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基于EST-SSR标记的朱顶红种质资源鉴定 被引量：5
1
作者 吕文涛 娄文睿 +1 位作者 娄晓鸣 宣继萍 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第4期1123-1132,共10页
以历年引进的朱顶红种质资源为试验材料,将其按照近似花品种和同名品种进行分组,其中近似花品种包括12个组合45个品种,同名品种包括12个组合31个品种,从已开发的EST-SSR标记中筛选多态性引物,对这些引进的朱顶红种质资源进行鉴定。结果... 以历年引进的朱顶红种质资源为试验材料,将其按照近似花品种和同名品种进行分组,其中近似花品种包括12个组合45个品种,同名品种包括12个组合31个品种,从已开发的EST-SSR标记中筛选多态性引物,对这些引进的朱顶红种质资源进行鉴定。结果表明:从朱顶红转录组开发的7对SSR标记中利用其中5对进行本次试验,通过近似花组合聚类结果分析得出,12个组合中,5个组合部分品种遗传相似系数较高,大部分组合及品种呈现错综复杂的亲缘关系;同名组合聚类结果为12个组合中有9个组合大部分品种聚在一起;‘橙色君主’、‘苹果花’和‘帆船’3个组合遗传背景复杂。部分组合亲缘关系可以看出,多组白色单瓣和红白条纹单瓣组合的遗传相似系数较高,多组重瓣和单瓣品种聚在一起。朱顶红具有丰富的遗传多样性,本研究为研究朱顶红品种间的亲缘关系,进行朱顶红种质资源鉴定提供参考。 展开更多
关键词 朱顶红 est-SSR标记 聚类分析 资源鉴定
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广西莪术EST-SSR标记开发及其在遗传多样性分析中的应用 被引量：6
2
作者 杨妮 郭嗣斌 +5 位作者 王建 刘平武 李孝琼 谢巍 苏伟敏 靳雅慧 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2291-2300,共10页
目的:分析姜黄表达序列标签(EST)中简单重复序列(SSR)位点的分布特点,开发近缘种广西莪术EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于进行广西莪术遗传多样性分析及分子育种的可行性。方法:下载NCBI中公布的姜黄EST 12 678条,利用SSR-FINDER搜索SSR位... 目的:分析姜黄表达序列标签(EST)中简单重复序列(SSR)位点的分布特点,开发近缘种广西莪术EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于进行广西莪术遗传多样性分析及分子育种的可行性。方法:下载NCBI中公布的姜黄EST 12 678条,利用SSR-FINDER搜索SSR位点,筛选符合条件的序列,采用Primer 5.0设计SSR引物,挑选30个表现型差异较大的广西莪术种质进行引物有效性及多态性检测,对50份广西莪术种质进行遗传多样性分析。结果:12 678条EST序列含有SSR位点1 243个,其中二核苷酸出现频率为50.36%,三核苷酸31.54%,四核苷酸10.30%,以AT/TA和CT/GA出现频率最高。利用Primer 5.0设计引物共325对,聚合酶链式反应(PCR)检测表明,104对引物可以扩增出理想PCR产物,在至少30份不同种质广西莪术中检测到48对SSR引物具有多态性,占设计引物的38.09%。遗传多样性分析研究,聚类分析结果表明50份广西莪术种质在相关系数0.7处,聚类为2类,遗传相似性系数变化范围较窄。结论:姜黄EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高。本研究开发了48对广西莪术EST-SSR标记,并筛选出富含SSR位点的候选序列,用聚类图验证了植物之间的亲缘关系,为广西莪术遗传多样性分析和分子育种研究提供参考。 展开更多
关键词 广西莪术 姜黄 表达序列标签-简单重复序列 引物开发 特异引物标记技术 分子标记体系 微卫星序列 遗传多样性分析
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水稻抗白叶枯病基因Xa23群体的MAS育种研究 被引量：9
3
作者 于洁 王耀雯 +5 位作者 马文清 王建岭 王育荣 赵开军 王春连 刘丕庆 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期1-5,共5页
将野生稻中发现的抗白叶枯病基因Xa23转入3个优良恢复系中,为培育新的抗白叶枯病品种奠定基础.采用分子标记辅助育种(MAS)和人工剪叶接种方法快速选育抗白叶枯病新品系.选取前期所得的材料进行P6菌接种鉴定,利用Xa23基因连锁的EST标记C... 将野生稻中发现的抗白叶枯病基因Xa23转入3个优良恢复系中,为培育新的抗白叶枯病品种奠定基础.采用分子标记辅助育种(MAS)和人工剪叶接种方法快速选育抗白叶枯病新品系.选取前期所得的材料进行P6菌接种鉴定,利用Xa23基因连锁的EST标记C189对接种所得的272份接种鉴定表现有抗性的材料进行标记检测,共得到含有Xa23基因的材料254份,研究发现所得到的材料已经基本稳定,可选取最优品系参加新品种的区试. 展开更多
关键词 水稻 水稻白叶枯病 est标记 Xa23基因 MAS
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七鳃鳗(Lampetra japonica)白细胞cDNA文库构建及生物信息学分析 被引量：5
4
作者 张宁 刘欣 +6 位作者 孙晶 刘岑洁 陈操 李竞 芦静 刘慧玲 李庆伟 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2010年第2期237-243,共7页
以复合免疫日本七鳃鳗(Lampetra japonica)外周血中分离的单个核白细胞为材料,构建库容量为4.5×106pfu.mL-1的cDNA文库,随机挑选单克隆菌落测序共得到10 500条有效ESTs(expressed sequence tags)序列.经PHRAP软件对序列拼接组装后... 以复合免疫日本七鳃鳗(Lampetra japonica)外周血中分离的单个核白细胞为材料,构建库容量为4.5×106pfu.mL-1的cDNA文库,随机挑选单克隆菌落测序共得到10 500条有效ESTs(expressed sequence tags)序列.经PHRAP软件对序列拼接组装后得到3 382个转录本,其中有1 080个重叠群和2 302个单一序列,有59.08%的转本录在NCBI数据库中搜索到同源序列.运用Blast2GO软件进行Gene Ontology注释,分别有27.47%、25.20%和10.01%的转录本参与细胞生理、代谢和生物调节等生物学途径;分别有48.43%、22.10%和10.69%的转录本起到结合、催化和结构分子活性等分子功能.统计数据显示,与细胞自身基因转录、蛋白质合成及转运等生命过程密切相关的基因如真核转录延长因子、反转录酶、核糖体蛋白、腺苷酸转运体、细胞色素C氧化酶和热休克蛋白等在血液白细胞群中大量表达.另外,与固有免疫密切相关的白细胞衍生趋化因子、抵抗素、颗粒体蛋白等表达量相对较高,说明固有免疫系统在七鳃鳗感染初期的免疫防卫方面起着主要作用. 展开更多
关键词 日本七鳃鳗 类淋巴细胞 est 分子标识 发育分化
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