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基于微芯片电泳技术的疫苗产品残留DNA片段大小分布检测方法的建立、验证及应用
1
作者 袁月 马晶 +6 位作者 陈婕 陈柯蓉 粟春燕 舒聪妍 李炎 王叔桥 杨蕾 《中国生物制品学杂志》 2025年第2期204-209,共6页
目的建立基于MultiNA微芯片电泳系统的残留DNA检测方法,对DNA片段的大小分布进行快速分析。方法基于MultiNA微芯片电泳系统建立对残留DNA片段大小分布检测方法,并验证方法的专属性、检测范围及精密度。利用所建立的方法检测Sabin株脊髓... 目的建立基于MultiNA微芯片电泳系统的残留DNA检测方法,对DNA片段的大小分布进行快速分析。方法基于MultiNA微芯片电泳系统建立对残留DNA片段大小分布检测方法,并验证方法的专属性、检测范围及精密度。利用所建立的方法检测Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(inactivated poliomyelitis vaccine,IPV)原液及成品中残留DNA片段大小。结果该方法专属性结果良好,检测范围为0~10000 bp,精密度检测CV均小于20%。该方法检测Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗原液,结果显示在400及500 bp左右有DNA片段;成品中未检出。结论建立了基于MultiNA微芯片电泳系统对残留DNA片段大小分布的检测方法,为生物制品中残留DNA片段大小分布检测方法提供了参考。 展开更多
关键词 残留dna 片段大小 MultiNA微芯片电泳系统 生物制品
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应用基因芯片技术筛选结直肠癌中差异DNA甲基化位点
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作者 余捷 王梓桦 +1 位作者 杨世英 薛寒冰 《胃肠病学》 2018年第6期330-335,共6页
背景:DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与结直肠癌等多种肿瘤的发生、发展密切相关,但具体作用机制尚未完全明确。筛选特异性甲基化基因和构建肿瘤的甲基化表达谱已成为当前研究热点。目的:应用基因甲基化芯片技术初步筛选... 背景:DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与结直肠癌等多种肿瘤的发生、发展密切相关,但具体作用机制尚未完全明确。筛选特异性甲基化基因和构建肿瘤的甲基化表达谱已成为当前研究热点。目的:应用基因甲基化芯片技术初步筛选结直肠癌组织与癌旁正常黏膜组织间差异甲基化位点,构建特异性结直肠癌差异甲基化基因谱。方法:应用甲基化450K芯片技术对6例结直肠癌及其癌旁组织进行甲基化分析,共分析位点431467个,按P值筛选出异常甲基化位点,按甲基化β值差值区分高甲基化位点和低甲基化位点;对筛选出的差异甲基化位点进一步行GO分析和KEGG分析,了解差异甲基化位点的功能。结果:共检出结直肠癌和癌旁正常组织显著差异的甲基化位点3649个,其中高甲基化位点1259个,主要分布于基因启动子区和基因体,筛选出特异的SLC15A3等高甲基化基因;低甲基化位点共2390个,主要分布于基因间区和基因体,筛选出特异的ACOT2、TTLL8、UHRF1等低甲基化基因。GO分析和KEGG分析发现,这些基因功能与DNA结合、转录因子活性、信号转导通路等有关。结论:结直肠癌和癌旁正常组织存在大量差异甲基化位点,提示DNA异常甲基化与结直肠癌的发生、发展密切相关。基因芯片技术可用于结直肠癌差异甲基化位点的初筛,但构建结直肠癌差异甲基化谱作为临床分子标记物仍需行进一步验证。 展开更多
关键词 dna甲基化 结直肠肿瘤 芯片分析技术
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用于毛细管电泳分离DNA的聚合物介质的研究进展 被引量:1
3
作者 张文龙 王延梅 《高分子通报》 CAS CSCD 2006年第6期75-81,97,共8页
综述了用于毛细管电泳分离DNA及测序的聚合物介质的研究进展。这类聚合物主要有均聚物、无规共聚物、嵌段共聚物、接枝共聚物、共混聚合物、准互穿聚合物网络和微交联纳米凝胶聚合物,并对各种结构的聚合物的筛分性能进行了比较。
关键词 毛细管电泳 微芯片毛细管电泳 dna分离 dna排序
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用于毛细管电泳和芯片电泳DNA分离的筛分介质
4
作者 黄欢 周国华 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期138-143,共6页
毛细管电泳和微芯片电泳是用于核酸分子分离的强有力工具,其筛分介质的选择尤为重要,是目前研究的热点之一。本文是按照均聚物和共聚物的分类,综述了线性聚丙烯酰胺、羟丙基甲基纤维素、羟乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮、聚环氧乙烷、聚 N... 毛细管电泳和微芯片电泳是用于核酸分子分离的强有力工具,其筛分介质的选择尤为重要,是目前研究的热点之一。本文是按照均聚物和共聚物的分类,综述了线性聚丙烯酰胺、羟丙基甲基纤维素、羟乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮、聚环氧乙烷、聚 N,N-二甲基聚丙烯酰胺、丙烯酰胺与聚 N,N-二甲基聚丙烯酰胺的共聚物等各种筛分体系的性质,包括其优点以及缺点,并对各自在 DNA 等生物大分子分离方面的应用进展进行了评述。简要介绍了筛分机理以及添加剂的加入对提高聚合物的分离能力和稳定性的影响。 展开更多
关键词 筛分介质 毛细管电泳 芯片电泳 dna分离 聚合物
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儿童青少年双相抑郁伴攻击行为患者全基因组DNA甲基化修饰研究
5
作者 张沛文 邹韶红 +1 位作者 沈小琴 迪丽娜孜·卡日 《神经疾病与精神卫生》 2021年第4期265-270,F0003,共7页
目的研究儿童青少年双相抑郁伴攻击行为患者全基因组DNA甲基化情况。方法选取2019年9月至2021年1月在新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科就诊的45例儿童青少年双相障碍抑郁患者,按照有、无攻击行为分为攻击组(16例)与无攻击组(29例)。... 目的研究儿童青少年双相抑郁伴攻击行为患者全基因组DNA甲基化情况。方法选取2019年9月至2021年1月在新疆维吾尔自治区人民医院临床心理科就诊的45例儿童青少年双相障碍抑郁患者,按照有、无攻击行为分为攻击组(16例)与无攻击组(29例)。纳入5例有攻击行为的儿童青少年双相障碍抑郁患者(攻击组)及5例无攻击行为的儿童青少年双相障碍抑郁患者(无攻击组),应用Illumina公司的850K甲基化芯片(Illumina Infinium HumanMethylation EPIC BeadChip,850K array)对10例患者外周血中的DNA进行甲基化分析,使用Genome Studio软件分析原始数据并筛选出两组间的差异甲基化位点,使用DAVID在线数据库对甲基化差异基因进行功能富集分析,并选出2个基因,使用焦磷酸测序对攻击组患者、无攻击组患者的外周静脉血样本进行验证。结果攻击组与非攻击组样本间存在差异高甲基化位点172个,包含高甲基化基因87个;其中差异低甲基化位点148个,包含低甲基化基因74个。差异甲基化位点存在于每条染色体上,主要分布于5'胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤-3'岛(CpG)的其他区域。有攻击组甲基化β值峰值在0.63左右,无攻击组甲基化β值峰值分别在0.40、0.85左右。Gene Ontology分析结果显示,差异甲基化基因参与轴突导向等生物学功能。Pathway分析中,存在于粘蛋白型O-聚糖生物合成通路。焦磷酸测序验证中,DPYSL2基因在两组的甲基化率分别是(27.438±17.874)%、(27.345±18.832)%,差异无统计学意义(P=0.987)。ABI3BP基因在两组的甲基化率分别是(84.188±25.761)%、(78.586±23.567)%,差异无统计学意义(P=0.113)。结论攻击组与非攻击组样本间存在差异甲基化位点及基因,这些差异甲基化位点及基因为明确儿童青少年双相抑郁患者攻击行为的发生原因提供了基础。 展开更多
关键词 双相障碍 儿童 青少年 攻击行为 dna甲基化 甲基化芯片
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一种基于微芯片电泳平台的级联化学发光信号放大策略用于HIV-DNA的高灵敏检测 被引量:1
6
作者 钟洁 赵书林 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期928-933,共6页
该文基于微芯片电泳-化学发光检测(MCE-CL)平台,以辣根过氧化酶标记的DNA(HRP-DNA)作为信号探针,利用HRP催化鲁米诺和双氧水化学发光反应及目标分子与DNA的杂交反应,结合T7Exo酶辅助信号放大,建立了一种MCE分离辅助双循环化学发光信号... 该文基于微芯片电泳-化学发光检测(MCE-CL)平台,以辣根过氧化酶标记的DNA(HRP-DNA)作为信号探针,利用HRP催化鲁米诺和双氧水化学发光反应及目标分子与DNA的杂交反应,结合T7Exo酶辅助信号放大,建立了一种MCE分离辅助双循环化学发光信号放大的新方法。结果显示:优化实验条件下,在1.0×10^(-14)~5.0×10^(-9) mol/L范围内,HIV-DNA的浓度对数值与HIV-DNA的化学发光强度呈良好的线性关系,检出限(S/N=3)为1.6×10^(-15) mol/L,在0.10、0.25、1.0、10(×10^(-12) mol/L)4个加标水平下的回收率为93.0%~103%,相对标准偏差(RSD)为0.50%~3.7%,方法具有较好的准确度,可应用于人血清中HIV-DNA的高灵敏检测。 展开更多
关键词 微芯片电泳 化学发光 信号放大 HIV-dna
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利用DNA芯片技术高效合成Ostreococcus Tauri叶绿体基因组(英文)
7
作者 柳伟强 刁文一 +8 位作者 钟云鹏 冯爱华 薛高旭 齐金才 周祯祯 贾延凯 廖国娟 孙中平 杨平 《现代生物医学进展》 CAS 2013年第32期6204-6209,共6页
目的:21世纪以来,随着合成生物学的高速发展及其所遇到的问题,开发下一代DNA合成技术已经成为了必然趋势。基因芯片技术和DNA大片段组装技术是建立下一代DNA合成平台的关键技术力量。方法:为了开发具有工业化标准的DNA芯片-基因组合成平... 目的:21世纪以来,随着合成生物学的高速发展及其所遇到的问题,开发下一代DNA合成技术已经成为了必然趋势。基因芯片技术和DNA大片段组装技术是建立下一代DNA合成平台的关键技术力量。方法:为了开发具有工业化标准的DNA芯片-基因组合成平台,我们首次利用电化学DNA芯片和DNA大片段组装技术合成了72kb的Ostreococcus tauri的全叶绿体基因组。结果:首先,我们使用电化学DNA芯片合成仪合成了564条150bp的Oligo Mix,并成功扩增分离了其中96%的Oligo序列,剩下的基因组序列是通过传统的固相亚磷酰胺三脂合成法合成。在此基础上,我们利用DNA重组技术将564条150bp Oligo片段分三步克隆到了一个pGSYN系统。通过高通量测序,我们证实叶绿体基因组被成功地人工合成。整个合成成本大约是目前传统基因合成成本的10%-20%。结论:研究证实基因芯片技术和DNA大片段组装技术的应用是能够明显的降低现阶段基因组合成工艺的成本。新技术的成熟推广和成本的有效控制也会进一步加速科学家对基因组功能的深入研究以及合成生物学的质的飞跃。 展开更多
关键词 叶绿体基因组 dna芯片 tonB转录终止子
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检测霍乱弧菌的基因芯片的制备 被引量:5
8
作者 金慧英 陶开华 +3 位作者 李越希 李法卿 陈华标 张锦海 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期444-445,共2页
目的 研制快速、特异、灵敏的检测霍乱弧菌基因芯片。方法 选择霍乱弧菌特异的编码外膜蛋白的ompW基因和毒素ctxA基因 ,设计引物和探针 ,并制备检测芯片 ,通过 2次PCR扩增 ,制备荧光标记的靶序列 ,并与芯片进行杂交 ,检测霍乱弧菌和... 目的 研制快速、特异、灵敏的检测霍乱弧菌基因芯片。方法 选择霍乱弧菌特异的编码外膜蛋白的ompW基因和毒素ctxA基因 ,设计引物和探针 ,并制备检测芯片 ,通过 2次PCR扩增 ,制备荧光标记的靶序列 ,并与芯片进行杂交 ,检测霍乱弧菌和非霍乱弧菌病原体。结果 所有霍乱弧菌菌株在采用单一和多重PCR2种方法制备的荧光标记靶序列与芯片杂交 ,均在芯片相应探针处出现阳性信号 ,非霍乱弧菌菌株杂交结果均为阴性。结论 霍乱弧菌基因检测芯片的研制 ,为霍乱弧菌感染的诊断提供了准确、快速、灵敏的方法 ,还可选择更多的基因位点设计探针以提高检测的可靠性 ,可以达到高通量、集成化和自动化的要求。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 基因芯片 PCR扩增 霍乱弧菌致病岛(VPI)
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1256例女性人乳头瘤病毒感染及其亚型分布调查 被引量:15
9
作者 宋艳芳 祝先进 +2 位作者 林青 高芳琳 林上忠 《福建医科大学学报》 2011年第1期58-60,共3页
目的调查1 256例女性人群人乳头瘤病毒(HPV)感染状况,为预防HPV感染和宫颈癌防治提供理论依据。方法采用导流杂交基因芯片技术对福州地区1 256例女性阴道分泌物进行HPV检查,分析HPV感染情况及其亚型分布。结果 1 256例患者中共检出HP... 目的调查1 256例女性人群人乳头瘤病毒(HPV)感染状况,为预防HPV感染和宫颈癌防治提供理论依据。方法采用导流杂交基因芯片技术对福州地区1 256例女性阴道分泌物进行HPV检查,分析HPV感染情况及其亚型分布。结果 1 256例患者中共检出HPV阳性者396例,感染率为31.53%,其中高危亚型313例,感染率为25.16%,低危亚型149例,感染率为11.86%。在HPV感染者中检出率较高的HPV高危型有16型(8.76%),58型(5.49%),52型(5.25%);低危型有6型(4.14%),11型(3.58%)。各年龄组(≤24岁、25-34岁、35-44岁、45-54岁、≥55岁)人群中HPV感染率分别为45.92%(45/98)、28.68%(117/408)、29.08%(139/478)、33.79%(74/219)和39.62%(21/53),≤24岁年龄组HPV感染率最高(χ2=14.392,P〈0.05)。结论在福州地区1 256例女性人群中,各年龄段均有较高的感染率,其中≤24岁年龄组HPV感染率最高,达45.92%;HPV感染的常见型别为HPV 16、58、52、6和11。 展开更多
关键词 乳头状瘤病毒感染 乳头状瘤病毒科 宫颈肿瘤 宫颈疾病 dna 病毒 芯片分析技术 福州
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分析基因表达图式的新方法 被引量:4
10
作者 冯闻铮 曹竹安 刘进元 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第2期127-131,共5页
随着基因组研究的深入进行,基因的分子生物学除了要寻找在生物学上重要的个别基因并研究其结构与功能外,更重要的应是了解整个基因组的功能活动,即细胞全部基因的表达图式.要解决如此复杂的问题就必须在研究方法上有所创新,基因表... 随着基因组研究的深入进行,基因的分子生物学除了要寻找在生物学上重要的个别基因并研究其结构与功能外,更重要的应是了解整个基因组的功能活动,即细胞全部基因的表达图式.要解决如此复杂的问题就必须在研究方法上有所创新,基因表达系列分析法、cDNA微阵列分析法。 展开更多
关键词 基因表达 图式 系列分析 Cdna微阵列 dna微芯片
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基于MEMS技术的PDMS电泳微芯片的研制 被引量:2
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作者 刘长春 崔大付 +2 位作者 赵强 王利 王蕾 《微细加工技术》 2004年第1期58-61,共4页
介绍了一种基于MEMS技术的PDMS电泳微芯片,该芯片主要由三部分组成:集成了高压电极的玻璃基底、PDMS薄膜以及刻有微流路的PDMS板。利用lift off工艺,在玻璃基底上制作了为电泳分离提供高压的Pt电极。为了提高PDMS微芯片的密封效率,同时... 介绍了一种基于MEMS技术的PDMS电泳微芯片,该芯片主要由三部分组成:集成了高压电极的玻璃基底、PDMS薄膜以及刻有微流路的PDMS板。利用lift off工艺,在玻璃基底上制作了为电泳分离提供高压的Pt电极。为了提高PDMS微芯片的密封效率,同时也为了保持微流路材料的一致性,通过挤压法首先在玻璃基底上形成了一层PDMS薄膜。电泳分离实验表明:在该微芯片上能够实现DNA片段的有效分离。 展开更多
关键词 MEMS技术 集成电极 电泳微芯片 dna分离 聚二甲基硅氧烷 PDMS 微流体生物芯片
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微型全化学分析系统及技术进展 被引量:14
12
作者 徐溢 EijkelJanC.T. ManzA. 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第7期1028-1034,共7页
对微型全化学分析系统 (μ TAS)的发展现状及其应用领域进行了综述 ,对 μ TAS在毛细管电泳微型化、DNA及生化分析、组合化学研究等领域的应用研究作了重点介绍 .
关键词 微型全化学分析系统 毛细管电泳微型化 微屏片
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霍乱弧菌和大肠杆菌O157∶H7检测芯片的制备
13
作者 金慧英 陶开华 +2 位作者 陈华标 李越希 李法卿 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期443-445,459,共4页
目的设计和制备快速检测霍乱弧菌和大肠杆菌O157∶H7基因芯片。方法选择霍乱弧菌特异的编码外膜蛋白的ompW基因和毒素ctxA基因以及大肠杆菌O157∶H7特异的编码菌体抗原rfbE、鞭毛抗原fliC和毒素SLT1、SLT2基因,设计引物和探针,并制备检... 目的设计和制备快速检测霍乱弧菌和大肠杆菌O157∶H7基因芯片。方法选择霍乱弧菌特异的编码外膜蛋白的ompW基因和毒素ctxA基因以及大肠杆菌O157∶H7特异的编码菌体抗原rfbE、鞭毛抗原fliC和毒素SLT1、SLT2基因,设计引物和探针,并制备检测芯片,通过两次PCR扩增,制备荧光标记的靶序列,并与芯片进行杂交,检测霍乱弧菌和大肠杆菌O157∶H7。结果所有霍乱弧菌和大肠杆菌O157:H7菌株在采用单一和多重PCR两种方法制备的荧光标记靶序列与芯片杂交,均在芯片相应探针处出现阳性信号,非霍乱弧菌和非O157:H7菌株杂交结果均为阴性。结论基因芯片可以快速检测霍乱弧菌的O157∶H7。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 大肠杆菌O157:H7 基因芯片
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显色法芯片技术快速鉴定分枝杆菌菌种 被引量:1
14
作者 赵源 胡忠义 +6 位作者 景奉香 刘志辉 王洁 郑瑞娟 陆俊梅 赵辉 尹俊 《中国医药生物技术》 CSCD 2007年第6期422-427,共6页
目的 利用显色法芯片技术建立快速鉴定分枝杆菌菌种的方法.方法 根据美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的分枝杆菌16S rDNA基因的保守区和突变区(第129~267位核苷酸的A突变区、第430~500位核苷酸的B突变区)分别设计引物和寡核苷酸探... 目的 利用显色法芯片技术建立快速鉴定分枝杆菌菌种的方法.方法 根据美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的分枝杆菌16S rDNA基因的保守区和突变区(第129~267位核苷酸的A突变区、第430~500位核苷酸的B突变区)分别设计引物和寡核苷酸探针,用地高辛标记引物并制备玻璃芯片.采用双重PCR技术分别对16种分枝杆菌标准株、5种非分枝杆菌标准株和120株分枝杆菌临床分离株(非结核分枝杆菌40株、结核分枝杆菌复合群80株)进行扩增,扩增产物分别与玻璃芯片进行杂交检测,尼龙膜显色,以显现蓝黑色斑点作为阳性信号,并根据其在芯片方阵中的位置判断分枝杆菌种类.根据芯片杂交结果,选取部分经显色法芯片技术检测的临床分离株进行DNA测序.结果 16种分枝杆菌标准株和120株分枝杆菌临床分离株经PCR扩增均各产生2条DNA片段,其中1条长度为272~280 bp,1条长度为183~192 bp.16种分枝杆菌标准株均与芯片上特异性探针杂交,应用显色法芯片技术分析16种分枝杆菌标准株和5种非分枝杆菌标准株的特异性为100%.120株分枝杆菌临床分离株均与分枝杆菌属探针a杂交,其中79株确定为结核分枝杆菌复合群,38株确定为非结核分枝杆菌(不产色分枝杆菌17株,胞内分枝杆菌8株,猿猴分支杆菌6株,瘰疬分枝杆菌5株,偶然分支杆菌2株),另3株只与分枝杆菌属探针a杂交,没有鉴定到种.选取的26株分枝杆菌临床分离株(结核分枝杆菌复合群8株,不产色分枝杆菌5株,胞内分枝杆菌、猿猴分枝杆菌、未鉴定到种的分枝杆菌各3株,瘰疬分枝杆菌、偶然分枝杆菌各2株)DNA测序显示,未鉴定到种的3株分枝杆菌中,1株为结核分枝杆菌突变株,1株为 Mycobacterium lentiflavum,1株为 Mycobacterium arupense,芯片上无后2种菌株的特异性探针;其余23株菌株测序结果与芯片检测结果一致.结论 显色法芯片技术能简便、快速、灵敏、特异地将大多数分枝杆菌鉴定到种,具有一定的临床推广应用价值. 展开更多
关键词 芯片分析技术 分枝杆菌属 dna 细菌 聚合酶链反应
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基于微芯片电泳的脱氧核糖核酸片段的浓缩和分离 被引量:4
15
作者 徐中其 廣川健 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期102-106,共5页
采用超负荷电动供给(electrokinetic supercharging,EKS)预浓缩技术,在微芯片电泳(MCE)上对脱氧核糖核酸(DNA)片段进行浓缩和分离。EKS是集合样品电动进样(EKI)和过渡等速电泳(tITP)的一种在线浓缩方法。研究表明:采用该方法后,在40.5m... 采用超负荷电动供给(electrokinetic supercharging,EKS)预浓缩技术,在微芯片电泳(MCE)上对脱氧核糖核酸(DNA)片段进行浓缩和分离。EKS是集合样品电动进样(EKI)和过渡等速电泳(tITP)的一种在线浓缩方法。研究表明:采用该方法后,在40.5mm长的单通道芯片上能够实现对低浓度样品的大量进样、浓缩和基线分离。在普通的紫外检测条件(检测波长为260nm)下,对DNA片段的平均检出限(S/N=3)约为0.07mg/L,仅为十字芯片上的微芯片电泳检出限的1/40。本文还对浓缩过程中的一些关键因素和定性分析进行了探讨。 展开更多
关键词 微芯片电泳 超负荷电动供给 电动进样 过渡等速电泳 dna片段
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蛋白质的微芯片电泳分离及其与脱氧核糖核酸迁移规律的比较
16
作者 刘春叶 许旭 +1 位作者 张剑 陈杰瑢 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期296-300,共5页
在自制的聚二甲基硅氧烷(PDMS)微芯片上,使用十二烷基磺酸钠(SDS)无胶筛分电泳分离体系(10g/L的羟乙基纤维素(HEC),1g/L的SDS,40mmol/L磷酸盐缓冲溶液,pH7.0),采用在线自校正激光诱导荧光检测方法,在6.4min内高效分离了异硫氰酸荧光素(F... 在自制的聚二甲基硅氧烷(PDMS)微芯片上,使用十二烷基磺酸钠(SDS)无胶筛分电泳分离体系(10g/L的羟乙基纤维素(HEC),1g/L的SDS,40mmol/L磷酸盐缓冲溶液,pH7.0),采用在线自校正激光诱导荧光检测方法,在6.4min内高效分离了异硫氰酸荧光素(FITC)衍生的6种蛋白质标准样品,连续6次电泳所得迁移时间的相对标准偏差(RSD)均小于10%。用自主建立的脱氧核糖核酸(DNA)定量分离模型对蛋白质迁移数据进行拟合,发现SDS-蛋白质复合物迁移规律与DNA相似,但迁移淌度与相对分子质量及电场强度之间的线性关系明显变差,可见原DNA分离模型要扩展到蛋白质范围必须对一些参数进行校正。 展开更多
关键词 自制微芯片 电泳 蛋白质 脱氧核糖核酸 迁移规律
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聚二甲基硅氧烷微流控芯片电泳的临床应用研究 被引量:3
17
作者 汪骅 韩崇旭 +4 位作者 王惠民 金庆辉 王大新 曹丽 董兰梅 《国际检验医学杂志》 CAS 2012年第1期4-6,共3页
目的探讨聚二甲基硅氧烷(PDMS)微流控芯片电泳技术的临床应用价值。方法利用模塑法制作PDMS微流控芯片,选择二胺基二苯甲烷(DDM)与羟丙基纤维素(HPC)对PDMS进行修饰,有效消除蛋白在芯片壁面上的吸附。PDMS微流控芯片电泳分离DNA标准品、... 目的探讨聚二甲基硅氧烷(PDMS)微流控芯片电泳技术的临床应用价值。方法利用模塑法制作PDMS微流控芯片,选择二胺基二苯甲烷(DDM)与羟丙基纤维素(HPC)对PDMS进行修饰,有效消除蛋白在芯片壁面上的吸附。PDMS微流控芯片电泳分离DNA标准品、PCR多重产物及血清脂蛋白。结果 10、20、50、100、200bp的DNA片段得到了很好的基线分离及良好重现性,峰面积的相对标准偏差分别为4.8%、6.3%、5.9%、3.5%、3.4%。线粒体疾病患者的多重PCR产物片段165、266、378、881bp在4min内实现了基线分离。血清低密度脂蛋白亚型、小而密低密度脂蛋白(sdLDL)实现了快速检测,冠心病组血清sdLDL检出率与健康体检组差异有统计学意义(P<0.01)。结论 PDMS微流控芯片电泳具有简单、快速、高效、低耗等特点,适合临床常规分析。 展开更多
关键词 dna 脂蛋白 PDMS微流控芯片
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基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值 被引量:14
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作者 杨映晖 伍定辉 +2 位作者 苏伟明 董春萍 姚向阳 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第11期1191-1195,共5页
目的探讨基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值。方法收集2017年6月至2018年6月厦门大学附属第一医院肺科门诊及住院的933例疑似肺结核患者初诊时采集的同一份晨痰标本,同时进行基因芯片法、GeneXpert MTB/RIF(简称“G... 目的探讨基因芯片法在结核分枝杆菌耐药基因快速诊断中的应用价值。方法收集2017年6月至2018年6月厦门大学附属第一医院肺科门诊及住院的933例疑似肺结核患者初诊时采集的同一份晨痰标本,同时进行基因芯片法、GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)和BACTEC MGIT 960液体培养及其比例法药物敏感性试验(简称“MGIT 960及其比例法药敏试验”)3种方法进行结核分枝杆菌及其耐药性检测,对检测结果进行对比分析。结果933例患者的痰标本中,基因芯片法检测出阳性484例,GeneXpert检测出阳性462例,MGIT 960培养出阳性411例。三种检测方法均为阳性的标本有395例,采用Excel表通过完全随机的方式抽取232例进行耐药性检测,以比例法药敏试验结果为参考标准,基因芯片法检测出异烟肼耐药的敏感度为86.67%(26/30),特异度为96.53%(195/202),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.798(0.682~0.914);检测出利福平耐药的敏感度为93.75%(30/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为96.55%(224/232),Kappa值为0.862(0.768~0.956);GeneXpert检测出利福平耐药的敏感度为84.38%(27/32),特异度为97.00%(194/200),一致性为95.26%(221/232),Kappa值为0.803(0.691~0.915);基因芯片法与GeneXpert对利福平耐药检测的一致性为96.12%(223/232),Kappa值为0.847(0.749~0.945)。Kappa值均大于0.75,具有良好的一致性。结论以MGIT 960及其比例法药敏试验结果为标准,基因芯片法敏感度、特异度和一致性高,与GeneXpert也具有良好的一致性,有助于结核病的早期诊断及防控。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 芯片分析技术 dna探针 微生物敏感性试验 实验室技术和方法 对比研究
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Programmable DNA-responsive microchip for the capture and release of circulating tumor cells by nucleic acid hybridization 被引量:3
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作者 Shan Guo Haiyan Huang +6 位作者 Xujing Deng Yuqi Chen Zhuoran Jiang Min Xie Songmei Liu Weihua Huang Xiang Zhou 《Nano Research》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第5期2592-2604,共13页
The detection and analysis of circulating tumor cells (CTCs) from patients' blood is important to assess tumor status; however, it remains a challenge. In the present study, we developed a programmable DNA-responsi... The detection and analysis of circulating tumor cells (CTCs) from patients' blood is important to assess tumor status; however, it remains a challenge. In the present study, we developed a programmable DNA-responsive microchip for the highly efficient capture and nondestructive release of CTCs via nucleic acid hybridization. Transparent and patternable substrates with hierarchical architectures were integrated into the microchip with herringbone grooves, resulting in greatly enhanced cell-surface interaction via herringbone micromixers, more binding sites, and better matched topographical interactions. In combination with a high-affinity aptamer, target cancer cells were specifically and efficiently captured on the chip. Captured cancer cells were gently released from the chip under physiological conditions using toehold-mediated strand displacement, without any destructive factors for cells or substrates. More importantly, aptamercontaining DNA sequences on the surface of the retrieved cancer cells could be further amplified by polymerase chain reaction (PCR), facilitating the detection of cell surface biomarkers and characterization of the CTCs. Furthermore, this system was extensively applied to the capture and release of CTCs from patients' blood samples, demonstrating a promising high-performance platform for CTC enrichment, release, and characterization. 展开更多
关键词 dna-responsive microchip hierarchical architecture circulating tumor cells(CTCs) aptamer CAPTURE RELEASE nucleic acid hybridization
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环烯烃共聚物芯片在电泳分析检测中的应用
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作者 何崇慧 杨红强 王廷海 《广州化工》 CAS 2014年第17期135-138,共4页
微芯片电泳是一种快速高效的微分析技术,有巨大的应用潜力,但由于芯片制作成本高、方法的实用性不足,目前在实际样品分析中的应用仍然相当有限。为了促进微芯片电泳的实际应用,本研究利用廉价的环烯烃共聚物(COC)塑料芯片,结合实验室自... 微芯片电泳是一种快速高效的微分析技术,有巨大的应用潜力,但由于芯片制作成本高、方法的实用性不足,目前在实际样品分析中的应用仍然相当有限。为了促进微芯片电泳的实际应用,本研究利用廉价的环烯烃共聚物(COC)塑料芯片,结合实验室自己搭建的低成本程控高压电源和激光诱导荧光检测装置(LIF),对DNA片段、氨基酸、苏丹红类染料进行分析检测,得到了较好的分离效果。 展开更多
关键词 COC 微芯片电泳 dna 氨基酸 苏丹红
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