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小叶杨NAC基因家族的鉴定及干旱胁迫下表达分析
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作者 李钦淼 马乐 +4 位作者 季喜梅 蔡柯伟 孟凡娟 赵曦阳 雷培 《江苏农业科学》 2025年第24期73-84,共12页
NAC基因属于最大的转录因子家族之一,NAC基因家族已在许多物种中被发现报道,但在小叶杨中尚未得到充分研究。本研究从小叶杨的基因组中共鉴定出127个PsNAC家族成员,分别位于19条不同的染色体上。采用生物信息学方法对小叶杨PsNAC基因家... NAC基因属于最大的转录因子家族之一,NAC基因家族已在许多物种中被发现报道,但在小叶杨中尚未得到充分研究。本研究从小叶杨的基因组中共鉴定出127个PsNAC家族成员,分别位于19条不同的染色体上。采用生物信息学方法对小叶杨PsNAC基因家族成员的理化性质、系统进化、基因结构、保守基序、启动子顺势元件、共线性和互作网络等进行分析,并对其基因功能进行预测。理化性质分析结果显示,PsNAC蛋白的长度为166~794 aa;平均分子量为41430.58 u;等电点范围在4.55~9.72之间;亚细胞定位预测PsNAC蛋白主要定位于细胞核。结构域分析结果表明,多数PsNAC成员均含有NAC结构域A~E,并在PsNAC成员中鉴定到10个保守基序,同时根据系统发育树分析可以将127个PsNAC成员共分为5个亚族。此外,启动子作用元件分析结果表明,PsNAC基因具有光、激素、胁迫及植物生长发育等相关元件。这些分析结果为后续小叶杨PsNAC基因家族的功能研究提供了重要参考,不仅有助于揭示小叶杨PsNAC基因家族在植物研究中的重要作用,为未来深入揭示小叶杨PsNAC转录因子在参与植物生长发育与抗逆等方面的分子调控机制研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 小叶杨 NAC转录因子 基因家族 生物信息学 干旱胁迫
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