钙调蛋白依赖性蛋白激酶Ⅰ(Calmodulin Dependent Protein Kinase Ⅰ,CAMK1)基因是一种蛋白质编码基因,参与细胞分化,可能会与繁殖相关。本研究在课题组前期关于阳原驴产仔数血液转录组分析的基础上,探索候选基因CAMK1在阳原驴群体中的...钙调蛋白依赖性蛋白激酶Ⅰ(Calmodulin Dependent Protein Kinase Ⅰ,CAMK1)基因是一种蛋白质编码基因,参与细胞分化,可能会与繁殖相关。本研究在课题组前期关于阳原驴产仔数血液转录组分析的基础上,探索候选基因CAMK1在阳原驴群体中的遗传多态性,并与产仔数进行关联分析,寻找与阳原驴产仔数显著相关的分子标记,为驴的专门化品种培育提供参考。试验以86头阳原驴母驴(其中10头为产双仔母驴)为研究对象,通过PCR-SSCP技术检测CAMK1基因SNP位点并将SNP位点与阳原驴产仔数进行关联分析。结果表明,在CAMK1基因中发现3个单碱基突变,分别为g.5309T>C、g.8164T>C、g.9059C>T,且3个突变位点均检测出CC、CT、TT 3种基因型。结果显示,g.5309T>C位点CT基因型个体的平均产仔数显著高于TT基因型;g.8164T>C位点CC和CT基因型个体的平均产仔数显著高于TT基因型;g.9059C>T位点CC基因型个体的平均产仔数显著高于TT基因型。综上表明,CAMK1基因3个位点与产仔数性状显著相关,推测CAMK1基因可作为阳原驴产仔数性状研究的候选基因和分子标记。展开更多
旨在探究德州驴体尺性状的遗传基础,本研究采集2~3周岁的健康德州驴母驴血液作为试验材料,共139头。测定试验群体的体尺性状,并进行描述性统计分析。利用“家驴一号”40K液相芯片对全部个体进行基因分型。使用混合线性模型对11个体尺性...旨在探究德州驴体尺性状的遗传基础,本研究采集2~3周岁的健康德州驴母驴血液作为试验材料,共139头。测定试验群体的体尺性状,并进行描述性统计分析。利用“家驴一号”40K液相芯片对全部个体进行基因分型。使用混合线性模型对11个体尺性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),并对候选基因进行功能注释和通路富集分析。结合精细映射和连锁不平衡分析,识别体尺性状的潜在因果SNPs位点。通过GWAS鉴定到3个全基因组显著和20个潜在显著的SNPs位点以及41个候选基因与体尺性状显著关联。GO和KEGG富集分析结果表明,候选基因显著富集在与成骨分化、骨骼肌发育和脂质代谢相关的生物学过程。综合精细映射和连锁不平衡分析,在16号染色体候选区域内检测到4个显著SNPs位点存在强连锁不平衡。本研究结果为德州驴体尺性状遗传机制的解析奠定了基础,为分子标记辅助选择在驴育种工作中的应用提供了参考依据。展开更多
文摘旨在探究德州驴体尺性状的遗传基础,本研究采集2~3周岁的健康德州驴母驴血液作为试验材料,共139头。测定试验群体的体尺性状,并进行描述性统计分析。利用“家驴一号”40K液相芯片对全部个体进行基因分型。使用混合线性模型对11个体尺性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),并对候选基因进行功能注释和通路富集分析。结合精细映射和连锁不平衡分析,识别体尺性状的潜在因果SNPs位点。通过GWAS鉴定到3个全基因组显著和20个潜在显著的SNPs位点以及41个候选基因与体尺性状显著关联。GO和KEGG富集分析结果表明,候选基因显著富集在与成骨分化、骨骼肌发育和脂质代谢相关的生物学过程。综合精细映射和连锁不平衡分析,在16号染色体候选区域内检测到4个显著SNPs位点存在强连锁不平衡。本研究结果为德州驴体尺性状遗传机制的解析奠定了基础,为分子标记辅助选择在驴育种工作中的应用提供了参考依据。
