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新麦草独脚金内酯合成相关基因CCD7的克隆及表达分析
1
作者
艾芊
云岚
+1 位作者
任晓敏
姚娜
《草地学报》
北大核心
2025年第2期382-390,共9页
植物CCD7基因参与合成独脚金内酯。为研究新麦草[Psathyrostachys juncea(Fisch.)Nevski]CCD7基因的功能,本研究以多分蘖型新麦草和少分蘖型新麦草的分蘖节为材料,通过RNA-seq及荧光定量PCR分析CCD7基因在新麦草中的表达量,通过构建pcam...
植物CCD7基因参与合成独脚金内酯。为研究新麦草[Psathyrostachys juncea(Fisch.)Nevski]CCD7基因的功能,本研究以多分蘖型新麦草和少分蘖型新麦草的分蘖节为材料,通过RNA-seq及荧光定量PCR分析CCD7基因在新麦草中的表达量,通过构建pcambia1300-cYFP-CCD7过表达载体,分析新麦草CCD7基因在烟草叶片中的亚细胞定位;通过生物信息学分析预测CCD7基因的基本功能。结果显示,新麦草CCD7基因序列克隆全长为1638 bp,亚细胞定位新麦草CCD7基因在烟草叶片细胞的叶绿体中表达;表达量分析表明新麦草的分蘖数量与该基因的表达量呈现负相关关系。预测新麦草CCD7保守结构域的范围是第13到第544个氨基酸,该基因在9个近缘物种中功能保守,编码蛋白性质相近,新麦草CCD7蛋白的丝氨酸磷酸化位点最有可能是蛋白发挥功能的磷酸化位点。
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关键词
新麦草
ccd7
过表达载体
亚细胞定位
基因克隆
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职称材料
黄瓜CsCCD7基因的核酸和蛋白质序列分析
被引量:
5
2
作者
徐庆华
胡宝忠
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2011年第8期172-180,共9页
为了研究CsCCD7蛋白的生物学功能,并为CsCCD7的表达调控提供理论依据,使用一系列生物信息学软件、数据库和在线程序,对黄瓜CsCCD7核酸序列及蛋白序列进行分析。结果表明,CsCCD7开放阅读框长1665bp,编码554AA,与CCD7蛋白同源性高;预测CsC...
为了研究CsCCD7蛋白的生物学功能,并为CsCCD7的表达调控提供理论依据,使用一系列生物信息学软件、数据库和在线程序,对黄瓜CsCCD7核酸序列及蛋白序列进行分析。结果表明,CsCCD7开放阅读框长1665bp,编码554AA,与CCD7蛋白同源性高;预测CsCCD7位于黄瓜第6号染色体上、基因全长含7个外显子和6个内含子。CsCCD7分子量是62.7KDa、是不稳定蛋白;其蛋白序列中富含磷酸化位点;此蛋白为非分泌型蛋白、无跨膜结构域;预测其定位于叶绿体;此蛋白二级结构预测表明β折叠和β转角加起来的量多于α螺旋的量、为亲水性蛋白质;其二级结构和三级结构预测显示属于类胡萝卜素双加氧酶家族成员。CsCCD7属于CCDs蛋白家族成员,为黄瓜腋芽生长抑制基因的同源基因,可能在黄瓜腋芽生长和发育阶段对独角金内酯的合成和信号转导途径中起到重要作用,CsCCD7有进一步研究的价值。
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关键词
黄瓜
ccd7
生物信息学分析
染色体定位
蛋白亚细胞定位
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职称材料
番茄独脚金内酯合成关键基因CCD7、CCD8 RNA沉默载体的构建
被引量:
3
3
作者
田芳
姚兆群
+2 位作者
陈美秀
徐瑛
赵思峰
《湖北农业科学》
2016年第21期5668-5671,共4页
根据已知的番茄(Lycopersicon esculentum Mill.)CCD7和CCD8基因的序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆CCD7和CCD8基因片段,通过特定酶切将2个基因进行拼接,再将串联基因以反向重复的方式连入p UCCRNAi载体,并定向插入到p35植物表达载体...
根据已知的番茄(Lycopersicon esculentum Mill.)CCD7和CCD8基因的序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆CCD7和CCD8基因片段,通过特定酶切将2个基因进行拼接,再将串联基因以反向重复的方式连入p UCCRNAi载体,并定向插入到p35植物表达载体上。结果表明,克隆获得了大小约为400 bp的CCD7和CCD8基因片段,基因片段拼接后获得800 bp左右的串联片段CCD7-8;将该基因片段插入p UCCRNAi载体后得到1 700 bp大小的含Intron的反向重复序列In-7-8,并成功插入到植物表达载体p35中,通过酶切分析,RNAi载体构建正确。最终成功构建了番茄CCD7和CCD8 2个串联基因的RNA沉默表达载体p35-In-7-8。
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关键词
番茄(Lycopersicon
ESCULENTUM
Mill.)
独脚金内酯
列当
类胡萝卜素裂解双加氧酶7(
ccd7
)和8(CCD8)
RNA沉默载体
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职称材料
NV—7CCD摄象器件的工作原理简介
4
作者
拓原
《电子天府》
1992年第4期10-13,61,共5页
关键词
NV-M7CCD
摄象器件
摄象机
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职称材料
题名
新麦草独脚金内酯合成相关基因CCD7的克隆及表达分析
1
作者
艾芊
云岚
任晓敏
姚娜
机构
内蒙古农业大学草业学院
草地资源教育部重点实验室
出处
《草地学报》
北大核心
2025年第2期382-390,共9页
基金
内蒙古自治区自然科学基金重点项目(2023ZD07)
国家自然科学基金面上项目(32371762)
内蒙古自治区种业创新重大示范工程“揭榜挂帅”项目(2022-JBGS00400303)资助。
文摘
植物CCD7基因参与合成独脚金内酯。为研究新麦草[Psathyrostachys juncea(Fisch.)Nevski]CCD7基因的功能,本研究以多分蘖型新麦草和少分蘖型新麦草的分蘖节为材料,通过RNA-seq及荧光定量PCR分析CCD7基因在新麦草中的表达量,通过构建pcambia1300-cYFP-CCD7过表达载体,分析新麦草CCD7基因在烟草叶片中的亚细胞定位;通过生物信息学分析预测CCD7基因的基本功能。结果显示,新麦草CCD7基因序列克隆全长为1638 bp,亚细胞定位新麦草CCD7基因在烟草叶片细胞的叶绿体中表达;表达量分析表明新麦草的分蘖数量与该基因的表达量呈现负相关关系。预测新麦草CCD7保守结构域的范围是第13到第544个氨基酸,该基因在9个近缘物种中功能保守,编码蛋白性质相近,新麦草CCD7蛋白的丝氨酸磷酸化位点最有可能是蛋白发挥功能的磷酸化位点。
关键词
新麦草
ccd7
过表达载体
亚细胞定位
基因克隆
Keywords
Psathyrostachys juncea
ccd7
Over expression vector
subcellular localization
Gene cloning
分类号
S543.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
黄瓜CsCCD7基因的核酸和蛋白质序列分析
被引量:
5
2
作者
徐庆华
胡宝忠
机构
东北农业大学成栋学院
东北农业大学生命科学学院
出处
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2011年第8期172-180,共9页
基金
国家863资助项目"腌渍黄瓜分子聚合育种技术研究及应用"(2007AA10Z177)
高等学校博士点专项科研基金"黄瓜矮化突变体分枝特性的研究"(200802240008)
文摘
为了研究CsCCD7蛋白的生物学功能,并为CsCCD7的表达调控提供理论依据,使用一系列生物信息学软件、数据库和在线程序,对黄瓜CsCCD7核酸序列及蛋白序列进行分析。结果表明,CsCCD7开放阅读框长1665bp,编码554AA,与CCD7蛋白同源性高;预测CsCCD7位于黄瓜第6号染色体上、基因全长含7个外显子和6个内含子。CsCCD7分子量是62.7KDa、是不稳定蛋白;其蛋白序列中富含磷酸化位点;此蛋白为非分泌型蛋白、无跨膜结构域;预测其定位于叶绿体;此蛋白二级结构预测表明β折叠和β转角加起来的量多于α螺旋的量、为亲水性蛋白质;其二级结构和三级结构预测显示属于类胡萝卜素双加氧酶家族成员。CsCCD7属于CCDs蛋白家族成员,为黄瓜腋芽生长抑制基因的同源基因,可能在黄瓜腋芽生长和发育阶段对独角金内酯的合成和信号转导途径中起到重要作用,CsCCD7有进一步研究的价值。
关键词
黄瓜
ccd7
生物信息学分析
染色体定位
蛋白亚细胞定位
Keywords
Cucumis sativus L.
ccd7
bioinformatics analysis
chromosome location
protein subcellular location
分类号
S6 [农业科学—园艺学]
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职称材料
题名
番茄独脚金内酯合成关键基因CCD7、CCD8 RNA沉默载体的构建
被引量:
3
3
作者
田芳
姚兆群
陈美秀
徐瑛
赵思峰
机构
新疆绿洲农业病虫害治理与植保资源利用自治区高校重点实验室/石河子大学农学院
出处
《湖北农业科学》
2016年第21期5668-5671,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31460467)
文摘
根据已知的番茄(Lycopersicon esculentum Mill.)CCD7和CCD8基因的序列设计特异性引物,采用RT-PCR克隆CCD7和CCD8基因片段,通过特定酶切将2个基因进行拼接,再将串联基因以反向重复的方式连入p UCCRNAi载体,并定向插入到p35植物表达载体上。结果表明,克隆获得了大小约为400 bp的CCD7和CCD8基因片段,基因片段拼接后获得800 bp左右的串联片段CCD7-8;将该基因片段插入p UCCRNAi载体后得到1 700 bp大小的含Intron的反向重复序列In-7-8,并成功插入到植物表达载体p35中,通过酶切分析,RNAi载体构建正确。最终成功构建了番茄CCD7和CCD8 2个串联基因的RNA沉默表达载体p35-In-7-8。
关键词
番茄(Lycopersicon
ESCULENTUM
Mill.)
独脚金内酯
列当
类胡萝卜素裂解双加氧酶7(
ccd7
)和8(CCD8)
RNA沉默载体
Keywords
tomato(Lycopersicon esculentum Mill.)
strigolactones
orobanche
carotenoid cleavage dioxygense 7(
ccd7
) and 8(CCD8)
RNA silencing vector
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
NV—7CCD摄象器件的工作原理简介
4
作者
拓原
出处
《电子天府》
1992年第4期10-13,61,共5页
关键词
NV-M7CCD
摄象器件
摄象机
分类号
TN948.41 [电子电信—信号与信息处理]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新麦草独脚金内酯合成相关基因CCD7的克隆及表达分析
艾芊
云岚
任晓敏
姚娜
《草地学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黄瓜CsCCD7基因的核酸和蛋白质序列分析
徐庆华
胡宝忠
《中国农学通报》
CSCD
北大核心
2011
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
番茄独脚金内酯合成关键基因CCD7、CCD8 RNA沉默载体的构建
田芳
姚兆群
陈美秀
徐瑛
赵思峰
《湖北农业科学》
2016
3
在线阅读
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职称材料
4
NV—7CCD摄象器件的工作原理简介
拓原
《电子天府》
1992
0
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职称材料
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