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禽流感病毒流行现状及qRT-PCR检测技术研究进展
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作者 刘雨晴 李安琪 +1 位作者 陈雯轩 吴华伟 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2026年第1期37-43,共7页
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)因高变异性和跨物种传播能力,对全球公共卫生和家禽养殖业构成严重威胁。从病毒学特征来看,AIV主要通过血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因分型,其快速演化加剧了防控... 禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)因高变异性和跨物种传播能力,对全球公共卫生和家禽养殖业构成严重威胁。从病毒学特征来看,AIV主要通过血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因分型,其快速演化加剧了防控难度。流行病学研究表明,野生鸟类迁徙和活禽贸易活动是AIV传播的主要途径,不同亚型分布呈现显著的区域和时间差异。在检测技术方面,实时荧光定量反转录聚合酶链反应(quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)因灵敏度高和特异性强成为AIV检测的核心方法,但AIV亚型混合感染及变异株的出现对检测技术提出了更高的要求。本文系统总结了AIV的分型依据、分子特征、流行病学特性及检测技术的最新进展,以期为AIV的精准监测和防控提供理论参考。 展开更多
关键词 禽流感病毒 qrt-pcr 流行病学 高通量检测 防控策略
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沙生蜡菊qRT-PCR内参基因筛选与验证
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作者 刘欣欣 赖成霞 +1 位作者 谷玉风 葛风伟 《新疆师范大学学报(自然科学版)》 2026年第1期74-82,共9页
从沙生蜡菊转录组数据中选择5个管家基因(ACT1、ACT7、CYP、HIS、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR检测候选内参基因在沙生蜡菊不同组织和冻害胁迫下的表达水平,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其稳定性进行评估,筛... 从沙生蜡菊转录组数据中选择5个管家基因(ACT1、ACT7、CYP、HIS、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR检测候选内参基因在沙生蜡菊不同组织和冻害胁迫下的表达水平,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其稳定性进行评估,筛选合适内参基因。以沙生蜡菊HaWRKY基因作为靶标基因,验证内参基因稳定性。结果表明,HaCYP和HaHIS在沙生蜡菊组织中稳定表达;HaHIS在冻害胁迫后稳定表达;综上所述,HaHIS可作为沙生蜡菊内参基因。本研究获得沙生蜡菊合适内参基因,为沙生蜡菊基因表达分析提供了可靠的技术支持,同时为深入研究其响应冻害分子机制和次生代谢调控奠定了基础。 展开更多
关键词 沙生蜡菊 内参基因 qrt-pcr 基因表达分析
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毛叶芋兰不同组织qRT-PCR内参基因选择与验证 被引量:1
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作者 池珈仪 刘舒璇 +2 位作者 向思诗 詹若挺 何瑞 《热带作物学报》 北大核心 2025年第1期35-43,共9页
毛叶芋兰(Nervilia plicata)是一种珍稀南药,目前对其有效成分及其分子调控机理鲜有报道。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)在植物基因表达分析中得到了广泛应用,但在毛叶芋兰中缺少研究,限制了相关工作的开展。在... 毛叶芋兰(Nervilia plicata)是一种珍稀南药,目前对其有效成分及其分子调控机理鲜有报道。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)在植物基因表达分析中得到了广泛应用,但在毛叶芋兰中缺少研究,限制了相关工作的开展。在前期工作基础上,本研究从毛叶芋兰转录组数据库中筛选出Actin、GAPDH、TUA、UBC、UBQ、EF-1α、EF-1β、CYP、RPL共9个常见管家基因,以毛叶芋兰叶片、叶柄和球茎3个组织部位为材料,开展qRT-PCR内参基因的筛选工作。经过9个基因在不同组织的表达水平、稳定性和综合分析,筛选出最适合的内参基因,并选择毛叶芋兰花青素合成途径关键基因NpDFR、Np3GT进行验证。结果发现:EF-1α和CYP的表达稳定性相近,整体稳定性最好。2个内参基因单独或共同使用时,NpDFR、Np3GT在不同组织的表达情况与转录组测序结果基本一致,表明其均可用作qRT-PCR的内参基因。本研究结果为进一步开展毛叶芋兰药效相关基因的分子作用机理研究提供依据。 展开更多
关键词 毛叶芋兰 内参基因 实时荧光定量pcr 表达稳定性
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沙芥qRT-PCR内参基因的筛选与验证 被引量:1
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作者 武兆昕 商凯凡 王萍 《植物生理学报》 北大核心 2025年第3期359-370,共12页
从沙芥全长转录组数据中选择10个内参基因(TIP41、UBQ10、UBC9、UP1、SAND、GAPDH、ACT、EF1α、PP2A、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR法检测候选内参基因在沙芥非生物和植物生长调节物质处理下的表达水平,并使用GeNorm、Normfinder... 从沙芥全长转录组数据中选择10个内参基因(TIP41、UBQ10、UBC9、UP1、SAND、GAPDH、ACT、EF1α、PP2A、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR法检测候选内参基因在沙芥非生物和植物生长调节物质处理下的表达水平,并使用GeNorm、Normfinder、BestKeeper和RefFinder分析其稳定性。结果表明:EF1α为沙芥所有处理样本混合组(Total组)最稳定内参基因;TIP41为干旱叶/根、NaCl处理叶根组合(LR组)/根、脱水LR组/叶片、ABA处理LR组/叶片、MeJA处理LR组/根中最稳定的内参基因;UBQ10为4℃处理LR组/叶片、42℃处理LR组、干旱LR组及SA处理LR组最稳定内参基因;ACT为4℃处理根、脱水处理根中最稳定内参基因;GADPH为42℃处理叶片中最稳定内参基因;PP2A为NaCl处理叶片、ABA处理根、SA处理根中最稳定的内参基因;UBC9为MeJA处理叶片中最稳定的内参基因。此外,选择3个胁迫相关基因(PcDREB2、PcCLCg和PcHSP17.8)验证了内参基因的准确性。本研究结果可用于沙芥非生物胁迫和植物生长调节物质处理下qPCR分析,为今后沙芥耐逆基因的表达分析提供了参考基因和理论依据。 展开更多
关键词 内参基因 沙芥 非生物胁迫 植物生长调节物质 qrt-pcr
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不同光质处理下糙皮侧耳qRT-PCR内参基因的优化
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作者 胡梦丹 祝梦柯 +3 位作者 张鹏 高玉千 邱立友 李亚楠 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第6期35-43,共9页
为了筛选出适合分析糙皮侧耳在不同光质处理下基因特异性表达的内参基因,以糙皮侧耳菌丝为材料,在不同光质处理的菌丝转录组数据中筛选12个基因作为糙皮侧耳实时荧光定量PCR的候选内参基因,对其表达丰度和表达稳定性进行评价。设计的12... 为了筛选出适合分析糙皮侧耳在不同光质处理下基因特异性表达的内参基因,以糙皮侧耳菌丝为材料,在不同光质处理的菌丝转录组数据中筛选12个基因作为糙皮侧耳实时荧光定量PCR的候选内参基因,对其表达丰度和表达稳定性进行评价。设计的12个候选内参基因荧光定量引物具有良好的特异性,熔解曲线呈单一峰,各基因CT值在18~26之间。geNorm、NormFinder和BestKeeper表达稳定性分析显示,真核翻译起始因子编码基因(eIF1)、泛素结合酶编码基因(UBC)、40S核糖体蛋白编码基因(40SRP)和肌动蛋白编码基因(Actin1)在3种分析中的表达稳定性均位于前列。这4个基因在不同光质处理下的表达丰度从高到低依次为UBC、eIF1、Actin1和40SRP。eIF1和UBC可以作为靶标基因高丰度表达水平下的最佳内参基因组合;40SRP和Actin1可作为靶标基因中、低丰度表达水平下的最佳内参基因组合。 展开更多
关键词 糙皮侧耳 内参基因 光处理 qrt-pcr
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三种非生物胁迫下谷子qRT-PCR内参基因的筛选
6
作者 雷翠云 马宁洁 +5 位作者 张晓霞 李瑞淼 冯萌萌 单萌 杨致荣 高建华 《植物生理学报》 北大核心 2025年第4期471-480,共10页
为了便于研究谷子(Setaria italica)这种新兴的C4禾谷类模式植物的基因表达模式,急需筛选鉴定谷子非生物胁迫下的内参基因。根据已有转录组数据和文献,筛选出8个基因作为候选内参基因。对名优谷子‘晋谷21号’的超早熟突变体xiaomi分别... 为了便于研究谷子(Setaria italica)这种新兴的C4禾谷类模式植物的基因表达模式,急需筛选鉴定谷子非生物胁迫下的内参基因。根据已有转录组数据和文献,筛选出8个基因作为候选内参基因。对名优谷子‘晋谷21号’的超早熟突变体xiaomi分别进行低氮、干旱和高盐胁迫处理,并在7个时间点(1、3、6、12、24、48、72 h)取样,分析8个候选基因在不同部位(叶、茎、根)的表达水平。通过在线工具RefFinder分析了所有样品中候选基因的表达稳定性。结果表明,Si4g07620基因(编码转录延伸因子)在所有样本中表现出较优的稳定性和可靠性,被确定为最佳内参基因;而鲜有作为内参基因的磷蛋白基因(Si5g32520)表现也相对稳定,仅次于Si4g07620。研究结果有助于深入探究谷子耐逆性的分子机理。 展开更多
关键词 谷子 基因表达分析 qrt-pcr 内参基因 非生物胁迫
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梨形环棱螺qRT-PCR内参基因的筛选
7
作者 郭雪朋 文衍红 +3 位作者 罗福广 王志强 祝东梅 周小云 《华中农业大学学报》 北大核心 2025年第6期253-262,共10页
为筛选梨形环棱螺(Bellamya purificata)在不同发育阶段、不同组织以及性别间各组织中表达稳定的最佳qRT-PCR内参基因,分别用geNorm、NormFinder、BestKeeper软件和比较ΔCt法,以及综合分析软件RefFinder评估actβ、18S、gapdh、ef1α、... 为筛选梨形环棱螺(Bellamya purificata)在不同发育阶段、不同组织以及性别间各组织中表达稳定的最佳qRT-PCR内参基因,分别用geNorm、NormFinder、BestKeeper软件和比较ΔCt法,以及综合分析软件RefFinder评估actβ、18S、gapdh、ef1α、ef1β、rps3、rpl4、tubα、tubβ和sdha共10个候选基因在梨形环棱螺的胚胎阶段、幼螺阶段和雌雄成螺各组织中的表达稳定性。结果显示,候选内参基因在胚胎和幼螺阶段的表达稳定性依次为gapdh>tubα>18S>ef1α>ef1β>rps3>actβ>tubβ>sdha>rpl4,在雌螺各组织中的表达稳定性依次为ef1β>tubα>rps3>ef1α>18S>actβ>gapdh>sdha>tubβ>rpl4,在雄螺各组织中的稳定性依次为ef1α>rps3>ef1β>rpl4>tubα>actβ>18S>gapdh>tubβ>sdha,在性别间各组织中的稳定性依次为ef1β>ef1α>rps3>tubα>18S>actβ>gapdh>rpl4>sdha>tubβ。上述结果表明,gapdh和tubα为胚胎和幼螺阶段较适宜的qRT-PCR内参基因,ef1β和tubα为雌螺组织间较适宜的qRT-PCR内参基因,ef1α和rps3为雄螺组织间较适宜的qRT-PCR内参基因,ef1α和ef1β为性别间较适宜的qRT-PCR内参基因。 展开更多
关键词 梨形环棱螺 qrt-pcr 内参基因 表达稳定性
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荧光定量PCR检测珍珠鸡Tva与ALV-A gp85基因方法的建立及应用
8
作者 宁宇航 李喜月 +7 位作者 王扬扬 马晨曦 李鑫鹏 荣晴 何雷 余祖华 丁轲 陈建 《中国家禽》 北大核心 2026年第1期70-78,共9页
研究旨在探讨体内水平下珍珠鸡各组织器官中A亚群禽白血病病毒(ALV-A)组织载量与维生素_(B12)(V_(B12))的含量、Tva基因转录水平之间的关系。试验通过建立检测珍珠鸡ALV-A gp85和Tva基因的荧光定量PCR方法,定量感染ALV-A的珍珠鸡不同组... 研究旨在探讨体内水平下珍珠鸡各组织器官中A亚群禽白血病病毒(ALV-A)组织载量与维生素_(B12)(V_(B12))的含量、Tva基因转录水平之间的关系。试验通过建立检测珍珠鸡ALV-A gp85和Tva基因的荧光定量PCR方法,定量感染ALV-A的珍珠鸡不同组织中ALV-A gp85基因和Tva基因表达水平,并通过ELISA测定珍珠鸡组织中V_(B12)浓度,分析ALV-A gp85表达水平与V_(B12)组织含量和Tva基因表达水平之间的关系。结果显示:研究建立的珍珠鸡Tva基因荧光定量PCR方法灵敏度较常规PCR提升1个数量级(10倍),ALV-A gp85基因检测灵敏度提高2个数量级(100倍),仅靶基因出现特异性扩增且批内及批间变异系数均小于2%,血浆样本ALV-A阳性检出率明显高于PCR和ELISA方法,具有良好的灵敏度、特异性和稳定性。皮尔逊相关性分析显示,珍珠鸡组织器官中V_(B12)浓度与ALV-A gp85转录水平均呈负相关,而ALV-A gp85与Tva基因转录水平整体上符合正相关关系,推测V_(B12)可能通过占据Tva受体干扰ALV-A感染宿主细胞。研究表明,试验成功建立一种定量检测珍珠鸡ALV-A gp85基因和Tva基因的方法,并确定珍珠鸡中V_(B12)组织含量与ALV-A组织载量以及Tva基因表达水平之间的关系,为禽白血病的防控奠定基础。 展开更多
关键词 A亚群禽白血病病毒 TVA gp85 qrt-pcr 珍珠鸡 维生素B_(12)
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基于ail基因的小肠结肠炎耶尔森菌qRT-PCR检测方法的建立
9
作者 冯春辉 林静怡 +6 位作者 赵猛 方娅琼 马玉婷 陆文凯 许文豪 张红见 冈林环树 《青海大学学报》 2025年第4期59-64,共6页
为了建立一种操作简便、快速高效、特异性高的小肠结肠炎耶尔森菌检测方法,并将其应用于临床样品的快速筛选和流行病学调查,以小肠结肠炎耶尔森菌ail基因为靶基因,建立了针对小肠结肠炎耶尔森菌的qRT-PCR检测方法,并对临床样品进行检测... 为了建立一种操作简便、快速高效、特异性高的小肠结肠炎耶尔森菌检测方法,并将其应用于临床样品的快速筛选和流行病学调查,以小肠结肠炎耶尔森菌ail基因为靶基因,建立了针对小肠结肠炎耶尔森菌的qRT-PCR检测方法,并对临床样品进行检测。结果表明:灵敏性检测结果显示,qRT-PCR方法对目的DNA的检测限为10-2copies/μL;特异性检测结果显示,仅有小肠结肠炎耶尔森菌被检出。通过与普通PCR比较分析可知,基于小肠结肠炎耶尔森菌ail基因建立的qRT-PCR方法特异性强,灵敏性高,且操作简便快速,检测成本较低。研究结果可为青海地区小肠结肠炎耶尔森菌的传播与流行提供一种快速、灵敏的分子检测方法。 展开更多
关键词 小肠结肠炎耶尔森菌 ail基因 qrt-pcr pcr 灵敏性 特异性
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新布尼亚病毒编码milRNA qRT-PCR检测一步法的建立及其临床应用价值
10
作者 吴寒英 方媛 +1 位作者 陈熹 杨平 《临床检验杂志》 2025年第7期534-540,共7页
目的构建新型布尼亚病毒(SFTSV)编码微小核糖核酸样小RNAs(microRNA-like small RNAs,milRNAs)的高效、稳定的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)一步法,并评估其临床应用价值。方法针对前期筛选的3种SFTSV milRNAs:sRNA S-1480、sRNA M-692、sRN... 目的构建新型布尼亚病毒(SFTSV)编码微小核糖核酸样小RNAs(microRNA-like small RNAs,milRNAs)的高效、稳定的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)一步法,并评估其临床应用价值。方法针对前期筛选的3种SFTSV milRNAs:sRNA S-1480、sRNA M-692、sRNA L-4706,设计并优化针对这3种milRNAs的qRT-PCR引物及反应体系。通过标准曲线绘制、引物浓度/序列优化、荧光染料优化、产物测序验证以及20例新布尼亚病毒感染者及20例健康人对照者血清标本检测,进一步评估方法的敏感性、特异性及临床适用性。结果成功构建一步qRT-PCR检测体系,以标准品构建的标准曲线在10 fmol/L~100 nmol/L范围内具有良好的线性关系(R 2>0.98),对3种milRNAs的检测下限均为10 fmol/L。ROC曲线分析结果显示,血清sRNA S-1480(AUC^(ROC)=0.9725)、sRNA M-692(AUC^(ROC)=0.7575)、sRNA L-4706(AUC^(ROC)=0.9575)以及3种milRNAs联合检测(AUC^(ROC)=0.9950)均可用于区分SFTSV感染者与健康人对照者。结论构建的一步qRT-PCR检测体系具有较高的敏感性,为SFTSV感染的临床诊断提供了高效、可靠的替代方案。 展开更多
关键词 微小核糖核酸样小RNAs 一步qrt-pcr方法 新布尼亚病毒
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钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选 被引量:16
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作者 马璐琳 段青 +5 位作者 崔光芬 杜文文 贾文杰 王祥宁 王继华 陈发棣 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期377-388,共12页
为了筛选适合于钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中相关基因qRT-PCR表达分析时的内参基因,根据钝裂银莲花蓝/白不同花色花器官组织的转录组测序结果,选取了多聚泛素酶基因(polyubiquitin,UBQ)、微管蛋白基因(β-tubulin,β-TUB)、水通... 为了筛选适合于钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中相关基因qRT-PCR表达分析时的内参基因,根据钝裂银莲花蓝/白不同花色花器官组织的转录组测序结果,选取了多聚泛素酶基因(polyubiquitin,UBQ)、微管蛋白基因(β-tubulin,β-TUB)、水通道蛋白基因(aquaporin,AQP)、肌动蛋白基因(actin,ACT)、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶基因(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、组蛋白基因(histone,HIS)、转录延伸因子基因(elongation factor 1-β,EF-1β)和60S核糖体蛋白基因(60S ribosomal protein L13-1,RPL13)等8个常用内参基因作为候选基因,以钝裂银莲花的叶片、茎杆和蓝/白色花器官等不同组织为试验材料,通过qRT-PCR检测这8个候选内参基因的表达情况,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper等软件对其稳定性进行分析评价。结果表明:8个候选内参基因中,UBQ表现最稳定,而β-TUB相对稳定性最差。以最稳定的UBQ为内参对钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中16个相关基因表达情况进行qRT-PCR分析,结果与前期转录组测序结果一致。UBQ为钝裂银莲花花色素合成途径相关基因表达分析的最适内参基因。 展开更多
关键词 钝裂银莲花 实时荧光定量pcr 内参基因 筛选 稳定性 类黄酮/花青素合成途径
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番茄qRT-PCR内参基因的筛选 被引量:11
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作者 姜静 王银磊 +4 位作者 赵丽萍 周蓉 李亚茹 赵统敏 余文贵 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期-,共8页
以高温、低温、盐胁迫、TYLCV接种处理和对照的番茄幼苗为植物材料,通过实时荧光定量RT-PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)方法分析了常用的8个内参基因肌动蛋白基因(ACT)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)、泛素基... 以高温、低温、盐胁迫、TYLCV接种处理和对照的番茄幼苗为植物材料,通过实时荧光定量RT-PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)方法分析了常用的8个内参基因肌动蛋白基因(ACT)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)、泛素基因(UBI)、18S核糖体RNA基因(18S)、转录延伸因子基因(EF-1a)、β-微管蛋白基因(TUB)、表达蛋白基因(EXP)和接合素蛋白复合物基因(CAC)在不同样本中的表达情况。利用ge Norm和Norm Finder软件分析筛选表达稳定性较高的内参基因。结果表明,在不同胁迫处理条件下,UBI和ACT的稳定性较高;在同样的胁迫处理中,8个内参基因的表达稳定性不同。综合而言,虽然UBI和ACT的稳定性同样较高,但在TYLCV接种处理试验中ACT的稳定性相对较差,而TUB和GAPDH表达较稳定,故TUB和GAPDH可在TYLCV接种处理试验中作为番茄qRT-PCR的内参基因。 展开更多
关键词 番茄 实时荧光定量pcr 内参基因
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新生籽鹅组织qRT-PCR分析中内参基因的选择 被引量:5
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作者 王忠伟 郭景茹 +3 位作者 王建发 臧琳 郭爽 杨焕民 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期427-431,共5页
分别以1日龄健康籽鹅肝脏、肾脏、心脏、肌肉和卵巢为研究对象,应用实时定量RT-PCR技术,探讨28SrRNA、18SrRNA、GAPDH、ACT、HPRT1、SDH和TUB等7个内参基因mRNA的表达水平。经过geNorm和NormFinder程序分析,结果显示7个内参基因稳定度... 分别以1日龄健康籽鹅肝脏、肾脏、心脏、肌肉和卵巢为研究对象,应用实时定量RT-PCR技术,探讨28SrRNA、18SrRNA、GAPDH、ACT、HPRT1、SDH和TUB等7个内参基因mRNA的表达水平。经过geNorm和NormFinder程序分析,结果显示7个内参基因稳定度由高到低依次为GAPDH=HRPT1>28SrRNA>TUB>SDH>ACT>18SrRNA;基因表达的稳定值分别为0.215(GAPDH),0.215(HRPT1),0.339(28SrRNA),0.471(TUB),0.721(SDH),0.888(ACT),1.177(18SrRNA);表明GAPDH和HRPT1这2个内参基因适合用于目的基因表达的校正。 展开更多
关键词 内参基因 实时定量RT-pcr geNorm程序 NormFinder程序 籽鹅
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小拟南芥实时荧光定量PCR(qRT-PCR)内参基因的筛选 被引量:16
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作者 郑丽洁 林军 黄先忠 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期774-783,共10页
小拟南芥(Arabidopsis pumila),又名无苞芥(Olimarabidopsis pumila),为拟南芥的近缘物种。选择合适的内参基因对于提高实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析基因表达的准确性至关重要。本研究在分析小拟南芥叶片... 小拟南芥(Arabidopsis pumila),又名无苞芥(Olimarabidopsis pumila),为拟南芥的近缘物种。选择合适的内参基因对于提高实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析基因表达的准确性至关重要。本研究在分析小拟南芥叶片转录组数据的基础上,筛选了12个表达稳定的候选内参基因,包括肌动蛋白1(actin-1,ACT-1)、α-微管蛋白1(α-tubulin,TUA1)、β-微管蛋白6(β-tubulin,TUB6)、翻译起始因子(translation initiation factor 2,IF2)、延伸因子1-α(elongation factor 1-alpha,EF1-α)、聚泛素14(polyubiquitin 14,UBQ14)、UBQ9、泛素连接酶35(ubiquitin-conjugating enzyme 35,UBC35)、转录起始因子1(transcription initiation factor,HAF1)、FK506结合蛋白62(FK506 binding protein 62,FKBP62)、miR319a和醛脱氢酶(aldehyde dehydrogenase,ALDH)。我们分别利用Norm Finder、Genorm和Bestkeeper软件分析了这12个基因在dH_2O、NaCl处理下及小拟南芥不同组织中的表达稳定性。研究表明,在dH_2O处理条件下表达稳定的基因为TUB6和FKBP62,在Na Cl处理条件下为EF1-α和IF2,在组织器官中为HAF1,这些基因适合作为相应试验条件下小拟南芥的内参基因。本研究为小拟南芥基因表达分析提供了可靠的内参基因,具有重要的参考价值。 展开更多
关键词 小拟南芥 无苞芥 盐胁迫 实时荧光定量pcr 内参基因
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鸡传染性法氏囊病毒实时qRT-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:4
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作者 周欣 杨霞 +4 位作者 赵军 常洪涛 王新卫 陈陆 王川庆 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期424-430,共7页
根据高效培养鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)时对病毒滴度检测的需要,本文针对IBDV VP4基因的保守序列设计并合成了一对引物,以所构建的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IBDV核酸载量的SYBR Green I荧光定量实时RT-PCR(qRT-PCR)方法,结果表... 根据高效培养鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)时对病毒滴度检测的需要,本文针对IBDV VP4基因的保守序列设计并合成了一对引物,以所构建的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IBDV核酸载量的SYBR Green I荧光定量实时RT-PCR(qRT-PCR)方法,结果表明,其Ct值与标准品模板在4.03×101~109拷贝/μL范围内呈良好的线性关系,对IBDV核酸的最低检出量为40拷贝/μL,灵敏度是常规RT-PCR检测方法的1 000倍;该方法不与其它禽源病毒发生交叉反应,批内变异系数小于0.5%。应用本方法对DF-1细胞中IBDV的增殖滴度进行了测定,并与经典的TCID50测定方法进行了比较。结果显示两种方法测定的IBDV在微载体悬浮培养和方瓶静态培养条件下DF-1细胞上的增殖曲线都具有一定的平行关系,且qRT-PCR方法比TCID50方法更加快速和敏感,更适合于对IBDV增殖滴度的实时快速测定。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病毒 DF-1细胞 qrt-pcr TCID50 增殖滴度
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红掌佛焰苞基因qRT-PCR分析中内参基因的筛选 被引量:5
16
作者 杨澜 杨光穗 +2 位作者 李崇晖 牛俊海 尹俊梅 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期51-58,共8页
为筛选红掌(Anthurium andraeanum Linden)中稳定表达、可用于佛焰苞中实时荧光定量PCR分析(q RT-PCR)的内参基因,对5个组成型表达基因EF1-a、UBQ7、ACTB、GADPH、His3进行表达稳定性分析,并利用所筛选的内参基因研究红掌的二氢黄酮醇... 为筛选红掌(Anthurium andraeanum Linden)中稳定表达、可用于佛焰苞中实时荧光定量PCR分析(q RT-PCR)的内参基因,对5个组成型表达基因EF1-a、UBQ7、ACTB、GADPH、His3进行表达稳定性分析,并利用所筛选的内参基因研究红掌的二氢黄酮醇还原酶基因(dfr)的表达水平。结果表明,5种内参基因在不同品种间的表达稳定性不同。据内参基因标准化因子的配对差异分析(Vn/n+1),判定内参基因的最适数目为2,ACTB和UBQ7在红掌不同品种及佛焰苞发育不同阶段中表达均稳定,是理想的内参基因。dfr在不同品种的佛焰苞及佛焰苞发育过程中均有表达,且dfr表达水平的变化趋势一致,因此,所选内参基因是合适的。 展开更多
关键词 红掌 佛焰苞 实时荧光定量pcr 内参基因
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孟氏隐唇瓢虫qRT-PCR分析中内参基因的筛选 被引量:5
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作者 潘畅 张宇宏 庞虹 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期261-270,共10页
选择合适的内参基因是qRT-PCR研究的关键。本文以孟氏隐唇瓢虫Cryptolaemus montrouzieri Mulsant为研究材料,利用qRT-PCR技术,对孟氏隐唇瓢虫4个候选内参基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表达量进行了分析,并用Ge Norm、No... 选择合适的内参基因是qRT-PCR研究的关键。本文以孟氏隐唇瓢虫Cryptolaemus montrouzieri Mulsant为研究材料,利用qRT-PCR技术,对孟氏隐唇瓢虫4个候选内参基因Actin、RPS23、GAPDH和β-tubulin的mRNA的表达量进行了分析,并用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper软件分析它们在孟氏隐唇瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中的表达稳定性。结果表明,以成虫不同组织为材料时,综合三种软件分析结果显示4个候选基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1)>β-tubulin(rank=2.3)>GAPDH(rank=3)>Actin(rank=3.7),以不同发育时期虫体为材料时,综合分析结果显示4个候选内参基因表达稳定性平均等级值排名为RPS23(rank=1.7)>Actin(rank=2)>GAPDH(rank=2.7)>β-tubulin(rank=3.7)。综合分析在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织两种处理下,三种软件的评价效果,4个候选基因表达稳定性等级值的总平均排名为RPS23(rank=1.3)>Actin(rank=2.8)=GAPDH(rank=2.8)>β-tubulin(rank=3)。RPS23在瓢虫不同发育阶段及成虫不同组织中均显示出较高的表达稳定性及与其它基因之间极大的相关性,可以确定为孟氏隐唇虫不同发育阶段及成虫不同组织基因表达分析中一个稳定表达的基因,可作为单个内参基因或者其它内参基因的协同基因,本实验为开展孟氏隐唇瓢虫功能基因表达分析奠定了方法学基础。 展开更多
关键词 孟氏隐唇瓢虫 qrt-pcr 内参基因 表达稳定性 GeNorm软件 NormFinder软件 BestKeeper软件
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利用qRT-PCR技术对PVY重组株系的鉴定 被引量:4
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作者 尚慧 韩树鑫 +6 位作者 高艳玲 张威 范国权 申宇 聂先舟 吕文河 白艳菊 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第2期238-244,共7页
【目的】马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)作为制约马铃薯生产的重要病毒之一,株系分化繁杂。近年被科学家研究分离的PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系而言,其基因组结构极为相似但致病性差异较大。【方法】本研究利用qRT-PCR方法,方便快... 【目的】马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)作为制约马铃薯生产的重要病毒之一,株系分化繁杂。近年被科学家研究分离的PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系而言,其基因组结构极为相似但致病性差异较大。【方法】本研究利用qRT-PCR方法,方便快捷的检测出马铃薯Y病毒的这2种不同株系,同时并使之可成功且稳定的应用于马铃薯生产中。通过查找Gen Bank已公布的PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系的全基因组序列,设计用于qRT-PCR检测,扩增目的片段大小为150 bp左右的特异性引物,应用实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)进行检测。【结果】通过设计的引物对保存的试管苗毒源进行检测,可以成功的精准鉴别出PVY^(N-Wi)和PVY^(NTN-NW)株系;同时对100份田间采集的叶片样品进行检测,成功的检测出100份样品中32份样品,受到PVY^(N-Wi)株系侵染;27份样品,受到PVY^(NTN-NW)株系侵染;同时存在9份样品,可能同时受到PVY^(N-Wi)、PVY^(NTN-NW)株系的侵染。【结论】实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR)可适用于马铃薯叶片样品的检测,为株系的快速鉴定提供了可靠的方法,可用于生产中大规模样品的检测,有利于及时采取防控措施,降低损失。 展开更多
关键词 马铃薯Y病毒(PVY) 株系分化 实时荧光定量pcr技术(qrt-pcr)
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黑龙江省某规模化奶牛场牛病毒性腹泻病毒qRT-PCR结合双抗夹心ELISA的检测 被引量:4
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作者 张世勋 赫鸣睿 +12 位作者 于洪江 何泊宁 赵尚琪 王丽 吴陈华 黄雯静 王天 刘宇 岳山 刘珊珊 翟军军 宋佰芬 朱战波 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第22期72-75,共4页
为了对黑龙江省规模化奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病进行检疫净化,试验应用qRT-PCR法检测了黑龙江省4个规模化奶牛场(A^D场)奶牛耳组织样品(共1286份,58组),qRT-PCR法检测得到的阳性组样品再用双抗夹心ELISA进行每份样品的检测。阳性牛间隔... 为了对黑龙江省规模化奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病进行检疫净化,试验应用qRT-PCR法检测了黑龙江省4个规模化奶牛场(A^D场)奶牛耳组织样品(共1286份,58组),qRT-PCR法检测得到的阳性组样品再用双抗夹心ELISA进行每份样品的检测。阳性牛间隔1个月用RT-PCR方法复检。结果表明:A场牛病毒性腹泻病毒阳性率为0.5%(1/193),B场为0.1%(2/875),C场为1.8%(1/55),D场未检测出牛病毒性腹泻/黏膜病抗原阳性牛(0/163)。间隔1个月,用RT-PCR方法复检,阳性符合率100%。说明qRT-PCR结合双抗夹心ELISA方法适合于规模化奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病的快速、特异性的检疫净化。 展开更多
关键词 奶牛 牛病毒性腹泻病毒 qrt-pcr 双抗夹心ELISA 检疫
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登革Ⅱ型病毒SYBRGreenⅠqRT-PCR方法的建立 被引量:3
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作者 胡哲 吴腾飞 +1 位作者 关振宏 陈启军 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2010年第2期91-95,110,共6页
目的建立敏感、特异、快速的检测登革Ⅱ型病毒(DENV-2)SYBR GreenⅠqRT-PCR方法。方法根据GenBank上发表的DENV-2株核苷酸序列,应用Primer Express 3.0软件在保守区设计特异性引物,优化SYBR GreenⅠ荧光定量PCR反应条件,利用Sanger测序... 目的建立敏感、特异、快速的检测登革Ⅱ型病毒(DENV-2)SYBR GreenⅠqRT-PCR方法。方法根据GenBank上发表的DENV-2株核苷酸序列,应用Primer Express 3.0软件在保守区设计特异性引物,优化SYBR GreenⅠ荧光定量PCR反应条件,利用Sanger测序验证该方法的特异性和敏感性。结果该方法与其他血清型登革病毒、流感病毒等均无交叉反应,最低检出20个病毒拷贝/μl RNA。检测14份已知阳性和阴性血清,结果与预期一致。结论本研究建立的DENV-2 SYBR GreenⅠqRT-PCR特异性强、敏感性高,可用于输入性DENV-2早期感染诊断。 展开更多
关键词 登革Ⅱ型病毒 SYBR GreenⅠ qRT—pcr 建立
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