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不同品种河流型水牛及其杂交品种肠道微生物群落分析
1
作者 万根 王也 +5 位作者 杨晓雪 杨佛生 姜成俊 叶昱 黄冬艳 宋德平 《江西农业大学学报》 北大核心 2025年第4期1049-1061,共13页
【目的】旨在评估相同条件下饲养的摩拉水牛(Murrah buffaloes)、尼里-拉菲水牛(Nili-Ravi buffaloes)、地中海水牛(Mediterranean buffaloes)及尼里-拉菲与摩拉、尼里-拉菲与地中海、摩拉与地中海水牛杂交品种的肠道微生物群落组成与结... 【目的】旨在评估相同条件下饲养的摩拉水牛(Murrah buffaloes)、尼里-拉菲水牛(Nili-Ravi buffaloes)、地中海水牛(Mediterranean buffaloes)及尼里-拉菲与摩拉、尼里-拉菲与地中海、摩拉与地中海水牛杂交品种的肠道微生物群落组成与结构,为阐明河流型水牛宿主遗传与肠道微生物群落之间的关系提供科学依据。【方法】采用二代测序技术(NGS)对摩拉水牛、尼里-拉菲水牛和地中海水牛及其杂交品种粪便细菌的16S rRNA V4超变区进行测序,分析其肠道微生物群落的差异及多样性。【结果】(1)19个河流型水牛粪便样本共获得2326407条读长(reads),平均每个样本有(1738±237)SD OTUs(operational taxonomic units)。(2)在门水平,与水牛品种相关的微生物包括拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、软壁菌门(Tenericutes)、黏胶球形菌门(Lentisphaerae)、蓝菌门(Cyanobacteria)和广古菌门(Euryarchaeota),其中尼里-拉菲水牛与摩拉水牛(P=0.019)、尼里-拉菲水牛与摩拉和地中海杂交水牛(P=0.019)的疣微菌门(Verrucomicrobia)丰度存在显著差异,尼里-拉菲水牛与其他5个品种水牛(P=0.001~0.005)的蓝菌门(Cyanobacteria)丰度均存在显著差异。(3)在属水平,与水牛品种相关的主要微生物包括瘤胃球菌属(Ruminococcus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、土壤芽孢杆菌属(Solibacillus)、文肯菌属(Rikenella)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)和另枝菌属(Alistipes),其中尼里-拉菲水牛与地中海水牛(P=0.041)的拟杆菌属(Bacteroides)丰度存在显著差异,摩拉和地中海杂交水牛与其他5个品种水牛(P=0.000~0.001)的阿克曼氏菌属(Akkermansia)丰度均存在显著差异。【结论】摩拉水牛、尼里-拉菲水牛、地中海水牛及其杂交品种的肠道微生物群落存在显著差异,表明遗传差异会影响水牛的肠道微生物群落组成和结构。 展开更多
关键词 微生物群落 水牛 16S rRNA 二代测序 品种
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牛病毒性腹泻病毒1型E2蛋白抗体侧流免疫层析检测方法的建立 被引量：1
2
作者 刘鑫欢 张纹纹 +8 位作者 程子龙 金前跃 郭志睿 郭大伟 龙云凤 杨蕾蕾 刘茂军 白娟 李文良 《南京农业大学学报》 北大核心 2025年第5期1100-1107,共8页
[目的]本研究旨在使用金-银纳米颗粒标记纯化的牛病毒性腹泻病毒1型(BVDV-1)重组E2蛋白,建立基于金-银纳米颗粒的E2蛋白抗体侧流免疫层析检测方法。[方法]对金-银纳米颗粒标记条件进行优化,选取2 mg·mL^(-1)的金黄色葡萄球菌A蛋白(... [目的]本研究旨在使用金-银纳米颗粒标记纯化的牛病毒性腹泻病毒1型(BVDV-1)重组E2蛋白,建立基于金-银纳米颗粒的E2蛋白抗体侧流免疫层析检测方法。[方法]对金-银纳米颗粒标记条件进行优化,选取2 mg·mL^(-1)的金黄色葡萄球菌A蛋白(staphylococal protein A,SPA)和BVDV-1单克隆抗体1E2B3包被于硝酸纤维素(NC)膜上,分别作为检测线(test line,T线)和质控线(control line,C线),对反应条件进行优化后建立侧流免疫层析检测方法。[结果]金-银纳米颗粒最佳标记条件:以pH7.4的硼酸-硼砂缓冲液作为金-银纳米颗粒的溶剂;最佳标记蛋白浓度为10μg·mL^(-1)。优化后的侧流免疫层析检测方法的反应条件:2 mg·mL^(-1)的SPA作为T线,0.6 mg·mL^(-1)的1E2B3作为C线,待检血清稀释度为1∶50。特异性试验结果表明建立的金-银纳米颗粒免疫层析试纸条不与猪瘟病毒(CSFV)、牛病毒性腹泻病毒2型(BVDV-2)、牛副流感病毒3型(BPIV3)、传染性牛鼻气管炎病毒(IBRV)、口蹄疫病毒(FMDV)、牛支原体和布鲁氏菌阳性血清发生交叉反应。敏感性试验结果显示,将BVDV阳性血清(中和抗体效价为1∶2048)稀释512倍时金-银纳米颗粒免疫层析试纸条仍可检出。使用金-银纳米颗粒免疫层析试纸条检测125份牛血清,并与中和试验结果比较,两者阴性血清符合率为100%,阳性血清符合率为96.04%,总体符合率为96.80%。[结论]本试验基于金-银纳米颗粒建立的免疫层析抗体检测方法具有特异性好、灵敏度高、操作简便快捷的特点,为快速检测BVDV-1抗体提供了有力的技术支撑。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 E2蛋白 抗体 金-银纳米颗粒 侧流免疫层析方法
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1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析
3
作者 沈学怀 赵瑞宏 +8 位作者 尹磊 侯宏艳 戴银 胡晓苗 殷冬冬 王洁茹 潘孝成 周学利 刘永杰 《畜牧与兽医》 北大核心 2025年第4期60-70,共11页
鸡源沙门菌不仅会引起鸡的感染发病,还会威胁食品和公共卫生安全。本研究从安徽肥东地区1只疑似沙门菌感染病鸡组织中分离出1株沙门菌,命名为SM24,评价该菌株的生长曲线,测定菌株致病性和半数致死量(LD50),用Kirby-Bauer法对分离株进行... 鸡源沙门菌不仅会引起鸡的感染发病,还会威胁食品和公共卫生安全。本研究从安徽肥东地区1只疑似沙门菌感染病鸡组织中分离出1株沙门菌,命名为SM24,评价该菌株的生长曲线,测定菌株致病性和半数致死量(LD50),用Kirby-Bauer法对分离株进行耐药性测试;通过全基因组测序构建分离株基因图谱,分析其携带的毒力和耐药基因特征。结果:分离株在LB培养基中生长良好;对SPF雏鸡具有明显的致病性,LD50为8.50×10^(5) CFU;SM24为多重耐药菌株,对青霉素类、头孢菌素类、喹诺酮类、四环素类、磺胺类以及新霉素、庆大霉素、阿奇霉素和氨曲南等16种抗生素表现耐药,对大观霉素、阿米卡星、氯霉素、氟苯尼考、亚胺培南和多黏菌素B敏感;全基因组测序分析表明,SM24为印第安纳血清型沙门菌(Salmonella Indiana),序列型为ST17,基因组大小为4865511 bp,GC含量为51.96%,携带一个IncHI2质粒,大小为165044 bp;SM24菌株基因组中携带280个毒力相关基因和144个耐药基因,其中整合移动元件(IME)位点和质粒上存在12个耐药基因;SM24菌株与国内报道的鸡源印第安纳沙门菌的遗传距离较远。综上,本研究分离鉴定到1株鸡源印第安纳沙门菌株,具有较强的毒力和多重耐药性,同时解析了菌株的全基因组特征,为深入研究印第安纳沙门菌的致病和耐药机制提供参考。 展开更多
关键词 鸡源印第安纳沙门菌 致病性 耐药性 毒力基因 耐药基因 全基因组测序
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水牛睾丸生精细胞蛋白质组学及其磷酸化修饰组学联合分析
4
作者 黄愉淋 王晨阳 +3 位作者 刘栩炀 张鹏飞 付强 张明 《南方农业学报》 北大核心 2025年第1期261-274,共14页
【目的】综合分析水牛睾丸生精细胞蛋白质组学及其磷酸化修饰组学,探究水牛精子发生过程中蛋白的动态表达变化及其调控机制,为解析水牛精子发生的分子机制提供理论依据。【方法】从性成熟期水牛睾丸组织中分离生精细胞,采用液相色谱—... 【目的】综合分析水牛睾丸生精细胞蛋白质组学及其磷酸化修饰组学,探究水牛精子发生过程中蛋白的动态表达变化及其调控机制,为解析水牛精子发生的分子机制提供理论依据。【方法】从性成熟期水牛睾丸组织中分离生精细胞,采用液相色谱—质谱联用技术(LC-MS/MS)构建水牛生精细胞蛋白质组和磷酸化蛋白质组表达谱。利用生物信息学软件对数据进行联合分析,筛选出关键蛋白及其磷酸化修饰位点。构建蛋白互作网络(PPI)和激酶—底物互作网络。采用Western blotting检测和免疫组织化学分析验证筛选出的关键蛋白。【结果】蛋白质组和磷酸化蛋白质组中分别鉴定出1785和129个蛋白,共同鉴定到78个蛋白质。蛋白质组中的高丰度蛋白包括热休克蛋白和微管蛋白等。GO功能注释和KEGG信号通路富集分析结果表明,RNA剪接在蛋白质组和磷酸化蛋白质组中均被显著富集(P<0.05),剪接体是磷酸化蛋白富集最多的信号通路。蛋白质组结构域富集分析结果表明,RNA识别基序结构域的富集程度最高。细胞周期依赖性蛋白激酶在蛋白质组PPI和磷酸化蛋白质组激酶—底物互作网络中均发挥关键作用。蛋白质组和磷酸化蛋白质组共同鉴定到的78个蛋白中,有17个蛋白与精子发生密切相关。Western blotting检测和免疫组织化学分析结果表明,LMNA蛋白及其磷酸化形式LMNA(pS392)均能被成功鉴定,LMNA主要分布于曲细精管基底膜附近,而LMNA(pS392)主要分布于曲细精管管腔附近。【结论】水牛睾丸生精细胞高表达热休克蛋白可能与水牛适应湿热气候有关,高表达微管蛋白可能与生精细胞在曲细精管内的迁移密切相关。RNA剪接和磷酸化修饰可能通过影响蛋白的功能和分布来调控精子的发生过程。 展开更多
关键词 生精细胞 蛋白质组 磷酸化蛋白质组 RNA剪接
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基于简化基因组测序的水牛遗传结构特征及选择信号分析
5
作者 李恒刚 黎旺长 +6 位作者 郑海英 尚江华 段安琴 黄丽清 冯超 杨小淦 杨春艳 《南方农业学报》 北大核心 2025年第9期2930-2939,共10页
[目的]了解不同水牛群体的遗传多样性并确定各品种间的遗传关系,为后续的广西水牛保种选育及其特色性状形成机制研究提供理论依据。[方法]分别采集摩拉水牛、尼里—拉菲水牛及杂交水牛(摩拉水牛与广西水牛杂交F1代)的颈静脉血液样本,通... [目的]了解不同水牛群体的遗传多样性并确定各品种间的遗传关系,为后续的广西水牛保种选育及其特色性状形成机制研究提供理论依据。[方法]分别采集摩拉水牛、尼里—拉菲水牛及杂交水牛(摩拉水牛与广西水牛杂交F1代)的颈静脉血液样本,通过Illumina HiSeqTM2000测序平台进行简化基因组测序,采用主成分分析(PCA)结合血统分析揭示不同水牛群体间的遗传关系和群体结构,然后通过计算群体内的连锁不平衡衰减情况及群体间的固定系数(FST),筛选出与水牛经济性状相关的选择基因,并基于DAVID v6.8数据库进行KEGG信号通路富集分析。[结果]3个水牛群体简化基因组测序获得的有效序列(Clean reads)比对到水牛第4版参考基因组(GCA_003121395.1)的平均比对率为99.54%;经SNP质控及过滤后,共获得2012270个SNPs。摩拉水牛与尼里—拉菲水牛间存在较大的遗传差异,群体内个体间也存在较远的遗传距离,其亲缘关系较远;相对于杂交水牛与尼里—拉菲水牛,杂交水牛与摩拉水牛的亲缘关系更近(FST均小于0.40)。3个水牛群体间的共有受选择基因有31个,且31个受选择基因主要富集于突触后膜和蛋白磷酸化通路上,共涉及5个基因,分别是AMPA型谷氨酸受体α1亚单位基因(GRIA1)、钾钙激活通道亚家族Mα1基因(KCNMA1)、Abelson小鼠白血病病毒癌基因同源物1基因(ABR)、TRIO Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子基因(TRIO)及丝裂原活化蛋白激酶4基因(MAP4K4)。[结论]基于简化基因组测序从摩拉水牛、尼里—拉菲水牛及杂交水牛3个群体中筛选出31个可能与水牛经济性状密切相关的候选基因,主要富集于突触后膜和蛋白磷酸化通路,其中GRIA1、KCNMA1、ABR、TRIO、MAP4K4等5个基因在神经调控和激素调节方面发挥着重要作用,通过神经系统、免疫反应和细胞行为等生物学过程间接影响水牛的体型、繁殖及泌乳性能。 展开更多
关键词 水牛 遗传结构 选择信号 SNP位点 简化基因组测序
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基于全基因组关联分析挖掘水牛产奶相关基因
6
作者 谢其洋 黎旺长 +6 位作者 郑海英 尚江华 段安琴 黄丽清 冯超 杨小淦 杨春艳 《南方农业学报》 北大核心 2025年第4期1255-1267,共13页
【目的】基于全基因组关联分析筛选影响水牛产奶量和产奶质量的相关基因,并验证这些基因的潜在功能,为加快优质高产水牛品种选育提供理论依据。【方法】选取70头水牛(36头杂交水牛、18头摩拉水牛和16头尼里—拉菲水牛)进行产奶性状表型... 【目的】基于全基因组关联分析筛选影响水牛产奶量和产奶质量的相关基因,并验证这些基因的潜在功能,为加快优质高产水牛品种选育提供理论依据。【方法】选取70头水牛(36头杂交水牛、18头摩拉水牛和16头尼里—拉菲水牛)进行产奶性状表型值测量,同时提取70头水牛的基因组DNA进行简化基因组重测序,结合水牛产奶性状进行主成分分析和全基因组关联分析,基于筛选到的SNP位点查找候选基因并进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析。【结果】70头水牛均具有完整的表型值,且这些产奶性状间存在极显著相关性(P<0.01);70头水牛不存在明显的群体分层,基本上可视为1个群体。在与水牛产奶量关联的12个SNPs附近筛选到9个候选基因,其中CDH8、SLC30A7和FANCC等3个基因是与水牛产奶量相关的关键基因;在与水牛高峰产奶量关联的32个SNPs附近筛选到28个候选基因,Yeats4、SMC6、SUMO1、Grin2a、INO80、GEN1、Exd1、GDPD4、ABCG5、LRRK2、Arx和GRM5等12个基因是与水牛高峰产奶量相关的关键基因;在与水牛乳蛋白率关联的3个SNPs附近筛选到1个候选基因(MID1),显著富集于GO功能条目和KEGG信号通路上(P<0.05,下同);在与水牛乳脂率关联的3个SNPs附近筛选到1个候选基因(CNTN5),显著富集于GO功能条目上;在与水牛乳蛋白含量关联的4个SNPs附近筛选到1个候选基因(FAM160A1),但该基因并未富集到GO功能条目或KEGG信号通路上;在与水牛乳脂含量关联的7个SNPs附近筛选到6个候选基因,其中CTNNA2、SSBP2和IPOll基因是与水牛乳脂含量相关的关键基因。【结论】基于全基因组关联分析从70头水牛中挖掘出46个产奶性状候选基因,其中20个是水牛产奶性状的关键基因,因此,生产中可选用这些基因作为新的分子标记资源,加速水牛良种选育。此外,基于全基因组关联分析能高效挖掘出水牛产奶相关基因,为数量性状研究开辟了新方向。 展开更多
关键词 水牛 产奶性状 表型值 候选基因 全基因组关联分析
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水牛BTG2基因序列分析、过表达载体构建及组织表达研究
7
作者 徐媛媛 谢莹雪 +2 位作者 陆杏蓉 冯超 尚江华 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第9期4009-4020,共12页
【目的】克隆水牛B细胞易位基因2(B-cell translocation gene 2,BTG2)基因编码区,分析其编码蛋白的生物学特性,构建过表达载体并转染水牛卵巢颗粒细胞,探究该基因在水牛不同组织中的表达模式,为后续深入研究水牛BTG2基因的生物学功能奠... 【目的】克隆水牛B细胞易位基因2(B-cell translocation gene 2,BTG2)基因编码区,分析其编码蛋白的生物学特性,构建过表达载体并转染水牛卵巢颗粒细胞,探究该基因在水牛不同组织中的表达模式,为后续深入研究水牛BTG2基因的生物学功能奠定基础。【方法】采集水牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、瘤胃、子宫角、乳腺和卵巢组织,提取总RNA后反转录获得cDNA。以水牛卵巢cDNA为模板克隆水牛BTG2基因编码区并测序,对水牛及不同物种的BTG2基因进行序列比对和系统进化树构建,利用在线软件预测水牛BTG2蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构等。构建OE-BTG2过表达载体并转染水牛颗粒细胞,检测转染后BTG2基因的表达情况。通过实时荧光定量PCR检测BTG2基因在水牛不同组织中的表达情况。【结果】水牛BTG2基因CDS区序列全长453 bp,共编码150个氨基酸。相似性比对结果显示,水牛与牦牛、普通牛、山羊和绵羊的核苷酸序列相似性均>98%,其中与牦牛和普通牛的相似性最高,达99.8%。系统进化树显示,水牛与牦牛和普通牛的遗传距离最近,与家鼠的遗传距离最远。水牛BTG2蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构和信号肽,氨基酸序列的第1―108位有1个btg1结构域,共有15个磷酸化位点和1个O-糖基化位点,主要定位于细胞核中。BTG2蛋白主要与CNOT7、CNOT8、CNOT11、CNOT9、CNOT1、CNOT10、ATF3、ANKRD49、HES6和PRMT1等蛋白互作。水牛BTG2蛋白二级结构以α-螺旋、延伸链和无规则卷曲为主,三级结构预测结果与其一致。成功构建OE-BTG2过表达载体并转染至水牛颗粒细胞,与对照组(pcDNA3.1(+))相比,过表达组(OE-BTG2)细胞中BTG2基因表达量极显著升高(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果显示,BTG2基因在水牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、瘤胃、子宫角、乳腺和卵巢组织中均有表达,其中在肝脏中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。【结论】BTG2基因在不同物种中具有较高的保守性,且在水牛不同组织中广泛表达,其中在肝脏中表达量最高。试验结果为深入研究水牛BTG2基因的功能提供了参考依据。 展开更多
关键词 水牛 BTG2基因 生物信息学 过表达载体 组织表达
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运动对绵羊腹腔镜活体采卵-体外胚胎生产效率的影响
8
作者 李蓉 李明扬 +9 位作者 曹苗 郭倚天 范利宏 包梅荣 仇春娟 龚璐 乌日嘎 陈大勇 程磊 席广银 《中国畜禽种业》 2025年第10期27-31,共5页
该试验选择55只体况良好的黑头萨福克成年母羊,随机分为强制运动组和对照组,其中运动组29只,不运动组26只。强制运动组每天运动1 h,距离3.5 km,每月运动21 d,连续运动3个月;对照组羊只每天仅在圈舍内自由活动。腹腔镜活体采卵后进行体... 该试验选择55只体况良好的黑头萨福克成年母羊,随机分为强制运动组和对照组,其中运动组29只,不运动组26只。强制运动组每天运动1 h,距离3.5 km,每月运动21 d,连续运动3个月;对照组羊只每天仅在圈舍内自由活动。腹腔镜活体采卵后进行体外成熟、体外受精和胚胎培养,分析卵母细胞的平均总回收卵数、平均可用卵数、平均可用卵率、 24 h卵裂率、总卵裂率、 D6囊胚率以及卵母细胞受精后的胚胎发育率(D6囊胚数/受精卵数)。结果显示:运动不影响平均总回收卵数、平均可用卵数和可用卵率(P>0.05);运动组胚胎卵裂率高于不运动组,但差异不显著(P>0.05);运动组卵母细胞受精后的胚胎发育率极显著高于对照组(P<0.01)。可见,运动可以提高卵母细胞发育能力,提高体外胚胎生产效率。 展开更多
关键词 运动 绵羊 卵母细胞 体外成熟 体外胚胎生产
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富钟水牛养殖管理常见问题与解决策略探究
9
作者 刘振强 莫昌环 +1 位作者 刘彦麟 蓝小梅 《智慧农业导刊》 2025年第17期79-83,共5页
该文旨在深入探讨富钟水牛养殖管理过程中常见的问题,并提出相应的解决策略。通过对富钟水牛的养殖环境、饲料管理、疾病防控和繁殖技术等方面进行详细分析,揭示当前养殖实践中存在的不足,如养殖环境不佳、饲料搭配不合理、疾病防控意... 该文旨在深入探讨富钟水牛养殖管理过程中常见的问题,并提出相应的解决策略。通过对富钟水牛的养殖环境、饲料管理、疾病防控和繁殖技术等方面进行详细分析,揭示当前养殖实践中存在的不足,如养殖环境不佳、饲料搭配不合理、疾病防控意识淡薄、繁殖效率低下等问题,并针对性地给出优化养殖环境、科学调配饲料、加强疾病防控体系建设和提高繁殖技术水平等解决措施,以期为富钟水牛养殖业的可持续发展提供理论支持和实践指导,提升养殖效益和水牛品质。 展开更多
关键词 富钟水牛 养殖 管理 常见问题 解决策略
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不同海拔区域舍饲养殖对牦牛生长发育及肉品质的影响
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作者 官久强 柏琴 +5 位作者 尚恺圆 张翔飞 周建旭 晁永亮 赵元杰 罗晓林 《草学》 2024年第6期73-76,共4页
牦牛依然是青藏高原主要的放牧遗传资源,在农牧民脱贫增收中扮演重要角色。近年,在川西北乃至整个青藏高原都在开展以牦牛舍饲养殖加快牦牛出栏的试验研究。本团队针对不同海拔高度舍饲养殖进行了系统研究,与放牧牦牛对比,以期揭示牦牛... 牦牛依然是青藏高原主要的放牧遗传资源,在农牧民脱贫增收中扮演重要角色。近年,在川西北乃至整个青藏高原都在开展以牦牛舍饲养殖加快牦牛出栏的试验研究。本团队针对不同海拔高度舍饲养殖进行了系统研究,与放牧牦牛对比,以期揭示牦牛不同海拔舍饲养殖的效果。试验结果显示:选择18月龄左右牦牛在不同海拔育肥,在3500m的红原县放牧,其日增重达145.21±28.82g;在2200m的西宁市舍饲,日增重达512.24±178.29g;在2500m的小金县舍饲,日增重达459.09±98.43g;在500m的成都平原舍饲,日增重达268.24±42.86g。研究表明,牦牛在不同海拔冬季育肥下差异显著,温度对牦牛舍饲养殖下的日增重影响较大。 展开更多
关键词 牦牛 不同海拔 舍饲 生长发育 肉品质
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基于非靶向代谢组学探究水牛唾液和血清中的发情标志物 被引量：2
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作者 余洲 杨柏高 +8 位作者 李崇阳 曹建华 牛一凡 覃广胜 王旭光 万鹏程 梁淦 赵学明 阿布力孜·吾斯曼 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第5期11-23,共13页
在现代化规模养殖中,水牛发情不明显的问题日益突出。研究旨在利用高通量非靶向代谢组学分析不同发情阶段水牛唾液和血清中代谢物的差异。在相同的饲养管理条件下,选择15头尼里-拉菲水牛,每头注射氯前列醇4 mL,注射当天计为第0天。分别... 在现代化规模养殖中,水牛发情不明显的问题日益突出。研究旨在利用高通量非靶向代谢组学分析不同发情阶段水牛唾液和血清中代谢物的差异。在相同的饲养管理条件下,选择15头尼里-拉菲水牛,每头注射氯前列醇4 mL,注射当天计为第0天。分别在水牛发情前期(第1天)、发情期(第3天)、发情后期(第6天)早上饲喂之前(08:00-11:00)采集唾液和血清,样品处理后采用非靶向代谢组学检测。结果显示,不同发情阶段水牛的唾液和血清中均存在差异代谢物,发情期/发情前期水牛唾液中共鉴定出30种显著差异代谢物,血清中共鉴定出85种显著差异代谢物;发情期/发情后期水牛唾液中共鉴定出8种显著差异代谢物,血清中共鉴定出66种显著差异代谢物。这些差异代谢物主要富集在胰高血糖素信号通路、磷酸戊糖途径、甘油酯代谢等通路上。唾液代谢物与血清代谢物之间存在相关性。唾液中的差异代谢物D-2-磷酸甘油酸、L-丙酰肉碱、白三烯d4和8-异前列腺素a1可能作为水牛发情生物标志物的关键代谢物。 展开更多
关键词 水牛 发情鉴定 血清 唾液 代谢组学
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水牛泌乳期与干乳期差异血清生化指标及代谢物研究 被引量：1
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作者 丁子旭 徐祎雪 +5 位作者 冯彤 王艳 崔奎青 李志鹏 杨春艳 刘庆友 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1054-1065,共12页
本研究旨在比较泌乳期与干乳期水牛(Bubalus bubalis)差异血清生化指标及差异血清代谢物的组成,探讨血清生化指标与代谢物的相互关联,进一步了解水牛营养代谢过程的调控机制。选取泌乳期(泌乳第100~200天)健康水牛9头和干乳期(停乳后第3... 本研究旨在比较泌乳期与干乳期水牛(Bubalus bubalis)差异血清生化指标及差异血清代谢物的组成,探讨血清生化指标与代谢物的相互关联,进一步了解水牛营养代谢过程的调控机制。选取泌乳期(泌乳第100~200天)健康水牛9头和干乳期(停乳后第30~60天)健康水牛9头,每头牛采血清样本两份,一份用生化分析仪进行20项指标检测;另一份用超高效液相色谱-串联质谱法(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)检测分析水牛血清中内源性代谢物。在生化指标检测结果中,泌乳期的谷草转氨酶/谷丙转氨酶(P<0.05)、甘油三酯(P<0.01)显著低于干乳期的,说明水牛在泌乳期时对酯类物质的利用效率更高;而泌乳期的胆固醇(P<0.01)、低密度脂蛋白(P<0.01)、高密度脂蛋白(P<0.001)、尿素氮(P<0.01)、葡萄糖(P<0.01)和免疫球蛋白A(P<0.0001)等指标显著高于干乳期的,说明泌乳期时水牛的物质代谢更高。对于血清代谢物进行分析得出共有183种代谢产物在2个时期中存在显著差异(P<0.05,VIP>1),这些代谢产物共富集到8条显著不同的代谢途径,分别是D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢,色氨酸代谢,卟啉和叶绿素代谢,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,组氨酸代谢,不饱和脂肪酸的生物合成,以及氮代谢(P<0.05)。这些结果说明在泌乳期时,水牛吸收的营养物质主要用于参与多种氨基酸的合成及脂肪酸的合成与利用。 展开更多
关键词 水牛(Bubalus bubalis) 血清生化指标 代谢组学 泌乳期 干乳期
原文传递
不同发情阶段水牛唾液的DIA定量蛋白组学分析 被引量：1
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作者 余洲 杨柏高 +5 位作者 李崇阳 张培培 曹建华 牛一凡 覃广胜 赵学明 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期5072-5084,共13页
旨在利用高通量DIA定量蛋白组学分析不同发情阶段水牛唾液中蛋白的差异。本研究将15头体况相近(平均体重为650~750 kg),发情正常,健康状态良好的2~5胎次的尼里-拉菲母水牛作为研究对象,在相同的管理条件下,对其注射氯前列醇并计为第0天... 旨在利用高通量DIA定量蛋白组学分析不同发情阶段水牛唾液中蛋白的差异。本研究将15头体况相近(平均体重为650~750 kg),发情正常,健康状态良好的2~5胎次的尼里-拉菲母水牛作为研究对象,在相同的管理条件下,对其注射氯前列醇并计为第0天,分别在发情前期(第1天)、发情期(第3天)、发情后期(第6天)早上饲喂之前(08:00-11:00)进行唾液的采集,唾液样本每个发情时期分组相同,每3头牛分为一组,共分为5组,样品处理后进行DIA定量蛋白组学检测。结果显示,不同发情阶段水牛的唾液中共定量到1982个蛋白质,分别在发情期/发情前期和发情期/发情后期比较组中鉴定到59和38个差异丰度蛋白。功能分析发现,CBL、SOD1、SPP1和ARPC1B等蛋白质可能在细胞调控和抗氧化、维持细胞间相互作用等方面发挥作用。KEGG通路分析显示,发情前期、发情期和发情后期水牛唾液差异丰度蛋白被富集到mTOR信号通路、孕酮介导的卵母细胞成熟等通路上。综上,通过不同发情阶段的对比,获得与繁殖相关的差异蛋白4个,CBL、ARPC1B、SOD1和SPP1。这些唾液中的差异丰度蛋白可能作为水牛发情生物标志物的关键蛋白,进而为开发水牛发情检测诊断试剂盒提供数据支撑。 展开更多
关键词 水牛 发情鉴定 唾液 蛋白组学
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饲粮粗蛋白质水平对5~9月龄生长水牛生长性能、养分表观消化率和瘤胃发酵参数的影响及其可消化粗蛋白质需要量的预测 被引量：1
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作者 阮莉珺 邓颖朝 +4 位作者 姚毅沛 魏才翔 覃广胜 王蕊张卉 邹彩霞 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期3713-3724,共12页
本试验旨在研究饲粮粗蛋白质(CP)水平对5~9月龄生长水牛生长性能、养分表观消化率和瘤胃发酵参数的影响,并对其可消化粗蛋白质(DCP)需要量进行预测。选取24头平均体重为(210.61±6.43)kg、体况相近的健康5~9月龄生长水牛,随机分为3... 本试验旨在研究饲粮粗蛋白质(CP)水平对5~9月龄生长水牛生长性能、养分表观消化率和瘤胃发酵参数的影响,并对其可消化粗蛋白质(DCP)需要量进行预测。选取24头平均体重为(210.61±6.43)kg、体况相近的健康5~9月龄生长水牛,随机分为3组,即低CP水平(12.49%)饲粮组(LP组)、中CP水平(15.64%)饲粮组(MP组)、高CP水平(18.79%)饲粮组(HP组),每组8个重复,每个重复1头牛。预试期15 d,正试期50 d。饲养试验结束后,每组随机选5头牛进行为期5 d的消化试验,采集粪样和饲粮样,根据粪样和饲粮样中CP含量计算DCP采食量(DCPI),通过析因式原理,建立DCP需要量的回归方程。结果显示:1)MP组和HP组生长水牛的平均日增重(ADG)显著高于LP组(P<0.05);MP组和HP组的干物质采食量(DMI)显著高于LP组(P<0.05)。2)MP组的CP和干物质(DM)表观消化率显著高于LP组(P<0.05);MP组和HP组的粗脂肪(EE)表观消化率显著高于LP组(P<0.05);MP组的中性洗涤纤维(NDF)表观消化率显著高于LP组和HP组(P<0.05)。3)HP组的瘤胃液氨态氮(NH3-N)浓度显著高于LH组和MP组(P<0.05);LP组的瘤胃液乙酸浓度显著高于HP组(P<0.05);LP组的瘤胃液异丁酸、异戊酸和戊酸浓度显著高于MP组和HP组(P<0.05),同时MP组的瘤胃液异丁酸、异戊酸和戊酸浓度显著高于HP组(P<0.05);MP组和HP组的瘤胃液丁酸/总挥发性脂肪酸比值显著高于LP组(P<0.05)。4)按照析因法计算得出生长水牛(体重256 kg左右)维持DCP需要量为3.51 g/(kg W^(0.75)·d),每千克增重所需的DCP为266.87 g。综上所述,饲喂CP水平为15.87%的饲粮可以提高5~9月龄生长水牛的DM、CP、EE和NDF表观消化率以及瘤胃液中乙酸、异丁酸、异戊酸和戊酸的浓度,有利于提高瘤胃中微生物的活性,进而提高饲料转化效率,促进生长水牛对饲粮中养分的消化吸收。5~9月龄生长水牛的DCP需要量模型为:DCP=3.51W^(0.75)+266.87ΔW(式中:DCP为DCP需要量,g/d;W^(0.75)为代谢体重,kg;ΔW为日增重,kg/d)。 展开更多
关键词 生长水牛 粗蛋白质水平 生长性能 养分表观消化率 可消化粗蛋白质需要量
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保种场涪陵水牛及西南地区水牛品种间遗传结构与ROH分析 被引量：2
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作者 屠芸 曾雅楠 +8 位作者 张蒸豪 洪瑞 王震 吴平 周泽洋 叶艺茹 杜亚楠 左福元 张龚炜 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1989-1998,共10页
旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地... 旨在对保种场涪陵水牛及西南地区其他沼泽型水牛品种进行群体遗传结构和连续纯合片段(ROH)分析,为涪陵水牛保种与遗传改良提供理论依据。本研究对保种场26头涪陵水牛以及1头杂交水牛(FM_HY)进行全基因组重测序,从NCBI下载了68头西南地区沼泽型水牛和7头河流型水牛的基因组重测序数据,基于所有的基因组数据获得的高质量单核苷酸多态性(SNPs)位点进行遗传结构、ROH以及近交系数的分析。全基因组重测序结果显示,涪陵水牛平均测序深度为10×,质量控制后共鉴定出14 326 437个SNPs。群体遗传结构分析显示,保种场内涪陵水牛与毗邻区域的宜宾水牛、贵州水牛、贵州白水牛、盐津水牛间具有明显的遗传结构差异,德宏水牛和滇东南水牛与上述5个品种区别均明显;当分群数量为K=6时,涪陵水牛可划分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构。涪陵水牛、宜宾水牛、贵州水牛这3个品种间共检测到2 722个ROHs,其中涪陵水牛检测到1 593个ROHs,且1~2 Mb的短ROH片段占比达78.15%;仅在涪陵水牛群体中检测到8个大于16 Mb的长ROH片段,最长为24.56 Mb。基于ROH计算的保种场涪陵水牛平均近交系数为0.056 8,其中7头个体近交系数较高(0.062 5~0.125 0);贵州水牛和宜宾水牛的平均近交系数分别为0.034 6和0.041 0。综上,涪陵水牛保种群可分为2个类群,与毗邻区域水牛品种相比具有一类独特的群体结构;保种场内7头涪陵水牛个体存在近交风险,迫切需要加强涪陵水牛的资源保护与利用工作。 展开更多
关键词 涪陵水牛 群体遗传结构 SNP ROH 近交系数
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活体采卵-体外胚胎生产体系在上海水牛保种中的应用 被引量：1
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作者 徐皆欢 何孟纤 +7 位作者 章伟建 李赫强 刘炜 宋雪潇 张文刚 张德福 胡杰 戴建军 《上海畜牧兽医通讯》 2024年第6期1-6,共6页
旨在建立上海水牛活体采卵(ovum pick-up,OPU)-体外胚胎生产(in vitro embryo production,IVP)体系,探究年龄对上海水牛超数排卵的影响,评价冷冻精液在该体系中的应用效果。假阴道法采集5头上海水牛新鲜精液10头次,精液经程序冷冻仪冷冻... 旨在建立上海水牛活体采卵(ovum pick-up,OPU)-体外胚胎生产(in vitro embryo production,IVP)体系,探究年龄对上海水牛超数排卵的影响,评价冷冻精液在该体系中的应用效果。假阴道法采集5头上海水牛新鲜精液10头次,精液经程序冷冻仪冷冻后,转移至液氮中保存1~2年;筛选卵巢和子宫发育良好的11头青年母牛和5头经产母牛为供体,进行超数排卵、OPU、体外成熟、体外受精、体外胚胎培养。结果表明,经冷冻保存1~2年的上海水牛冻精的活率为75.43%±15.24%,活力为0.61±0.16;经产供体在发育卵泡总数、两侧卵巢发育卵泡比例、卵泡大小、OPU回收量等指标上均优于青年供体;利用冻精体外受精,胚胎卵裂率59.29%,桑葚胚率26.54%;胚胎玻璃化冷冻保存,实现IVP。上海水牛OPU-IVP体系为提升上海珍稀濒危种质资源保护效率与良种开发利用提供重要技术保障。 展开更多
关键词 上海水牛 超数排卵 活体采卵 体外胚胎生产 冷冻精液
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上海水牛的生长性能、屠宰性能及肉品质分析
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作者 齐丽娜 陆雪林 +5 位作者 吴昊旻 张文刚 李先玉 薛云 周瑾 章伟建 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第6期91-94,共4页
试验旨在测定上海水牛的生长性能、屠宰性能和肉品质,系统评价其肉用潜力。首先选取6、12、30和60月龄的上海水牛测定其体重体尺,然后选取5头(30月龄)阉牛进行屠宰,测定其屠宰性能及肉品质。结果表明,30月龄试验牛的平均胴体重为271.80 ... 试验旨在测定上海水牛的生长性能、屠宰性能和肉品质,系统评价其肉用潜力。首先选取6、12、30和60月龄的上海水牛测定其体重体尺,然后选取5头(30月龄)阉牛进行屠宰,测定其屠宰性能及肉品质。结果表明,30月龄试验牛的平均胴体重为271.80 kg±11.69 kg,净肉重193.80 kg±7.90 kg,骨重76.00 kg±4.50 kg,屠宰率(50.40±1.54)%,净肉率(35.94±0.95)%,胴体肉骨比2.57±0.12,眼肌面积81.79 cm^(2)±7.31 cm^(2),嫩度10.05 kg/cm^(2)±1.16 kg/cm^(2),p H_(0h)值6.03±0.15,p H_(24 h)值5.51±0.01;上海水牛每100克肉中的平均含水量为72.330 g±1.217 g,脂肪4.223 g±1.719 g,蛋白质21.460 g±0.578 g,总灰分1.388 g±0.220 g,总氨基酸17.210 g±0.431 g,总核苷酸241.800 mg±15.320 mg,总脂肪酸2.831 g±1.060 g。综上所述,上海水牛的屠宰率和净肉率较高、肉质良好,具有较好的肉用潜力。今后在加强上海水牛地方品种保护的同时,应重视开发利用,继续加强对其肉质风味特色的遗传改良,进一步提高产肉量。 展开更多
关键词 上海水牛 生长性能 屠宰性能 肉品质
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水牛卵泡不同发育阶段差异表达基因分析
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作者 徐晓晛 蒋晗偲 +4 位作者 李志鹏 崔奎青 罗西尔 杨春艳 刘庆友 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期853-863,共11页
本研究旨在利用转录组测序技术探究摩拉水牛(Bubalus bubalis)发情期不同大小卵泡的基因表达谱,并进一步了解其对卵泡发育过程中相关激素的影响。通过对摩拉水牛进行Ovsynch法同期发情处理,B超检测卵泡大小并按照大、中、小3种类型(>... 本研究旨在利用转录组测序技术探究摩拉水牛(Bubalus bubalis)发情期不同大小卵泡的基因表达谱,并进一步了解其对卵泡发育过程中相关激素的影响。通过对摩拉水牛进行Ovsynch法同期发情处理,B超检测卵泡大小并按照大、中、小3种类型(>8 mm、4~7 mm、0~3 mm)区分,活体采集卵泡液后提取RNA送单细胞转录组测序。将获得的数据进行组间两两比较,以|log2fold change|≥1且P<0.05为标准筛选差异转录本,并取各组差异表达转录本并集共1473个转录本做表达趋势筛选,其中587个转录本符合牛卵泡发育过程中的转录调控规律,通过GO和KEGG富集分析并筛选得到了33条通路,各通路主要与细胞间相互作用、类固醇生成和激素产生、细胞分化和发育、细胞运动、代谢调节、生理适应性等过程相关。通过对通路上的基因进行蛋白质互作网络分析,进一步获得了可能影响水牛卵泡发育过程中激素调节的关键基因,如BAMBI、FST、INHA、INHBA、INHBB、GATA6和GFAP。综上,该研究结果为进一步探究水牛卵泡发育过程中的关键基因及可能的分子调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 水牛(Bubalus bubalis) 卵泡大小 卵母细胞 激素调节 转录组测序
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牦牛“海绵吸附”bta-miR-125b的lncRNA筛选验证及慢病毒载体构建
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作者 贺鸿世 姚一龙 +5 位作者 索朗斯珠 孟朝轶 孔庆辉 席广银 郭敏 徐业芬 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第9期1-8,共8页
旨在筛选在牦牛卵泡发育过程中可能吸附bta-miR-125b的长链非编码RNA(lncRNA),并构建双荧光素酶载体与慢病毒过表达载体,为研究调控牦牛生殖相关lncRNA的功能及机制提供基础。利用miRanda与RNAhybrid数据库预测可能靶向牦牛bta-miR-125b... 旨在筛选在牦牛卵泡发育过程中可能吸附bta-miR-125b的长链非编码RNA(lncRNA),并构建双荧光素酶载体与慢病毒过表达载体,为研究调控牦牛生殖相关lncRNA的功能及机制提供基础。利用miRanda与RNAhybrid数据库预测可能靶向牦牛bta-miR-125b的lncRNAs,筛选出bta-miR-125b具有“海绵吸附”作用的lncRNAs,由RNAhybrid进行结合位点预测,筛选出最优的lncRNA;采集牦牛卵巢分离卵泡并提取总RNA构建cDNA池,以RT-PCR技术扩增筛选所得lncRNA;在此基础上利用pmir-GLO载体构建技术构建该lncRNA野生型及突变型双荧光素酶报告载体,并将其与bta-miR-125b mimics共转染至293T细胞,检测双荧光素酶活性;最后利用慢病毒载体构建技术将测序正确的lncRNA与pHBLV-CMV-MCS-EF1-ZsGreen-T2A-puro载体同源区的片段同源重组,通过慢病毒包装系统(psPAX2:pMD2G)包装后感染293T细胞,计算感染效率及滴度。结果:两个数据库中的lncRNA-ARS-UCD1.2与bta-miR-125b存在紧密结合位点,扩增出lncRNA-ARS-UCD1.2的序列全长为1552 bp;双荧光素酶活性检测表明牦牛lncRNA-ARS-UCD1.2与bta-miR-125b mimic具有靶向关系(P<0.01);同源重组后经酶切鉴定及测序验证表明成功构建了重组质粒,感染效率达(61.520±0.875)%,感染滴度为4×10^(8)TU/mL,表明lncRNA-ARS-UCD1.2过表达慢病毒载体成功构建。综上,本试验筛选出牦牛“海绵吸附”bta-miR-125b的lncRNA,并验证了两者的靶向结合关系,同时成功构建了该lncRNA的过表达慢病毒载体,为下一步深入研究lncRNA在细胞中的功能机制奠定了基础。 展开更多
关键词 牦牛 长链非编码RNA bta-miR-125b 海绵吸附 慢病毒载体
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不同生长阶段水牛血清代谢物差异比较研究 被引量：2
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作者 刘淼儿 丁子旭 +6 位作者 徐祎雪 冯彤 王艳 崔奎青 罗西尔 李志鹏 刘庆友 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1565-1574,共10页
本研究旨在比较不同生长阶段的水牛(Bubalus bubalis)血清生化指标以及血清代谢物,以期发掘差异血清生化成分和差异代谢标志物。随机采集30头不同生长阶段(10头犊牛哺乳期、10头断奶期、10头成年期)的水牛血清样本,分别用于测定血清生... 本研究旨在比较不同生长阶段的水牛(Bubalus bubalis)血清生化指标以及血清代谢物,以期发掘差异血清生化成分和差异代谢标志物。随机采集30头不同生长阶段(10头犊牛哺乳期、10头断奶期、10头成年期)的水牛血清样本,分别用于测定血清生化指标和血清内源代谢物。研究结果表明,3个生长阶段之间均有显著差异(两两对比P<0.05)的指标分别是尿素氮、甘油三酯、免疫球蛋白A、总胆固醇和间接胆红素。与成年期水牛相比,犊牛哺乳期水牛总胆固醇水平较低,因为瘤胃吸收的醋酸盐丰度较低和对糖异生的依赖程度较低。血清代谢组比较分析发现,在正负离子模式下分别鉴定出4824种和11522种代谢物,从3个生长阶段两两比较后的差异代谢物中筛选到12种血清差异代谢物,包括1,3,7-三甲基尿酸、可可碱、甲基黄嘌呤、尿囊酸、胞苷、3-尿苷丙酸和花生四烯酸等。在不同生长阶段的水牛之间主要在氨基酸和脂肪酸合成代谢通路存在显著差异,说明在水牛犊牛哺乳期向断奶期过渡时,蛋白质代谢途径显著提高,因此建议在基础日粮里适量添加蛋白质,旨在保障水牛健康生长,提高水牛对饲料的利用效率。成年水牛血清中的甲基黄嘌呤和色氨酸含量高,说明成年水牛相较幼年水牛抗氧化能力和免疫能力显著提高。 展开更多
关键词 水牛 生长阶段 血清生化指标 代谢组学
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