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基于PML-IGVL边界条件的黏滞声波方程数值模拟
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作者 陈志立 汪勇 +3 位作者 桂志先 何幼娟 羊丹 年泽润 《石油地球物理勘探》 北大核心 2025年第2期392-401,共10页
地震勘探中的波动方程正演模拟受计算和存储能力的限制,只能在有限空间进行,需要对其设置边界条件。常用的完全匹配层(Perfect Match Layer,PML)是一种应用广泛的边界条件,需要对边界条件设定一定的层数,层数太大时会降低正演速度和增... 地震勘探中的波动方程正演模拟受计算和存储能力的限制,只能在有限空间进行,需要对其设置边界条件。常用的完全匹配层(Perfect Match Layer,PML)是一种应用广泛的边界条件,需要对边界条件设定一定的层数,层数太大时会降低正演速度和增大内存存储。因此,文中通过将PML边界条件和改进后的梯度黏弹边界(Improved Gradient Viscoelastic Layer,IGVL)结合提出一种PML-IGVL边界条件,同时,为了减少截断误差和数值频散,将PML-IGVL边界条件应用于紧致交错网格的黏滞声波方程中进行数值模拟。均匀介质和Marmousi模型中的波场数值模拟结果表明,相对于PML边界条件,PML-IGVL边界条件使用的边界厚度更小,在相同较低边界层数下,能更好地吸收反射波,同时能节省更多的存储空间,并提高正演效率,证明了PML-IGVL边界条件的有效性和优越性,是正演模拟中一种有效的边界吸收方法。 展开更多
关键词 紧致交错有限差分 黏滞声波方程 数值模拟 pml边界条件 改进梯度黏弹边界 pml-IGVL边界条件
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PML::RARα融合蛋白对白介素6受体的转录调控研究
2
作者 赵玲玲 崔灿琦 糜坚青 《内科理论与实践》 2025年第2期146-151,共6页
目的:探讨PML::RARα融合蛋白对白介素6受体(interleukin-6 receptor,IL-6R)的调控机制,及IL-6R对急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)细胞增殖和分化的影响。方法:采用GSE12662和GSE10358数据集分析APL细胞中IL-6... 目的:探讨PML::RARα融合蛋白对白介素6受体(interleukin-6 receptor,IL-6R)的调控机制,及IL-6R对急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)细胞增殖和分化的影响。方法:采用GSE12662和GSE10358数据集分析APL细胞中IL-6R的表达水平;采用逆转录实时定量PCR(reverse transcription quantitative real-time PCR,RT-qPCR)检测全反式维A酸(all-trans retinoic acid,ATRA)处理前后的NB4细胞及Zn^(2+)诱导前后PR9细胞中IL-6R的mRNA表达;通过染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)-seq数据分析、ChIPqPCR实验及双荧光素酶报告基因活性检测,研究PML::RARα对IL-6R的调控机制;构建IL-6R过表达质粒并通过逆转录病毒转染至NB4细胞,利用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)实验检测细胞增殖,流式细胞术检测NB4细胞的分化情况。结果:GSE12662数据集分析结果显示,APL患者早幼粒细胞中IL-6R的表达水平(12.20±0.41)显著低于正常早幼粒细胞(13.14±0.47,t=4.289,P<0.001)和中性粒细胞(14.82±0.40,t=12.35,P<0.001);GSE10358数据集分析结果显示,APL患者白血病细胞中IL-6R表达水平(5.93±0.84)显著低于非APL急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者(6.50±0.87,t=3.91,P<0.001)。APL患者细胞中IL-6R表达受PML::RARα融合蛋白的抑制,在APL中呈低表达模式,其机制为PML::RARα直接结合在IL-6R启动子区域,从而抑制其转录。在APL细胞株NB4中过表达IL-6R后,细胞增殖显著被抑制,转染4 d后,CCK-8检测到的吸光度值分别为0.86±0.01和0.40±0.01(t=32.66,P<0.001);同时细胞分化显著增强,CD11b阳性细胞比例由(3.10±1.22)%升高至(14.4±1.11)%(t=11.84,P<0.001)。结论:IL-6R是PML::RARα的靶基因,PML::RARα通过直接结合IL-6R启动子抑制其转录;明确IL-6R通过抑制APL细胞增殖并诱导其部分分化发挥其生物学功能。 展开更多
关键词 白介素6受体 急性早幼粒细胞白血病 pml::RARα 细胞增殖 细胞分化
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基于MC-PML的二维Rayleigh波正演模拟及频散特征分析 被引量:2
3
作者 杜兴忠 黄金强 +3 位作者 胡昌荣 宋绍飞 高国超 金宗玮 《地球物理学进展》 CSCD 北大核心 2024年第2期542-560,共19页
Rayleigh波正演模拟是认识Rayleigh波传播规律的重要手段,也是Rayleigh波反演的基础.然而,在浅地表高泊松比地质体的Rayleigh波正演模拟中,应力镜像与二阶速度展开的自由表面处理方法配合传统的C-PML技术会产生严重的数值不稳定问题.为... Rayleigh波正演模拟是认识Rayleigh波传播规律的重要手段,也是Rayleigh波反演的基础.然而,在浅地表高泊松比地质体的Rayleigh波正演模拟中,应力镜像与二阶速度展开的自由表面处理方法配合传统的C-PML技术会产生严重的数值不稳定问题.为此,本文首先从弹性波动方程出发,基于应力镜像与二阶速度展开法,推导了自由边界条件下应力分量与速度分量的更新公式;然后再借助MC-PML边界条件处理模型左右两边和底部的人工截断边界,以确保自由边界与吸收边界耦合区域的计算稳定;最终采用GPU并行编程架构,实现了基于MC-PML的Rayleigh波正演模拟技术.通过四组典型模型试验及频散分析结果表明:应力镜像与二阶速度展开的自由表面处理方法结合MC-PML技术能够准确刻画Rayleigh波传播规律,MC-PML技术不受自由表面影响,未见数值不稳定,频散能量谱的峰值连线与理论频散曲线的高度一致性进一步证实本文Rayleigh波正演模拟所采用的关键处理技术是正确的. 展开更多
关键词 RAYLEIGH波 正演模拟 高泊松比 C-pml MC-pml 频散
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抗PML抗体免疫荧光法快速诊断急性早幼粒细胞白血病
4
作者 秦亚溱 喻新建 +1 位作者 刘艳荣 陈珊珊 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1998年第1期76-78,共3页
对35例白血病病人骨髓标本进行抗PML抗体免疫荧光测定。19例急性早幼粒细胞白血病(APL)标本中,11例未治、3例服ATRA4天以内,以及3例复发病人均为典型APL荧光表现,2例ATRA诱导完全缓解APL病人荧光表现为非APL型。16例未治的非APL病人均... 对35例白血病病人骨髓标本进行抗PML抗体免疫荧光测定。19例急性早幼粒细胞白血病(APL)标本中,11例未治、3例服ATRA4天以内,以及3例复发病人均为典型APL荧光表现,2例ATRA诱导完全缓解APL病人荧光表现为非APL型。16例未治的非APL病人均为典型非APL表现。研究结果表明,抗PML抗体免疫荧光法简便、快速、特异,适于诊断未治和复发的APL病人。 展开更多
关键词 pml抗体免疫荧光法 急性早幼粒细胞白血病 pml蛋白 pml/RARa融合蛋白
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基于ADE-PML方法的快速计算目标电磁场分布研究
5
作者 叶文娟 《科技创新与应用》 2024年第5期12-15,共4页
在电磁场分布计算领域,目标的电磁分布计算是一个重要且复杂的问题。目前,常用的计算方法有有限元法、有限差分法、时域积分方程法等。这些方法都有各自的优缺点,但是无论哪种方法都需要进行离散化、求解和后处理等,存在计算量大、计算... 在电磁场分布计算领域,目标的电磁分布计算是一个重要且复杂的问题。目前,常用的计算方法有有限元法、有限差分法、时域积分方程法等。这些方法都有各自的优缺点,但是无论哪种方法都需要进行离散化、求解和后处理等,存在计算量大、计算时间长、计算精度低等问题。为了解决这些问题,一些新的计算方法被提出,如自适应离散化误差修正技术,自适应边界条件技术等。这些技术能够有效地提高计算精度和计算效率,但是在具体工程应用中,仍然存在一些问题,例如处理复杂目标的电磁场分布计算难度仍然较大、计算时间较长等。通过基于ADE-PML方法研究快速计算复杂目标的电磁场分布,进一步提高电磁场分布计算效率,有助于复杂目标电磁分布工程应用分析。 展开更多
关键词 ADE-pml 快速 电磁场 分布 计算效率
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PML与其他高级语言的互操作分析
6
作者 谭冬 唐志广 《船舶标准化工程师》 2024年第1期46-49,共4页
为弥补可编程的宏语言(Programmable Macro Language,PML)在创建图形用户界面(Graphical User Interface,GUI)与操作系统交互等方面的不足,对一种通过中间件程序集连接PML和其他高级语言,利用互操作拓展PML功能的思路和方法进行介绍。... 为弥补可编程的宏语言(Programmable Macro Language,PML)在创建图形用户界面(Graphical User Interface,GUI)与操作系统交互等方面的不足,对一种通过中间件程序集连接PML和其他高级语言,利用互操作拓展PML功能的思路和方法进行介绍。研究表明:利用C#开发的动态链接库(Dynamic Link Library,DLL)可为PML程序生成优质的用户界面,并能将后台连接至数据库。研究成果可为PML的拓展与交互提供一定参考。 展开更多
关键词 pml 互操作 AM二次开发 C#
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PML翻译后修饰在肿瘤细胞中的研究进展 被引量:2
7
作者 黄倩 林雪平 +1 位作者 潘巍巍 刘胜兵 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1532-1536,共5页
早幼粒细胞白血病(promyelocytic leukemia,PML)基因最初被发现于急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)中,在大部分APL病例中发现染色体异位t(15;17),即17号染色体上的维甲酸受体α(retinoic acid recept... 早幼粒细胞白血病(promyelocytic leukemia,PML)基因最初被发现于急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)中,在大部分APL病例中发现染色体异位t(15;17),即17号染色体上的维甲酸受体α(retinoic acid receptor α,RARα)基因与位于15号染色体上的PML基因相互异位,产生新的融合蛋白PML-RARα,这种融合蛋白在APL中发挥重要的作用[1]。PML蛋白又称TRIM19,属于三重基序蛋白(tripartite motif,TRIM)家族成员,有6个细胞核亚型和1个胞质亚型[2]。TRIM家族蛋白由1个锌指结构域、1个或2个B-box 基序、1个螺旋-卷曲-卷曲结构域构成,也叫RBCC(ring, B-box and coiled-coil)家族蛋白3],PML蛋白有3个富集半胱氨酸的锌指结构域和1个螺旋-卷曲-卷曲结构域,这些结构域共同形成RBCC模块。PML核小体 (PML nuclear bodies,PML-NBs) 是核基质相关结构域,PML-NBs在多数细胞核中以点状分布(直径为0.1~1 μm), 展开更多
关键词 pml蛋白 pml核小体 SUMO化 磷酸化
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雄黄对NB4和HL-60细胞的形态,PML mRNA及蛋白的表达影响 被引量:24
8
作者 钟璐 陈芳源 +2 位作者 韩洁英 邵念贤 欧阳仁荣 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2001年第3期223-227,共5页
本研究以NB4 ,HL 60细胞为研究对象 ,采用Wright′s染色法及荧光染色法、免疫荧光技术及RT PCR法 ,探讨雄黄对NB4 ,HL 60细胞的形态、PMLmRNA及蛋白的表达影响。结果发现 :①经雄黄处理后 ,各组均出现细胞凋亡的形态学上改变。②雄黄处... 本研究以NB4 ,HL 60细胞为研究对象 ,采用Wright′s染色法及荧光染色法、免疫荧光技术及RT PCR法 ,探讨雄黄对NB4 ,HL 60细胞的形态、PMLmRNA及蛋白的表达影响。结果发现 :①经雄黄处理后 ,各组均出现细胞凋亡的形态学上改变。②雄黄处理后NB4细胞内融合蛋白降解 ,PML蛋白聚积于POD结构 ,随后降解 ;在HL 60细胞中PML蛋白发生相似改变。③雄黄处理后各组细胞PMLmRNA表达均无显著影响。结论指出 ,在雄黄诱导下PML在蛋白水平参与诱导白血病细胞凋亡机制 ,雄黄能诱导NB4 ,HL 60细胞凋亡 。 展开更多
关键词 雄黄 NB4细胞 HL-60细胞 pml蛋白 早幼粒细胞白血病 急性粒细胞白血病
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稀疏存储的显式有限元三角网格地震波数值模拟及其PML吸收边界条件 被引量:33
9
作者 刘有山 滕吉文 +1 位作者 刘少林 徐涛 《地球物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第9期3085-3099,共15页
有限元法是复杂介质地震模拟的有力工具,它能比较客观地反映地震波的传播,比较细致地再现地震图像.但是,为了获得较精确的结果,有限元法模拟地震波的传播需要的网格点数多,具有计算量大和消耗内存多的缺点.针对上述缺点,本文对刚度矩阵... 有限元法是复杂介质地震模拟的有力工具,它能比较客观地反映地震波的传播,比较细致地再现地震图像.但是,为了获得较精确的结果,有限元法模拟地震波的传播需要的网格点数多,具有计算量大和消耗内存多的缺点.针对上述缺点,本文对刚度矩阵采用压缩存储行(CSR)格式,以减少计算量并节省内存;采用集中质量矩阵得到对角的质量矩阵以提高有限元法(显式有限元)的计算效率;时间离散采用保能量的Newmark算法以提高有限元法的计算精度;采用变分形式(弱形式)的PML吸收边界条件对人工截断边界进行处理.通过与高精度的数值方法——谱元法的数值试验的对比表明,上述方法的引入可使有限元法在计算精度和计算效率方面均可取得比较显著的改进.为了获得相当的计算精度,相比于7阶谱元法,显式有限元法需要更精细的网格.然而,显式有限元法的计算速度比前者快近2倍,而内存需求仅为谱元法的1/4~1/6. 展开更多
关键词 显式有限元法 压缩存储行(CSR)格式 集中质量矩阵 Newmark算法 pml吸收边界条件 谱元法
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ATRA和雄黄对白血病细胞PML基因及蛋白表达的影响 被引量:25
10
作者 钟璐 陈芳源 +2 位作者 韩洁英 邵念贤 欧阳仁荣 《上海第二医科大学学报》 CSCD 2001年第2期106-109,133,共5页
目的探讨PML基因及蛋白在白血病细胞中的表达和细胞内分布定位。 方法经ATRA、雄黄处理后的NB4、HL - 60、K5 62细胞为研究对象 ,细胞形态学观察采用Wright s染色法及荧光染色法 ;PML蛋白细胞内分布定位采用免疫荧光技术 ;PMLmRNA表达... 目的探讨PML基因及蛋白在白血病细胞中的表达和细胞内分布定位。 方法经ATRA、雄黄处理后的NB4、HL - 60、K5 62细胞为研究对象 ,细胞形态学观察采用Wright s染色法及荧光染色法 ;PML蛋白细胞内分布定位采用免疫荧光技术 ;PMLmRNA表达采用RT -PCR法。 结果 1 ATRA处理后 ,NB4和HL - 60细胞形态学上出现分化表现 ,K5 62细胞无变化 ;经雄黄处理后 ,各组细胞形态学上均出现凋亡特征性改变。 2 ATRA处理后 ,NB4细胞内融合蛋白降解 ,PML蛋白恢复定位 ,HL - 60、K5 62细胞内PML蛋白定位分布无变化 ;雄黄处理后NB4细胞内融合蛋白降解 ,PML聚积于POD结构 ,随后降解 ;在HL - 60及K5 62细胞 ,PML发生相似改变。3 ATRA、雄黄处理后各组细胞PMLmRNA表达均无显著影响。 结论在不同诱导剂刺激下 ,PML基因在蛋白水平参与细胞终末分化及诱导白血病细胞凋亡机制 ;PML蛋白在POD中发挥诱导凋亡控制细胞生长的作用。 展开更多
关键词 pml ATRA 雄黄 NB4细胞 HL-60细胞 白血病 细胞凋亡 基因表达
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实时定量PCR检测46例初诊急性早幼粒细胞白血病患者PML/RARα mRNA的分子表达 被引量:10
11
作者 主鸿鹄 刘艳荣 +6 位作者 秦亚溱 李金兰 常艳 王亚哲 单福香 江滨 陆道培 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2007年第1期1-5,共5页
本研究探讨实时定量PCR(Q-PCR)检测PML/RARαmRNA的方法学,并对46例初诊急性早幼粒细胞白血病(APL)患者骨髓标本进行检测。构建PML/RARα的bcr1型和bcr3型转录本以及内参照abl基因转录本的阳性标准品质粒;利用ABI Prism7500型Q-PCR仪对4... 本研究探讨实时定量PCR(Q-PCR)检测PML/RARαmRNA的方法学,并对46例初诊急性早幼粒细胞白血病(APL)患者骨髓标本进行检测。构建PML/RARα的bcr1型和bcr3型转录本以及内参照abl基因转录本的阳性标准品质粒;利用ABI Prism7500型Q-PCR仪对46例初诊APL患者和40例非APL患者骨髓标本进行检测,PML/RARαmRNA定量结果以校正比值(NQ)表示,NQ=PML/RARαmRNA拷贝数/ABLmRNA拷贝数;应用四色流式细胞术检测免疫表型。结果显示,Q-PCR结果的日间差和日内差平均变异系数(CV)分别为1.58%和0·88%。可重复敏感度为可以检测5copies/100ng RNA。40例非APL患者PML/RARαmRNA均为阴性。46例初诊APL患者PML/RARαmRNA表达量NQ中位值为0.450(0.084-1.082)。比较32例bcr1型和14例bcr3型两组患者的特征表明,PML/RARαmRNA NQ中位值分别为0.454(0.084-1.082)和0.386(0.151-0.848)(P>0·05)。形态学诊断M3v的患者比例分别为9.40%和48.96%(P<0.05);初诊时WBC中位数分别为2.15(0.2-59.6)和9·35(0.91-122.8)(P<0.05),而在性别、年龄、初诊时血红蛋白和血小板计数、骨髓中APL细胞比例、DIC指标等方面无差异。流式细胞仪术检测时,CD45/SSC射门情况下,APL细胞群分布可以分为两类:高侧向角(L-SSC,粗颗粒)和非高侧向角(NL-SSC,细颗粒)两类。bcr1型患者中85.70%表现为L-SSC,而bcr3型患者中64·29%表现为NL-SSC。结论:建立的Q-PCR方法稳定可靠,敏感度高;bcr1型和bcr3型APL患者的PML/RARαmRNA表达量无差异,bcr3型APL患者中形态学M3v比例和WBC数比bcr1型患者高;PML/RARα不同转录本类型和免疫表型以及细胞形态学之间有一定的相关性。 展开更多
关键词 白血病 急性早幼粒细胞白血病 实时定量PCR pml/RARΑ
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弹性波正演模拟中PML吸收边界条件的改进 被引量:22
12
作者 秦臻 任培罡 +1 位作者 姚姚 张才 《地球科学(中国地质大学学报)》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第4期658-664,共7页
在弹性波有限差分正演模拟中,完全匹配层(PML)吸收边界条件是使用广泛、吸收效果最好的吸收边界条件.在目前的两种PML实现方法中,分裂形式的完全匹配层(SPML)方法计算存储量大、编程实现复杂;非分裂形式的完全匹配层(NPML)方法计算效率... 在弹性波有限差分正演模拟中,完全匹配层(PML)吸收边界条件是使用广泛、吸收效果最好的吸收边界条件.在目前的两种PML实现方法中,分裂形式的完全匹配层(SPML)方法计算存储量大、编程实现复杂;非分裂形式的完全匹配层(NPML)方法计算效率低、计算过程复杂.针对传统PML吸收边界条件在实现过程中存在的问题,推导出了一种简洁有效的非卷积实现的NPML吸收边界条件,既不需要对场分量进行分裂,也不需要做复杂的卷积运算.分析结果表明,本文实现的NPML吸收边界条件不仅具有良好的吸收衰减性能,而且计算方程简单,编程实现容易,占有内存更小. 展开更多
关键词 pml 吸收边界条件 弹性波 正演模拟 地球物理
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CFS-PML边界条件在PSTD算法中的实现与性能分析 被引量:13
13
作者 姜永金 毛钧杰 柴舜连 《微波学报》 CSCD 北大核心 2004年第4期36-39,共4页
文中将具有复频率参数的PML(CFS PML)边界条件引入到时域伪谱 (PSTD)算法中 ,并利用卷积PML(CPML)方法予以实现 ,CPML的吸收性能作为时间的函数被给出。与传统PML相比 ,该边界条件不仅可以吸收传播模 ,而且还可以吸收低频凋落模。仿真... 文中将具有复频率参数的PML(CFS PML)边界条件引入到时域伪谱 (PSTD)算法中 ,并利用卷积PML(CPML)方法予以实现 ,CPML的吸收性能作为时间的函数被给出。与传统PML相比 ,该边界条件不仅可以吸收传播模 ,而且还可以吸收低频凋落模。仿真结果也表明 ,CPML中参数α ,Kmax在一定范围内取值可使该边界的反射误差得到最小。 展开更多
关键词 pml 低频 频率参数 性能分析 算法 仿真结果 时域 边界条件 卷积 反射
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急性早幼粒细胞白血病PML/RARα异型的临床意义 被引量:8
14
作者 孙爱宁 周海侠 +3 位作者 吴德沛 王玮 金正明 仇惠英 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2005年第3期500-502,共3页
为评价急性早幼粒细胞白血病(APL)PML/RARα异型与临床治疗及预后的相关性,对71例诱导治疗的APL患者定期进行血像、骨髓像检查,用巢式RT-PCR检测PML/RARα不同转录本。结果表明:短型(S)和V型白细胞总数比长型(L型)显著升高,所以较易早... 为评价急性早幼粒细胞白血病(APL)PML/RARα异型与临床治疗及预后的相关性,对71例诱导治疗的APL患者定期进行血像、骨髓像检查,用巢式RT-PCR检测PML/RARα不同转录本。结果表明:短型(S)和V型白细胞总数比长型(L型)显著升高,所以较易早期发生严重的出血合并症。S型和V型PML/RARα患者的复发率高于L型患者。结论:APL患者PML/RARα异型可作为独立的预后因素。 展开更多
关键词 APL pml/RARα异型 白血病
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基于广角FD-BPM的PML边界处理方法 被引量:11
15
作者 林青春 肖悦娱 何赛灵 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第3期349-353,共5页
本文提出了基于三阶 Padé近似广角有限差分光束传输法 (FD- BPM)的简单有效的完美匹配层 (PML)边界处理方法 .分别给出了该方法应用于斜波导和多模干涉 (MMI)数值模拟的结果 ,并与用完全透明边界条件处理的模拟计算结果进行了比较 ... 本文提出了基于三阶 Padé近似广角有限差分光束传输法 (FD- BPM)的简单有效的完美匹配层 (PML)边界处理方法 .分别给出了该方法应用于斜波导和多模干涉 (MMI)数值模拟的结果 ,并与用完全透明边界条件处理的模拟计算结果进行了比较 .本文最后对基于广角 FD- BPM的 PML边界处理方法进行了优化 . 展开更多
关键词 完美匹配层 有限差光束传输光 广角传播 多模干涉 FD-BPM pml 边界处理 斜波导 数值模拟
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从石蜡包埋肺癌组织提取RNA检测PML基因转录的研究 被引量:6
16
作者 赵志龙 宗志红 +2 位作者 李建新 刘宏旭 赵惠儒 《中国肺癌杂志》 CAS 2008年第4期563-566,共4页
背景与目的甲醛固定石蜡包埋组织(FPE)包含大量临床病理信息,同时还含有大量的基因和蛋白物质可用来研究临床意义。本研究的目的是探讨从FPE中提取RNA的可能性,检测急性早幼粒细胞白血病基因(PML)在肺癌FPE中的转录表达。方法选取前期... 背景与目的甲醛固定石蜡包埋组织(FPE)包含大量临床病理信息,同时还含有大量的基因和蛋白物质可用来研究临床意义。本研究的目的是探讨从FPE中提取RNA的可能性,检测急性早幼粒细胞白血病基因(PML)在肺癌FPE中的转录表达。方法选取前期经免疫组织化学染色证实无PML蛋白表达的40例肺癌FPE,存档时间在60-85个月,5例新鲜冰冻肺腺癌组织作为对照;利用Trizol一步法提取RNA,经OD值检测验证RNA质量;RT-PCR检测PML的基因转录表达。结果自肺癌FPE和新鲜冰冻组织提取的RNA的OD比值在1.7-2.1。RT-PCR显示,40例FPE以及5例新鲜冰冻组织中,PML(295bp)以及β-actin(318bp)mRNA均有表达。结论利用Trizol一步法自FPE提取RNA进行RT-PCR,可有效扩增出300bp左右的产物;肺癌组织中PML蛋白存在转录后缺失。 展开更多
关键词 RNA提取 石蜡包埋组织 pml蛋白 RT-PCR 病理学
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地震波数值模拟的非规则网格PML吸收边界 被引量:32
17
作者 徐义 张剑锋 《地球物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第5期1520-1526,共7页
以格子法为基础,以声波方程为例研究非规则网格PML(Perfectly Matched Layer)方法.本方法的核心是建立局部坐标系下的分裂方程和基于积分近似的微分方程弱形式.该非规则网格模拟方法允许在计算域内设置任意形状的人工边界.对于二维半空... 以格子法为基础,以声波方程为例研究非规则网格PML(Perfectly Matched Layer)方法.本方法的核心是建立局部坐标系下的分裂方程和基于积分近似的微分方程弱形式.该非规则网格模拟方法允许在计算域内设置任意形状的人工边界.对于二维半空间问题,与采用矩形人工边界相比,采用半圆形人工边界可减少计算量20%以上.采用光滑的曲边界,不仅可减少计算区域,还可避免常规的PML吸收边界在吸收带角点区域的特殊处理.本方法事先计算和存储边界单元的局部几何参数,在计算的每一时间步查表调用这些参数,与常规的直边界PML方法相比,不增加任何计算量. 展开更多
关键词 格子法 非规则网格 pml 吸收边界 声波方程 地震波场模拟
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腺病毒E1B55ku癌蛋白打破hDaxx与PML在细胞核的共定位 被引量:8
18
作者 万艳平 谭立志 +3 位作者 刘传爱 吴移谋 Colosimo April 廖代清 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2001年第4期46-48,共3页
利用间接免疫荧光试验 ,通过Confocal激光扫描生物荧光显微镜和图像软件分析腺病毒 (adenovirus,Ad)E1B 5 5ku癌蛋白 (AdE1B 5 5ku)与人Daxx(humanDaxx ,hDaxx)在细胞核的定位关系 ,研究它对早幼粒细胞性白血病蛋白 (promyelocyticleuke... 利用间接免疫荧光试验 ,通过Confocal激光扫描生物荧光显微镜和图像软件分析腺病毒 (adenovirus,Ad)E1B 5 5ku癌蛋白 (AdE1B 5 5ku)与人Daxx(humanDaxx ,hDaxx)在细胞核的定位关系 ,研究它对早幼粒细胞性白血病蛋白 (promyelocyticleukemiaprotein ,PML)与hDaxx在细胞核定位关系的影响。实验结果表明 ,AdE1B 5 5ku与hDaxx共定位细胞核 ,并打破hDaxx与PML共定位于细胞核PML致癌结构域 (PMLoncogenicdomains,PODs) 展开更多
关键词 腺病毒E1B55ku癌蛋白 HDAXX pml 细胞核 共定位 感染
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PML-FDTD法在分析负折射率材料中的应用 被引量:6
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作者 宋磊 李康 +3 位作者 孔繁敏 庄桥 杨光杰 梅良模 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1422-1425,共4页
将时域有限差分(FDTD)法引入了对负折射率材料物理现象的仿真研究.给出了二维TM波在负折射率材料中的时域差分方程,并且在吸收边界处使用了理想匹配层(PML).为了避免在迭代过程中出现的不稳定现象,在差分方程的推导中引入了Drude模型,并... 将时域有限差分(FDTD)法引入了对负折射率材料物理现象的仿真研究.给出了二维TM波在负折射率材料中的时域差分方程,并且在吸收边界处使用了理想匹配层(PML).为了避免在迭代过程中出现的不稳定现象,在差分方程的推导中引入了Drude模型,并对Pendry提出的由负折射率材料构成的平板透镜具有的完美成像现象进行了数值仿真验证.由仿真结果发现,完美成像现象只在平板透镜的折射率n=-1时出现,当n≠-1时则会出现近轴聚焦效应. 展开更多
关键词 负折射率材料(DNG) 时域有限差分(FDTD)法 理想匹配层(pml) Drude模型
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实时定量RT-PCR检测急性早幼粒细胞白血病PML-RARa融合基因 被引量:7
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作者 郎丽 李惠民 +2 位作者 刘华 王义民 张学美 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2007年第4期714-719,共6页
本研究旨在建立用实时定量RT-PCR检测急性早幼粒细胞白血病(APL)PML-RARa mRNA的方法,探讨APLPML-RARa融合基因表达水平与疗效的关系。用RT-PCR扩增培养的NB4细胞的PML-RARa融合基因,取1μgNB4细胞的总cDNA进行10倍的梯度稀释,作为标准... 本研究旨在建立用实时定量RT-PCR检测急性早幼粒细胞白血病(APL)PML-RARa mRNA的方法,探讨APLPML-RARa融合基因表达水平与疗效的关系。用RT-PCR扩增培养的NB4细胞的PML-RARa融合基因,取1μgNB4细胞的总cDNA进行10倍的梯度稀释,作为标准品,建立荧光定量RT-PCR方法,对方法的灵敏性、稳定性、重复性进行了测定。定量检测4例急性早幼粒细胞白血病(APL)患者治疗前后骨髓内PML-RARa融合基因转录本水平,并对1例经治疗完全缓解后又复发的患者PML-RARa转录本水平(拷贝数)进行动态监测。结果表明:用本研究建立的实时定量RT-PCR方法可检测出10-5μgNB4细胞cDNA中的PML-RARa融合基因,其重复性的CT值,管间、批间变异系数(CV)分别为2.1%、3.8%。4例患者初治骨髓PML-RARa基因转录本水平的分别为1884、5533、1803、4677拷贝,平均为3475拷贝。经ATRA+化疗治疗后其PML-RARa基因转录水平下降至40、135、79、229拷贝,平均为121拷贝。还有1例患者治疗前PML-RARa基因转录本水平为8600拷贝,经过4个月治疗,虽然此时患者处于完全缓解期,但其转录水平拷贝数仍有730。3个月后患者出现复发,转录本水平升至为11000拷贝。经过ATRA+化疗治疗后转录本水平又逐渐下降至1200拷贝。结论;建立的实时定量RT-PCR灵敏、重复性好。治疗后APL患者的PML-RARa融合基因转录本水平明显下降,复发时基因转录本水平又升高。融合基因表达水平的改变与临床疾病进展关系一致,这有助于监测白血病微小残留病,评价疗效及判断预后。 展开更多
关键词 实时定量RT-PCR 急性早幼粒细胞白血病 pml/RARa融合基因 微小残留病灶
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