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题名猪圆环病毒1型和2型四川分离株全基因克隆分析
被引量：3
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作者
朱玲
郭万柱
徐志文
陈杨
周远成
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机构
四川农业大学动物科技学院
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出处
《四川农业大学学报》
CSCD
2007年第2期127-130,共4页
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基金
四川省科技厅生物技术专项
四川省教育厅重点专项(2004D004)。
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文摘
参照Genbank收录猪圆环病毒（porcine circovirus,PCV）1、2型序列,设计两对特异性引物,分别扩增猪圆环病毒1型和2型四川分离株（PCV1-YA1株和PCV2-SC株）全基因组,获得了预期目标大小一致扩增产物,分别将其克隆于PMD18-T载体,分别命名为PMD18-T-PCV1-YA与PMD18-T-PCV2-SC。经酶切鉴定和序列测定证实,成功克隆了PCV1-YA1株1759bp和PCV2-SC株1767 bp的全基因组序列。所得序列与GenBank中的国内外其它PCV1和PCV2毒株进行比较分析,其同源性分别达到98.8%-99.9%与93.6%-98.6%;而PCV1-YA1株和PCV2-SC株之间的同源性则仅为69.2%,进一步分析两个毒株的主要阅读框架,毒株间ORF1核苷酸序列及推导的氨基酸同源性均为85.3%,而ORF2的核苷酸序列及推导的氨基酸同源性分别为66%和65.2%。推导显示两毒株之间ORF1编码产物疏水性区域分布有相似之处,而ORF2编码产物的跨膜区存在差异。
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关键词
猪圆环病毒
全基因
克隆
序列分析
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Keywords
porcine cireovirus, complete genome, clone, sequenced similarity analysis
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分类号
S858.280.43
[农业科学—临床兽医学]
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