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基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法
被引量：
3
1
作者
马浪浪
梁振娟
+3 位作者
先新
罗仕文
李清超
梁黔云
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期45-50,共6页
DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测...
DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测的方法主要有BSP-seq(亚硫酸氢盐修饰结合直接测序法)、Me DIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序法)、MBD-seq(甲基化DNA富集结合高通量测序法)。就这3种方法在原理、流程、优缺点、优化使用及后期需要用到的部分生物信息学资源等方面的研究进展作一综述,旨在为研究者在采用高通量测序方法研究DNA甲基化模式时提供一些思路。
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关键词
高通量测序技术
全基因组
DNA甲基化水平
BSP-seq
MeDIP-seq
mbd-seq
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职称材料
题名
基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法
被引量：
3
1
作者
马浪浪
梁振娟
先新
罗仕文
李清超
梁黔云
机构
四川农业大学玉米研究所
毕节市农业科学研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第7期45-50,共6页
基金
贵州省科学技术基金计划重点项目[黔科合JZ字(2014)2001号]
贵州省科学技术基金计划项目[黔科合J字(2013)2002号]
贵州省毕节市农业攻关项目(毕科合19号)
文摘
DNA甲基化的研究最近几年一直是表观遗传学研究的重点。有关DNA甲基化水平检测的方法大体上有十几种,随着第二代测序技术的发展,实现了在全基因组水平上对甲基化状态进行检测。目前,基于第二代高通量测序进行全基因组DNA甲基化水平检测的方法主要有BSP-seq(亚硫酸氢盐修饰结合直接测序法)、Me DIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序法)、MBD-seq(甲基化DNA富集结合高通量测序法)。就这3种方法在原理、流程、优缺点、优化使用及后期需要用到的部分生物信息学资源等方面的研究进展作一综述,旨在为研究者在采用高通量测序方法研究DNA甲基化模式时提供一些思路。
关键词
高通量测序技术
全基因组
DNA甲基化水平
BSP-seq
MeDIP-seq
mbd-seq
Keywords
high-throughput sequencing technology
genome-wide
DNA methylation level
BSP-seq
MeDIP-seq
mbd-seq
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法
马浪浪
梁振娟
先新
罗仕文
李清超
梁黔云
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
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