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鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的生物信息学分析及抗原表位预测 被引量:3
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作者 王姝懿 赵学亮 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2019年第10期1141-1146,共6页
目的探讨鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的组成结构及生物学功能。方法运用ProtScale,TMHMM Server,Signal P 3.0 Server,NetPhos3.0 Server,SOPMA,Swiss-mode和DNAStar等生物信息学软件分析鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的氨基酸序列组成、理化性质、... 目的探讨鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的组成结构及生物学功能。方法运用ProtScale,TMHMM Server,Signal P 3.0 Server,NetPhos3.0 Server,SOPMA,Swiss-mode和DNAStar等生物信息学软件分析鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的氨基酸序列组成、理化性质、亲疏水性、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点、二、三级结构和B、T细胞抗原表位等。结果 CAF-1是由170个氨基酸构成的富含苏氨酸的稳定亲水蛋白,相对分子质量为17.7×10~3,理论等电点为4.83,不含跨膜区且磷酸化程度较高。二级结构中β转角和无规则卷曲为主要结构原件,分别占41.18%和32.35%。同源建模显示,GMQE和QMEAN评估分值分别为0.90和0.76。抗原表位预测显示,该蛋白含有多个B细胞优势抗原表位和7个优势CTL表位。结论生物信息学预测CAF-1基因编码蛋白为稳定分泌蛋白和外膜蛋白,含有较多的B、T细胞抗原表位,具有较好的抗原性,可作为新型疫苗的潜在候选基因。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 caf-1基因 抗原表位 生物信息学
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CAF-1在体细胞重编程中的作用机制 被引量:1
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作者 张迎冰 于芮峦 +3 位作者 乔培培 杨莹 张涌 苏建民 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1769-1777,共9页
染色质组装因子1(chromatin assembly factor-1,CAF-1),是由p150、p60、p48三个亚单位组成的组蛋白伴侣。CAF-1主要功能是在DNA复制中与增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)相互作用,负责募集组蛋白H3、H4沉积在... 染色质组装因子1(chromatin assembly factor-1,CAF-1),是由p150、p60、p48三个亚单位组成的组蛋白伴侣。CAF-1主要功能是在DNA复制中与增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)相互作用,负责募集组蛋白H3、H4沉积在新合成的DNA上以促进核小体装配。越来越多的研究解析CAF-1复合体的结构及其生物学功能,并发现CAF-1在体细胞重编程过程中发挥重要作用。因此,本文重点介绍了CAF-1的结构、生物学功能和在体细胞重编程中的作用。 展开更多
关键词 caf-1 体细胞重编程 结构 功能
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组蛋白分子伴侣CAF-1与DNA损伤修复相关研究进展
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作者 李睿姝 韩榕 《安徽农业科学》 CAS 2021年第18期12-17,共6页
DNA的完整稳定是真核生物正常生命活动的基础,为了保证自身基因结构的稳定,生物体进化出了完整的DNA损伤反应(DDR)系统及应对各种损伤的修复系统。染色质作为生物遗传信息的承载,它的动态调节对包含DAN复制、转录、重组和修复等生物学... DNA的完整稳定是真核生物正常生命活动的基础,为了保证自身基因结构的稳定,生物体进化出了完整的DNA损伤反应(DDR)系统及应对各种损伤的修复系统。染色质作为生物遗传信息的承载,它的动态调节对包含DAN复制、转录、重组和修复等生物学过程在内的生命活动至关重要。组蛋白分子伴侣以不依赖ATP的方式在染色质组织中发挥着关键作用,影响着染色质的动力学变化。有研究表明,H3-H4组蛋白分子伴侣CAF-1在染色质相关的DNA损伤修复中发挥着一定作用。就近年来对CAF-1、DNA损伤修复及两者相关性的研究进行探讨,并对DNA损伤修复的深入研究进行展望。 展开更多
关键词 染色质 组蛋白分子伴侣 caf-1 DNA损伤修复
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从肿瘤微环境CAF调控肿瘤干细胞Wnt/β-catenin和SDF-1/CXCR4双通路探讨固本清源方延缓前列腺癌恩扎卢胺耐药机制
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作者 陈浩然 朱旭东 +3 位作者 王家政 陈亚飞 王艺林 刘浩 《中华中医药杂志》 北大核心 2025年第5期2527-2532,共6页
目的:探讨固本清源方延缓前列腺癌恩扎卢胺耐药作用及其机制。方法:建立恩扎卢胺耐药荷瘤小鼠模型,观察固本清源方联合恩扎卢胺对荷瘤小鼠肿瘤生长的影响。免疫荧光检测荷瘤小鼠肿瘤组织中癌相关成纤维细胞(CAF)及干细胞标志物CD133、C... 目的:探讨固本清源方延缓前列腺癌恩扎卢胺耐药作用及其机制。方法:建立恩扎卢胺耐药荷瘤小鼠模型,观察固本清源方联合恩扎卢胺对荷瘤小鼠肿瘤生长的影响。免疫荧光检测荷瘤小鼠肿瘤组织中癌相关成纤维细胞(CAF)及干细胞标志物CD133、CD44的表达。免疫荧光及ELISA检测固本清源方对CAF活化及其分泌无翅/集成基因(Wnt)、基质细胞衍生因子-1(SDF-1)能力的影响。建立CAF与前列腺癌干细胞共培养体系,观察固本清源方联合恩扎卢胺干预对接种CAF与前列腺癌干细胞荷瘤小鼠肿瘤生长的影响,采用Real-time PCR、Western Blot检测肿瘤组织中Wnt3a、SDF-1、β-连环蛋白(β-catenin)、趋化因子受体4(CXCR4)mRNA、蛋白表达。结果:与C4-2B细胞组比较,耐药小鼠肿瘤组织中FAP、α-SMA及CD133、CD44高表达,固本清源方能抑制上述标志物表达。体外实验显示,固本清源方不仅能抑制CAF活化,还能抑制其分泌Wnt3a、SDF-1。接种CAF-前列腺癌干细胞荷瘤小鼠肿瘤重较前列腺癌干细胞荷瘤小鼠显著增加(P<0.01),而高、中、低固本清源方联合恩扎卢胺组的抑瘤率分别为45.83%、38.54%、21.03%,中、高剂量组瘤重显著低于恩扎卢胺组(P<0.01),中、高固本清源方联合恩扎卢胺组较恩扎卢胺组显著下调肿瘤组织中Wnt3a、SDF-1、β-catenin、CXCR4 mRNA和蛋白表达(P<0.01,P<0.05)。结论:固本清源方联合恩扎卢胺延缓恩扎卢胺耐药,可能通过抑制CAF调控的前列腺癌干细胞Wnt/β-catenin和SDF-1/CXCR4通路发挥作用。 展开更多
关键词 去势抵抗性前列腺癌 固本清源方 恩扎卢胺 癌相关成纤维细胞 前列腺癌干细胞 WNT/Β-CATENIN通路 SDF-1/CXCR4通路 耐药
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鼠疫耶尔森菌重要功能蛋白caf 1抗原表位的精细定位
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作者 郭荣 阿布力米提.莫明 +1 位作者 刘希佳 孙素荣 《疾病预防控制通报》 2018年第4期8-10,33,共4页
目的完成鼠疫耶尔森氏菌重要功能蛋白caf 1的精细线性抗原表位鉴定。方法利用DNA重组技术获得重组蛋白rcaf 1,免疫新西兰兔制备抗rcaf 1多克隆抗体;使用DNA Star-protean软件及生物网站http://www.cbs.dtu.dk/services/Signal P/预测rca... 目的完成鼠疫耶尔森氏菌重要功能蛋白caf 1的精细线性抗原表位鉴定。方法利用DNA重组技术获得重组蛋白rcaf 1,免疫新西兰兔制备抗rcaf 1多克隆抗体;使用DNA Star-protean软件及生物网站http://www.cbs.dtu.dk/services/Signal P/预测rcaf 1的抗原表位,并通过基因工程技术获得连接KLH载体蛋白的多肽;使用ELISA方法鉴定预测的精细抗原表位。结果对鼠疫耶尔森氏菌重要功能蛋白caf 1预测的精细线性抗原表位,经ELISA法检测,其中多肽片段P1为弱阳性、P2为阳性,具有较好的免疫原性。结论针对鼠疫耶尔森菌重要功能蛋白caf 1抗原表位的预测是准确的,为鼠疫潜在诊断靶点及新型疫苗的选择提供了可靠依据。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 CAF 1蛋白 抗原表位 定位
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HIV-1的表型间变异与免疫因子相互作用的动力学模型 被引量:6
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作者 娄洁 马知恩 邵一鸣 《数学物理学报(A辑)》 CSCD 北大核心 2007年第5期898-906,共9页
该文建立了一个描述两种不同的HIV-1表型与细胞因子相互作用的动力学模型.作者用Km单调系统理论研究了HIV-1中两种不同表型:噬巨嗜细胞型(NSI)和嗜淋巴细胞型(SI)与两种在HIV感染过程中的重要指标性细胞因子:IL-2和CAF的发展趋势.在HIV-... 该文建立了一个描述两种不同的HIV-1表型与细胞因子相互作用的动力学模型.作者用Km单调系统理论研究了HIV-1中两种不同表型:噬巨嗜细胞型(NSI)和嗜淋巴细胞型(SI)与两种在HIV感染过程中的重要指标性细胞因子:IL-2和CAF的发展趋势.在HIV-1感染过程中,两种细胞表型与两种细胞因子之间形成了一种负反馈环.用Hill函数表达这种负反馈作用.结果表明模型的平衡态的数量为奇数个,它们之间满足一种Km偏序,并且第奇数个平衡态是渐近稳定的,而第偶数平衡态是不稳定的.此外还得到了各个平衡态的吸引域.其生物学的意义为:即使系统存在较低水平的平衡态,感染后的病毒载量仍会趋向于一个较高的水平.这个结论和临床研究的发现是一致的. 展开更多
关键词 HIV-1 SI细胞表型 NSI细胞表型 IL-2 CAF Km单调系统理论
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染色质组装因子1 p60预测非小细胞肺癌预后的价值 被引量:1
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作者 陈端瑞 孟辉 《中国肿瘤临床与康复》 2015年第11期1292-1295,共4页
目的探讨染色质组装因子(CAF-1)p60在非小细胞肺癌中的预后价值,分析其与临床病理特征的相关性。方法连续性选取179例非小细胞肺癌肿瘤组织,采用免疫组化法检测肿瘤组织中CAF-1 p60的表达,分析其与临床病理特征的相关性及预后意义。结果... 目的探讨染色质组装因子(CAF-1)p60在非小细胞肺癌中的预后价值,分析其与临床病理特征的相关性。方法连续性选取179例非小细胞肺癌肿瘤组织,采用免疫组化法检测肿瘤组织中CAF-1 p60的表达,分析其与临床病理特征的相关性及预后意义。结果 CAF-1 p60在肺癌组织中为核表达。CAF-1 p60高表达率为47.5%(85/179),低表达率为52.5%(94/179)。CAF-1 p60表达与TNM分期(P<0.001)、肿瘤分化程度(P=0.018)、远处转移(P=0.011)密切相关。KaplanMeier生存曲线提示,CAF-1 p60高表达患者的生存率明显低于低表达者(P<0.001)。Cox多变量生存分析提示,CAF-1 p60高表达是重要的独立预后因素(HR=2.747,P=0.001)。结论在非小细胞肺癌中,CAF-1 p60高表达提示预后不良,并且与肿瘤分期、分级及远处转移相关。CAF-1 p60可以作为非小细胞肺癌的独立预后因子。 展开更多
关键词 肺肿瘤 染色质组装因子1 P60 预后
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SDF-1/CXCR4在肿瘤相关成纤维细胞中的作用 被引量:6
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作者 于彪 刘晴 吴晓明 《基础医学与临床》 CSCD 2020年第9期1256-1260,共5页
肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)是肿瘤微环境的重要组成成分,分泌多种因子在恶性肿瘤发生、发展过程中起重要作用。CAFs来源的基质细胞衍生因子-1(SDF-1)通过其特异性受体CXCR4以自分泌或旁分泌方式调控包括CAFs的激活和维持、肿瘤的增殖、... 肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)是肿瘤微环境的重要组成成分,分泌多种因子在恶性肿瘤发生、发展过程中起重要作用。CAFs来源的基质细胞衍生因子-1(SDF-1)通过其特异性受体CXCR4以自分泌或旁分泌方式调控包括CAFs的激活和维持、肿瘤的增殖、侵袭和转移,血管生成、肿瘤耐药等在内的肿瘤生物学行为。因此,靶向SDF1/CXCR4能为抑制肿瘤进展、临床肿瘤治疗提供新策略。 展开更多
关键词 肿瘤相关成纤维细胞(CAFs) 基质细胞衍生因子-1(SDF-1) CXCR4
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前列腺癌LNCaP-AI+F细胞外泌体促进基质细胞WPMY-1功能活化 被引量:4
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作者 范维肖 雷琳 +5 位作者 李蕊 刁艳君 常亮 杨柳 马越云 郝晓柯 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期293-298,共6页
目的:探讨前列腺癌外泌体对基质细胞WPMY-1迁移和侵袭能力的影响及其作用机制。方法:超速离心法提取前列腺癌LNCaP-AI+F细胞上清中的外泌体,电镜观察外泌体的典型形态结构,Zetaview检测外泌体的粒径分布,Wb鉴定外泌体标志蛋白及其他相... 目的:探讨前列腺癌外泌体对基质细胞WPMY-1迁移和侵袭能力的影响及其作用机制。方法:超速离心法提取前列腺癌LNCaP-AI+F细胞上清中的外泌体,电镜观察外泌体的典型形态结构,Zetaview检测外泌体的粒径分布,Wb鉴定外泌体标志蛋白及其他相关蛋白。将WPMY-1细胞与前列腺癌外泌体(40μg/ml)共孵育后,激光共聚焦显微镜观察WPMY-1细胞对PKH67标记的外泌体的摄取情况,Transwell实验检测WPMY-1细胞迁移和侵袭能力,qPCR检测IL-8、PDGFB和MMP9等三种肿瘤相关成纤维细胞(cancer-associated fibroblast,CAF)分子表达水平,Wb检测EGFR和ERK1/2蛋白磷酸化水平。结果:电镜下可观察到典型茶托状外泌体结构,外泌体粒径分布集中在100 nm左右,其标志蛋白CD63和ALIX的表达证实了所提取颗粒为外泌体。此外,外泌体还表达EGFR、HER2和SRC等三种与前列腺癌进展相关的蛋白。WPMY-1细胞与外泌体共孵育后,共聚焦显微镜下可看到该细胞摄取大量外泌体,明显促进WPMY-1细胞的迁移和侵袭能力(均P<0.01);与对照组比较,外泌体(40μg/ml)处理后WPMY-1 IL-8、PDGFB及MMP9表达水平增高(P<0.05或P<0.01);且外泌体促进了WPMY-1细胞EGFR和ERK1/2的磷酸化(P<0.01)。结论:前列腺癌细胞可通过外泌体作用于基质细胞WPMY-1,使其高表达多种CAF相关分子,促进EGFR和ERK1/2的磷酸化,增强其迁移和侵袭能力。 展开更多
关键词 前列腺癌 LNCap-AI+F细胞 外泌体 迁移 侵袭 WPMY-1细胞 肿瘤相关成纤维细胞
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组蛋白伴侣在发育过程中的功能 被引量:8
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作者 赵占克 王玉凤 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期41-48,共8页
组蛋白伴侣能够协助组蛋白参与染色质的解凝和组装,从而调控基因的表达,对动植物的配子发生、受精、胚胎发育以及生长、衰老等发育过程都具有重要作用。文章主要对目前研究较多的组蛋白伴侣—核质蛋白、CAF-1、HIRA、ASF1/CIA及NAP1在... 组蛋白伴侣能够协助组蛋白参与染色质的解凝和组装,从而调控基因的表达,对动植物的配子发生、受精、胚胎发育以及生长、衰老等发育过程都具有重要作用。文章主要对目前研究较多的组蛋白伴侣—核质蛋白、CAF-1、HIRA、ASF1/CIA及NAP1在发育过程中的相关功能作一综述。 展开更多
关键词 组蛋白伴侣 核质蛋白 caf-1 HIRA ASF1/CIA NAP1
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肿瘤相关成纤维细胞分泌SDF-促进卵巢癌细胞增殖耐药 被引量:7
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作者 李静 龚成 曾锋 《中国妇幼保健》 CAS 2015年第19期3287-3290,共4页
目的:探讨基质细胞来源因子1(SDF-1)在卵巢癌中的表达情况和对卵巢癌细胞Ca OV3增殖耐药的影响。方法:用Kmplot在线软件分析SDF-1表达水平对卵巢癌患者预后的影响;20μg/ml SDF-1预处理Ca OV3细胞12 h后,在对照组和SDF-1预处理组细胞中... 目的:探讨基质细胞来源因子1(SDF-1)在卵巢癌中的表达情况和对卵巢癌细胞Ca OV3增殖耐药的影响。方法:用Kmplot在线软件分析SDF-1表达水平对卵巢癌患者预后的影响;20μg/ml SDF-1预处理Ca OV3细胞12 h后,在对照组和SDF-1预处理组细胞中克隆形成试验比较细胞克隆形成能力改变;CCk8试验检测细胞增殖能力活性;不同浓度c DDP作用后CCk8试验检测细胞相对活性;c DDP 40μmol/L作用12 h后荧光共聚焦confocal检测细胞DNA双链损伤标志蛋白γ-H2AX表达及同源重组修复关键蛋白RAD51表达,以及两者细胞核中共定位;Western blotting法比较分离得到的配对正常卵巢成纤维细胞NOF和肿瘤相关成纤维细胞中SDF-1的表达情况。结果:在2个卵巢癌公共数据库GSE26712(HR=1.82,P=0.000 21)和GSE9891(HR=1.73,P=0.000 56)中SDF-1高表达组预后显著差于低表达组;第7天对照组和SDF-1组细胞克隆数目分别为(52.3±6.2)和(135.2±8.4);第14天分别为(114.3±3.8)和(258.2±8.6)(P<0.01);SDF-1组细胞增殖速度明显高于对照组(P<0.01);c DDP 40μmol/L作用48 h对照组和SDF-1组细胞存活率分别为(43.2±3.5)%和(67.8±6.6)%(P<0.01);c DDP 40μmol/L作用12 h SDF-1组γ-H2AX较对照组明显减少,同时DNA损伤部位却募集到更多的RAD51;Western blot结果示配对CAF较NOF表达更高的SDF-1。结论:SDF-1在卵巢癌间质细胞CAF中高表达,促进肿瘤细胞增殖与克隆形成能力,提高细胞同源重组修复能力介导c DDP耐药,其高表达是卵巢癌预后不良的标志。 展开更多
关键词 卵巢癌 肿瘤相关成纤维细胞 基质细胞来源因子1 增殖 顺铂耐药
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尾叶桉育苗容器和基质的筛选试验 被引量:2
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作者 吴菊英 吴坤明 +3 位作者 徐建民 卓铜勋 何克军 甘文友 《广东林业科技》 1997年第4期29-34,共6页
文章介绍了尾叶桉3种容器、2种基质和4种配比的育苗实验,分析比较了容器、基质及其不同配比对尾叶桉4个月生苗木和1.5年生幼林生长的影响,选出了比较理想的容器和基质及其配比。
关键词 尾叶桉 育苗 容器 基质配比
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Roles of chromatin assembly factor 1 in the epigenetic control of chromatin plasticity 被引量:6
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作者 HUANG Hai JIAO RenJie 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2012年第1期15-19,共5页
Genetic information embedded in DNA sequence and the epigenetic information marked by modifications on DNA and his- tones are essential for the life of eukaryotes. Cells have evolved mechanisms of DNA duplication and ... Genetic information embedded in DNA sequence and the epigenetic information marked by modifications on DNA and his- tones are essential for the life of eukaryotes. Cells have evolved mechanisms of DNA duplication and chromatin restoration to ensure the inheritance of genetic and epigenetic information during cell division and development. In this review, we focus on the maintenance of epigenetic landscape during chromatin dynamics which requires the orchestration of histories and their chaperones. We discuss how epigenetic marks are re-established in the assembly of new chromatin after DNA replication and repair, highlighting the roles of CAF-1 in the process of changing chromatin state. The functions of CAF-1 provide a link be- tween chromatin assembly and epigenetic restoration. 展开更多
关键词 caf-1 epigenetic information chromatin plasticity signal transduction histone chaperone
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Chromodomain protein CDYL is required for transmission/restoration of repressive histone marks 被引量:3
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作者 Yongqing Liu Shumeng Liu +10 位作者 Shuai Yuan Huajing Yu Yu Zhang Xiaohan Yang Guojia Xie Zhe Chen Wanjin Li Bosen Xu Luyang Sun Yongfeng Shang Jing Liang 《Journal of Molecular Cell Biology》 SCIE CAS CSCD 2017年第3期178-194,共17页
Faithful transmission or restoration of epigenetic information such as repressive histone modifications through generations is crit- ical for the maintenance of cell identity. We report here that chromodomain Y-like p... Faithful transmission or restoration of epigenetic information such as repressive histone modifications through generations is crit- ical for the maintenance of cell identity. We report here that chromodomain Y-like protein (CDYL), a chromodomain-containing transcription corepressor, is physically associated with chromatin assembly factor 1 (CAF-1) and the repiicative heUcase MCM complex. We showed that CDYL bridges CAF-1 and MCM, facilitating histone transfer and deposition during DNA replication. We demonstrated that CDYI. recruits histone-modifying enzymes G9a, SETDB1, and EZH2 to replication forks, leading to the addition of H3Kgme2/3 and H3K27me2/3 on newly deposited histone H3. Significantly, depletion of CDYL impedes early S phase progres- sion and sensitizes cells to DNA damage. Our data indicate that CDYL plays an important role in the transmission/restoration of repressive histone marks, thereby preserving the epigenetic landscape for the maintenance of cell identity. 展开更多
关键词 epigenetic inheritance histone modification CDYL caf-1 MCM
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