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分离自黑茶的散囊菌属真菌中的NRPS基因的检测和分布 被引量:9
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作者 王晗 王永 +1 位作者 纪燕玲 王志伟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期464-475,共12页
【目的】检测源自黑茶的散囊菌属分离菌株中的NRPS基因,推测它们相应的次级代谢产物合成能力,并考察了基于NRPS基因分布特征进行散囊菌属真菌遗传多样性分析的可能性。【方法】运用IQS法提取来自湖南、四川和湖北等地黑茶样品的14株散囊... 【目的】检测源自黑茶的散囊菌属分离菌株中的NRPS基因,推测它们相应的次级代谢产物合成能力,并考察了基于NRPS基因分布特征进行散囊菌属真菌遗传多样性分析的可能性。【方法】运用IQS法提取来自湖南、四川和湖北等地黑茶样品的14株散囊菌(Eurotium spp.)菌株的总DNA,利用特异性引物对菌株中11种NRPS基因片段进行PCR检测和序列分析,并结合UPGMA法分析了NRPS基因的分布。【结果】各菌株分别含有4 10个NRPS基因片段。NRPS7、CPS1基因在所有菌株中都可以检测到,而NRPS2、NRPS6基因则仅在个别菌株中检测到;其它NRPS基因的分布则呈现出多样性。来自同一块砖茶的菌株Fw-30813-7、Fw-30813-4、Fw-30813-1和Fw-30925-5之间,NRPS1、NRPS2、NRPS3、NRPS4和NRPS8五个基因的分布存在差异,显示出黑茶内散囊菌的遗传多样性。来自湖南白沙溪茶厂的茯砖样品的菌株Fa-20719-3不含有NRPS5和NRPS8基因;而从湖南益阳茶厂茯砖茶7个分离菌株中均含有这两种基因。不同地点加工出来的黑茶样品中的散囊菌菌株之间存在一些明显的遗传差异。【结论】首次从我国黑茶中的散囊菌属分离菌株中检测到NRPS基因,并推测了NRPS产物的多样性,展示了其多样化分布特征,提示NRPS基因的分析有可能成为衡量散囊菌遗传多样性的另一个尺度。 展开更多
关键词 黑茶 散囊菌属 nrps基因 分布特征
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海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组新颖PKS和NRPS基因簇的发掘 被引量:5
2
作者 房耀维 刘姝 +5 位作者 王淑军 吕明生 焦豫良 陈国强 潘建梅 牛军 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期48-57,共10页
利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖PKS和NRPS基因簇,并初步预测基因簇对应产物,为新颖聚酮化合物的发现,基因簇的异源表达和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造提供信息。... 利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖PKS和NRPS基因簇,并初步预测基因簇对应产物,为新颖聚酮化合物的发现,基因簇的异源表达和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造提供信息。在利用anti SMASH对S.arenicola CNS 205和S.arenicola CNP193次级代谢产物基因簇进行预测,并经过NRPS-PKS knowledgebase验证的基础上,以S.arenicola CNS 205基因簇为对照,初步选择新颖基因簇;进一步用NCBI Blast和Nap Dos分析判断基因簇的新颖性后获得3个新颖基因簇:基因簇7,基因簇10和基因簇20。结合anti SMASH对基因簇核心结构的预测和与已知功能同源性基因簇,NCBI Blast比对的同源序列,以及Nap Dos对个基因簇中KS domain和C domain的进化分析等信息,初步表明基因簇7和基因簇20的对应产物分别为烯二炔类和有半胱氨酸及其他氨基酸参与合成的肽类化合物。由于基因簇10得到的信息较少,不能预测其代谢产物。 展开更多
关键词 基因簇发掘 新颖PKS基因簇 新颖nrps基因簇 产物预测
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哈茨木霉基因组中NRPS基因多样性的生物信息学分析 被引量:5
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作者 原晓龙 赵能 +3 位作者 陈剑 王娟 杨宇明 王毅 《西部林业科学》 CAS 2017年第4期7-12,17,共7页
为了解哈茨木霉中非核糖体肽的生物合成,本文通过本地BLAST、结构域分析结合抗生素和次生代谢产物分析软件(antiSMASH)、天然产物结构域查找软件(NaPDoS)等次生代谢产物生物合成基因分析工具对哈茨木霉基因组中的非核糖体肽合成酶NRPS... 为了解哈茨木霉中非核糖体肽的生物合成,本文通过本地BLAST、结构域分析结合抗生素和次生代谢产物分析软件(antiSMASH)、天然产物结构域查找软件(NaPDoS)等次生代谢产物生物合成基因分析工具对哈茨木霉基因组中的非核糖体肽合成酶NRPS基因进行分析,通过本地BLAST获得42个可能具有NRPS基因的重叠群(contig),开放阅读框及结构域分析显示具A-T-C(A为腺苷酰化结构域、T为肽酰基载体蛋白结构域,又称为PCP结构域、C为缩合结构域)3个结构域的蛋白序列有21条;antiSMASH分析结果显示其基因组中合成NRPs的基因簇有10个;NaPDoS和聚类分析结果表明哈茨木霉中的NRPS基因催化合成的NRPs包括铁载体类、毒素类、抗生素类及一些未知化合物。 展开更多
关键词 哈茨木霉 基因组发掘 nrps基因多样性 生物信息学分析
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长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定 被引量:3
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作者 原晓龙 陈剑 +3 位作者 张传光 毕玮 王娟 王毅 《西部林业科学》 CAS 2016年第1期14-20,24,共8页
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、... 非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示Us NRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示Us NRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT-PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。 展开更多
关键词 长松萝 nrps 基因克隆 生物信息学分析 分子系统进化分析 诱导表达
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PKS-NRPS数据库的研究进展 被引量:8
5
作者 姚琳 郭东林 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第16期280-283,共4页
非核糖体多肽合成酶(NRPS)和聚酮合成酶(PKS)是调控次级代谢物聚酮类物质和非核糖体多肽合成的关键酶。据推测,至少有1000种聚酮/多肽化合物已经被发现,理论分析表明超过10亿的化合物能被合成。目前,国外通过高通量筛选、计算机预测-文... 非核糖体多肽合成酶(NRPS)和聚酮合成酶(PKS)是调控次级代谢物聚酮类物质和非核糖体多肽合成的关键酶。据推测,至少有1000种聚酮/多肽化合物已经被发现,理论分析表明超过10亿的化合物能被合成。目前,国外通过高通量筛选、计算机预测-文献挖掘等方法,获得了大批量的PKS/NRPS基因及化合物结构,并由此构建和开发了一些PKS/NRPS数据库和软件,作者分析了这些数据库包括Norine、NRPS-PKS、ASMPKS和软件Cluscan、Clusean的相关信息及并概述了这些数据库及软件的应用。 展开更多
关键词 PKS nrps 数据库 生物信息学
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1个含有SDR结构域PKS/NRPS基因的克隆 被引量:1
6
作者 原晓龙 李娟 +1 位作者 李云琴 王毅 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1247-1253,共7页
聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中... 聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中分离得到1个PKS/NRPS基因(命名Bbpks2),利用生物信息学分析对其功能进行预测并检测该基因在以6.0 g·L^-1麦芽提取物和3.0 g·L^-1酵母提取物为基本氮源培养基,7种碳源添加物和以1.8 g·L^-1麦芽糖和6.0 g·L^-1葡萄糖为基本碳源培养基,4种氮源添加物培养基上的具体表达情况,其中每种添加物含量为4.0 g·L^-1。结果显示:Bbpks2基因长度为12 051 bp,编码4 016个氨基酸;其结构域组织顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR,是一种含有SDR结构域的PKS/NRPS;系统进化分析发现,BbPKS2与球孢白僵菌JEF007菌株(PMB64475.1)、头状虫草Tolypocladium capitatum(PNY25600.1)等的PKS/NRPS蛋白聚在同个分支中,可能参与一种聚酮/非核糖体多肽类化合物的生物合成;比较不同氮源、碳源添加物对Bbpks2基因表达的影响,发现该基因在添加了乳糖的培养基上的表达量是其他碳源添加物的3.4倍以上,添加了牛肉浸粉的培养基上表达量是其他氮源添加物的1.3倍以上。该研究为下一步通过异源表达鉴定Bbpks2基因的具体功能,及其调控机理研究和基因资源利用奠定基础。 展开更多
关键词 森林保护学 球孢白僵菌 杂合PKS/nrps 生物信息学分析
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海洋放线菌NRPS基因的筛选 被引量:3
7
作者 陈路劼 赵薇 +3 位作者 林如 谢阳 江红 连云阳 《海峡药学》 2012年第9期240-243,共4页
目的建立快速、高效的NRPS基因筛选体系,从海洋微生物中筛选具有潜在合成多肽类次级代谢产物的活性菌株,为定向获得新的含氨基酸抗生素奠定基础。方法采用选择性培养分离获得海洋放线菌,通过快速抗菌活性初筛,设计特异性引物利用PCR技... 目的建立快速、高效的NRPS基因筛选体系,从海洋微生物中筛选具有潜在合成多肽类次级代谢产物的活性菌株,为定向获得新的含氨基酸抗生素奠定基础。方法采用选择性培养分离获得海洋放线菌,通过快速抗菌活性初筛,设计特异性引物利用PCR技术对初筛活性菌株进行NRPS基因筛选,进一步对阳性菌株进行16S rDNA排重。结果利用建立的NRPS基因筛选体系对初筛具有抗菌活性的295株放线菌进行筛选,得到12株阳性菌株,分别属于小单孢菌属、链霉菌属和疣孢菌属。结论利用PCR技术建立了快速、高效的NRPS基因筛选体系,为多肽类活性化合物的获得提供了基因学的依据。 展开更多
关键词 海洋放线菌 nrps 基因筛选
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福建、陕西两地荧光假单胞菌NRPS基因的多态性
8
作者 陈天君 孙燕 +2 位作者 苏春 李治 魏冉 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期77-81,共5页
在环脂肽NRPS基因C1、Te保守区各设计一对引物,利用PCR技术,从福建和陕西两地的土样中筛选携带环脂肽NRPS基因的荧光假单胞菌,运用SSCP、酶切分型的方法分析NRPS基因的多态性。结果显示,福建、陕西两地菌株的C1和Te保守区经SSCP电泳后... 在环脂肽NRPS基因C1、Te保守区各设计一对引物,利用PCR技术,从福建和陕西两地的土样中筛选携带环脂肽NRPS基因的荧光假单胞菌,运用SSCP、酶切分型的方法分析NRPS基因的多态性。结果显示,福建、陕西两地菌株的C1和Te保守区经SSCP电泳后所得的条带数均有3、5、7带型,且条带位置有差异。据统计,两地C1区均有10个分型,Te区总计10个分型。其中福建菌株Te区有9个分型,无SSCP-10型;陕西菌株Te区有8个分型,无SSCP-2、SSCP-4型。用限制性内切酶HinfⅠ和SphⅠ对NRPS基因Te区进行酶切,福建菌种Te区扩增产物的酶切产物分为15种,陕西菌种Te区的酶切产物分为11种。表明荧光假单胞菌NRPS基因具有多种形态,且不同地区的类型分布有所差异。相较之下,福建菌株的NRPS基因多样性更好,更有可能获得活性较强或产新型环脂肽的菌株。 展开更多
关键词 荧光假单胞菌 环脂肽 nrps基因 多态性
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球孢白僵菌非核糖体多肽合成酶基因BbNRPS的克隆与鉴定
9
作者 李娟 原晓龙 +1 位作者 虞泓 王毅 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期3519-3523,共5页
真菌非核糖体多肽通常具有多种生物学活性。本研究从球孢白僵菌基因组中挖掘出其非核糖体多肽合成酶基因(BbNRPS),克隆获得其全长c DNA,并对该基因进行生物信息学和表达谱分析。结果显示,BbNRPS基因cDNA开放阅读框总长4194 bp,编码1397... 真菌非核糖体多肽通常具有多种生物学活性。本研究从球孢白僵菌基因组中挖掘出其非核糖体多肽合成酶基因(BbNRPS),克隆获得其全长c DNA,并对该基因进行生物信息学和表达谱分析。结果显示,BbNRPS基因cDNA开放阅读框总长4194 bp,编码1397个氨基酸残基,BLAST比对发现其包含A-T-C结构域;SignalP显示其为分泌蛋白,位于细胞质基质。系统发育显示BbNRPS蛋白序列与其他合成铁载体SidC的NRPS聚为一类,推测其合成铁载体。表达谱显示,肌糖能促进BbNRPS基因的表达。该研究为球孢白僵菌NRPS基因的挖掘提供参考。 展开更多
关键词 球孢白僵菌 nrps 克隆
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携带NRPS基因的新疆嗜盐放线菌抑菌活性筛选
10
作者 张飞 吕玲玲 +1 位作者 万传星 张利莉 《塔里木大学学报》 2014年第1期1-5,共5页
为了筛选具有抗生素产生潜能的放线菌菌株,以金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),表皮葡萄球菌(Staphylococcus pidermidis),大肠杆菌(Escherichia coli),白色念珠菌(Candida albican),热带念珠菌(Candida tropicalis)和克柔氏念珠... 为了筛选具有抗生素产生潜能的放线菌菌株,以金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),表皮葡萄球菌(Staphylococcus pidermidis),大肠杆菌(Escherichia coli),白色念珠菌(Candida albican),热带念珠菌(Candida tropicalis)和克柔氏念珠菌(Candida krusei)为靶标菌,采用牛津杯法对48株携带NRPS基因的放线菌发酵液甲醇和乙酸乙酯萃取相进行了抑菌活性筛选。结果表明:共有18株菌表现出抑菌活性,其中抗金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的有15株,抗白色念珠菌的有10株,抗大肠杆菌的有3株;18株菌分属于放线多孢菌属(Actinopolyspora),拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)和链霉菌属(Streptomyces);且18株菌中有16株含有两种以上抗生素合成基因。菌株发酵液抗G+细菌的抑菌活性部位在乙酸乙酯萃取相中,抗白色念珠菌和大肠杆菌的抑菌活性部位在甲醇相中。 展开更多
关键词 放线菌 nrps 抗菌活性筛选
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禾本科植物内生真菌研究20:基于NRPS5基因的我国东部早熟禾亚科植物内生真菌系统发育学分析 被引量:1
11
作者 郭萍 王冠华 +2 位作者 纪燕玲 于汉寿 王志伟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期2200-2208,共9页
【背景】冷季型禾草-Epichloae真菌内生共生体在我国广泛存在,Epichloae内生真菌具有遗传多样性。【目的】选取来自江苏、山东和安徽等6省共8地的早熟禾亚科植物中的21个Epichlo?sp.菌株,检测菌株的NRPS5基因;分析不同宿主内Epichlo?属... 【背景】冷季型禾草-Epichloae真菌内生共生体在我国广泛存在,Epichloae内生真菌具有遗传多样性。【目的】选取来自江苏、山东和安徽等6省共8地的早熟禾亚科植物中的21个Epichlo?sp.菌株,检测菌株的NRPS5基因;分析不同宿主内Epichlo?属内生真菌NRPS5基因多样性。【方法】提取Epichlo?spp.菌株DNA,利用特异性引物对菌株中NRPS5基因进行PCR检测和序列分析,并基于NRPS5基因构建最大简约法系统发育树。【结果】NRPS5基因可能广泛分布于我国东部冷季型禾本科植物Epichloae内生真菌中。在同种内生真菌和同一宿主(除鹅观草)中的不同种内生真菌中NRPS5基因相对保守,但不同宿主的内生真菌其碱基序列差异大,与宿主植物采集地点、采集时间和子座的有无均无相关性,NRPS5基因的差异主要与宿主植物有关。这说明NRPS5基因序列比较保守,推测属于NRPS蛋白的功能核心区。【结论】NRPS5基因序列相对保守,可作为真菌遗传多样性分析的一种辅助手段。 展开更多
关键词 nrps5基因 Epichloae 早熟禾亚科植物 遗传多样性
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链霉菌聚酮类化合物和非核糖体多肽的生物合成及菌株育种研究进展
12
作者 邹超 孙博 +3 位作者 宋佳 刘宽博 张万忠 赵晨 《生物学杂志》 北大核心 2025年第5期103-110,共8页
链霉菌(Streptomyces)作为一种重要的微生物类群,能够产生多种天然产物,包括抗癌、抗病毒、抗真菌和抗寄生虫等活性物质,在医药、农业及化工等领域发挥着重要作用。链霉菌的次级代谢产物主要包括聚酮类化合物和非核糖体多肽。由于链霉... 链霉菌(Streptomyces)作为一种重要的微生物类群,能够产生多种天然产物,包括抗癌、抗病毒、抗真菌和抗寄生虫等活性物质,在医药、农业及化工等领域发挥着重要作用。链霉菌的次级代谢产物主要包括聚酮类化合物和非核糖体多肽。由于链霉菌的代谢网络和调控机制极为复杂,加之其生物合成基因簇在大多数环境下都处于沉默状态,导致天然产物的产量较低,限制了其工业化生产的应用。因此,研究如何通过激活沉默的生物合成基因簇以及采用分子生物学育种策略来提高天然产物的产量具有重要意义。针对在农业方面具有重要应用价值的次级代谢产物,主要介绍链霉菌聚酮类化合物和非核糖体多肽的生物合成途径,综述诱变选育、碳、氮、磷代谢通路改造及异源表达等近年来提高链霉菌天然产物产量的方法,并展望结合高通量筛选及计算机预测的研究方向。以期为提高链霉菌次级代谢产物的研究提供参考,为新型聚酮类化合物和非核糖体多肽的开发与应用提供基础。 展开更多
关键词 链霉菌 PKS系统 nrps系统 异源表达 碳、氮、磷代谢通路改造 诱变育种
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抗菌和细胞毒活性海洋细菌的筛选及其次生代谢基因证据 被引量:13
13
作者 朱鹏 郑立 +2 位作者 林晶 邵健忠 严小军 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期228-234,共7页
从不同海域的海水、海泥和海洋生物中分离海洋细菌,利用琼脂扩散法和MTT法对细菌培养液的乙酸乙酯提取物进行了抗菌和细胞毒活性筛选,并对具有细胞毒活性的细菌菌株进行了16SrRNA系统发生学分析和多聚酮合酶(PKSⅠ型)、非核糖体肽合成酶... 从不同海域的海水、海泥和海洋生物中分离海洋细菌,利用琼脂扩散法和MTT法对细菌培养液的乙酸乙酯提取物进行了抗菌和细胞毒活性筛选,并对具有细胞毒活性的细菌菌株进行了16SrRNA系统发生学分析和多聚酮合酶(PKSⅠ型)、非核糖体肽合成酶(NRPS)的筛选。结果显示,在分离到的346株海洋细菌中,42株细菌具有抗菌活性,12株具有细胞毒活性。对12株具有细胞毒活性的细菌菌株进行了16SrRNA系统发生学分析,它们分别属于Agrobacterium,Pseudoalteromons,Bacillus,Paracoccus,Rheinheimera,Aerococcus,Exiguobacterium和Alteromonas8个属。对这12株具有细胞毒活性的细菌菌株进行进一步的PKS和NRPS筛选,得到了4株含有PKSⅠ型的KS结构域或NPRS的A结构域的海洋细菌,为从聚酮和非核糖体肽等生物合成途径去深入研究其次生代谢产物提供了基因学的证据。 展开更多
关键词 海洋细菌 抗菌 细胞毒 16S rRNA 多聚酮合酶(PKS) 非核糖体肽合成酶(nrps)
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禾本科植物内生真菌研究13:禾本科植物内生真菌的分离鉴定及基因组DNA的快速提取 被引量:5
14
作者 王永 纪燕玲 +2 位作者 王晗 陈永敢 王志伟 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期52-56,共5页
调查我国7省12个不同地区的禾本科植物内生真菌,经分离、培养后鉴定得到2种Epichlo属和4种Neotyphodium属内生真菌。采用改良的QS(improved quick and safe,IQS)法进行禾本科植物内生真菌基因组DNA的提取,并通过PCR进行验证。以生长... 调查我国7省12个不同地区的禾本科植物内生真菌,经分离、培养后鉴定得到2种Epichlo属和4种Neotyphodium属内生真菌。采用改良的QS(improved quick and safe,IQS)法进行禾本科植物内生真菌基因组DNA的提取,并通过PCR进行验证。以生长在平板上的菌丝为起始材料,仪器要求简单、操作简便,快速安全、省时省力,整个提取过程大约40 min。该方法和常规SDS法相比,时间缩短到2周,为原来的1/4。以IQS法提取的DNA为模板,检测禾本科植物内生真菌中的NRPS基因,并在NCBI上进行比对分析,发现与已有的NRPS基因高度相似。这种快速提取法所获得的基因组DNA质量高,可用于后续PCR、基因克隆及其他高通量测试,特别适合获取大量真菌菌株基因组DNA时使用。 展开更多
关键词 禾本科植物内生真菌 基因组DNA的提取 nrps基因 PCR扩增 序列比对
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放线菌中铁载体生物合成机制研究进展 被引量:8
15
作者 黄婷婷 林双君 邓子新 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期765-773,共9页
铁载体是由微生物产生,对铁元素具有高亲和性的小分子化合物。这类天然产物所展现的结构多样性引起人们对其生物合成机制的极大兴趣。目前已有研究报道的铁载体生物合成途径主要有2种,一是直接由非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptide ... 铁载体是由微生物产生,对铁元素具有高亲和性的小分子化合物。这类天然产物所展现的结构多样性引起人们对其生物合成机制的极大兴趣。目前已有研究报道的铁载体生物合成途径主要有2种,一是直接由非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptide synthetases,NRPSs)家族的多酶复合体负责合成,另一种是以不依赖于NRPS(NRPS-independent,NIS)的方式,由一类特殊合成酶家族参与合成。在过去的十多年中,铁载体生物合成成为天然产物生物合成研究领域的热点之一,其中几种依赖于NRPS途径合成的铁载体生物合成机制已得到充分阐明,而对NIS方式合成的铁载体研究也获得了诸多进展。作为放线菌的一类重要次级代谢产物,通过遗传学、化学等手段对放线菌所产生铁载体生物合成途径的遗传学和生物化学研究,能够为发展新的抗菌药物提供契机,同时也能加深我们对这一类生物活性物质形成机制的认识。综述近期该研究方向的进展。 展开更多
关键词 铁载体 非核糖体肽合成 不依赖于nrps的合成 生物合成 放线菌
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39株内生放线菌次级代谢产物的合成潜能 被引量:8
16
作者 王海强 安向向 +2 位作者 侯淑芬 郝盼龙 张秀敏 《河北大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第3期254-261,共8页
为了解药用植物内生放线菌次级代谢产物合成潜能,采用2种不同的发酵培养基对39株分离自5种药用植物根部的内生放线菌进行发酵,利用甲醇抽提发酵液,然后对抽提液进行13株病原指示菌的抗菌活性测定.结果显示32株(82%)供试菌的发酵抽提液... 为了解药用植物内生放线菌次级代谢产物合成潜能,采用2种不同的发酵培养基对39株分离自5种药用植物根部的内生放线菌进行发酵,利用甲醇抽提发酵液,然后对抽提液进行13株病原指示菌的抗菌活性测定.结果显示32株(82%)供试菌的发酵抽提液至少对1种病原指示菌表现出抑制活性.为进一步评价供试菌株的次级代谢产物合成潜能,对所有供试菌株的基因组DNA进行了聚酮合酶(PKS)基因与非核糖体肽合成酶(NRPS)基因的扩增及检测.结果表明:所有供试菌株至少能扩增出1种次级代谢产物合成基因,其比例为PKS Ⅰ型(1)(59%)),PKS Ⅰ型(2)(62%),PKS Ⅱ型(82%),NRPS(1)(100%),NRPS(2)(100%),表明大多数药用植物内生放线菌具有合成聚酮类和非核糖体肽类化合物的潜能,在适宜的培养条件下可能产生这些种类的活性物质,有待进一步开发. 展开更多
关键词 内生放线菌 抗菌活性 聚酮合酶(PKS)基因 非核糖体肽合成酶(nrps)基因
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粤蓝链霉菌代谢产物的抗菌抗肿瘤活性及相关基因的初步研究 被引量:5
17
作者 邓名荣 郭俊 朱红惠 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2010年第3期367-372,共6页
粤蓝链霉菌(Streptomyces vietnam ensis)是新近报道的物种,能在多种培养基中产生水溶性紫罗兰蓝色素。本研究发现发酵液乙酸乙酯粗提物对革兰氏阳性细菌有较强的广谱抗菌活性,对部分革兰氏阴性菌也有不同程度的抑制作用,TLC生-物显影... 粤蓝链霉菌(Streptomyces vietnam ensis)是新近报道的物种,能在多种培养基中产生水溶性紫罗兰蓝色素。本研究发现发酵液乙酸乙酯粗提物对革兰氏阳性细菌有较强的广谱抗菌活性,对部分革兰氏阴性菌也有不同程度的抑制作用,TLC生-物显影试验进一步表明,两个蓝色组分B1、B2是主要的抗菌活性成分;同时,粗提物在20μg/mL的浓度下对HeLa细胞的生长抑制率达96.7%,显示了极强的抗肿瘤活性。利用简并引物扩增PKS/NRPS基因保守区域,获得相关序列4条,其中两条所代表的PKS基因簇有可能是粤蓝链霉菌产生次级代谢产物的重要途径,这些新基因的发现为组合生物合成提供了更多的基因资源。 展开更多
关键词 粤蓝链霉菌 次级代谢产物 抗菌活性 抗肿瘤活性 PKS/nrps基因
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组合生物合成研究进展 被引量:3
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作者 胡又佳 朱春宝 朱宝泉 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期321-330,共10页
组合生物合成是在抗生素产生菌的次级代谢产物合成途径中涉及到的一些酶的编码基因之间的互换 ,从而产生许多新的“非天然的天然化合物”。本文综述了近二年来组合生物合成的研究所取得的进展 ,着重介绍了 类 PKS的研究结果 ,并对 类 ... 组合生物合成是在抗生素产生菌的次级代谢产物合成途径中涉及到的一些酶的编码基因之间的互换 ,从而产生许多新的“非天然的天然化合物”。本文综述了近二年来组合生物合成的研究所取得的进展 ,着重介绍了 类 PKS的研究结果 ,并对 类 PKS、NRPS及 展开更多
关键词 组合生物合成 PKS nrps DOS
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耐盐芽孢杆菌B11抗菌活性物质的分离纯化及其特征分析 被引量:2
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作者 张帅 邱鹏 +4 位作者 龙秀锋 侯燕燕 鲁凤娟 张鹤铭 田永强 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第18期256-260,266,共6页
对耐盐芽孢杆菌B11产生的抗菌活性物质进行了分离纯化及特性研究。从盐碱土壤中分离得到一株对金黄色葡萄球菌具有强拮抗活性的耐盐芽孢杆菌B11,其发酵液中抗菌活性物质具有良好的热稳定性、p H稳定性和紫外光照稳定性,100℃加热1 h,抑... 对耐盐芽孢杆菌B11产生的抗菌活性物质进行了分离纯化及特性研究。从盐碱土壤中分离得到一株对金黄色葡萄球菌具有强拮抗活性的耐盐芽孢杆菌B11,其发酵液中抗菌活性物质具有良好的热稳定性、p H稳定性和紫外光照稳定性,100℃加热1 h,抑菌活性仅下降11.0%,且在p H为3和11环境下,抑菌活性也仅下降11.4%和10.9%,对酸碱环境具有耐受性。发酵液经预处理、离心、阳离子阴离子交换层析,经正丁醇抽提和半制备高效液相色谱得到活性物质A1和A2,其中A1分子量为1423.8 u且带有多电荷,氨基酸分析仪鉴定A1为非核糖体多肽(NRPS),对金黄色葡萄球菌的最小抑菌浓度为8.0μg/m L;A2活性很弱且含量较低,初步鉴定为小分子抗菌物质,分子量为373 u。耐盐芽孢杆菌B11的抗菌代谢产物应用于食品防腐具有很大的潜力。 展开更多
关键词 耐盐芽孢杆菌 金黄色葡萄球菌 分离纯化 nrps
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新颖的黏细菌模块化天然产物装配线 被引量:1
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作者 朱丽萍 黎志凤 +2 位作者 韩魁 李曙光 李越中 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第6期525-539,共15页
黏细菌的显著特征之一是能够合成结构多样、功能丰富的天然产物.模块化聚酮合酶(PKS)和非核糖体肽合成酶(NRPS)途径是黏细菌合成天然产物的主要方式.与经典模块PKS/NRPS相比,黏细菌来源的模块化PKS/NRPS常表现出新颖的装配特征,显示出... 黏细菌的显著特征之一是能够合成结构多样、功能丰富的天然产物.模块化聚酮合酶(PKS)和非核糖体肽合成酶(NRPS)途径是黏细菌合成天然产物的主要方式.与经典模块PKS/NRPS相比,黏细菌来源的模块化PKS/NRPS常表现出新颖的装配特征,显示出多样化的遗传加工潜能和装配产物结构多样性.本文综合归类分析了黏细菌来源的模块化PKS/NRPS遗传装配线类型及其对应化合物的生化结构特征,图文并茂地呈现了黏细菌在遗传、生化、组合生物合成、进化和药物开发领域的生机和潜能,并展望了基因组学时代带来的契机. 展开更多
关键词 黏细菌 天然产物 聚酮合酶(PKS) 非核糖体肽合成酶(nrps) 模块化
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