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题名水稻OsUVR8基因电子克隆及生物信息学分析
被引量：3
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作者
鲍思元
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机构
湖北科技学院基础医学院
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出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第2期169-175,139,共8页
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文摘
[目的]获得水稻Os UVR8基因的编码区序列,并进行生物信息学分析。[方法]以拟南芥UVR8蛋白的氨基酸序列作为查询探针,用电子克隆的方法获得Os UVR8基因的编码区序列;用生物信息学软件对Os UVR8蛋白进行预测和分析。[结果]Os UVR8基因有13个外显子,编码区序列长1 764 bp,编码587个氨基酸。Os UVR8蛋白分子量为62132.7 Da,理论等电点为5.87,含有41个芳香族氨基酸,比较稳定,为亲水性蛋白。无规则卷曲是主要的二级结构,其次是延伸链。位于细胞内叶绿体、线粒体之外的区域。具有9个RCC1重复。有35个磷酸化位点,19个O-β-葡萄糖糖基化位点,6个Yin-Yang位点。三级结构与拟南芥UVR8蛋白三级结构相似。[结论]获得了水稻Os UVR8基因的编码区序列并进行了生物信息学分析。
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关键词
水稻
UV-B光受体
UVR8
osuvr8
生物信息学分析
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Keywords
rice
UV-B photoreceptor
UVR8
osuvr8
bioinformatics analysis
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分类号
S188
[农业科学—农业基础科学]
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