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题名巴西橡胶树β-木糖苷酶基因的克隆与生物信息学分析
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作者
古小玲
涂敏
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机构
中国热带农业科学院科技信息研究所
中国热带农业科学院橡胶研究所
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出处
《热带农业科学》
2014年第7期51-55,共5页
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基金
海南省自然科学基金(No.313062)
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文摘
以巴西橡胶树根为材料,利用RT-PCR技术从总RNA中捕获到一个β-木糖苷酶家族基因(β-xylosidase或β-D-xyloside xylohydrolase,EC 3.2.1.37),cDNA长度2 880 bp,开放阅读框2 319 bp,编码773个氨基酸,命名为HbEC32。在HbEC32氨基酸序列中具有一个较强的跨膜区,二级结构分析表明其属于混合型蛋白。HbEC32在N端前8~20氨基酸区域内为较强的疏水区,但整条多肽链表现为亲水性。对15个β-木糖苷酶蛋白进行系统进化分析发现,巴西橡胶树的HbEC32基因与蓖麻亲缘关系最近。
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关键词
巴西橡胶树
hbec32
基因克隆
序列分析
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Keywords
Hevea brasiliensis
hbec32
gene cloning
sequence analysis
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分类号
S794.1
[农业科学—林木遗传育种]
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