HMA(Heavy metal transporting ATPase)基因家族属于P-ATPase家族中一个亚类,在植物吸收、转运金属元素的过程中起重要调控作用。为了解HMA在沙棘吸收、转运和应对重金属胁迫过程中的作用,本研究利用生物信息学手段,在沙棘中共鉴定出68...HMA(Heavy metal transporting ATPase)基因家族属于P-ATPase家族中一个亚类,在植物吸收、转运金属元素的过程中起重要调控作用。为了解HMA在沙棘吸收、转运和应对重金属胁迫过程中的作用,本研究利用生物信息学手段,在沙棘中共鉴定出68个HMA基因。结果表明,68个HMA基因不均匀分布于12条染色体上。系统发育分析显示,沙棘HMA基因家族主要划分为P1B-1、P1B-2、P1B-3和P1B-4这4个亚家族。综合HMA的基因结构、基因染色体位置和同线性分析发现,串联重复与基因进化有关。此外,启动子上游区域的顺式作用元件分析发现,大多数HMA基因含有非生物胁迫相关的顺式作用元件。综上所述,本研究将为P1B型ATP酶家族的进一步研究奠定基础,并为ATPase(HMA)基因家族在沙棘抗重金属胁迫中的功能验证提供有价值的线索。展开更多
文摘HMA(Heavy metal transporting ATPase)基因家族属于P-ATPase家族中一个亚类,在植物吸收、转运金属元素的过程中起重要调控作用。为了解HMA在沙棘吸收、转运和应对重金属胁迫过程中的作用,本研究利用生物信息学手段,在沙棘中共鉴定出68个HMA基因。结果表明,68个HMA基因不均匀分布于12条染色体上。系统发育分析显示,沙棘HMA基因家族主要划分为P1B-1、P1B-2、P1B-3和P1B-4这4个亚家族。综合HMA的基因结构、基因染色体位置和同线性分析发现,串联重复与基因进化有关。此外,启动子上游区域的顺式作用元件分析发现,大多数HMA基因含有非生物胁迫相关的顺式作用元件。综上所述,本研究将为P1B型ATP酶家族的进一步研究奠定基础,并为ATPase(HMA)基因家族在沙棘抗重金属胁迫中的功能验证提供有价值的线索。
