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唇形后口虫SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立及其应用
1
作者
郝文悦
王锦锦
+9 位作者
葛建龙
李彬
王印庚
廖梅杰
荣小军
赵宏晶
江敏棋
赵文广
牛立成
潘娇
《渔业科学进展》
北大核心
2025年第3期183-193,共11页
后口虫病是近年来影响刺参(Apostichopus japonicus)养殖效益的重要病害种类之一。唇形后口虫(Boveria labialis)是刺参后口虫病的病原。由于缺乏针对该物种的快速、准确的检测方法,研究人员难以系统解析该病原体的传播途径。本研究以...
后口虫病是近年来影响刺参(Apostichopus japonicus)养殖效益的重要病害种类之一。唇形后口虫(Boveria labialis)是刺参后口虫病的病原。由于缺乏针对该物种的快速、准确的检测方法,研究人员难以系统解析该病原体的传播途径。本研究以测序获得的唇形后口虫部分线粒体基因组序列为基础,根据nad10基因序列设计唇形后口虫引物,建立其SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法,并对刺参不同养殖区和不同养殖模式下养殖系统中唇形后口虫载量进行检测分析。结果显示,设计的唇形后口虫引物在质粒标准品4.05×10^(1)~4.05×10^(9) copies/μL范围内建立的标准曲线具有良好的线性关系,相关系数R^(2)=0.997,熔解曲线呈现单一峰,无引物二聚体或非特异性扩增;灵敏度实验最低检测限为40.5 copies/μL;所设计的引物仅对唇形后口虫出现特异性扩增,对海洋尾丝虫(Uronema marinum)、贪食纤口虫(Chaenea vorax)、僧帽肾形虫(Colpoda cucullus)和多小核草履虫(Paramecium multi-micronuleatum)无交叉反应;重复性实验中各浓度的批内和批间Ct值均一性较高,批内实验变异系数(CV)值为0.32%~0.82%,批间实验CV值为0.40%~0.88%,稳定性较好。利用本方法对4种刺参养殖模式不同养殖区的环境样品和饲料进行检测,结合镜检结果对比分析发现,海水中唇形后口虫DNA载量与刺参体内唇形后口虫量呈中度正相关(R=0.563),底泥、附着物样品中的唇形后口虫DNA载量与刺参体内唇形后口虫量呈高度正相关(R=0.931)。推测,鲜海泥是唇形后口虫传播的重要载体之一。本研究结果可为唇形后口虫的快速检测、传播途径解析和防控提供参考。
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关键词
刺参
寄生性疾病
唇形后口虫
实时荧光定量PCR检测
传播途径
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职称材料
一株致病性异育银鲫源维氏气单胞菌的分离鉴定
被引量:
6
2
作者
邓院生
方进
+2 位作者
王俊
周莉
朱蓉
《水产学杂志》
CAS
2015年第2期1-5,共5页
从急性患病异育银鲫Carassius auratus gibelio肝胰脏中分离到一株优势菌。对该菌株进行了显微和超微结构观察、生理生化表型鉴定、16S rRNA和毒力基因分析及人工感染实验。结果显示:分离菌呈短杆状、两头钝圆、端生鞭毛,为革兰氏阴性菌...
从急性患病异育银鲫Carassius auratus gibelio肝胰脏中分离到一株优势菌。对该菌株进行了显微和超微结构观察、生理生化表型鉴定、16S rRNA和毒力基因分析及人工感染实验。结果显示:分离菌呈短杆状、两头钝圆、端生鞭毛,为革兰氏阴性菌;发酵葡萄糖产酸,氧化酶、触酶试验阳性,高盐浓度不生长;16S rRNA序列与气单胞菌属Aeromonas的基因相似性为98%以上,系统发育分析进一步表明该菌为维氏气单胞菌A.veronii,在该菌中可检测到肠毒素基因,且回接感染能导致健康银鲫发病,表明该菌具有致病性。
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关键词
异育银鲫
系统性出血
维氏气单胞菌
分离鉴定
致病性
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职称材料
题名
唇形后口虫SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立及其应用
1
作者
郝文悦
王锦锦
葛建龙
李彬
王印庚
廖梅杰
荣小军
赵宏晶
江敏棋
赵文广
牛立成
潘娇
机构
上海海洋大学水产与生命学院
海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室
青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室
中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所
出处
《渔业科学进展》
北大核心
2025年第3期183-193,共11页
基金
山东省重点研发计划(重大科技创新工程)(2023CXGC010410)
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2023TD29)
青岛市重点研发计划(22-3-3-hygg-1-hy)共同资助。
文摘
后口虫病是近年来影响刺参(Apostichopus japonicus)养殖效益的重要病害种类之一。唇形后口虫(Boveria labialis)是刺参后口虫病的病原。由于缺乏针对该物种的快速、准确的检测方法,研究人员难以系统解析该病原体的传播途径。本研究以测序获得的唇形后口虫部分线粒体基因组序列为基础,根据nad10基因序列设计唇形后口虫引物,建立其SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法,并对刺参不同养殖区和不同养殖模式下养殖系统中唇形后口虫载量进行检测分析。结果显示,设计的唇形后口虫引物在质粒标准品4.05×10^(1)~4.05×10^(9) copies/μL范围内建立的标准曲线具有良好的线性关系,相关系数R^(2)=0.997,熔解曲线呈现单一峰,无引物二聚体或非特异性扩增;灵敏度实验最低检测限为40.5 copies/μL;所设计的引物仅对唇形后口虫出现特异性扩增,对海洋尾丝虫(Uronema marinum)、贪食纤口虫(Chaenea vorax)、僧帽肾形虫(Colpoda cucullus)和多小核草履虫(Paramecium multi-micronuleatum)无交叉反应;重复性实验中各浓度的批内和批间Ct值均一性较高,批内实验变异系数(CV)值为0.32%~0.82%,批间实验CV值为0.40%~0.88%,稳定性较好。利用本方法对4种刺参养殖模式不同养殖区的环境样品和饲料进行检测,结合镜检结果对比分析发现,海水中唇形后口虫DNA载量与刺参体内唇形后口虫量呈中度正相关(R=0.563),底泥、附着物样品中的唇形后口虫DNA载量与刺参体内唇形后口虫量呈高度正相关(R=0.931)。推测,鲜海泥是唇形后口虫传播的重要载体之一。本研究结果可为唇形后口虫的快速检测、传播途径解析和防控提供参考。
关键词
刺参
寄生性疾病
唇形后口虫
实时荧光定量PCR检测
传播途径
Keywords
Apostichopus japonicus
Parasitic disease
Boveria labialis
Real-time fluorescent quantitative PCR detection
Transmission route
分类号
S942.42 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
一株致病性异育银鲫源维氏气单胞菌的分离鉴定
被引量:
6
2
作者
邓院生
方进
王俊
周莉
朱蓉
机构
中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室
中国科学院大学
出处
《水产学杂志》
CAS
2015年第2期1-5,共5页
基金
中国科学院战略性先导科技专项(XDA08030202)
国家973项目(2010CB126303)
+1 种基金
国家自然科学基金(31270213
31372551)
文摘
从急性患病异育银鲫Carassius auratus gibelio肝胰脏中分离到一株优势菌。对该菌株进行了显微和超微结构观察、生理生化表型鉴定、16S rRNA和毒力基因分析及人工感染实验。结果显示:分离菌呈短杆状、两头钝圆、端生鞭毛,为革兰氏阴性菌;发酵葡萄糖产酸,氧化酶、触酶试验阳性,高盐浓度不生长;16S rRNA序列与气单胞菌属Aeromonas的基因相似性为98%以上,系统发育分析进一步表明该菌为维氏气单胞菌A.veronii,在该菌中可检测到肠毒素基因,且回接感染能导致健康银鲫发病,表明该菌具有致病性。
关键词
异育银鲫
系统性出血
维氏气单胞菌
分离鉴定
致病性
Keywords
Carassius auratus gibelio
systemic hemorrhage
A eromonas veronii
isolation and identification
pathogenicity
分类号
S942.42 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
唇形后口虫SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法的建立及其应用
郝文悦
王锦锦
葛建龙
李彬
王印庚
廖梅杰
荣小军
赵宏晶
江敏棋
赵文广
牛立成
潘娇
《渔业科学进展》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一株致病性异育银鲫源维氏气单胞菌的分离鉴定
邓院生
方进
王俊
周莉
朱蓉
《水产学杂志》
CAS
2015
6
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职称材料
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