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CRISPR-Cas9技术筛选肿瘤治疗靶点的优势和缺陷
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作者 常鸿宇 杨澍 郏凯威 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2026年第1期99-104,共6页
成簇规律间隔短回文重复系统及相关蛋白9(CRISPR-Cas9)作为高效、特异的基因编辑工具,已在人类疾病,尤其是肿瘤治疗领域被广泛研究。本文系统梳理CRISPR-Cas9的特点、机制与优势,重点分析该技术在肿瘤治疗靶点筛选中的新突破与前沿应用... 成簇规律间隔短回文重复系统及相关蛋白9(CRISPR-Cas9)作为高效、特异的基因编辑工具,已在人类疾病,尤其是肿瘤治疗领域被广泛研究。本文系统梳理CRISPR-Cas9的特点、机制与优势,重点分析该技术在肿瘤治疗靶点筛选中的新突破与前沿应用,阐明CRISPR-Cas9在肿瘤生物治疗靶点筛选技术中的核心地位。同时,直面CRISPR-Cas9技术筛选靶点在当前临床研究中面临的诸多挑战,深入探讨其局限性和关键瓶颈问题,展望其优化策略和未来发展趋势。 展开更多
关键词 crispr-cas9 肿瘤治疗 筛选靶点 基因编辑 临床应用
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基于CRISPR-Cas9敲除系统的胚胎干细胞基态多能性退出调控基因的筛选与鉴定
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作者 杨艺 阮艳 +3 位作者 张俊磊 田衍平 余梦 李红丽 《陆军军医大学学报》 北大核心 2025年第18期2223-2236,共14页
目的系统性鉴定调控胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESC)基态多能性退出的关键基因,为深入解析多能性状态转换及早期细胞命运决定机制提供新靶点和理论依据。方法利用全基因组Brie敲除文库感染Nanog-绿色荧光蛋白(Nanog-green fluores... 目的系统性鉴定调控胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESC)基态多能性退出的关键基因,为深入解析多能性状态转换及早期细胞命运决定机制提供新靶点和理论依据。方法利用全基因组Brie敲除文库感染Nanog-绿色荧光蛋白(Nanog-green fluorescent protein,Nanog-GFP)报告基因标记的ESC,在白血病抑制因子/血清(leukemia inhibitory factor/serum,LIF/S)条件下持续培养14 d;通过流式细胞术分选Nanog-GFP^(+)(基态)与Nanog-GFP^(-)(始发态)细胞群,提取基因组DNA进行高通量测序;采用MAGeCK软件分析GFP^(-)/Input、GFP^(+)/Input与GFP^(+)/GFP^(-)组的差异基因,利用Metascape和基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)进行功能富集分析;基于筛选结果构建候选基因敲除模型,通过细胞形态观察、Nanog阳性率检测、克隆形成实验及分子标志物检测评估候选基因功能。结果在GFP^(+)/Input筛选中,鉴定出2921个负向变化基因(主要富集于RNA代谢、细胞周期等基础生命过程)和1393个正向变化基因(主要富集于神经系统发育、糖代谢和脉管系统发育等过程)。在GFP^(-)/Input筛选中,鉴定到2765个负向变化基因(主要富集于RNA代谢、细胞周期等基础生命过程)和1303个正向变化基因(主要富集于神经发育、细胞存活、内皮迁移等过程)。在GFP^(+)/GFP^(-)筛选中,鉴定出1001个负向变化基因[主要参与细胞应激响应和丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路抑制]和983个正向变化基因[主要参与成纤维细胞生长因子/细胞外信号调节激酶(fibroblast growth factor/extracellular signal-regulated kinase,FGF/ERK)信号通路和糖代谢过程],其中不仅包括已知的多能性维持因子(如Nanog、Nr5a2、Klf2、Klf4)及多能性退出相关基因(如Gata6、Grb2、Zeb1、Fgfr1),还包括一些在基态多能性退出过程中功能尚未明确的基因(如Dmrt1、Rxra、Zbtb14和Tmem41b)。候选基因功能验证显示,瞬时敲除Dmrt1、Tmem41b和Hic2的ESC中Nanog+细胞比例显著升高(P<0.01),表明这些基因可能抑制基态多能性退出。Dmrt1稳定敲除使ESC呈现更基态的表型,表现为克隆形态变紧密、呈穹隆状,未分化克隆比例增加(P<0.01),基态多能性标志基因(如Nanog、Nr5a2、Dppa3)表达上调(P<0.01),而始发态标志基因(如Fgf5、Lefty1、Dnmt3b)表达下调(P<0.01)。回复表达Dmrt1可逆转上述表型。结论本研究通过全基因组CRISPR-Cas9筛选鉴定出调控ESC基态多能性退出的候选基因集,明确Dmrt1在促进ESC基态多能性退出过程中的关键作用。 展开更多
关键词 crispr-cas9 胚胎干细胞 基态 始发态 多能性退出
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CRISPR-Cas9基因编辑技术修复抗凝血酶基因SERPINC1c.318_319insT突变
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作者 谢海啸 周星星 +3 位作者 徐琦煜 张柯 刘斯奇 王明山 《临床检验杂志》 2025年第6期405-409,共5页
目的初步探讨CRISPR-Cas9基因编辑技术在修复抗凝血酶(AT)基因SERPINC1c.318_319insT突变中的应用价值。方法通过CRISPR在线设计网站设计并合成单链向导RNA(sgRNA),构建AT c.318_319insT突变体和CRISPR-Cas9修复体,将野生型、AT c.318_3... 目的初步探讨CRISPR-Cas9基因编辑技术在修复抗凝血酶(AT)基因SERPINC1c.318_319insT突变中的应用价值。方法通过CRISPR在线设计网站设计并合成单链向导RNA(sgRNA),构建AT c.318_319insT突变体和CRISPR-Cas9修复体,将野生型、AT c.318_319insT突变体和CRISPR-Cas9修复体的基因片段转入慢病毒表达载体中,采用PCR及测序法验证。将构建成功的慢病毒重组质粒转染至人胚肾细胞HEK293T中。细胞培养后,裂解HEK293T细胞,用ELISA法和western blot法比较野生型、CRISPR-Cas9修复体和突变体的细胞裂解液中AT抗原(AT:Ag)含量;用细胞免疫荧光实验对重组AT蛋白进行体外表征。结果AT c.318_319insT突变体和CRISPR-Cas9修复体构建成功,HEK293T细胞体外实验显示,以细胞裂解液中野生型的AT:Ag设为100%,CRISPR-cas9修复体AT:Ag为47%,AT c.318_319insT的AT:Ag为22%,western blot和细胞免疫荧光实验的结果与之相符。结论细胞体外实验验证CRISPR-Cas9基因编辑技术能有效原位修复抗凝血酶基因SERPINC1c.318_319insT突变,为CRISPR-Cas9基因编辑技术应用于临床血栓性遗传病的基因治疗提供实验支持。 展开更多
关键词 血栓性疾病 抗凝血酶 突变 crispr-cas9 基因编辑
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一种基于CRISPR-Cas9的大肠杆菌快速迭代基因编辑工具
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作者 许香香 周航 +3 位作者 张凯宁 马倩 张译文 张学礼 《微生物学通报》 北大核心 2025年第11期5336-5346,共11页
【背景】聚集CRISPR-Cas9系统在大肠杆菌基因编辑中被广泛应用,但目前人工设计的CRISPR-Cas9编辑工具在编辑速度上仍有提升空间。【目的】为了快速迭代基因编辑,需要优化CRISPR-Cas9编辑工具的操作步骤,减少操作时间,从而提高编辑速度... 【背景】聚集CRISPR-Cas9系统在大肠杆菌基因编辑中被广泛应用,但目前人工设计的CRISPR-Cas9编辑工具在编辑速度上仍有提升空间。【目的】为了快速迭代基因编辑,需要优化CRISPR-Cas9编辑工具的操作步骤,减少操作时间,从而提高编辑速度。【方法】加速迭代基因编辑(accelerated iterative gene editing, AIGE)系统中工具质粒使用非温敏型复制子,能够使大肠杆菌(Escherichia coli)在其最适温度进行编辑;借助CRISPR-Cas9系统靶向切割小向导RNA(small guide RNA, sgRNA)表达质粒的抗性基因位置,按照顺序转化sgRNA表达质粒即可实现快速迭代编辑;引入了归巢内切酶编码基因与归巢内切酶识别序列,只需一步诱导便可消除2个工具质粒。【结果】无须宿主细胞的任何基因组预先修饰,该系统在常用大肠杆菌K-12菌株BW25113、DB3.1与Crooks菌株ATCC 8739中都实现了高效迭代编辑。除了通过优化编辑温度为大肠杆菌最适温度而在整体上所缩短的时间,编辑结束后用于消除工具质粒的时间也从约72 h缩短到了约30 h。经过一步诱导操作,2个工具质粒均能被高效消除。【结论】AIGE通过不限制培养温度、sgRNA表达质粒迭代消除,以及将以往报道的两步法消除工具质粒简化为一步消除,加快了大肠杆菌的基因编辑速度,为大肠杆菌的基因工程改造提供了一个快速迭代基因编辑平台。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因编辑 大肠杆菌
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CRISPR-Cas9系统在反刍动物生产中的应用研究进展
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作者 张羽鹏 张宗瑞 +3 位作者 张宁 周琛帛 吴苏君 张元庆 《中国畜禽种业》 2025年第11期39-50,共12页
CRISPR-Cas9基因编辑技术因其精准性、高效性和低成本的优势,已成为反刍动物遗传改良的核心工具。该文主要概述了CRISPR-Cas9技术在反刍动物遗传改良领域的研究进展,重点阐述了该技术在牛、羊生长性状调控、泌乳性能优化、繁殖能力提升... CRISPR-Cas9基因编辑技术因其精准性、高效性和低成本的优势,已成为反刍动物遗传改良的核心工具。该文主要概述了CRISPR-Cas9技术在反刍动物遗传改良领域的研究进展,重点阐述了该技术在牛、羊生长性状调控、泌乳性能优化、繁殖能力提升及抗病机制强化等方面的应用现状以及在生产实践中面临的技术瓶颈与伦理争议,从分子育种角度展望了其未来在农业领域的应用前景,旨在为相关技术的迭代发展提供理论依据和实践参考。 展开更多
关键词 基因编辑 crispr-cas9 肉品质 泌乳 繁殖 抗病
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CRISPR-Cas9基因编辑技术在羊育种中的研究进展
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作者 赵进韬 张瑞国 王喜军 《中国草食动物科学》 北大核心 2025年第5期79-84,共6页
CRISPR-Cas9基因编辑技术是利用细菌的适应性免疫系统,精确对目标DNA序列进行切割和编辑的一种革命性的分子工具。其核心优势在于高效性、精准性和灵活性,能够在基因组特定位点插入、删除或替换,从而实现对基因功能的精确调控。相比传... CRISPR-Cas9基因编辑技术是利用细菌的适应性免疫系统,精确对目标DNA序列进行切割和编辑的一种革命性的分子工具。其核心优势在于高效性、精准性和灵活性,能够在基因组特定位点插入、删除或替换,从而实现对基因功能的精确调控。相比传统的基因编辑技术,CRISPR-Cas9操作简便、成本低廉,且适用于多种生物体系,因此在基础研究、医学治疗和农业育种等领域得到了广泛应用。在羊育种研究中,应用CRISPRCas9基因编辑技术可以精准编辑与其重要经济性状相关的基因,如肌肉生长(MSTN)、羊毛品质(FGF5)和抗病性(HYAL2)等基因,从而加速优良品种的分子育种进程;另外,CRISPR-Cas9基因编辑技术还可用于改善羊的繁殖效率和抗病能力。本文就CRISPR-Cas9基因编辑技术的基本原理及其在羊育种研究中的基因功能调控、生产性能改良和抗病育种等方面进行阐释,同时探讨其应用过程中存在的潜在挑战,以期为推动育种技术创新提供理论参考。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因编辑 分子育种 重要性状
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CRISPR-Cas9基因编辑报道系统于dbDNA来源的iPSC AAVS1安全港的定点整合研究
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作者 何佳佳 陈耀 +2 位作者 曹淳 鞠小丽 周小明 《华中科技大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第2期151-158,共8页
目的建立简便的doggybone DNA(dbDNA)制备技术路线,探讨dbDNA与传统质粒DNA基因表达与诱导免疫反应的差异;利用dbDNA诱导人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)重编程为诱导性多能干细胞(induced pluripotent ste... 目的建立简便的doggybone DNA(dbDNA)制备技术路线,探讨dbDNA与传统质粒DNA基因表达与诱导免疫反应的差异;利用dbDNA诱导人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)重编程为诱导性多能干细胞(induced pluripotent stem cell,iPSC);探索在iPSC AAVS1位点插入超长DNA片段的方案,并同时将Cas9表达框定点插入dbDNA来源的iPSC腺相关病毒位点1(adeno-associated virus site 1,AAVS1)安全港内,构建仅需输入目的基因靶向单向导RNA(single guide RNA,sgRNA)即可实现iPSC基因编辑的稳定细胞株。方法利用Phi29 DNA聚合酶多重置换扩增、原核端粒酶TelN酶切及共价连接、限制性内切酶和外切酶去除骨架环,从而建立简便的dbDNA制备技术路线,将dbDNA-GFP载体与pMax-dbDNA-GFP传统质粒载体分别电转至PBMC,检测绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)表达效率,利用qPCR检测两组细胞干扰素-γ(interferon-γ,IFN-γ)的mRNA表达水平;制备dbDNA重编程载体dbDNA-MOS、dbDNA-KLF4、dbDNA-MYC及dbDNA-BCL并核转PBMC诱导重编程,通过形态学、碱性磷酸酶染色、RT-PCR以及干细胞多能性标志物检测来鉴定dbDNA-iPSC细胞系;在iPSC AAVS1位点利用ZFN与TALEN基因编辑技术插入11.5 kb的含有Cas9表达框、序列中引入终止密码子的EGFP读码框、真核细胞筛选标记等元件的超长DNA片段,通过红色荧光检测、基因组PCR反应以及Western blot等方法鉴定Cas9整合入AAVS1位点的iPSC细胞株,将EGFP单链同源修复模板与EGFP sgRNA共转染阳性iPSC细胞株,靶向修复EGFP基因中错误终止密码子,正确表达绿色荧光蛋白,从而验证Cas9蛋白的基因编辑能力。结果成功制备dbDNA载体并利用其实现基因表达,dbDNA表达GFP基因效率与传统质粒DNA表达效率相近,IFN-γ的mRNA表达水平dbDNA组小于传统质粒DNA组;成功获取形态似人胚胎干细胞,碱性磷酸酶染色、多能性相关基因表达及干细胞多能性标志物阳性的iPSC细胞系;并在该细胞系安全港AAVS1位点成功基因编辑插入超长片段CRISPR-Cas9基因编辑报道系统,基因组PCR鉴定整合片段成功插入基因组,表达红色荧光蛋白,Western blot证实Cas9蛋白成功表达,并成功修复EGFP基因,使细胞表达绿色荧光。结论本研究成功建立了简便的dbDNA制备的技术路线,dbDNA载体基因表达效率与传统质粒DNA无差异,诱导免疫反应较小;经形态学、碱性磷酸酶染色、RT-PCR以及干细胞多能性标志物鉴定获取dbDNA来源的iPSC;成功在iPSC AAVS1安全港插入一个11.5 kb的超长DNA片段,构建Cas9介导基因编辑的iPSC稳定细胞株。 展开更多
关键词 诱导性多能干细胞 dbDNA crispr-cas9 腺相关病毒位点1
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基于CRISPR-Cas9技术探讨基因治疗的技术创新及发展趋势
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作者 万正浩 《生物医学工程学进展》 2025年第3期311-320,共10页
基因治疗作为生物医学领域的一项变革性进展,利用基因编辑技术和载体传递手段修复或替代缺陷基因,在医学研究和临床应用中展现出了巨大的潜力。近年来,随着成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(Clustered Regularly Interspaced ... 基因治疗作为生物医学领域的一项变革性进展,利用基因编辑技术和载体传递手段修复或替代缺陷基因,在医学研究和临床应用中展现出了巨大的潜力。近年来,随着成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat/CRISPR-Associated Protein 9,CRISPR-Cas9)技术的重大突破、非病毒载体的持续改进及政策支持的不断增强,基因治疗的应用范围已从传统的单基因遗传病扩展至肿瘤、慢性病及感染性疾病等多个领域,显示出广泛的应用前景。尽管基因治疗已经取得显著进展,但仍面临安全性、有效性、伦理问题及治疗费用高昂等诸多挑战,极大地限制了其临床应用潜力。该文旨在基于CRISPR-Cas9技术探讨基因治疗技术的创新及发展趋势,通过分析当前的研究进展和临床应用,发掘基因治疗在遗传性疾病、癌症及罕见病等治疗中的潜力,并讨论该技术在未来研究中的发展方向,以期为相关领域的研究提供工具。 展开更多
关键词 基因治疗 crispr-cas9技术 技术创新 疾病治疗 发展趋势
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Functionalized chitosan as nano-delivery platform for CRISPR-Cas9 in cancer treatment
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作者 Asif Nawaz Nur Syamimi Ariffin Tin Wui Wong 《Asian Journal of Pharmaceutical Sciences》 2025年第3期24-42,共19页
CRISPR-Cas system permanently deletes any harmful gene-of-interest to combat cancer growth.Chitosan(CS)is a potential cancer therapeutic that mediates via PI3K/Akt/mTOR,MAPK and NF-kβsignaling pathway modulation.CS a... CRISPR-Cas system permanently deletes any harmful gene-of-interest to combat cancer growth.Chitosan(CS)is a potential cancer therapeutic that mediates via PI3K/Akt/mTOR,MAPK and NF-kβsignaling pathway modulation.CS and its covalent derivatives have been designed as nanocarrier of CRISPR-Cas9 alone(plasmid or ribonucleoprotein)or in combination with chemical drug for cancer treatment.The nanocarrier was functionalized with polyethylene glycol(PEG),targeting ligand,cell penetrating ligand and its inherent positive zeta potential to mitigate premature clearance and particulate aggregation,and promote cancer cell/nucleus targeting and permeabilization to enable CRISPR-Cas9 acting on the host DNA.Different physicochemical attributes are required for the CS-based nanocarrier to survive from the administration site,through the systemic circulation-extracellular matrix-mucus-mucosa axis,to the nucleus target.CRISPR-Cas9 delivery is met with heterogeneous uptake by the cancer cells.Choice of excipients such as targeting ligand and PEG may be inappropriate due to lacking overexpressed cancer receptor or availability of excessive metabolizing enzyme and immunoglobulin that defies the survival and action of these excipients rendering nanocarrier fails to reach the target site.Cancer omics analysis should be implied to select excipients which meet the pathophysiological needs,and chitosan nanocarrier with a“transformative physicochemical behavior”is essential to succeed CRISPR-Cas9 delivery. 展开更多
关键词 CANCER CHITOSAN crispr-cas9 EXCIPIENT NANOCARRIER
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CRISPR-Cas9基因编辑技术在西洋参中的探索与应用
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作者 邱杰 胡静 +4 位作者 马荣荣 毛积磊 胡怡林 刘甜甜 侯丽娟 《农业开发与装备》 2025年第8期85-87,共3页
成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas基因编辑技术由于其易于操作且高效,成为应用最广泛的基因编辑工具,开启了基因组工程的新时代,越来越多的植物物种通过这种技术进行基因定向编辑。西洋参是五加科人参属多年生药食同源的名贵中... 成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas基因编辑技术由于其易于操作且高效,成为应用最广泛的基因编辑工具,开启了基因组工程的新时代,越来越多的植物物种通过这种技术进行基因定向编辑。西洋参是五加科人参属多年生药食同源的名贵中草药之一,在药品、食品以及化妆品等多个领域均有广泛的应用。若将基因编辑技术应用于人参等药用植物具有深远意义。然而,CRISPR-Cas9基因编辑技术在西洋参物种的应用还处于初级阶段。对基因编辑技术的发展历程、结构特点、工作原理以及在不同植物物种中的应用进行论述,并对基因编辑技术在西洋参中的应用前景进行了展望。目的是为该技术在西洋参基因组功能研究、遗传改良和种质创新等方面的应用提供参考。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因编辑 西洋参 遗传改良
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基于CRISPR-Cas9的谷氨酸棒杆菌代谢途径重构及L-赖氨酸高产菌株构建
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作者 马然静 《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》 2025年第11期142-146,共5页
赖氨酸是重要的发酵氨基酸产品,提升其微生物合成效率具有显著的工业价值。本研究基于CRISPR-Cas9系统对谷氨酸棒杆菌赖氨酸合成路径关键基因lysC、dapA与pyc进行定向编辑与代谢重构,构建了多种工程菌株并进行发酵性能评估。结果显示联... 赖氨酸是重要的发酵氨基酸产品,提升其微生物合成效率具有显著的工业价值。本研究基于CRISPR-Cas9系统对谷氨酸棒杆菌赖氨酸合成路径关键基因lysC、dapA与pyc进行定向编辑与代谢重构,构建了多种工程菌株并进行发酵性能评估。结果显示联合作用可显著提高赖氨酸产量与碳源转化效率,高产菌株在发酵罐中表现稳定,路径设计与产物性能高度一致,验证该策略在高产菌株构建中的实用性和有效性。 展开更多
关键词 crispr-cas9 谷氨酸棒杆菌 赖氨酸 代谢工程
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CRISPR-Cas9技术在作物育种中的应用及伦理考量
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作者 陈春彦 《种子科技》 2025年第6期32-34,共3页
CRISPR-Cas9技术通过精确的基因敲除、插入或定点突变等,显著提高了作物抗逆性及产量,目前已广泛应用于各个领域,具有操作简单、周期短、效率高等优点。介绍了CRISPR-Cas9技术的产生与发展、技术原理及其在粮食作物和经济作物育种中的应... CRISPR-Cas9技术通过精确的基因敲除、插入或定点突变等,显著提高了作物抗逆性及产量,目前已广泛应用于各个领域,具有操作简单、周期短、效率高等优点。介绍了CRISPR-Cas9技术的产生与发展、技术原理及其在粮食作物和经济作物育种中的应用,并分析了相关研究和应用案例,深入探讨了该技术面临的问题,为保障全球粮食安全和农业可持续发展提供参考。 展开更多
关键词 crispr-cas9技术 作物育种 伦理考量
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基于CRISPR-Cas9的黄瓜Csago1c突变体创制及其种子萌发分析 被引量:1
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作者 况勇 肖逸 +3 位作者 管丽丽 孙照龙 李俊 甘德芳 《核农学报》 北大核心 2025年第8期1617-1629,I0002-I0004,共16页
Argonaute(AGO)蛋白是RNA诱导的基因沉默复合体的核心组分,参与调控植物生长发育及逆境胁迫响应等生物学过程。为探讨黄瓜Cs AGO1c基因的功能,利用CRISPR/Cas9技术构建黄瓜Cs AGO1c基因编辑载体,农杆菌介导法转化新泰密刺自交系,经筛选... Argonaute(AGO)蛋白是RNA诱导的基因沉默复合体的核心组分,参与调控植物生长发育及逆境胁迫响应等生物学过程。为探讨黄瓜Cs AGO1c基因的功能,利用CRISPR/Cas9技术构建黄瓜Cs AGO1c基因编辑载体,农杆菌介导法转化新泰密刺自交系,经筛选和分子检测获得CsAGO1c基因突变植株,分析Csago1c突变体的编辑情况、突变体植株的表型以及种子萌发情况。结果表明,试验获得4株转基因抗性苗(T_(0)),其中#4和#12为编辑植株,#7和#11未发生编辑;但#7植株在T1代出现了大片段碱基缺失、少数碱基缺失、单碱基插入以及碱基替换等多种编辑情况。突变体植株在叶片形状、节间长、卷须、侧枝、雄花和雌花着生节位等与对照均无明显差异,但突变体种子萌发率降低,推测Cs AGO1c可能参与调控黄瓜种子的萌发过程。该研究结果对探明黄瓜Cs AGO1c基因功能以及对黄瓜遗传改良和新品种选育具有重要理论指导意义。 展开更多
关键词 黄瓜 Argonaute(AGO)蛋白 CRISPR/Cas9 基因编辑 种子萌发
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RS-1提高CRISPR-Cas9系统介导的人乳铁蛋白基因敲入效率 被引量:12
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作者 周文君 郭日红 +2 位作者 邓明田 王锋 张艳丽 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1224-1234,共11页
尝试利用CRISPR-Cas9系统敲除山羊基因组中β-乳球蛋白(BLG)基因,以实现在BLG基因座敲入人乳铁蛋白(h LF)基因,并进一步探讨了不同浓度RAD51蛋白激活剂(RS-1)对同源重组效率的影响。首先针对山羊BLG的第一外显子设计并构建了sg RNA和Cas... 尝试利用CRISPR-Cas9系统敲除山羊基因组中β-乳球蛋白(BLG)基因,以实现在BLG基因座敲入人乳铁蛋白(h LF)基因,并进一步探讨了不同浓度RAD51蛋白激活剂(RS-1)对同源重组效率的影响。首先针对山羊BLG的第一外显子设计并构建了sg RNA和Cas9共表达载体p Cas9-sg BLG,将该载体转染至山羊耳成纤维细胞,利用PCR和T7EN1法验证了其基因组编辑活性;然后进一步构建了BLG基因打靶载体p BHA-h LF-NIE(包含NEO/EGFP);将该打靶载体与p Cas9-sg BLG载体共转染至山羊耳成纤维细胞,分别用0、5、10和20μmol/L RS-1处理细胞,分析了绿色荧光蛋白的表达效率;同时用800μg/m L G418对不同浓度RS-1处理后的细胞进行筛选,挑取EGFP阳性细胞克隆,进一步通过PCR和测序鉴定h LF定点敲入的阳性细胞克隆。结果显示:设计的sg RNA编辑山羊BLG位点的效率为25%-31%;报告基因的表达效率提示RS-1可以促进基因敲入效率的提高,其效率与RS-1浓度呈正相关,20μmol/L RS-1处理组的效率是对照组的3.5倍;利用G418筛选h LF敲入阳性细胞克隆后,当RS-1浓度为0-10μmol/L时,h LF敲入效率随着RS-1浓度增加而升高,在10μmol/L时阳性克隆率最高为32.61%,然而在20μmol/L时敲入阳性克隆率下降至22.22%,且衰老细胞克隆增多。以上结果表明,利用CRISPR-Cas9系统可以实现在山羊耳成纤维细胞中敲除BLG基因和敲入h LF基因,且适宜浓度的RS-1可以显著提升基因敲入效率,本试验为高效利用CRISPR-Cas9系统获得基因敲入的细胞提供了参考依据。 展开更多
关键词 crispr-cas9 RS-1 Β-乳球蛋白 同源重组 人乳铁蛋白 山羊耳成纤维细胞
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利用CRISPR-Cas9系统定点突变猪MSTN基因的研究 被引量:12
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作者 张冬杰 刘娣 +2 位作者 张旭 汪亮 杨国伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期207-212,共6页
为了今后能够有效的利用CRISPR-Cas9系统进行基因功能研究及转基因动物的培育,本研究将带有绿色荧光蛋白(GFP)和肌肉生长抑制素基因(Myostatin,MSTN)靶序列的CRISPR-Cas9系统转染入PK15细胞系,利用流式细胞仪分离并收集转染成功的阳性细... 为了今后能够有效的利用CRISPR-Cas9系统进行基因功能研究及转基因动物的培育,本研究将带有绿色荧光蛋白(GFP)和肌肉生长抑制素基因(Myostatin,MSTN)靶序列的CRISPR-Cas9系统转染入PK15细胞系,利用流式细胞仪分离并收集转染成功的阳性细胞,使用PCR扩增结合克隆测序的方法检测和分析CRISPR-Cas9系统的定点突变情况,以评价CRISPR-Cas9系统的作用效果。结果发现,随机挑选的100个阳性克隆中,38个发生了变异,突变效率为38%,其中32个为插入突变,6个为缺失突变。插入突变中突变1(Mutation1)所占比例最高,为47.4%。本研究中CRISPR-Cas9系统的突变效率达到了38%,是目前进行基因组编辑的一个有效工具,推测其突变类型具有一定的偏好性。 展开更多
关键词 crispr-cas9系统 基因组编辑 突变率
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甘蓝型油菜BnaLCR23基因CRISPR-Cas9表达载体的构建及遗传转化 被引量:6
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作者 刘询 张斌 +2 位作者 李浪 刘春林 阮颖 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期3024-3029,共6页
BnaLCR23基因是甘蓝型油菜"湘油15号"种子不同发育时期抑制差减杂交文库中的一个功能未知基因,分析表明其功能可能与种子发育和油脂代谢相关,为了明确该基因的功能,本研究基于CRISPR-Cas9基因编辑系统构建了该基因的敲除质粒... BnaLCR23基因是甘蓝型油菜"湘油15号"种子不同发育时期抑制差减杂交文库中的一个功能未知基因,分析表明其功能可能与种子发育和油脂代谢相关,为了明确该基因的功能,本研究基于CRISPR-Cas9基因编辑系统构建了该基因的敲除质粒。利用根癌农杆菌介导的油菜下胚轴遗传转化方法将敲除质粒转入甘蓝型油菜中,经潮霉素抗性筛选以及抗性苗基因组DNA的PCR检测,获得转基因油菜。转基因油菜材料的获得为深入研究BnaLCR23基因在甘蓝型油菜种子发育和储存物的积累过程中的功能提供了帮助。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 BnaLCR23 crispr-cas9 遗传转化
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CRISPR-Cas9植物基因编辑系统敲除拟南芥AG基因表达载体的构建 被引量:6
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作者 王晓霞 苏哲 +1 位作者 岳彩云 樊金会 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期593-597,共5页
CRISPR-Cas系统是细菌和古细菌在进化过程中逐渐形成的一种适应性免疫系统,通过sg RNA介导对靶位点进行定位并利用Cas酶对核酸实现双链断裂(double-strand break,DSB)。CRISPR-Cas系统作为一种新兴的基因定点编辑技术逐渐成熟并在多个... CRISPR-Cas系统是细菌和古细菌在进化过程中逐渐形成的一种适应性免疫系统,通过sg RNA介导对靶位点进行定位并利用Cas酶对核酸实现双链断裂(double-strand break,DSB)。CRISPR-Cas系统作为一种新兴的基因定点编辑技术逐渐成熟并在多个植物中成功得到应用,以此技术对目的基因进行靶向的敲除或敲入。本实验以拟南芥AG基因为基础,构建CRISPR-Cas9植物基因编辑系统敲除拟南芥AG基因的表达载体,并利用农杆菌介导CRISPR-Cas9植物基因编辑系统敲除拟南芥AG基因,以获得高效的敲除拟南芥基因的遗传转化体系。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因敲除 拟南芥 AG 遗传转化
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利用CRISPR-Cas9技术快速创制番茄雄性不育系 被引量:3
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作者 杨亮 刘欢 +6 位作者 李菊 李志 苗明军 龙海成 周玉洁 王海娥 常伟 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第11期3619-3627,共9页
为创制番茄雄性不育系,利用CRISPR-Cas9技术对番茄雄性不育基因SlTM6进行定向编辑,在SlTM6基因第一外显子区域设计两个靶位点,构建CRISPR-Cas9基因敲除载体,并通过农杆菌转化番茄优异自交系T048。对8株转基因阳性株系进行靶位点序列分... 为创制番茄雄性不育系,利用CRISPR-Cas9技术对番茄雄性不育基因SlTM6进行定向编辑,在SlTM6基因第一外显子区域设计两个靶位点,构建CRISPR-Cas9基因敲除载体,并通过农杆菌转化番茄优异自交系T048。对8株转基因阳性株系进行靶位点序列分析发现,共有6株发生了编辑事件,编辑效率为75%,其中,双等位编辑株系表现为柱头外露,雄蕊发育不完全且无花粉活性,而杂合编辑株系可育。对T0代杂合编辑株系进行继代培养后获得无外源载体成分的纯合雄性不育株系,同时开发分子标记并进行验证。本研究表明,通过CRISPR-Cas9技术对雄性不育基因SlTM6进行定向编辑可快速创制雄性不育番茄新种质。 展开更多
关键词 番茄(Solanum lycopersicum) 雄性不育 SlTM6 crispr-cas9 基因组编辑
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木薯MeMLO12基因克隆及其CRISPR-Cas9表达载体的构建 被引量:2
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作者 蔡吉苗 李博勋 +3 位作者 黄贵修 李超萍 时涛 王国芬 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1528-1537,共10页
MLO基因是植物中特有的一类抗病性负调控因子,该基因突变导致植物产生广谱抗病性。本研究从木薯全基因组中克隆获得木薯MLO12基因的DNA和cDNA序列,并将其命名为MeMLO12。该基因全长3743 nt、编码区(ORF)全长1728 nt,具有一个完整的开放... MLO基因是植物中特有的一类抗病性负调控因子,该基因突变导致植物产生广谱抗病性。本研究从木薯全基因组中克隆获得木薯MLO12基因的DNA和cDNA序列,并将其命名为MeMLO12。该基因全长3743 nt、编码区(ORF)全长1728 nt,具有一个完整的开放阅读框,含有15个外显子和14个内含子,编码586个氨基酸,蛋白的分子质量为67.2 kDa,等电点为8.85。该基因编码的蛋白定位在内质网膜上,无信号肽,在23~45、74~96、161~183、285~307、312~334、371~393、413~435 aa处形成7次跨膜结构域。qRT-PCR定量分析发现,受木薯黄单胞病菌侵染后,MeMLO12基因在木薯抗、感品种中的表达量存在明显的差异,参与木薯与黄单胞菌之间的互作,表现出负调控作用。选择该基因第11个外显子进行Snap Gene Viewer分析,获得了10 455条sgRNA的种子序列,从中选取3条靶序列约23 nt,碱基组成上3'末端含G结尾,将其构建到CRISPR-Cas9载体上,经验证,确认MeMLO12的3条靶序列已经成功构建到基因编辑载体上,将其命名为pSGR-Cas9-AT-MeMLO12载体。 展开更多
关键词 木薯 MeMLO12基因 克隆 表达分析 crispr-cas9载体 构建
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CRISPR-Cas9研究进展及在基因治疗上的应用 被引量:2
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作者 刘瑞琪 王玮玮 +3 位作者 吴勇延 赵秋云 王勇胜 卿素珠 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期72-78,共7页
CRISPR-Cas9[Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPRassociated(Cas)9]是近年兴起的一种高特异性和高效的基因编辑新技术,由向导RNA(single guide RNA,sgRNA)和cas9(CRISPR-associated 9)蛋白组成... CRISPR-Cas9[Clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)/CRISPRassociated(Cas)9]是近年兴起的一种高特异性和高效的基因编辑新技术,由向导RNA(single guide RNA,sgRNA)和cas9(CRISPR-associated 9)蛋白组成,引起DNA位点特异性双链断裂(double-strand breaks,DSBs),引发同源重组修复(homology-directed repair,HDR)或非同源末端连接修复(non-homologous end joining,NHEJ),达到靶基因修饰的作用。CRISPR-Cas9技术自发现以来,因其便于操作、花费较低、高特异性、可同时打靶任意数量基因等优点而被应用。近年研究显示,对于一些遗传性疾病,可通过CRISPR-Cas9精确的基因编辑破坏致病的内源基因、改正引起疾病的突变体或插入新的保护性基因进行治疗,该技术为基因治疗开启了一个新方向。主要从CRISPR-Cas9结构、作用机制及在疾病基因治疗上的应用等方面进行了综述。 展开更多
关键词 crispr-cas9 基因编辑 基因治疗
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