目的建立铜绿假单胞菌的多位点可变数目串联重复序列(multiple locus variable number of tandem repeats a-nalysis,MLVA)基因分型技术,初步用于耐药监测和院内感染的监测。方法选择11个位点对50株临床分离菌株进行PCR扩增和凝胶电泳,...目的建立铜绿假单胞菌的多位点可变数目串联重复序列(multiple locus variable number of tandem repeats a-nalysis,MLVA)基因分型技术,初步用于耐药监测和院内感染的监测。方法选择11个位点对50株临床分离菌株进行PCR扩增和凝胶电泳,用R 2.14.1软件进行聚类分析。SPSS13.0统计软件进行统计分析。结果 11个位点中,ms216多态性最低,为0.619,ms212多态性最高,为0.838。50株铜绿假单胞菌被分为4大基因群,且均为单菌株基因型。前9个位点与11个位点的组合对菌株的分辨能力相同(HGDI=1.0000);前7个位点与前8个位点组合的分辨能力相同(HGDI=0.9984,成簇率为4.0%);前5个位点与前6个位点组合的分辨能力相同(HGDI=0.9935,成簇率为10.0%)。结论前5个VNTR位点组合有良好分辨能力,可用于大规模分子流行病学调查;前7个VNTR位点具有更高的分辨能力,可用于精确分析。展开更多
文摘目的建立铜绿假单胞菌的多位点可变数目串联重复序列(multiple locus variable number of tandem repeats a-nalysis,MLVA)基因分型技术,初步用于耐药监测和院内感染的监测。方法选择11个位点对50株临床分离菌株进行PCR扩增和凝胶电泳,用R 2.14.1软件进行聚类分析。SPSS13.0统计软件进行统计分析。结果 11个位点中,ms216多态性最低,为0.619,ms212多态性最高,为0.838。50株铜绿假单胞菌被分为4大基因群,且均为单菌株基因型。前9个位点与11个位点的组合对菌株的分辨能力相同(HGDI=1.0000);前7个位点与前8个位点组合的分辨能力相同(HGDI=0.9984,成簇率为4.0%);前5个位点与前6个位点组合的分辨能力相同(HGDI=0.9935,成簇率为10.0%)。结论前5个VNTR位点组合有良好分辨能力,可用于大规模分子流行病学调查;前7个VNTR位点具有更高的分辨能力,可用于精确分析。
