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基于16sRNA测序技术研究重度三尖瓣关闭不全患者肠道菌群的变化
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作者 方斗 张朝龙 +4 位作者 肖硕 李玉欣 汪珍忠 钟丽珊 黄焕雷 《心血管病学进展》 2025年第6期559-564,共6页
目的 分析单纯重度三尖瓣关闭不全患者肠道菌群的变化,探索在三尖瓣关闭不全患者进行菌群干预治疗的可行性。方法 以2022年9月—2023年10月连续入住广东省人民医院心外科的单纯重度三尖瓣关闭不全患者为三尖瓣关闭不全试验组(T组,n=20)... 目的 分析单纯重度三尖瓣关闭不全患者肠道菌群的变化,探索在三尖瓣关闭不全患者进行菌群干预治疗的可行性。方法 以2022年9月—2023年10月连续入住广东省人民医院心外科的单纯重度三尖瓣关闭不全患者为三尖瓣关闭不全试验组(T组,n=20);每纳入1例试验组患者时,同期在住院拟行手术治疗的单纯重度二尖瓣关闭不全患者中随机抽取1例纳入二尖瓣关闭不全对照组(M组,n=20);另外,每纳入2例试验组患者时,在正常人群中选取1例健康成年人纳入健康对照组(N组,n=10)。使用无菌器皿采集T、M、N组三组人群的粪便样本,进行16sRNA测序,根据测序结果进行生物学分析。结果 α多样性显示,T组患者肠道菌群Simpson、Sobs、Chao1、ACE指数低于M组和N组,但无统计学差异(P>0.05)。β多样性显示,T、M和N组三组之间呈彼此分离的情况。菌群与右心功能指标的相关性分析显示,瘤胃球菌科、颤螺菌目、Ruminococcus_sp_N15MGS-57、食葡糖罗斯拜瑞氏菌的相对丰度与三尖瓣环收缩期位移呈正相关。结论 重度三尖瓣关闭不全患者存在肠道菌群紊乱,并且多种菌群与重度三尖瓣关闭不全患者的右心功能存在明显的相关性,提示肠道菌群与重度三尖瓣关闭不全的发生发展有一定的相关性。 展开更多
关键词 重度三尖瓣关闭不全 肠道菌群 心力衰竭 16srna测序
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犬贾第虫核糖体16sRNA部分序列克隆及测定
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作者 秦睿玲 张西臣 +1 位作者 田宗成 李建华 《热带医学杂志》 CAS 2002年第4期324-326,共3页
目的 获取犬贾第虫核糖体 16sRNA基因序列。方法 从犬贾第虫包囊中 ,快速提取DNA ,并以DNA为模板 ,利用热启动PCR技术扩增出一 6 11bp的预计大小的基因片段 ,纯化回收后 ,与PMD18 T载体连接转化到DH5a大肠杆菌中 ,筛选到阳性克隆经PCR... 目的 获取犬贾第虫核糖体 16sRNA基因序列。方法 从犬贾第虫包囊中 ,快速提取DNA ,并以DNA为模板 ,利用热启动PCR技术扩增出一 6 11bp的预计大小的基因片段 ,纯化回收后 ,与PMD18 T载体连接转化到DH5a大肠杆菌中 ,筛选到阳性克隆经PCR、EcoRⅠ和HindⅢ双酶切鉴定 ,并用双脱氧链末端终止法测定DNA序列 ,登陆BLAST进行同源性比较和分析。结果 获得了长度为 6 11bp的基因序列 ,并发现与犬贾第虫核糖体的同源性最高达 99%。结论 获得了犬贾第虫核糖体 16sRNA的部分基因序列 ,为研究其在核酸进化领域中的地位和PCR法快速诊断贾第虫病提供了理想的基因材料。 展开更多
关键词 核糖体 测定 犬贾第虫 16srna 克隆
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PCR/16sRNA联合核苷酸测序法检测化脓性脑膜炎病原菌的临床价值 被引量:1
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作者 陈文娟 干驰 +2 位作者 赵瑞柯 莫茜 曹清 《现代生物医学进展》 CAS 2018年第12期2289-2293,共5页
目的:探讨PCR/16sRNA联合核苷酸测序法在化脓性脑膜炎病原菌检测中的临床诊断价值。方法:选择2016年4月至2017年2月上海儿童医学中心临床考虑中枢感染的43例化脓性脑膜炎患儿的脑脊液标本,所有患儿标本同时进行培养,并行PCR/16sRNA联合... 目的:探讨PCR/16sRNA联合核苷酸测序法在化脓性脑膜炎病原菌检测中的临床诊断价值。方法:选择2016年4月至2017年2月上海儿童医学中心临床考虑中枢感染的43例化脓性脑膜炎患儿的脑脊液标本,所有患儿标本同时进行培养,并行PCR/16sRNA联合核苷酸测序法检测,记录检测结果,并统计检测方法的灵敏度和特异度,以脑脊液培养检测结果为金标准,对比脑脊液培养和PCR/16sRNA联合核苷酸测序法的灵敏度和特异度。结果:脑脊液培养的灵敏度为21.7%,特异度为100.0%;PCR/16sRNA联合核苷酸测序的灵敏度为69.6%,特异度为95.0%;两者的灵敏度比较差异具统计学意义(P<0.05),而两者特异性比较差异无统计学意义(P>0.05)。PCR/16sRNA联合核苷酸测序可检出脑脊液培养阴性的病原体。结论:PCR/16sRNA联合核苷酸测序具有较高的灵敏度,可检出脑脊液培养阴性的病原体,且受抗菌药物影响小,可为临床早期提供化脓性脑膜炎的病原学依据,降低致死率及致残率。 展开更多
关键词 化脓性脑膜炎 病原学诊断 聚合酶链反应 16srna
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基于16sRNA测序技术探讨不同体质腹型肥胖者肠道菌群特征 被引量:1
4
作者 袁梦华 扈新刚 赵燕 《山东中医杂志》 2024年第7期694-699,共6页
目的:探讨痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖人群肠道菌群的丰度及物种差异。方法:共纳入91例不同体质腹型肥胖受试者,收集了91例大便样本,其中痰湿体质受试者44例,非痰湿体质受试者47例。使用NovaSeq6000基因测序仪,对痰湿体质与非痰湿体... 目的:探讨痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖人群肠道菌群的丰度及物种差异。方法:共纳入91例不同体质腹型肥胖受试者,收集了91例大便样本,其中痰湿体质受试者44例,非痰湿体质受试者47例。使用NovaSeq6000基因测序仪,对痰湿体质与非痰湿体质受试者肠道菌群相对丰度、物种多样性进行分析。结果:痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖受试者的肠道菌群门纲目科属五个层级菌群相对丰度的差异显著。痰湿体质与非痰湿体质相比门纲目科属五个层级菌群相对丰度以及差别较大,其中拟杆菌、类杆菌、毛螺菌、肠杆菌相对丰度差异有统计学意义(P<0.05)。结论:痰湿体质与非痰湿体质腹型肥胖受试者肠道菌群存在差异,二者间菌群差异可能是形成体质差异的内在因素。 展开更多
关键词 中医体质 痰湿体质 非痰湿体质 肠道菌群 16srna 腹型肥胖 Alpha多样性
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基于16sRNA高通量测序技术分析粉尘接触与煤矿工人咽部菌群变化关联性
5
作者 张薛纯 王袁 +3 位作者 何海兰 沈福海 王宏丽 刘和亮 《中国职业医学》 CAS 2024年第2期177-182,共6页
目的探讨煤矿粉尘接触人群咽部菌群分布情况。方法采用判断抽样法,选择从事职业性粉尘接触工作20年以上的8名煤矿工人为接尘组,以工作中不接触粉尘的4名煤矿工人为对照组。采用咽拭子采集2组人群的咽拭子,提取咽部菌群,采用16sRNA基因... 目的探讨煤矿粉尘接触人群咽部菌群分布情况。方法采用判断抽样法,选择从事职业性粉尘接触工作20年以上的8名煤矿工人为接尘组,以工作中不接触粉尘的4名煤矿工人为对照组。采用咽拭子采集2组人群的咽拭子,提取咽部菌群,采用16sRNA基因高通量测序技术进行基因测序,分析菌群的多样性、菌群丰度和均匀度。结果对照组人群的咽部菌群组成的操作分类单元有254个,较接尘组多210个。与对照组比较,接尘组人群咽部菌落的Chao1指数、Shannon指数、PD-tree指数和Pielou指数均降低(P值均<0.01)。在门水平上,接尘组人群咽部拟杆菌门和梭杆菌门丰度均高于对照组(P值均<0.05);在属水平上,与对照组比较,接尘组人群咽部普氏菌属、奈瑟菌属和单胞菌属等丰度均增高(P值均<0.05),乳杆菌属丰度降低(P值<0.05)。受试者工作特征曲线分析结果显示,乳杆菌属、梭杆菌属和罗氏菌属对接尘工人咽部菌群失衡有较高的预测价值,曲线下面积均为1.00±0.00。结论煤矿粉尘接触人群咽部菌群物种多样性和菌群均匀度均降低,可能与煤尘的持续吸入扰乱了人体咽部的微生物环境有关。 展开更多
关键词 粉尘 煤矿工人 咽部菌群 16srna 高通量测序
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1株产琥珀酸厌氧螺菌鉴定方法
6
作者 吴华 张培 +3 位作者 屈平华 王岩 吴风华 蒋宇杰 《中华医院感染学杂志》 北大核心 2025年第15期2253-2257,共5页
目的通过对比分析生化方法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和16S rRNA基因测序三种鉴定途径的效果,为临床微生物实验室鉴定产琥珀酸厌氧螺菌提供科学、合理的选择建议。方法采用方法学评价进行分析。针对就诊于广东... 目的通过对比分析生化方法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和16S rRNA基因测序三种鉴定途径的效果,为临床微生物实验室鉴定产琥珀酸厌氧螺菌提供科学、合理的选择建议。方法采用方法学评价进行分析。针对就诊于广东农垦中心医院的1例狗咬伤后引发败血症的患者3月27日分离的1株产琥珀酸厌氧螺菌,对其细菌形态、培养方式及菌落特性进行总结梳理。实验采用全自动微生物鉴定分析系统(梅里埃VITEK 2 Compact)、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS,包括VITEK MS、MALDI Biotyper、Autof ms 1000和EX-Accuspec)以及16S rRNA基因测序技术对分离菌株进行鉴定,同时对各鉴定方法的性能进行评估比较。结果产琥珀酸厌氧螺菌为专性厌氧的革兰阴性螺旋菌,其生长特点表现为生长缓慢,菌落呈现扁平和无色透明,氧化酶和触酶均呈阴性。在使用全自动微生物鉴定分析系统VITEK 2 Compact ANC卡进行鉴定时,未能成功识别该菌;而通过VITEK MS、MALDI Biotyper、Autof ms 1000和EX-Accuspec的鉴定,均确诊为产琥珀酸厌氧螺菌。此外,16S rRNA基因测序技术鉴定为产琥珀酸厌氧螺菌。结论现有的全自动生化鉴定系统不能鉴定产琥珀酸厌氧螺菌,MALDL-TOF MS和16S rRNA基因测序技术可准确鉴定产琥珀酸厌氧螺菌,临床微生物工作人员可根据自身现有条件选择适当的鉴定方法。 展开更多
关键词 厌氧螺菌属 产琥珀酸厌氧螺菌 16SrRNA 生化鉴定 基质辅助激光解吸电离飞行质谱
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金鱼嗜水气单胞菌的分离鉴定及药敏试验 被引量:15
7
作者 周毅 张培培 +3 位作者 徐晔 曹洁 孟学平 段宏安 《水产科学》 CAS 北大核心 2014年第6期379-384,共6页
自病死金鱼肝脏中分离到一株优势菌,对其进行感染试验、培养特性观察、生化特性鉴定及16SrRNA序列分析。试验结果表明,该分离菌株为嗜水气单胞菌,与已报道的嗜水气单胞菌的16S rRNA序列同源性>99.3%。用纸片扩散法进行药敏试验,试验... 自病死金鱼肝脏中分离到一株优势菌,对其进行感染试验、培养特性观察、生化特性鉴定及16SrRNA序列分析。试验结果表明,该分离菌株为嗜水气单胞菌,与已报道的嗜水气单胞菌的16S rRNA序列同源性>99.3%。用纸片扩散法进行药敏试验,试验结果显示,该分离株对四环素类、喹诺酮类、磺胺类、头孢呋新、头孢他啶、头孢吡肟等21种药物敏感,对青霉素G、氨苄西林、阿莫西林、头孢氨苄、林可霉素、麦迪霉素耐药。本次金鱼发病是由嗜水气单胞菌感染引起,可选用强力霉素、麦迪霉素、复方新诺明、磺胺甲基异恶唑、阿奇霉素、恩诺沙星、诺氟沙星等多种药物进行防治。 展开更多
关键词 金鱼 嗜水气单胞菌 分离 鉴定 16srna 药敏试验
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可形成生物膜的禽源产色葡萄球菌的分离鉴定及耐药性研究 被引量:11
8
作者 马玲 谭义俊 +4 位作者 邵帅 吴健敏 廖文军 黄红梅 白安斌 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期703-707,共5页
从发病鸡关节腔内分离获得1株革兰氏阳性球菌,根据细菌形态、生理生化特性、动物试验,结合16S rRNA基因核苷酸序列测定、系统进化树分析及生物膜半定量检测,确定该分离菌株为可形成生物膜的的产色葡萄球菌,该菌在正常条件下不致病。药... 从发病鸡关节腔内分离获得1株革兰氏阳性球菌,根据细菌形态、生理生化特性、动物试验,结合16S rRNA基因核苷酸序列测定、系统进化树分析及生物膜半定量检测,确定该分离菌株为可形成生物膜的的产色葡萄球菌,该菌在正常条件下不致病。药物敏感试验和耐药基因检测发现,该菌对磺胺六甲、阿奇霉素、米诺环素等8种药物敏感,对环丙沙星、头孢噻肟钠和复方新诺明中敏,而对万古霉素等13种药物低敏甚至不敏感。检测到该分离菌株包含氨基糖苷类、四环素类和磺胺类的6个耐药基因,说明这是一株多重耐药菌株,推测其耐药性与生物膜的形成有密切关系。 展开更多
关键词 产色葡萄球菌 凝固酶阴性葡萄球菌 16srna 生物膜 耐药性
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脓毒症小鼠肠道菌群紊乱的研究 被引量:7
9
作者 李玮 林名瑞 +2 位作者 陈怀宇 文丹 林建东 《中国急救医学》 CAS CSCD 2021年第10期887-892,共6页
目的对比脓毒症组小鼠与正常对照组小鼠的肠道菌群,以明确肠道菌群组成特点。方法将60只BALB/C小鼠随机等分为对照组(CF组)和脓毒症组(SF组)(每组各30只)。SF组小鼠按脂多糖(LPS)10 mg/kg腹腔注射构建脓毒症模型,CF组则予等量生理盐水... 目的对比脓毒症组小鼠与正常对照组小鼠的肠道菌群,以明确肠道菌群组成特点。方法将60只BALB/C小鼠随机等分为对照组(CF组)和脓毒症组(SF组)(每组各30只)。SF组小鼠按脂多糖(LPS)10 mg/kg腹腔注射构建脓毒症模型,CF组则予等量生理盐水腹腔注射。术后24、72 h每组小鼠留取粪便标本行16sRNA测序。在72 h同时取盲肠组织做组织学检查。结果LPS干预后72 h小鼠结肠局部黏膜上皮缺失,肠腺结构消失,炎性细胞浸润,上皮细胞肿胀。肠道菌群方面:SF组较CF组小鼠的肠道菌群多样性明显减少。CF组小鼠肠道菌群主要以拟杆菌门和厚壁菌门为主,但SF组小鼠厚壁菌属比例总体呈现减少趋势,变形菌门则表现为增长的趋势。LPS干预后24 h SF组小鼠肠道菌群出现紊乱:粪肠球菌属、大肠杆菌属、弗格森埃希菌属、缓慢葡萄球菌属及不可培养的大肠杆菌属明显增多(P<0.05),梭状芽孢菌属、毛螺科菌属、未培养的梭菌属则明显减少(P<0.05)。LPS干预后72 h SF组小鼠肠道菌群的变化情况:铅黄肠球菌、粪肠球菌、大肠杆菌、费格森埃希菌、金氏拟杆菌、奇异变形杆菌、未培养的埃希菌属和肠球菌明显增多(P<0.05),鼠乳杆菌、未培养的拟杆菌属、约氏乳杆菌则明显减少(P<0.05)。结论脓毒症小鼠可致肠道微生态的紊乱,微生物的多样性减少,潜在致病菌的过度生长,同时炎症作用下肠道屏障的破坏可能为微生物移位创造条件,也可能成为病情进一步发展的重要推动力。 展开更多
关键词 脓毒症 脂多糖 小鼠 肠道菌群 16srna
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MALDI-TOF MS直接检测清洁中段尿液标本中病原菌的价值 被引量:8
10
作者 徐令清 张冈毅 +5 位作者 钟子莹 温伟洪 汤英贤 钟国权 李介华 刘丽忠 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第22期2748-2751,共4页
目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)对清洁中段尿液标本中细菌的鉴定价值。方法收集300份清洁中段尿液标本,接种于血琼脂平板上,对尿液标本进行离心处理,采用MALDI-TOF MS对离心后的尿沉渣进行鉴定,同时对培养... 目的探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)对清洁中段尿液标本中细菌的鉴定价值。方法收集300份清洁中段尿液标本,接种于血琼脂平板上,对尿液标本进行离心处理,采用MALDI-TOF MS对离心后的尿沉渣进行鉴定,同时对培养出的单个菌落进行鉴定,并用Vitek 2 Compact及BD phoenixM50全自动微生物分析系统进行鉴定复核。结果300份清洁中段尿液标本中,63份培养鉴定到1种细菌,MALDI-TOF MS的菌株鉴定结果与两种全自动微生物分析系统的细菌鉴定结果的符合率为100.0%;MALDI-TOF MS在以上63份尿沉渣中直接检出25株细菌,检出率为39.7%(25/63);其中大肠埃希菌15株,占60.0%(15/25);肺炎克雷伯菌4株,占16.0%(4/25);粪肠球菌2株,占8.0%(2/25);产气肠杆菌1株,里昂葡萄球菌1株,黏质沙雷菌1株,分别各占4.0%(1/25);20份标本培养出两种细菌,应用MALDI-TOF MS直接在2份尿沉渣中检出2株屎肠球菌,检出率为10.0%(2/20)。结论MALDI-TOF MS鉴定准确率高,可从临床标本直接检测病原菌,节省培养时间,对两种混合菌感染的标本也有一定鉴定能力。 展开更多
关键词 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 病原菌 中段尿 16srna
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116株结核分枝杆菌链霉素耐药菌株rspL和rrs基因突变特征研究 被引量:5
11
作者 谢彤 李桂莲 +4 位作者 巨韩芳 赵德福 赵慧 穆成 王撷秀 《中国防痨杂志》 CAS 2010年第10期636-638,共3页
关键词 rrs基因 耐药菌株 链霉素 结核分枝杆菌 突变特征 16srna 氨基糖苷类抗生素 RPSL基因
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一株具有抗真菌活性的食酸丛毛单胞菌的分离和鉴定 被引量:3
12
作者 秦磊 王恒安 +3 位作者 欧阳志明 顾翠妹 成志恒 赵国屏 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期72-76,共5页
在土壤中分离到一株细菌STRA ,菌块测定法显示该菌可显著抑制玉米小斑病菌和稻恶苗病菌 ,具有抗真菌活性。该菌可以在SFM和LB等多种培养基上生长 ,且菌落生长无明显终止现象 ;革兰氏染色为阴性 ,电镜观察可见 2~ 4根鞭毛。 (G +C) %在 ... 在土壤中分离到一株细菌STRA ,菌块测定法显示该菌可显著抑制玉米小斑病菌和稻恶苗病菌 ,具有抗真菌活性。该菌可以在SFM和LB等多种培养基上生长 ,且菌落生长无明显终止现象 ;革兰氏染色为阴性 ,电镜观察可见 2~ 4根鞭毛。 (G +C) %在 5 9%~ 6 7%范围内。生化指标的检测显示该菌株对所测试的多数糖类不能发酵 ,经BioMerieuxVitek的革兰氏阴性细菌检测试验卡 (GNI)鉴定为食酸丛毛单胞菌 (Delftiaacidovorans)。设计两对简并引物对其 16SRNA进行PCR扩增 ,16SRNA的序列及其相关生物信息学分析结果进一步确证生化鉴定结果。该分离株的抗真菌物质的特性鉴定。 展开更多
关键词 抗真菌活性 食酸丛毛单胞菌 分离 鉴定 16srna
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焦磷酸测序法在败血症常见病原体检测中的应用 被引量:3
13
作者 胡子有 韩慧 +1 位作者 曾勇 吴炳义 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1053-1056,共4页
目的将焦磷酸测序技术应用于败血症常见病原体的检测鉴定。方法根据细菌16S rRNA序列的特点,设计焦磷酸测序用的PCR扩增引物和测序引物,提取败血症常见病原体的基因组DNA,进行焦磷酸测序,分析获得的序列,进行比对,对病原体种类作出判断... 目的将焦磷酸测序技术应用于败血症常见病原体的检测鉴定。方法根据细菌16S rRNA序列的特点,设计焦磷酸测序用的PCR扩增引物和测序引物,提取败血症常见病原体的基因组DNA,进行焦磷酸测序,分析获得的序列,进行比对,对病原体种类作出判断。结果经焦磷酸测序可以获取有效长度28 bp的序列,使用该测序序列可以有效区分化脓性链球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷白杆菌、脑膜炎双球菌、沙门氏菌,但不能区分金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌。结论应用焦磷酸测序可以较有效地对败血症常见病原体的种类实现种属水平的区分。 展开更多
关键词 焦磷酸测序 败血症 病原体 16srna
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溶磷细菌筛选及在复垦土壤上对难溶态磷的活化作用 被引量:3
14
作者 乔志伟 刘超 邵晓贵 《地球与环境》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期558-564,共7页
为研究溶磷细菌在复垦土壤上对难溶态磷的活化作用,通过PVK平板法从石灰性土壤中分离筛选出7株溶磷细菌,7株菌株的溶磷能力在296.5~563.5 mg/L之间,菌株的溶磷能力与溶磷圈直径(D)与菌落直径(d)的比值呈显著正相关(p<0.01);16sRNA序... 为研究溶磷细菌在复垦土壤上对难溶态磷的活化作用,通过PVK平板法从石灰性土壤中分离筛选出7株溶磷细菌,7株菌株的溶磷能力在296.5~563.5 mg/L之间,菌株的溶磷能力与溶磷圈直径(D)与菌落直径(d)的比值呈显著正相关(p<0.01);16sRNA序列分析表明,W1、W6属于Enterobacter sp.,W2、W4属于Burkholderia sp.,W3、W5属于Rahnella sp.,W7属于Fluorescent pseudomonas.选择W3、W4、W7作为试验菌株,以磷酸三钙、磷矿粉为难溶态磷源,研究单菌株及组合菌株在配施难溶态磷酸盐条件下对复垦土壤有效磷、各形态无机磷含量及油菜产量的影响.结果表明,同一底物下溶磷细菌各处理复垦土壤有效磷含量和油菜产量显著高于基质处理(p<0.05),组合菌株处理优于单菌株处理,W3+W4+W7处理两项指标都最高;在溶磷细菌+磷酸三钙底物下,W3+W4+W7处理复垦土壤有效磷含量和油菜产量分别比单施溶磷细菌、溶磷细菌+磷矿粉两个底物下同一处理显著增加94.81%、40.25%和34.13%、9.43%;相同底物下溶磷细菌各处理复垦土壤Ca2-P、Ca8-P、A1-P、Fe-P含量都高于基质处理,Ca10-P含量小于基质处理,O-P含量与基质处理差异不显著.这一结果可为溶磷细菌在复垦土壤上应用技术的研发提供理论基础. 展开更多
关键词 溶磷细菌 16srna 复垦土壤 难溶态磷 活化
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一株嗜盐细菌的16SrRNA基因序列分析 被引量:4
15
作者 汪长东 陈鹏 +1 位作者 闫旭 何光源 《生物技术》 CAS CSCD 2008年第6期1-3,共3页
目的:从舟山深海海泥中获得了底泥样品,并从中提取到了一株嗜盐细菌。方法:通过用不同盐浓度的培养基培养,挑取单菌落,反复划线纯化,得到了嗜盐菌的单菌落,通过菌株基因组DNA的提取、菌株的抗性实验、质粒的提取、16SrRNA的PCR扩增及克... 目的:从舟山深海海泥中获得了底泥样品,并从中提取到了一株嗜盐细菌。方法:通过用不同盐浓度的培养基培养,挑取单菌落,反复划线纯化,得到了嗜盐菌的单菌落,通过菌株基因组DNA的提取、菌株的抗性实验、质粒的提取、16SrRNA的PCR扩增及克隆、16SrRNA的全序列分析等手段。结果:得到该菌株的16SrRNA的基因序列。结论:该株嗜盐菌是一株新色盐杆菌。 展开更多
关键词 嗜盐菌 筛选 16srna PCR
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阪崎肠杆菌检测技术研究进展 被引量:5
16
作者 李锦程 王玉坤 曹远银 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期371-373,共3页
关键词 阪崎肠杆菌 检测技术 革兰阴性细菌 肠道正常菌群 16srna PCR法检测 PCR测定 生化鉴定
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一株耐盐葡萄球菌的分离与鉴定 被引量:1
17
作者 卫文强 邢伟伟 +4 位作者 于运运 朱欣茹 房娜 王风玲 季少平 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2014年第3期185-187,共3页
目的从盐碱地土壤中分离耐盐耐药细菌。方法采用倍比稀释法从土壤中分离不同性状的细菌,分别对这些细菌进行耐盐性实验,将筛选到耐150g/L NaCl的菌株进行生化实验、药敏实验和16sRNA序列分析。结果16sRNA分析表明从土壤中分离到一株耐... 目的从盐碱地土壤中分离耐盐耐药细菌。方法采用倍比稀释法从土壤中分离不同性状的细菌,分别对这些细菌进行耐盐性实验,将筛选到耐150g/L NaCl的菌株进行生化实验、药敏实验和16sRNA序列分析。结果16sRNA分析表明从土壤中分离到一株耐盐表皮葡萄球菌,能分解乳糖和蔗糖,可在150g/L NaCl中生长,该菌株对青霉素和苯唑西林耐药。结论该耐盐葡萄球菌株的分离将为耐盐基因的克隆及转基因耐盐菌株的应用奠定基础。 展开更多
关键词 葡萄球菌 耐盐 16srna 鉴定
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农户自制酸菜中益生潜力乳酸菌的分离鉴定 被引量:3
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作者 郝永伟 吕蕾 刘新利 《齐鲁工业大学学报》 CAS 2014年第2期34-36,共3页
从农户自制酸菜中分离,鉴定具有益生潜力的优质乳酸菌菌株。根据菌落形态,革兰氏染色和透明圈,从酸菜汁中初步分离到40株乳酸菌菌株,以耐人工胃液为筛选指标,从初筛菌中选择耐酸能力强的乳酸菌,用16sRNA分子生物学方法鉴定菌种。比较筛... 从农户自制酸菜中分离,鉴定具有益生潜力的优质乳酸菌菌株。根据菌落形态,革兰氏染色和透明圈,从酸菜汁中初步分离到40株乳酸菌菌株,以耐人工胃液为筛选指标,从初筛菌中选择耐酸能力强的乳酸菌,用16sRNA分子生物学方法鉴定菌种。比较筛选菌的耐胆碱能力,产酸性能以及抑菌能力,从中挑选出综合能力最好的菌株。分离得到一株耐酸,耐人工肠液,耐胆碱,产酸能力强,对大肠杆菌,金黄色葡萄球菌和烟曲霉都具有抑制能力的植物乳杆菌。 展开更多
关键词 酸菜 乳酸菌 筛选 16srna鉴定
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大黄对脓毒症小鼠早期肠道菌群的影响 被引量:5
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作者 李玮 林名瑞 +3 位作者 郭小艳 陈怀宇 文丹 姚洁 《蛇志》 2021年第2期138-140,149,共4页
目的采用16sRNA测序技术检测大黄对脓毒症小鼠早期肠道菌群的变化情况,分析大黄对脓毒症小鼠的治疗作用机制。方法将45只BALB/C小鼠随机等分为3组,即对照组、脓毒症组、脓毒症大黄干预组。实验前正常饮食、饮水。术前2 d脓毒症大黄干预... 目的采用16sRNA测序技术检测大黄对脓毒症小鼠早期肠道菌群的变化情况,分析大黄对脓毒症小鼠的治疗作用机制。方法将45只BALB/C小鼠随机等分为3组,即对照组、脓毒症组、脓毒症大黄干预组。实验前正常饮食、饮水。术前2 d脓毒症大黄干预组按生药量50 mg/kg灌胃给药,每天2次;对照组、脓毒症组给予等量生理盐水灌胃。3组小鼠灌胃给药2 d后,脓毒症组及脓毒症大黄干预组小鼠按LPS 10 mg/kg腹腔注射构建脓毒症模型,对照组予等量生理盐水腹腔注射。建模后24 h取盲肠组织行病理检查以及粪便组织16sRNA检测。结果经大黄干预后,脓毒症小鼠盲肠组织结构的改变得到一定程度的缓解。脓毒症组小鼠厚壁菌属比例明显减少,拟杆菌属相对增多。脓毒症大黄干预组小鼠拟杆菌属、厚壁菌属、弯曲菌属均有减少,而变形菌属明显增多。结论大黄干预后,脓毒症小鼠肠道菌群进一步变化,变形杆菌属相对增多为优势菌群;结合病理结果,考虑大黄对脓毒症小鼠的治疗作用主要是通过保护肠道黏膜屏障而起到保护作用。 展开更多
关键词 脓毒症 LPS 小鼠 大黄 16srna
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基于12S、16S和Cyt b基因部分序列的丽棘蜥系统发育分析
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作者 秦新民 李惠敏 +2 位作者 蔡乐靖 曾德龙 管清新 《广西师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2012年第1期71-76,共6页
本文测定丽棘蜥12SRNA、16SRNA、Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载15种有鳞目动物的同源序列,以鳄目的2个种(Alligator sinensis和Cairman crocodilus)作为外群,构建MP、NJ和ML分子系统树,探讨它们的系统发育关系。MP、NJ和ML分子... 本文测定丽棘蜥12SRNA、16SRNA、Cyt b基因部分序列,并从GenBank中下载15种有鳞目动物的同源序列,以鳄目的2个种(Alligator sinensis和Cairman crocodilus)作为外群,构建MP、NJ和ML分子系统树,探讨它们的系统发育关系。MP、NJ和ML分子系统树聚类的结果显示:蛇蜥亚目、壁虎亚目、蚓蜥亚目、石龙子亚目和鬣蜥亚目能够完全分开,蛇亚目和蜥蜴亚目在有鳞目中为姐妹支关系。 展开更多
关键词 丽棘蜥 12SRNA基因 16srna基因 CYT B基因 系统发育
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