芦竹(Arundo donax)是一种生长迅速、具有营养繁殖能力、耐逆性强且高产的多年生草本植物,被认为是边际退化土地生物质生产的理想候选作物。前期研究发现‘宁芦1号’幼苗的株高和分蘖显著高于‘绿洲1号’(P<0.01),为探究两种芦竹苗...芦竹(Arundo donax)是一种生长迅速、具有营养繁殖能力、耐逆性强且高产的多年生草本植物,被认为是边际退化土地生物质生产的理想候选作物。前期研究发现‘宁芦1号’幼苗的株高和分蘖显著高于‘绿洲1号’(P<0.01),为探究两种芦竹苗期表型差异的原因,本研究对其转录组进行了高通量测序,并对苗期生长相关基因进行注释、GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析,从转录组层面解析了芦竹苗期生长发育的分子机理。研究共鉴定到26 145个差异表达的基因,GO分析显示,这些基因主要富集于细胞、结合和细胞过程。KEGG分析表明,上述差异表达基因主要在核糖体通路、苯丙素合成通路、植物激素信号转导通路和其他代谢过程中显著富集。AP2/ERF、B3、bHLH、bZIP等转录因子与芦竹苗期生长优势密切相关,在调控生长发育中发挥重要作用。本研究通过转录组学与表型分析揭示了两种芦竹苗期生长发育的差异基因表达特征及相关调控通路,深化了对芦竹生长调控网络的理解,并为芦竹的遗传改良和新品种选育提供了科学依据。展开更多
文摘芦竹(Arundo donax)是一种生长迅速、具有营养繁殖能力、耐逆性强且高产的多年生草本植物,被认为是边际退化土地生物质生产的理想候选作物。前期研究发现‘宁芦1号’幼苗的株高和分蘖显著高于‘绿洲1号’(P<0.01),为探究两种芦竹苗期表型差异的原因,本研究对其转录组进行了高通量测序,并对苗期生长相关基因进行注释、GO(gene ontology)和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析,从转录组层面解析了芦竹苗期生长发育的分子机理。研究共鉴定到26 145个差异表达的基因,GO分析显示,这些基因主要富集于细胞、结合和细胞过程。KEGG分析表明,上述差异表达基因主要在核糖体通路、苯丙素合成通路、植物激素信号转导通路和其他代谢过程中显著富集。AP2/ERF、B3、bHLH、bZIP等转录因子与芦竹苗期生长优势密切相关,在调控生长发育中发挥重要作用。本研究通过转录组学与表型分析揭示了两种芦竹苗期生长发育的差异基因表达特征及相关调控通路,深化了对芦竹生长调控网络的理解,并为芦竹的遗传改良和新品种选育提供了科学依据。
