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虚拟实验室技术评价recA标准序列比对法对洋葱伯克霍尔德菌复合体种别鉴定效果 被引量：1
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作者 孔庆鑫 沈林海 +3 位作者 徐虹 韦凌娅 陈冰冰 倪晓平 《中国卫生检验杂志》 CAS 2015年第18期3025-3028,3034,共5页
目的利用虚拟实验室技术评价rec A标准序列比对(ARRS)法,对洋葱伯克霍尔德菌复合体(Bcc)种别鉴定效果。方法通过对Gen Bank、MLST数据库等公共数据库内相关信息进行核实和分析,筛选出在Gen Bank、MLST 2个数据库中均存在详实的rec A基因... 目的利用虚拟实验室技术评价rec A标准序列比对(ARRS)法,对洋葱伯克霍尔德菌复合体(Bcc)种别鉴定效果。方法通过对Gen Bank、MLST数据库等公共数据库内相关信息进行核实和分析,筛选出在Gen Bank、MLST 2个数据库中均存在详实的rec A基因及MLST分型信息的Bcc菌株作为目标菌株。根据目标菌株的rec A基因序列信息,采用ARRS法对其进行鉴定。鉴定结果与MSLT数据库中该菌株分型鉴定结果进行比较。以MSLT法作为Bcc菌株鉴定的标准方法,计算ARRS法的灵敏度、特异度等相关统计学指标,评估其对Bcc菌株种别鉴定的效果。结果 ARRS法和MSLT法对93株目标菌株的鉴定结果显示,92株鉴定结果一致。相对于MSLT法,ARRS法灵敏度为98.9%,特异度为100.0%;2种方法一致性为98.9%(P<0.01)。结论 ARRS法对于鉴定Bcc内菌株具有较好的效果,可以满足临床筛检、医院感染流行病学调查等需求。 展开更多
关键词 虚拟实验室 洋葱伯克霍尔德菌复合体 recA标准序列比对法 MSLT法
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