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拟南芥和线虫基因序列及剪切位点的理论预测 被引量：6
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作者 陈翠霞 李前忠 林昊 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期125-131,共7页
将拟南芥(A.thaliana)和线虫(C.elegans)基因组按外显子、内含子及基因间序列区分为3类。分别选取64、40、20 种三联体的概率作为信号参数构建离散源,根据离散增量预测序列所属类型。结果表明:拟南芥各条染色体标准集总预测成功率达到82... 将拟南芥(A.thaliana)和线虫(C.elegans)基因组按外显子、内含子及基因间序列区分为3类。分别选取64、40、20 种三联体的概率作为信号参数构建离散源,根据离散增量预测序列所属类型。结果表明:拟南芥各条染色体标准集总预测成功率达到82.19%,检验集为87.95%;线虫各条染色体标准集总预测成功率达到79.67%,检验集达到81.93%。另外,将两种基因序列中的外显子分别划分成3类, 用外显子剪切位点、翻译起始和结束位点附近的三联体的3个位点作为3条子链,以各条子链的12个参数构建离散源,用离散增量对3种序列类型进行预测,预测成功率都达80%以上。 展开更多
关键词 外显子 内含子 拟南芥 线虫 基因序列 剪切位点 人类
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