阎萍 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第10期1437-1440,共4页
染色质重塑复合体SWI/SNF亚基基因在肿瘤中突变率高达20%,突变造成编码蛋白失活及整个复合体功能异常,导致肿瘤发生。目前SWI/SNF抑制肿瘤的已知机制主要包括其与Polycomb复合体间的表观拮抗及与c-Myc及PIK3CA等原癌基因信号通路协同作... 染色质重塑复合体SWI/SNF亚基基因在肿瘤中突变率高达20%,突变造成编码蛋白失活及整个复合体功能异常,导致肿瘤发生。目前SWI/SNF抑制肿瘤的已知机制主要包括其与Polycomb复合体间的表观拮抗及与c-Myc及PIK3CA等原癌基因信号通路协同作用等。 展开更多
关键词 SWI/snf 染色质重塑 ARID1A
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香蕉枯萎病菌SNF1基因的克隆及生物信息学分析 被引量:2
10
作者 刘一贤 周端咏 +2 位作者 毛超 汪军 黄俊生 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第21期160-164,共5页
为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白... 为了解SNF1基因在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用以及FOC1和FOC4两个生理小种之间的致病力差异关系,采用了PCR、RT-PCR的方法扩增了2个生理小种的SNF1基因,测序并采用生物信息学软件对相似序列进行搜索、比对,并对该基因编码的预测蛋白进行氨基酸序列比对和分析。研究结果显示,2个生理小种的SNF1基因的ORF分别为2 136、2 130 bp,二者相差6个碱基,同源性为99.5%。FOC1和FOC4的SNF1基因分别编码711、709个氨基酸,相差两个氨基酸,为丝氨酸(FOC1)和谷氨酰胺(FOC1)。生物信息学软件预测结果表明该蛋白N端不存在信号肽,但具有两个相同的功能结构域位点,分子量约为79 ku,pI为6.80。 展开更多
关键词 香蕉枯萎病菌 生理小种 snf1基因 细胞壁降解酶 致病性
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SnF_2标准生成Gibbs自由能的测定 被引量:2
11
作者 韩元山 王常珍 +1 位作者 田彦文 翟玉春 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第9期876-879,共4页
采用LaF3单晶(掺杂)作为固体电解质,在多次抽空充氩气的操作箱内,将Pb,Sn磨细过筛,按照4∶1的比例分别将Pb,PbF2,Sn,SnF2混合并压成片·Pb PbF2为参比电极,Sn SnF2为工作电极,银丝为电极引线组成工作电池·电池的结构为:(+)Ag|P... 采用LaF3单晶(掺杂)作为固体电解质,在多次抽空充氩气的操作箱内,将Pb,Sn磨细过筛,按照4∶1的比例分别将Pb,PbF2,Sn,SnF2混合并压成片·Pb PbF2为参比电极,Sn SnF2为工作电极,银丝为电极引线组成工作电池·电池的结构为:(+)Ag|Pb,PbF2|LaF3单晶(掺杂)|Sn,SnF2|Ag(-)·用高阻数字电压表准确测定了电池在293 15~353 15K范围内的电动势·以两种PbF2标准生成Gibbs自由能数据和电池电动势为基础,计算得到SnF2标准生成自由能同温度的关系·电池电动势测量的实验误差远远小于PbF2标准生成Gibbs自由能数据中所给定的误差,采用两种不同的PbF2标准生成Gibbs自由能数据所得到的SnF2标准生成自由能的数值,彼此之间的偏差很小·所以上述两种计算结果都是可靠的· 展开更多
关键词 Gibbs自由能 snf2 LaF3固体电解质 电池电动势 PbF2 误差
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敲除SNF1基因提高酿酒酵母乙醇生物合成的研究 被引量:2
12
作者 雷娟娟 王艳尊 +6 位作者 江贤章 高媛媛 李欣 蓝灿华 陈由强 吴松刚 黄建忠 《药物生物技术》 CAS CSCD 2009年第2期103-107,共5页
SNF1基因编码的Snf1p对起始受葡萄糖阻遏基因的转录是必需的。通过重叠延伸PCR和两步PCR法合成了两端各带有352bp和345bp与SNF1序列上下游同源的基因敲除组件。将该敲除组件转化至酿酒酵母YS2,获得被loxP-kan-loxP序列组件替换而产生kan... SNF1基因编码的Snf1p对起始受葡萄糖阻遏基因的转录是必需的。通过重叠延伸PCR和两步PCR法合成了两端各带有352bp和345bp与SNF1序列上下游同源的基因敲除组件。将该敲除组件转化至酿酒酵母YS2,获得被loxP-kan-loxP序列组件替换而产生kanr的阳性克隆子。然后将质粒pSH65转入阳性克隆子并诱导表达Cre酶切除kan基因,进而通过传代丢失质粒pSH65后得到SNF1单倍体缺陷型菌株。重复转化敲除组件实现另一条等位基因的敲除,得到SNF1双倍体缺陷型菌株YS2-△snf1::loxp-kan-loxp。厌氧发酵试验表明该突变株的乙醇产量较出发菌株YS2提高了8.74%。残糖量试验表明在培养基中葡萄糖消耗殆尽后,突变株相对于出发菌株而言并没有利用乙醇作为碳源,乙醇产量保持稳定未有下降。敲除SNF1基因是提高酿酒酵母生物合成乙醇的一条有效途径。 展开更多
关键词 酿酒酵母 snf1基因 基因敲除 乙醇
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SWI/SNF染色质重塑复合物依赖的心脏发育及心脏病理性重构的表观遗传调控机制 被引量:2
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作者 李一飞 周开宇 华益民 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期312-317,共6页
近年来随着表观遗传研究的发展,染色质重塑对于基因表达的调控也越来越受到关注。其中SWI/SNF作为最为重要的一种染色质重塑复合物,其在种属间具有较高的保守性,通过结合相应的DNA序列,改变染色质局部形态,从而调控基因的表达。SWI/SNF... 近年来随着表观遗传研究的发展,染色质重塑对于基因表达的调控也越来越受到关注。其中SWI/SNF作为最为重要的一种染色质重塑复合物,其在种属间具有较高的保守性,通过结合相应的DNA序列,改变染色质局部形态,从而调控基因的表达。SWI/SNF染色质重塑复合物及其主要功能亚基在心脏发育、心脏功能整合及心肌病理性重构调控过程中均具有重要意义,且已经取得了众多突破性研究成果。这些研究结果为心脏疾病的发生发展机制提供了一种全新的理论与实验支持。文章综述SWI/SNF染色质重塑复合物在心脏发育及病理性重构中的研究进展。 展开更多
关键词 SWI/snf染色质重塑复合物 表观遗传学 心脏发育 病理性重构
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SWI/SNF染色质重塑复合物与肾脏肿瘤 被引量:3
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作者 夏秋媛 周晓军 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期313-315,共3页
SWI/SNF复合物是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,在肿瘤中起抑癌基因作用,其多个亚基失活与肾脏肿瘤的发生、发展关系密切,且常常提示肿瘤预后不良。该文现综述SWI/SNF复合物与肾脏肿瘤的相关研究进展,旨在阐述SWI/SNF复合物在某些肾脏... SWI/SNF复合物是一种ATP依赖的染色质重塑复合物,在肿瘤中起抑癌基因作用,其多个亚基失活与肾脏肿瘤的发生、发展关系密切,且常常提示肿瘤预后不良。该文现综述SWI/SNF复合物与肾脏肿瘤的相关研究进展,旨在阐述SWI/SNF复合物在某些肾脏肿瘤发生及演变过程中可能的作用。 展开更多
关键词 肾肿瘤 横纹肌样瘤 SWI/snf 染色质重塑 文献综述
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基于SNF的一种检测和跟踪性能优化方法 被引量:1
15
作者 徐本连 董学平 王执铨 《火力与指挥控制》 CSCD 北大核心 2006年第8期11-14,共4页
对于一个监视系统,跟踪性能的优化要求检测系统和跟踪系统通过引入反馈进行联合设计,针对最大量测幅值邻域滤波器(SNF),提出了先验和后验检测跟踪优化准则,通过分析得出先验优化准则不可行这一结论,而利用后验优化准则同时对检测阈值和... 对于一个监视系统,跟踪性能的优化要求检测系统和跟踪系统通过引入反馈进行联合设计,针对最大量测幅值邻域滤波器(SNF),提出了先验和后验检测跟踪优化准则,通过分析得出先验优化准则不可行这一结论,而利用后验优化准则同时对检测阈值和门值的联合优化,仿真结果表明,用后验优化准则进行检测和跟踪性能优化,不仅具有比恒虚警率更好的跟踪精度,而且其计算代价也大为降低。 展开更多
关键词 snf滤波器 目标跟踪 优化方法
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酿酒酵母SNF4基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1
16
作者 吴毕莎 柯崇榕 +3 位作者 林晓华 林清强 陈由强 黄建忠 《生物信息学》 2012年第1期8-11,共4页
SNF4基因编码的Snf4p具有调节Snf1复合体的蛋白激酶活性功能,根据已知的SNF4基因序列设计引物扩增获得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列。序列分析表明,SNF4基因的开放阅读框为969bp,编码322个氨基酸残基。应用生物信息方法预测其理... SNF4基因编码的Snf4p具有调节Snf1复合体的蛋白激酶活性功能,根据已知的SNF4基因序列设计引物扩增获得S.cerevisiae YS2的SNF4基因完整序列。序列分析表明,SNF4基因的开放阅读框为969bp,编码322个氨基酸残基。应用生物信息方法预测其理化性质、疏水性、信号肽、亚细胞定位、活性位点及其高级结构。结果表明:Snf4p为具有一定亲水性的非跨膜胞内稳定酸性蛋白,功能结构域为CBS_pair superfamily结构域,二级结构主要由a-螺旋组成,空间结构是由4个CBS结构域构成两个CBS对围绕形成的二聚体。Snf4p的第一个CBS对区域的β片层结构是Snf1p、Sip2p的β发夹结构结合作用区。 展开更多
关键词 snf4 酿酒酵母 ADH2 生物信息学
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LC-MS分析CmSnf1基因过表达对蛹虫草代谢组的影响
17
作者 王晓军 周湘 +4 位作者 李乐 李芳盛 荣丹 邹根 汪滢 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1744-1754,共11页
Sucrose-nonfermenting 1(SNF1)蛋白激酶调节大量基因的转录,改变代谢酶的活性,并控制各种营养反应性细胞发育过程。本研究通过LC-MS非靶向代谢组学技术比较蛹虫草Cordyceps militaris野生型菌株Cm01和CmSnf1基因过表达菌株菌丝体的化... Sucrose-nonfermenting 1(SNF1)蛋白激酶调节大量基因的转录,改变代谢酶的活性,并控制各种营养反应性细胞发育过程。本研究通过LC-MS非靶向代谢组学技术比较蛹虫草Cordyceps militaris野生型菌株Cm01和CmSnf1基因过表达菌株菌丝体的化学成分,从整体代谢物水平阐明CmSnf1基因过表达对蛹虫草代谢产物积累的影响。研究表明:CmSnf1基因过表达后,在LC-MS正负离子模式下检测出547种差异代谢物,同野生型菌株相比,220种产物上调和327种下调。尤其显著的是黄酮类物质2-香叶基-3,4,2′,4′-四羟基二氢查耳酮上调了140.55倍,甘油磷脂代谢中的磷脂酰丝氨酸(PS)下调了47.53倍。差异代谢产物参与甘油脂代谢、氨基酸生物合成和降解、半乳糖代谢、丙酮酸和酮类化合物代谢等多种途径。CmSnf1过表达菌株与野生型相比在酮类化合物代谢上具有优势,推测CmSnf1基因在蛹虫草药用功效中发挥着重要的作用。 展开更多
关键词 snf1 蛹虫草 Cmsnf1基因过表达 代谢组学
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Na_2SnF_6水解反应的高温高压实验方法研究
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作者 王玉荣 I-MingChou CyganGaryL. 《地球化学》 CAS 1987年第3期280-285,共6页
用四种不同类型高压釜研究Na_2SnF_6在200—647℃、1 kbar条件下的水解特征。实验表明,淬火速率影响实验结果的精度。快速淬火高压釜及金袋摇摆釜是研究这类化学平衡反应的理想设备,采用水解法可获得水解常数及热焓。
关键词 Na2snf6 水解反应 高温高压 化学平衡 水热实验
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敲除MIG1和SNF1基因对酿酒酵母共利用葡萄糖和木糖的影响 被引量:9
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作者 蔡艳青 齐显尼 +3 位作者 齐奇 蔺玉萍 王正祥 王钦宏 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期54-67,共14页
Mig1和Snf1是酿酒酵母葡萄糖阻遏效应的两个关键调控因子。为了提高酿酒酵母工程菌同时利用葡萄糖和木糖的能力,分别对MIG1和SNF1基因进行了单敲除和双敲除,并通过摇瓶发酵实验和RNA-Seq转录组分析,初步揭示了Mig1和Snf1可能影响葡萄糖... Mig1和Snf1是酿酒酵母葡萄糖阻遏效应的两个关键调控因子。为了提高酿酒酵母工程菌同时利用葡萄糖和木糖的能力,分别对MIG1和SNF1基因进行了单敲除和双敲除,并通过摇瓶发酵实验和RNA-Seq转录组分析,初步揭示了Mig1和Snf1可能影响葡萄糖和木糖共利用表达差异基因的层级调控机制。研究结果表明,MIG1单敲除对混合糖的共利用影响不大;SNF1单敲除会加快混合糖中木糖的利用而且葡萄糖和木糖可以被同时利用,这可能归因于SNF1单敲除会解除对一些氮分解代谢阻遏基因表达的抑制,从而促进了细胞对氮源营养的利用;进一步敲除MIG1,会解除更多氮分解代谢阻遏基因表达的抑制,以及一些碳中心代谢途径基因表达上调。虽然MIG1和SNF1双敲除菌株利用葡萄糖加快而利用木糖变慢,但是葡萄糖和木糖可以被同时利用,进而加快乙醇的积累。综上所述,MIG1和SNF1的敲除导致氮分解阻遏基因表达上调,有助于促进葡萄糖和木糖的共利用;解析Mig1和Snf1对氮分解阻遏基因的层级调控作用,为进一步提高葡萄糖和木糖的共利用提供新的靶点。 展开更多
关键词 酿酒酵母 葡萄糖阻遏 MIG1 snf1 RNA-SEQ 氮分解代谢阻遏
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不同碳、氮源质量浓度对高山被孢霉脂质积累及SNF1复合体转录调控的影响研究 被引量:4
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作者 常璐璐 唐鑫 +3 位作者 张灏 陈永泉 陈海琴 陈卫 《中国油脂》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期113-118,140,共7页
高山被孢霉(M.alpina)是一株具有较强脂质合成能力的产油微生物,其脂质积累受培养基中碳、氮源调控。探究了不同葡萄糖和酒石酸铵质量浓度对M.alpina生长及脂质积累的影响,并进一步研究不同碳、氮源质量浓度下M.alpina SNF1复合体各亚... 高山被孢霉(M.alpina)是一株具有较强脂质合成能力的产油微生物,其脂质积累受培养基中碳、氮源调控。探究了不同葡萄糖和酒石酸铵质量浓度对M.alpina生长及脂质积累的影响,并进一步研究不同碳、氮源质量浓度下M.alpina SNF1复合体各亚基的转录水平。结果表明:初始酒石酸铵质量浓度一定时,M.alpina脂肪酸含量随碳氮比(C/N)的增加而提高,C/N为24.6时其脂肪酸含量比C/N为4.6时提高42.6%,初始葡萄糖质量浓度一定时,氮源限制下(C/N=76.7)M.alpina脂肪酸产率达到2.6 g/L,是氮源存在时的1.5~3.2倍,与葡萄糖相比氮源水平对M.alpina脂质积累影响更为显著。氮源一定时高葡萄糖质量浓度(C/N=24.6)下SNF1复合体各亚基转录水平比对照组提高13.9~20.5倍;而氮限制导致的高C/N同样可促进其转录水平的提高。高C/N和氮限制均属于营养失衡信号,说明M.alpina SNF1转录水平的变化是其对胞外营养水平的响应方式,并与脂质积累水平具有相关性。 展开更多
关键词 高山被孢霉 snf1复合体 脂质积累 营养信号 转录调控
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