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基于Circos弦图的居民出行模式可视分析 被引量：6
1
作者 冯涛 艾廷华 +3 位作者 杨伟 张翔 信睿 陈学业 《华中师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2016年第3期471-480,共10页
基于对城市中出租车OD(Origin-Destination:起始点-终止点)流时空模式的研究,能为城市路网规划、出租车营运方案制定以及居民出行计划提供科学的依据.而时空数据可视化与可视分析是从时空轨迹大数据中感知城市动态、分析OD时空模式的重... 基于对城市中出租车OD(Origin-Destination:起始点-终止点)流时空模式的研究,能为城市路网规划、出租车营运方案制定以及居民出行计划提供科学的依据.而时空数据可视化与可视分析是从时空轨迹大数据中感知城市动态、分析OD时空模式的重要手段.该文基于Circos软件,以一种全新的可视化方式对出租车轨迹数据中的OD流进行时空多尺度可视分析.这种方式能在不同时空尺度下表征出租车轨迹OD流的流量、流向及OD流属性特征,能够展示多时空尺度下轨迹OD流数据的时空模式,能更好地理解居民在城市内部区域之间的流动模式,进而揭示居民的出行模式.通过对北京出租车历史轨迹GPS数据进行可视化实验,结果表明该可视化技术能在多时空尺度下表征轨迹OD流数据的时空模式. 展开更多
关键词 circos弦图 OD流 时空多尺度 可视化 出行模式
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大豆粒长、粒宽性状多年的遗传分析与互作位点定位 被引量：2
2
作者 谷月 徐明月 +7 位作者 张清秀 金会会 蒋洪蔚 辛大伟 齐照明 刘春燕 胡振帮 陈庆山 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期2425-2434,共10页
大豆的粒形性状主要包括子粒的粒长、粒宽、粒厚和体现形态学的长宽比、长厚比和宽厚比。本研究以Charleston为母本,东农594为父本杂交构建的RIL群体为材料。从2006年种植在东北农业大学农场试验田,采用SEA-DH软件的主基因+多基因混合... 大豆的粒形性状主要包括子粒的粒长、粒宽、粒厚和体现形态学的长宽比、长厚比和宽厚比。本研究以Charleston为母本,东农594为父本杂交构建的RIL群体为材料。从2006年种植在东北农业大学农场试验田,采用SEA-DH软件的主基因+多基因混合遗传模型进行了大豆粒长、粒宽性状的遗传分析和基因互作分析。此外,利用自主研发的Gene interaction软件完成了大豆连锁群的互作位点的分子标记分析,利用Circos绘制互作位点连锁群信息。结果表明粒长和粒宽性状主要以2对主基因+多基因的方式遗传,粒长的两对主基因间存在互补作用,粒宽性状的两对主基因间存在互补作用、重叠作用和抑制作用。利用互作软件,2008年粒长中符合率≥85%的互作位点共有261对,代表性的互作对包括Satt202(134.1)/Satt009(0)、Satt202(134.1)/Satt584(107.5)、Satt202(134.1)/Satt440(25.4)。2009年粒宽中符合率≥85%的互作位点共有37对,代表性的互作对包括Satt289(142.1)/Satt009(0)、Satt009(0)/Sat_076(93.3)、Satt200(72.5)/Satt009(0)。 展开更多
关键词 大豆 粒长/宽 遗传分析 基因互作 circos
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杭州湾南岸滨海湿地土地利用变化研究 被引量：2
3
作者 赵赛帅 陈海珍 +2 位作者 李璐 吴亚文 章璐 《地理空间信息》 2022年第4期54-58,共5页
以杭州湾南岸滨海湿地为研究区,结合Landsat TM/OLI遥感数据,选取了1992—2017年间的6个时期的影像,构建了适应研究区特点的多种影像特征指数,采用随机森林分类方法提取土地利用类型分布,结合Circos图实现土地利用转移可视化,分析滨海... 以杭州湾南岸滨海湿地为研究区,结合Landsat TM/OLI遥感数据,选取了1992—2017年间的6个时期的影像,构建了适应研究区特点的多种影像特征指数,采用随机森林分类方法提取土地利用类型分布,结合Circos图实现土地利用转移可视化,分析滨海地区土地利用演化过程及其空间和时间变化特征。研究结果表明,选取特征指数结合随机森林分类方法进行土地利用信息提取结果较佳,总体精度达到85.43%(2004年)和87.43%(2014年),同时结合Circos图直观显示土地利用变化方向。本研究方法可为杭州湾滨海湿地潮滩资源开发、利用与保护等提供科学依据,为更好地协调经济发展与生态保护提供决策支持。 展开更多
关键词 滨海湿地 土地利用/覆被变化 随机森林 circos图
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基因组比较数据可视化的快速实现
4
作者 胡祎瑶 钟扬 《复旦学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期107-112,共6页
Circos软件是一款功能强大的用于基因组比较分析数据可视化的图形生成软件,但是该软件需要使用者自己编程提取所需数据,因此如何将基因组注释和比较分析结果与该软件衔接是个非常实际的问题.这里,我们开发了一个能够将基因组数据快速与C... Circos软件是一款功能强大的用于基因组比较分析数据可视化的图形生成软件,但是该软件需要使用者自己编程提取所需数据,因此如何将基因组注释和比较分析结果与该软件衔接是个非常实际的问题.这里,我们开发了一个能够将基因组数据快速与Circos^([1])软件衔接的工具一Geno2Cir.这个工具可以处理对位排列好的基因组数据,进行物种间序列差异的比较,得到能够直接用于生成Circos图像的文件.本工具不仅可以进行基因组之间的两两比较,也可以进行多个基因组之间的同时比较.前者利用窗口步移法进行序列之间的直接比较,后者利用K2P(Kimura-2-parameter)方法先计算两两序列之间的距离,然后得到所有序列之间的距离矩阵之后再计算总体的差异.这一工具可以应用于裸子植物松属物种的叶绿体基因组,以及亲缘关系较远但是序列差异较小的凤蝶总科线粒体基因组的比较. 展开更多
关键词 Geno2Cir 比较基因组学 可视化 circos
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