目的采用生物信息学方法分析、预测结核分枝杆菌Rv1980c基因编码蛋白MPT64的结构和功能。方法通过NCBI网站获取Rv1980c基因的基本信息;使用Proteparam、ProtScale和ProtCompB软件预测MPT64蛋白的理化性质和亚细胞定位;使用SignalP Serve...目的采用生物信息学方法分析、预测结核分枝杆菌Rv1980c基因编码蛋白MPT64的结构和功能。方法通过NCBI网站获取Rv1980c基因的基本信息;使用Proteparam、ProtScale和ProtCompB软件预测MPT64蛋白的理化性质和亚细胞定位;使用SignalP Server v.4.0、TMHMM Server v.2.0、NetNGlyc Server 1.0和Net Phos Server v.3.1对MPT64蛋白的信号肽、跨膜结构、糖基化及磷酸化位点进行分析;使用SOPMA和I-TASSER预测MPT64蛋白的二级结构并对该蛋白的三级结构分子模型进行构建;使用BepiPred和NetMHCpan-4.1、NetMHCIIpan-4.0对MPT64蛋白的抗原表位进行分析预测;使用VaxiJen、ToxIBT对预测出的表位进行抗原相似性及毒性筛选;使用STRING数据库预测MPT64的相互作用蛋白及其相关功能。结果Rv1980c编码的MPT64蛋白由228个氨基酸组成,其分子式为C_(1115)H_(1729)N_(285)O_(342)S_(8),理论等电点为4.84,平均亲水性系数为-2.322,不稳定性指数28.73,预测其为亲水性蛋白;亚细胞可能定位于细胞外。MPT64蛋白可能存在一个跨膜结构,可能存在一个信号肽、两个糖基化位点和25个磷酸化位点。其二级结构包含28.07%的a-螺旋(Hh),18.86%的β-折叠(Ee),5.26%的β-转角(Tt),47.81%无规则卷曲(Cc)。MPT64蛋白含有2个B细胞优势表位,12个T细胞优势表位;预测其互作蛋白为FBPB、ESXA、MPT63、ESXB、NrdF1、FBPA、Pst S1、APA、CFP21、MPT70。结论成功对MPT64蛋白进行了生物信息学分析与结构功能预测,为MPT64的进一步研究奠定基础。展开更多
针对装备研制阶段预测人力、人员及训练MPT(manpower,personnel and training)需求的问题,提出了基于相似理论及新系统、原系统、基准比较系统和建议系统的MPT需求分析思想,建立了由多级相似元组成的装备相似比较模型,并确定了MPT需求...针对装备研制阶段预测人力、人员及训练MPT(manpower,personnel and training)需求的问题,提出了基于相似理论及新系统、原系统、基准比较系统和建议系统的MPT需求分析思想,建立了由多级相似元组成的装备相似比较模型,并确定了MPT需求分析的过程和输入、输出。在上述分析的基础上,设计和开发了装备研制MPT需求分析系统(EDMPTRAS),主要包括系统总体设计、功能设计和数据库设计。最后,结合某自行火炮的研制过程进行了系统实现和应用,证明了系统的可用性和有效性。展开更多
文摘目的采用生物信息学方法分析、预测结核分枝杆菌Rv1980c基因编码蛋白MPT64的结构和功能。方法通过NCBI网站获取Rv1980c基因的基本信息;使用Proteparam、ProtScale和ProtCompB软件预测MPT64蛋白的理化性质和亚细胞定位;使用SignalP Server v.4.0、TMHMM Server v.2.0、NetNGlyc Server 1.0和Net Phos Server v.3.1对MPT64蛋白的信号肽、跨膜结构、糖基化及磷酸化位点进行分析;使用SOPMA和I-TASSER预测MPT64蛋白的二级结构并对该蛋白的三级结构分子模型进行构建;使用BepiPred和NetMHCpan-4.1、NetMHCIIpan-4.0对MPT64蛋白的抗原表位进行分析预测;使用VaxiJen、ToxIBT对预测出的表位进行抗原相似性及毒性筛选;使用STRING数据库预测MPT64的相互作用蛋白及其相关功能。结果Rv1980c编码的MPT64蛋白由228个氨基酸组成,其分子式为C_(1115)H_(1729)N_(285)O_(342)S_(8),理论等电点为4.84,平均亲水性系数为-2.322,不稳定性指数28.73,预测其为亲水性蛋白;亚细胞可能定位于细胞外。MPT64蛋白可能存在一个跨膜结构,可能存在一个信号肽、两个糖基化位点和25个磷酸化位点。其二级结构包含28.07%的a-螺旋(Hh),18.86%的β-折叠(Ee),5.26%的β-转角(Tt),47.81%无规则卷曲(Cc)。MPT64蛋白含有2个B细胞优势表位,12个T细胞优势表位;预测其互作蛋白为FBPB、ESXA、MPT63、ESXB、NrdF1、FBPA、Pst S1、APA、CFP21、MPT70。结论成功对MPT64蛋白进行了生物信息学分析与结构功能预测,为MPT64的进一步研究奠定基础。
文摘针对装备研制阶段预测人力、人员及训练MPT(manpower,personnel and training)需求的问题,提出了基于相似理论及新系统、原系统、基准比较系统和建议系统的MPT需求分析思想,建立了由多级相似元组成的装备相似比较模型,并确定了MPT需求分析的过程和输入、输出。在上述分析的基础上,设计和开发了装备研制MPT需求分析系统(EDMPTRAS),主要包括系统总体设计、功能设计和数据库设计。最后,结合某自行火炮的研制过程进行了系统实现和应用,证明了系统的可用性和有效性。
