研究了基因序列分析中的DNA序列相似性重复片段的查找问题.在对重复片段的相似性衡量进行分析之后,基于海明距离提出了新的相似度衡量标准模式相似度和片段相似度,并在此基础上提出了一个新的相似性重复片段的定义SATR(segment-similari...研究了基因序列分析中的DNA序列相似性重复片段的查找问题.在对重复片段的相似性衡量进行分析之后,基于海明距离提出了新的相似度衡量标准模式相似度和片段相似度,并在此基础上提出了一个新的相似性重复片段的定义SATR(segment-similarity based approximate tandem repeats).在进行SATR的查找时,采用了一个轻量级的索引后继数组,并设计出在后继数组上进行SATR查找的算法.实验评估和性能分析表明,基于后继数组的SATR查找算法在查找结果和查找时间上都要优于其他同类方法.展开更多
本文对植物外源总 DNA 导入技术在国内外的研究进展进行了综述,提供了这一技术成功地在棉花、水稻、高梁、小麦、大豆、烟草、玉米等农作物上应用的实例,分析外源总 DNA 导入技术与植物基因工程这二个不同层次的农业分子育种的研究现状...本文对植物外源总 DNA 导入技术在国内外的研究进展进行了综述,提供了这一技术成功地在棉花、水稻、高梁、小麦、大豆、烟草、玉米等农作物上应用的实例,分析外源总 DNA 导入技术与植物基因工程这二个不同层次的农业分子育种的研究现状和进展。作者认为:外源总 DNA 导入技术简便实用,可将 DNA 直接导入栽培植物,培育出优质、高产、抗病虫害、抗逆的作物新品种,产生巨大的经济效益。展开更多
核内线粒体DNA片段(nuclear mitochondrial DNA segments,Numts)给线粒体DNA的研究和应用带来了严重干扰,因而备受广大学者的关注。国内外学者在Numts的检测方面做了大量的研究。尤其是近年来,随着大量基因组数据的积累,相关研究不再局...核内线粒体DNA片段(nuclear mitochondrial DNA segments,Numts)给线粒体DNA的研究和应用带来了严重干扰,因而备受广大学者的关注。国内外学者在Numts的检测方面做了大量的研究。尤其是近年来,随着大量基因组数据的积累,相关研究不再局限于研究特定线粒体基因的核内同源片段,而是拓展到基因组水平上比较不同物种的Numts含量和分布,物种内部Numts的多态性也日益被研究者重视。该文从Numts的形成机制、检测方法、数量和分布对线粒体DNA研究的干扰及排除方法等方面进行了总结与归纳,也对Numts的研究意义与未来的发展趋势进行了简要分析。展开更多
文摘研究了基因序列分析中的DNA序列相似性重复片段的查找问题.在对重复片段的相似性衡量进行分析之后,基于海明距离提出了新的相似度衡量标准模式相似度和片段相似度,并在此基础上提出了一个新的相似性重复片段的定义SATR(segment-similarity based approximate tandem repeats).在进行SATR的查找时,采用了一个轻量级的索引后继数组,并设计出在后继数组上进行SATR查找的算法.实验评估和性能分析表明,基于后继数组的SATR查找算法在查找结果和查找时间上都要优于其他同类方法.
文摘本文对植物外源总 DNA 导入技术在国内外的研究进展进行了综述,提供了这一技术成功地在棉花、水稻、高梁、小麦、大豆、烟草、玉米等农作物上应用的实例,分析外源总 DNA 导入技术与植物基因工程这二个不同层次的农业分子育种的研究现状和进展。作者认为:外源总 DNA 导入技术简便实用,可将 DNA 直接导入栽培植物,培育出优质、高产、抗病虫害、抗逆的作物新品种,产生巨大的经济效益。
文摘核内线粒体DNA片段(nuclear mitochondrial DNA segments,Numts)给线粒体DNA的研究和应用带来了严重干扰,因而备受广大学者的关注。国内外学者在Numts的检测方面做了大量的研究。尤其是近年来,随着大量基因组数据的积累,相关研究不再局限于研究特定线粒体基因的核内同源片段,而是拓展到基因组水平上比较不同物种的Numts含量和分布,物种内部Numts的多态性也日益被研究者重视。该文从Numts的形成机制、检测方法、数量和分布对线粒体DNA研究的干扰及排除方法等方面进行了总结与归纳,也对Numts的研究意义与未来的发展趋势进行了简要分析。
