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基于AFLP的安徽省黄连木遗传多样性
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作者 张秋璐 曹翠萍 +3 位作者 舒芬芬 赵旭阳 郑常飞 汤希林 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第1期181-190,200,共11页
【目的】研究安徽省黄连木种质资源的遗传多样性,旨在为安徽省黄连木种质资源的保护利用和品种选育提供理论依据和实践指导。【方法】运用4对AFLP多态性有效引物对16个居群共341个样本单株进行遗传多样性和遗传结构分析评价,计算各遗传... 【目的】研究安徽省黄连木种质资源的遗传多样性,旨在为安徽省黄连木种质资源的保护利用和品种选育提供理论依据和实践指导。【方法】运用4对AFLP多态性有效引物对16个居群共341个样本单株进行遗传多样性和遗传结构分析评价,计算各遗传多样性参数,进行分子方差分析(AMOVA),对居群进行非加权算数平均配对法(UPGMA)聚类分析和主坐标分析(PCA)。【结果】1)共扩增出652个多态性位点。在物种水平上,多态性位点百分率(PPL_(s))为100%,有效等位基因数(N_(es))为1.233,Nei’s基因多样性指数(H_(es))为0.182,Shannon信息指数(I_(s))为0.323;在居群水平上,平均多态性位点百分率(PPL_(p))为52.15%,有效等位基因数(N_(ep))为1.214,Nei’s基因多样性指数(H_(ep))为0.137,Shannon信息指数(I_(p))为0.218。2)二层次和三层次的AMOVA分析均显示,黄连木遗传变异主要存在于居群内。区域(皖北、皖中、皖南、大别山区)之间遗传差异不显著;居群间遗传分化系数(G_(st))为0.243,基因流(N_(m))为1.562,UPGMA聚类分析将16个居群分为4组,与主坐标分析结果一致。研究还发现了一些种质特异性AFLP标记。【结论】安徽省黄连木种质资源的遗传多样性与居群间遗传分化均呈现较高水平,有必要采取综合措施来保护黄连木的遗传多样性。 展开更多
关键词 黄连木 aflp 遗传多样性 遗传结构 种质资源保护
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Deep gene exchange break among Konosirus punctatus populations across the northwestern Pacific inferred from AFLP and ISSR markers
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作者 Na Song Yiping Ying +1 位作者 Yang Zhang Tianxiang Gao 《Acta Oceanologica Sinica》 2025年第1期104-112,共9页
The correct understanding of fish population structure plays a positive role in their fishery management.The dotted gizzard shad,Konosirus punctatus,is widely distributed in the coastal waters of the northwestern Paci... The correct understanding of fish population structure plays a positive role in their fishery management.The dotted gizzard shad,Konosirus punctatus,is widely distributed in the coastal waters of the northwestern Pacific.With the over-exploitation of economically important fishes,its importance is increasingly prominent.To further examine the population genetic structure of K.punctatus across the northwestern Pacific,the amplified fragment length polymorphism(AFLP)and the inter-simple sequence repeats(ISSRs)were employed to perform genetic variation analysis.The results showed that the combination of polyacrylamide gel electrophoresis and silver staining can effectively detect genetic variation for K.punctatus populations.The average proportions of polymorphic loci were 46.26%and 87.13%for AFLP and ISSR markers,respectively,and the genetic diversity parameters showed no obvious differences among populations.Both analysis molecular variance(AMOVA)and pairwise F_(st)suggested that there was significant genetic differentiation between Chinese and Japanese populations.All samples also clustered into two clades based on the unweighted pair-group method analysis(UPGMA)tree by two markers,which indicated significant genetic differentiation among populations.Consistent with the previous studies,there are two highly differentiated groups at the nuclear gene level and they were suggested to be treated as two separate genetic management units.The results of the present study could provide the genetic management strategy for this important economic species. 展开更多
关键词 Konosirus punctatus population genetic differentiation aflp ISSR
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红尾仙女虾AFLP反应体系建立及引物筛选
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作者 王苗苗 李琴 +3 位作者 陈焕根 韩晓磊 杨思雨 张智敏 《水产养殖》 2025年第6期18-21,共4页
应用传统的SDS-酚仿抽提法,提取了红尾仙女虾12个个体的基因组DNA,建立红尾仙女虾扩增酶切片段长度多态性(AFLP)分子标记反应体系,从30对引物中成功筛选出10对适合红尾仙女虾进行遗传分析的引物组合。结果表明,采用以上引物进行AFLP试... 应用传统的SDS-酚仿抽提法,提取了红尾仙女虾12个个体的基因组DNA,建立红尾仙女虾扩增酶切片段长度多态性(AFLP)分子标记反应体系,从30对引物中成功筛选出10对适合红尾仙女虾进行遗传分析的引物组合。结果表明,采用以上引物进行AFLP试验研究,得到稳定的试验结果,所得产物经电泳和银染后可获得清晰的指纹图谱。 展开更多
关键词 红尾仙女虾 DNA提取 扩增片段长度多态性 引物筛选
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基于AFLP遗传多样性和功能成分含量的葛资源特性研究 被引量:1
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作者 彭斯文 龙世平 +5 位作者 朱校奇 唐汉军 谢进 徐瑞 黄艳宁 曹亮 《中国野生植物资源》 CSCD 2024年第10期9-16,共8页
目的:研究葛资源的遗传多样性和品质特征。方法:提取葛幼嫩叶片基因组DNA,使用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术对各样品进行扩增,并应用GeneMapper分析软件对AFLP扩增结果进行分析;采用高效液相色谱(HPLC)对葛根中异黄酮类化合物... 目的:研究葛资源的遗传多样性和品质特征。方法:提取葛幼嫩叶片基因组DNA,使用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术对各样品进行扩增,并应用GeneMapper分析软件对AFLP扩增结果进行分析;采用高效液相色谱(HPLC)对葛根中异黄酮类化合物葛根素、大豆苷、大豆甙元等主要成分进行含量测定,并利用SPSS软件进行成分含量的聚类分析。结果:5对AFLP荧光引物扩增获得1113条多态性条带,多态性比率达到100%。非加权组平均法(UPGMA)聚类分析结果显示,20号样品(湖南茶陵野葛)与其它葛资源差异较大,在相关系数为0.35时与其它样品分开,剩余样品在0.48的相关系数处分为两大类群,其中一类主要为野葛(云南、重庆),但有17号(湖南武冈粉葛)、18号样品(湖南江背粉葛)与该类聚集为一群,其遗传背景与野葛相似;而另一个类群主要为粉葛(广东、广西、湖南)和湖南的野葛资源,湖南野葛资源与云南等地区野葛差异较大。成分含量聚类分析结果表明所有样品可分属野葛与粉葛2个群,其中野葛的成分含量比粉葛高,但17号样品(湖南武冈粉葛)聚集在野葛群。结论:综合分析发现AFLP分子标记技术能揭示葛的遗传多样性,野葛及粉葛在成分含量方面存在明显差异,其中17号样品(湖南武冈粉葛)成分含量与野葛相近,为优异的粉葛资源。 展开更多
关键词 粉葛 遗传多样性 aflp 葛根素
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基于AFLP标记的胭脂花野生居群遗传多样性分析
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作者 邢震 刘颖 +2 位作者 王芳 郑维列 潘会堂 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第7期2248-2256,共9页
为保护和开发野生胭脂花种质资源提供依据,本研究以7个典型的胭脂花(Primula maximowiczii Regel)野生居群为材料,利用AFLP标记分析了胭脂花居群的遗传结构和遗传多样性。研究共筛选出6对多态性高的引物,获得了161个多态位点。其中,五... 为保护和开发野生胭脂花种质资源提供依据,本研究以7个典型的胭脂花(Primula maximowiczii Regel)野生居群为材料,利用AFLP标记分析了胭脂花居群的遗传结构和遗传多样性。研究共筛选出6对多态性高的引物,获得了161个多态位点。其中,五台山居群(WTS)和灵山居群(LS)的多态性位点百分率分别为97.44%和92.31%。野生胭脂花居群内遗传多样性占总遗传多样性的86.20%,居群间遗传多样性占总遗传多样性的13.80%,居群间的遗传分化较小(Gst=0.114)。分子变异方差分析显示,居群间与居群内的遗传变异存在极显著差异(P<0.001),野生胭脂花的遗传变异主要来自居群内部。Nei's无偏估计和UPGMA聚类分析表明,7个胭脂花居群按照地理位置从南到北进行聚类,其中海坨山居群(HTS)和灵山居群(LS)之间的遗传距离最小,遗传一致度最大。研究结果为开发和选育具有高观赏价值的胭脂花提供了参考,对制定野生胭脂花种质资源保护策略具有指导作用。 展开更多
关键词 胭脂花 遗传多样性 aflp 分子标记
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小麦抗叶锈病基因Lr19的AFLP标记 被引量:6
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作者 李星 杨文香 +4 位作者 李亚宁 刘大群 闫红飞 孟庆芳 张汀 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1796-1800,共5页
以Thatcher和23个以Thatcher为遗传背景的小麦抗叶锈病近等基因系及TcLr19与Thatcher杂交F2代植株为材料,利用AFLP技术开展了小麦抗叶锈病基因Lr19的分子标记研究。共获得7个与小麦抗叶锈病基因连锁的分子标记:P-AGT/M-GAG289bp(3.3cM)... 以Thatcher和23个以Thatcher为遗传背景的小麦抗叶锈病近等基因系及TcLr19与Thatcher杂交F2代植株为材料,利用AFLP技术开展了小麦抗叶锈病基因Lr19的分子标记研究。共获得7个与小麦抗叶锈病基因连锁的分子标记:P-AGT/M-GAG289bp(3.3cM)、P-ACA/M-GGT102bp(4.1cM)、P-ACA/M-GGT106bp(4.1cM)、P-AAC/M-CAG123bp(4.9cM)、P-AAC/M-GGT203bp(5.0cM)、P-ACA/M-GGT290bp(5.7cM)和P-ATC/M-GAG293bp(9.6cM)。这些特异性片段经回收、克隆、测序得出了特异带的序列。该研究可促进遗传图谱、物理图谱的构建和小麦抗叶锈病基因Lr19的克隆。 展开更多
关键词 小麦 LR19 分子标记 aflp 抗叶锈病基因 aflp标记 小麦 aflp技术 分子标记 近等基因系 遗传背景 基因连锁 遗传图谱
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AFLP分子标记鉴别大白菜品种 被引量:20
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作者 宋顺华 郑晓鹰 《分子植物育种》 CAS CSCD 2005年第3期381-387,共7页
本试验采用AFLP技术,研究了90份来自7个不同栽培地区的大白菜品种材料。共筛选了20对引物,不同引物组合检测多态性谱带的能力有很大的差异,多态性谱带的数量从9条到32条不等。其中E-ACA/M-CTG是大白菜品种十分高效的引物组合,共产生71... 本试验采用AFLP技术,研究了90份来自7个不同栽培地区的大白菜品种材料。共筛选了20对引物,不同引物组合检测多态性谱带的能力有很大的差异,多态性谱带的数量从9条到32条不等。其中E-ACA/M-CTG是大白菜品种十分高效的引物组合,共产生71条清晰的扩增带,其中有32条多态性谱带,多态性谱带的百分率为45.7%。通过该引物组合,能将90个品种全部区分开来。同时应用该引物组合检测2个大白菜杂交品种(北京新2号,京夏王)各10株,其中有1株北京新2号的谱带异常,其余同一品种不同单株的带型完全一致。表明AFLP标记用于研究品种指纹图谱,并鉴别品种是完全可行的。 展开更多
关键词 aflp分子标记 大白菜 aflp技术 aflp标记 多态性 栽培地区 杂交品种 指纹图谱 鉴别品种 引物 谱带 组合 ACA 百分率 检测 北京 单株
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板栗叶片DNA的提取及AFLP反应体系的建立 被引量:28
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作者 程丽莉 苏淑钗 +1 位作者 秦岭 尹伟伦 《北京农学院学报》 2005年第2期5-9,共5页
以初展开的板栗嫩叶为材料,利用改进的CTAB法,提取到高质量的板栗叶片总DNA。通过优化酶切连接、预扩增、选择性扩增等试验条件,建立了板栗AFLP银染反应体系,得到了清晰的板栗AFLP指纹图谱。为板栗品种的分子标记和板栗品种间亲缘关系... 以初展开的板栗嫩叶为材料,利用改进的CTAB法,提取到高质量的板栗叶片总DNA。通过优化酶切连接、预扩增、选择性扩增等试验条件,建立了板栗AFLP银染反应体系,得到了清晰的板栗AFLP指纹图谱。为板栗品种的分子标记和板栗品种间亲缘关系等研究奠定了基础。研究结果表明:①DNA模板的质量影响酶切以及后续的连接扩增反应。以初展开的嫩叶提取的板栗叶片总DNA纯度最高,所含蛋白质、小分子杂质少,改良的CTAB提取法可用于板栗AFLP分析,形成清晰的AFLP指纹。②先进行酶切后再进行酶连的反应体系比酶切酶连一起进行的体系效果更好。板栗基因组DNA最佳酶切反应体系为:模板DNA总量500ng,反应体积为25μl,10×Y+/TanqoTMBuffer2.5μl,BSA0.8μl,EcoRI5U,MseI5U。连接反应体系中T4DNA连接酶浓度2U即达最佳效果。酶切、酶连反应最佳温度均为37℃。③以板栗为材料进行AFLP标记时,E AAC+M CAA、E AAC+M CAT和E AGT+M CAT三个引物均获得较好的多态性。其中以E AGT+M CAT引物组合的扩增条带信号强度一致性好,条带分布均匀,能够得到稳定、清晰、分辨率较高的指纹谱带,可进行中国板栗的遗传变异分析。 展开更多
关键词 反应体系 叶片DNA 板栗 aflp指纹图谱 种间亲缘关系 aflp分析 基因组DNA aflp标记 遗传变异分析 CTAB法 选择性扩增 DNA模板 DNA纯度 模板DNA DNA连接 总DNA 试验条件 分子标记 质量影响 研究结果 反应体积 最佳温度 信号强度
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中国白菜AFLP分子遗传图谱的构建 被引量:39
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作者 王美 张凤兰 +3 位作者 孟祥栋 刘秀村 赵岫云 樊治成 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2004年第1期28-33,共6页
以白菜高抗TuMV白心株系91 112和高感TuMV桔红心株系T12 91为亲本建立的小孢子DH系作为图谱构建群体,以AFLP标记来构建白菜连锁图谱。通过对64对AFLP引物组合的筛选,利用20对引物得到了263个AFLP多态性位点。经Mapmaker/EXP3.0软件处理... 以白菜高抗TuMV白心株系91 112和高感TuMV桔红心株系T12 91为亲本建立的小孢子DH系作为图谱构建群体,以AFLP标记来构建白菜连锁图谱。通过对64对AFLP引物组合的筛选,利用20对引物得到了263个AFLP多态性位点。经Mapmaker/EXP3.0软件处理,构建了1张含255个标记位点,10个连锁群,覆盖长度为883.7cM的连锁图。255个AFLP位点中偏离孟德尔遗传的比率(P<0.05)为15 0%和27 5%(P<0.01)。 展开更多
关键词 中国 白菜 aflp分子 遗传图谱 图谱构建 aflp引物
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小麦抗叶锈病基因Lr45的AFLP分子标记 被引量:15
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作者 张娜 杨文香 +4 位作者 闫红飞 刘大群 褚栋 孟庆芳 张汀 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期1364-1368,共5页
利用AFLP技术对小麦抗叶锈基因Lr45进行了标记,从60对AFLP引物中筛选出2对在亲本及TcLr45×ThatcherF2抗感群体间揭示多态性的引物P-AGG/M-GAG和P-ACA/M-GGT。其扩增片段为261bp和105bp,2个标记与Lr45的遗传距离分别为0.6cM和1.3cM... 利用AFLP技术对小麦抗叶锈基因Lr45进行了标记,从60对AFLP引物中筛选出2对在亲本及TcLr45×ThatcherF2抗感群体间揭示多态性的引物P-AGG/M-GAG和P-ACA/M-GGT。其扩增片段为261bp和105bp,2个标记与Lr45的遗传距离分别为0.6cM和1.3cM。测序比较261bp片段与大麦属VulgareHotrI基因部分序列同源性达86%,105bp片段与一粒小麦磷脂酰丝氨酸脱羧酶基因部分序列同源性高达96%。2个测序片段均包含开放阅读框(ORF)序列。 展开更多
关键词 aflp分子标记 抗叶锈病基因 小麦 序列同源性 aflp技术 磷脂酰丝氨酸 抗叶锈基因 开放阅读框 扩增片段 遗传距离 多态性 大麦属 I基因 酶基因 引物 测序 亲本 F2
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梅花不同样本间亲缘关系的AFLP初步分析 被引量:16
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作者 杨朝东 王健 +2 位作者 张俊卫 张波 包满珠 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期2084-2089,共6页
应用AFLP技术初步研究20个梅花株系间的亲缘关系,19对选择性引物扩增出清晰的总位点数918个,其中多态性位点324个,占总位点数的35.29%。采用SAS类平均法聚类分析AFLP数据,λ值为0.9759时,将20个梅花株系分为4个类群。半野生种曲梗梅的... 应用AFLP技术初步研究20个梅花株系间的亲缘关系,19对选择性引物扩增出清晰的总位点数918个,其中多态性位点324个,占总位点数的35.29%。采用SAS类平均法聚类分析AFLP数据,λ值为0.9759时,将20个梅花株系分为4个类群。半野生种曲梗梅的多态性位点数最高,‘多萼朱砂’、‘复瓣小宫粉’等梅花品种次之。在类群Ⅳ中,具有明显亲缘关系的两组亲本及其杂交子代各自聚为一组,表明AFLP技术和聚类分析方法可以用来研究梅花品种间的亲缘关系。‘小宫粉’、‘江南朱砂’和它们的子代亲缘关系密切,结果仍能区别其较小差异,这有助于解决梅花中存在的不同产地相同品种异名和同名而品种不同的问题。垂枝类梅花品种间有较近的亲缘关系或者遗传来源,支持枝姿作为梅花分类的重要形态特征,垂枝类品种属于梅花中比较进化的类群与其历史演化相吻合。本研究中所采用的DNA限制性内切酶酶切组合及所筛选的AFLP选择性引物对适合研究梅花品种间的亲缘关系和遗传多样性。 展开更多
关键词 梅花(Pruaus mume Sieb.et Zucc.) aflp 聚类分析 亲缘关系 aflp技术 梅花品种 限制性内切酶酶切
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利用AFLP技术分析中国明对虾的韩国南海种群和养殖群体的遗传差异 被引量:14
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作者 王伟继 高焕 +1 位作者 孔杰 王清印 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期81-86,共6页
利用AFLP技术对新发现的中国明对虾的一个地理种群--韩国南海种群(SP)和中国明对虾的养殖群体(CP)进行了遗传分析.每个群体随机取样30个,5对AFLP引物获得326个位点.其中SP多态位点比例(P0.99)46.93%,Shannon多样性指数(I)0.1884,Nei(19... 利用AFLP技术对新发现的中国明对虾的一个地理种群--韩国南海种群(SP)和中国明对虾的养殖群体(CP)进行了遗传分析.每个群体随机取样30个,5对AFLP引物获得326个位点.其中SP多态位点比例(P0.99)46.93%,Shannon多样性指数(I)0.1884,Nei(1978)基因多样性指数(h)0.1197,群体差异性位点9个,占检测位点总数的2.7%.CP多态位点比例(P0.99)51.84%,Shannon多样性指数(I)0.1954,Nei(1978)基因多样性指数(h)0.1229,群体差异性位点19个,占检测位点总数的5.8%.SP种群各项遗传参数都低于CP种群.两个群体的非偏差遗传相似度和遗传距离分别为0.9899和0.0102.利用中国明对虾的韩国南海种群和养殖群体杂交可以获得新的种质资源,这将为获得最大变异数量性状表型和基因多样性的产生提供可能. 展开更多
关键词 中国明对虾 aflp 遗传差异 特征标记 aflp技术 养殖群体 地理种群 SHANNON多样性指数 南海 韩国 技术分析
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黄瓜枯萎病菌遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
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作者 张艳菊 陈霞 +3 位作者 刘东 秦智伟 周秀艳 蒲子婧 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期301-304,共4页
黄瓜枯萎病是由半知菌亚门尖孢镰刀菌黄瓜专化型(Fusarium oxysporumf.sp.cucumainumOwen)侵染引起的一种土传病害,是影响黄瓜生产的最主要病害之一。近年来随着分子生物学技术的迅速发展,国内外学者对于病原真菌的遗传多样性做了大... 黄瓜枯萎病是由半知菌亚门尖孢镰刀菌黄瓜专化型(Fusarium oxysporumf.sp.cucumainumOwen)侵染引起的一种土传病害,是影响黄瓜生产的最主要病害之一。近年来随着分子生物学技术的迅速发展,国内外学者对于病原真菌的遗传多样性做了大量的研究,Wang等[2]对影响黄瓜枯萎病菌AFLP技术体系的多种因素作了探讨,得到了1种适合于黄瓜枯萎病菌AFLP分析的优化体系;Duan等[3]应用RAPD、 展开更多
关键词 黄瓜枯萎病菌 aflp分析 遗传多样性 aflp技术体系 分子生物学技术 土传病害 尖孢镰刀菌 病原真菌
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小麦AFLP片段序列多态性分析和AFLP-SCAR标记的研究 被引量:12
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作者 王立新 常利芳 +2 位作者 黄岚 王晓维 赵昌平 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期943-951,共9页
为了解相同长度的AFLP片段中DNA序列的多态性,对70条小麦AFLP片段进行回收、克隆以及测序分析,比较了不同品种间相同长度的AFLP片段、一条AFLP片段的不同单克隆以及品种间非多态性AFLP片段的DNA序列。对70个片段构成的98对同长片段进行... 为了解相同长度的AFLP片段中DNA序列的多态性,对70条小麦AFLP片段进行回收、克隆以及测序分析,比较了不同品种间相同长度的AFLP片段、一条AFLP片段的不同单克隆以及品种间非多态性AFLP片段的DNA序列。对70个片段构成的98对同长片段进行DNA序列比对,结果表明:(1)只有3对片段的序列100%相同,其他95对片段之间DNA序列差异为1%-70%;(2)不同小麦品种间同长的AFLP片段中普遍存在DNA序列完全不同、部分不同和具有SNP的现象;(3)一条回收的AFLP带纹的不同单克隆之间也存在DNA序列完全不同、部分不同和具有SNP的现象;(4)品种间有些非多态性AFLP片段的DNA序列也存在多态性。揭示了小麦三套基因组间AFLP等位基因的多态性,以及不同AFLP位点同长片段的DNA序列多态性,对AFLP标记的使用提出了一些不同看法,并提出了利用AFLP片段的序列多态性设计SCAR引物的方法。 展开更多
关键词 小麦 aflp标记 多态性 aflp-SCAR标记
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AFLP技术的改进及其在果树上的应用 被引量:2
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作者 刘勇 吴波 +2 位作者 刘德春 黄家权 孙中海 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 2004年第6期923-927,共5页
AFLP分子标记技术是一种基于PCR的高分辨DNA指纹分析方法,和其它标记技术相比,它具有相对简便、快速、可靠、便宜的优点。综合有关文献资料就AFLP的原理、试验技术方面的改进及其在果树遗传多样性检测、种质资源鉴定、亲缘关系分析和遗... AFLP分子标记技术是一种基于PCR的高分辨DNA指纹分析方法,和其它标记技术相比,它具有相对简便、快速、可靠、便宜的优点。综合有关文献资料就AFLP的原理、试验技术方面的改进及其在果树遗传多样性检测、种质资源鉴定、亲缘关系分析和遗传图谱的构建等方面的应用和进展进行阐述。 展开更多
关键词 aflp 改进后aflp 遗传多样性检测 亲缘关系分析 种质鉴定 遗传图谱构建 果树
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枸杞属AFLP分析体系优化与建立 被引量:2
16
作者 戴国礼 曹有龙 +2 位作者 安巍 赵建华 周军 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期166-171,共6页
以枸杞属种质资源为试材,对AFLP分析过程中包括DNA的提取质量和浓度、Mse I/EcoR I以及T4DNA连接酶的浓度、反应时间等影响因素进行了研究。建立了一种适于枸杞AFLP银染技术的优化体系。该体系中各优化因素为:模板DNA的用量为300-40... 以枸杞属种质资源为试材,对AFLP分析过程中包括DNA的提取质量和浓度、Mse I/EcoR I以及T4DNA连接酶的浓度、反应时间等影响因素进行了研究。建立了一种适于枸杞AFLP银染技术的优化体系。该体系中各优化因素为:模板DNA的用量为300-400ng,酶切体系中Mse I和EcoR I各加入3U,T4 DNA连接酶加入2.0U,采用酶切与连接在同一体系中一步完成,其酶切温度为37℃,反应时间为5h。与22℃连接过夜。并对预扩增、选择性扩增和银染的效果进行了检测,以引物M+CAC/E+AGG构建了枸杞种质资源的AFLP指纹图谱,该图谱扩增带多,多态性强,且质量好。 展开更多
关键词 枸杞属 aflp 反应体系 aflp的优化与建立
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AFLP标记与水稻杂种产量及产量杂种优势的预测 被引量:29
17
作者 蔡健 兰伟 《中国农学通报》 CSCD 2005年第4期39-43,121,共6页
利用AFLP分子标记对46个水稻品种进行遗传多样性分析,继而研究分子标记遗传距离与按照NC设计获得的195个杂交组合的产量及特殊配合力的相关性,探讨预测杂种优势的可能性。结果表明:(1)通过UPGMA聚类分析(图3),可将供试材料分为16个类群... 利用AFLP分子标记对46个水稻品种进行遗传多样性分析,继而研究分子标记遗传距离与按照NC设计获得的195个杂交组合的产量及特殊配合力的相关性,探讨预测杂种优势的可能性。结果表明:(1)通过UPGMA聚类分析(图3),可将供试材料分为16个类群,并把来源不明的品种(系)划分到相应类群中,从而对这些材料进行初步鉴定。可见,AFLP分子标记是检测类内品种间遗传差异的有效方法,为水稻品种(系)亲本选配提供理论依据。(2)分子标记遗传距离与杂种产量优势、F1产量、特殊配合力之间都呈显著正相关,相关系数介于0.3235-0.7713之间。但相关程度还不足以预测杂种优势。增效座位和减效座位以及使用与杂种优势有关的QTL连锁标记位点可能提高杂种优势的预测能力,但最终解决,将依赖于杂种优势遗传机理的研究。 展开更多
关键词 杂种优势 aflp标记 aflp分子标记 UPGMA聚类分析 遗传多样性分析 特殊配合力 品种(系) 遗传距离 水稻品种 杂交组合 初步鉴定 有效方法 遗传差异 亲本选配 产量优势 相关系数 相关程度 预测能力 标记位点 遗传机理 相关性
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温度对AFLP银染检测的影响 被引量:11
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作者 陈大霞 司马杨虎 +1 位作者 赵爱春 鲁成 《蚕学通讯》 2003年第1期1-4,共4页
在家蚕AFLP分子标记多样性的研究中发现温度对AFLP -银染的结果有一定的影响。本实验以湘晖与 872杂交的 91个F2 个体为材料 ,对AFLP银染过程中温度的影响进行了分析。温度试验结果显示 :在 2
关键词 家蚕 aflp分子标记 多样性 温度 aflp银染检测
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小麦基因组AFLP技术体系建立的研究 被引量:1
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作者 蔡健 陆娟 兰伟 《阜阳师范学院学报(自然科学版)》 2005年第2期25-27,共3页
扩增片断长度多态性(AFLP)可靠性强,多态检出率高,因而被认为是最有效的DNA指纹分析技术.利用这一技术,在不需要预先知道DNA序列信息的情况下就可以同时进行多数DNA酶切片段的PCR扩增.以小麦为材料,对AFLP指纹银染技术及实验操作中的关... 扩增片断长度多态性(AFLP)可靠性强,多态检出率高,因而被认为是最有效的DNA指纹分析技术.利用这一技术,在不需要预先知道DNA序列信息的情况下就可以同时进行多数DNA酶切片段的PCR扩增.以小麦为材料,对AFLP指纹银染技术及实验操作中的关键技巧作了比较详尽的叙述,并建立起了AFLP技术体系. 展开更多
关键词 体系建立 小麦 基因组 DNA指纹分析技术 aflp技术体系 aflp指纹 长度多态性 PCR扩增 酶切片段 序列信息 实验操作 银染技术 可靠性 检出率
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AFLP分子标记技术及其在茶树上的应用 被引量:1
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作者 晏嫦妤 罗军武 《茶叶通讯》 2005年第3期21-24,共4页
本文介绍了AFLP分子标记技术的基本原理、特点和技术流程。对AFLP分子标记在茶树种质资源鉴定与分类、遗传多样性、亲缘关系的建立和遗传图谱的构建等方面的应用进行了概述,并对其存在的问题和在茶树领域的应用前景进行了分析。
关键词 aflp 分子标记 茶树 应用 aflp分子标记技术 种质资源鉴定 遗传多样性 技术流程 遗传图谱 亲缘关系
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