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基于rbcL序列探讨荨麻科植物的系统发育关系 被引量：3
1
作者 康冬丽 潘其辉 +1 位作者 易自力 蒋建雄 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2008年第4期255-264,共10页
对苎麻属4个种的rbcL序列进行了PCR扩增和T/A克隆产物的序列测定,扩增出长度为1370bp的rbcL序列。从GenBank中选取荨麻科8个属的rbcL序列,将所有物种的rbcL序列排序后,总长度约为1428bp。其中保守位点1263个,变异位点165个,信息位点71... 对苎麻属4个种的rbcL序列进行了PCR扩增和T/A克隆产物的序列测定,扩增出长度为1370bp的rbcL序列。从GenBank中选取荨麻科8个属的rbcL序列,将所有物种的rbcL序列排序后,总长度约为1428bp。其中保守位点1263个,变异位点165个,信息位点71个。利用MEGA3.1软件构建荨麻科植物的MP和NJ系统树,并根据rbcL区碱基序列的差异计算种间的遗传距离,从而进一步探讨荨麻科植物之间的亲缘关系。其中,赤车属、锥头麻属、藤麻属、楼梯草属和冷水花属聚为一支,具有较近的亲缘关系;墙草属、单蕊麻属和苎麻属聚为另一组;而荨麻属植物在一级分支中就与荨麻科其他属植物分开,说明该属与其他属的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 荨麻科 rbcl序列 信息位点 距离依靠法
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不同条件对大肠杆菌K12转化质粒pKD46效率研究 被引量：6
2
作者 李伟星 张力 +3 位作者 王扬 张君胜 杨晓志 张铎 《湖北农业科学》 北大核心 2010年第8期1803-1806,共4页
研究了不同处理方法、不同生长时期以及热激时间等因素对Escherichia coli K12转化质粒pKD46效率的影响。结果表明,在OD600为0.43时,利用RbCl法制备的新鲜感受态细胞,在42℃热激90s时,对质粒pKD46的转化效率最高,可达到5.4×106。同... 研究了不同处理方法、不同生长时期以及热激时间等因素对Escherichia coli K12转化质粒pKD46效率的影响。结果表明,在OD600为0.43时,利用RbCl法制备的新鲜感受态细胞,在42℃热激90s时,对质粒pKD46的转化效率最高,可达到5.4×106。同时,优化了其他影响转化效率的因素。 展开更多
关键词 大肠杆菌K12菌株 质粒pKD46 rbcl法
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食品中植物源性成分非定向筛查技术的应用
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作者 郭颖慧 胡梅 +7 位作者 霍胜楠 郑世超 陈怡文 王骏 任易婕 孟静 程祥龙 崔生辉 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2023年第7期1006-1012,共7页
目的实现食品中植物源性成分非定向筛查技术在实际样品中的检测应用,为打击植物源性成分的掺伪掺假提供技术支撑。方法采用改良CTAB法、SDS法和试剂盒法对多种植物源性食品基因组DNA进行提取,对获得的脱氧核糖核酸(DNA)质量、浓度和纯... 目的实现食品中植物源性成分非定向筛查技术在实际样品中的检测应用,为打击植物源性成分的掺伪掺假提供技术支撑。方法采用改良CTAB法、SDS法和试剂盒法对多种植物源性食品基因组DNA进行提取,对获得的脱氧核糖核酸(DNA)质量、浓度和纯度进行比较。以植物中叶绿体基因组中的RbcL基因为条形码,选用30种常见植物物种对该引物进行通用性、特异性验证。将二代高通量测序与DNA条形码技术相结合,对山东省市售的4个混合植物样本进行种属鉴别。结果改良CTAB法和试剂盒法可有效去除植物中多糖类和多酚类物质的干扰,DNA提取效果较理想,SDS法较差;CTAB法获得的DNA浓度高于试剂盒法。该方法对选用的30种植物物种通用性、特异性良好。在属和种水平下,混合样本中植物物种的同步检出率较高,种水平的物种检出率达到98%,出现非目标匹配。结论RbcL基因片段可以作为植物种属鉴别的条形码,在属水平下的鉴别率较高,在种水平下存在高检出、低分辨率的问题,后期可以通过增加条形码长度等方法进行进一步改善,以期推进DNA宏条形码方法在植物鉴定领域的常规化应用奠定基础。 展开更多
关键词 植物源性成分 基因组DNA 提取方法 rbcl基因 高通量测序 非定向筛查
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