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陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发 被引量：8
1
作者 徐鹏 蔡继鸿 +4 位作者 杨阳 郭琪 张香桂 徐珍珍 沈新莲 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期65-74,共10页
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁... 随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。 展开更多
关键词 陆地棉 耐盐 转录组 EST-SSR标记 EST-indel标记 差异表达基因
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分子标记辅助选择籼型直立恢复系 被引量：5
2
作者 程朝平 刘成德 +4 位作者 杨德卫 卢礼斌 叶宁 郑向华 叶新福 《分子植物育种》 CAS CSCD 2011年第5期561-566,共6页
直立型密穗基因是水稻中与株型密切相关的基因,对作物高产分子育种有重要应用价值。为了培育直立密穗型的籼稻新品种,本研究以优良籼稻品种东南恢602(弯穗型)做母本,具有直立型密穗基因的近等基因系DW135为父本配置杂交组合。根据直立... 直立型密穗基因是水稻中与株型密切相关的基因,对作物高产分子育种有重要应用价值。为了培育直立密穗型的籼稻新品种,本研究以优良籼稻品种东南恢602(弯穗型)做母本,具有直立型密穗基因的近等基因系DW135为父本配置杂交组合。根据直立型密穗基因dep1在第5外显子上碱基缺失,筛选出一个插入缺失长度多态性(Insertion deletion length polymorphism,InDe1)位点,设计合成插入缺失(InDel)标记,该标记能准确检测含或不含dep1基因的纯合基因型和杂合基因型品种。利用该标记对回交群体进行辅助选择,筛选含有dep1基因的纯合株系,成熟后对穗部性状的调查结果与分子标记检测结果基本一致。利用与目的基因共分离的分子标记,建立直立穗型分子标记辅助育种体系,为今后开展株型育种提供了理论依据和材料基础。 展开更多
关键词 分子标记辅助选择 直立型密穗 株型育种 dep1基因 indel标记
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香菇不同温型菌龄菌株杂交F1代杂种优势初步分析 被引量：3
3
作者 于海龙 章炉军 +5 位作者 李洁 刘青 郝宇晴 宋春艳 谭琦 张丹 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2022年第5期22-32,共11页
基于InDel标记对香菇(Lentinula edodes)种质资源进行多样性分析的结果,选取中低温中菌龄的菌株(MLM)0912、238、沪香F2、L 05采用单孢杂交方式进行组内杂交;选取MLM与中高温长菌龄的菌株(MHL)L 808、申香215,MLM与高温短菌龄的菌株(HS)... 基于InDel标记对香菇(Lentinula edodes)种质资源进行多样性分析的结果,选取中低温中菌龄的菌株(MLM)0912、238、沪香F2、L 05采用单孢杂交方式进行组内杂交;选取MLM与中高温长菌龄的菌株(MHL)L 808、申香215,MLM与高温短菌龄的菌株(HS)L 66、L 363,以及MLM与野生菌株YS 01,采用单孢杂交方式进行组间杂交。结果表明:构建的16个单孢杂交群体共获得14797个杂交子。杂交F代存在性状衰退现象,31.35%的菌株可正常出菇。MLM组内杂交正常出菇菌株占比为13.78%~32.22%,中亲优势、超亲优势菌株占比分别为3.83%~4.49%、1.09%~3.79%;MLM与MHL组间杂交正常出菇菌株占比为15.76%~38.39%,产量中亲优势、超亲优势菌株占比分别为2.67%~6.66%、0.80%~3.19%;MLM与HS组间杂交正常出菇菌株占比为36.32%~80.68%,产量中亲优势、超亲优势菌株占比分别为8.98%~27.78%、3.75%~15.22%;MLM与野生菌株杂交正常出菇菌株占比为50.88%,产量中亲优势、超亲优势菌株占比分别为3.07%、0.22%。基于InDel标记的亲本遗传相似系数与杂交F代正常出菇菌株占比和产量中亲优势菌株占比呈显著负相关,表明InDel标记在杂种优势预测中具有较好的应用潜力。研究结果可为食用菌杂交育种中杂种优势的预测提供科学数据。 展开更多
关键词 香菇 杂交育种 indel标记 遗传相似系数 杂种优势
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