以tuf基因为靶标的5种16SrⅠ组植原体环介导恒温扩增技术 被引量：7

1

作者 王圣洁 王胜坤 +5 位作者 林彩丽 于少帅 汪来发 朴春根 郭民伟 田国忠 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第8期54-63,共10页

【目的】建立一种能够特异性检测和鉴定16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,实现16SrⅠ组植原体的快速检测。【方法】以植原体tuf基因作为靶标,通过序列比对,设计多组具有特异性的LAMP引物组,筛选出一套适用于16SrⅠ组植原体的特异性... 【目的】建立一种能够特异性检测和鉴定16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,实现16SrⅠ组植原体的快速检测。【方法】以植原体tuf基因作为靶标,通过序列比对,设计多组具有特异性的LAMP引物组,筛选出一套适用于16SrⅠ组植原体的特异性检测体系。以16SrⅡ组、16SrⅤ组、16SrⅩⅨ组植原体样品按照此检测体系进行反应,来验证其特异性;同时将稀释后的感病组织样品同步进行PCR和LAMP检测,以确定其检测灵敏度。对来自不同省市的6份田间样品以及9份组培样品进行检测,以验证其检测的稳定性。【结果】16SrⅠ-LAMP在恒温63℃条件下40 min内完成扩增,能检测5种分别引起泡桐丛枝、苦楝丛枝、桑树萎缩、莴苣黄化和长春花绿变病的16SrⅠ组植原体,不能检测其他组植原体包括16SrⅡ组的花生丛枝、甘薯丛枝、臭矢菜丛枝、16SrⅤ组的枣疯病、红花槐丛枝、樱桃致死黄化和16SrⅩⅨ组的板栗黄化皱缩植原体。通过在反应液中加入钙黄绿素肉眼判断绿色为阳性结果,褐色为阴性结果,与用荧光定量设备进行判读扩增曲线的结果一致。相比于PCR检测,16SrⅠ-LAMP检测的灵敏度提高了8倍;16SrⅠ-LAMP能够快速检测出来自不同区域的田间泡桐发病样品、感病泡桐组培苗和嫁接传病脱毒苗。【结论】以tuf基因作为靶标,建立能同时检测5种16SrⅠ组植原体的环介导恒温扩增技术,具有高效、特异、操作简便、检测时间短及成本较低等优点,适合于基层和现场检测。 展开更多

关键词 植原体 环介导恒温扩增 tuf基因 快速检测

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我国热区疫霉种的分布、疫病及其防治研究进展 被引量：4

2

作者 唐庆华 宋薇薇 +5 位作者 朱辉 牛晓庆 余凤玉 韩超文 吴多扬 覃伟权 《江西农业学报》 CAS 2011年第8期100-103,共4页

综述了我国热带地区疫霉种类及其引起的植物病害,并总结了疫病的防治措施,最后对疫病防治的新策略进行了展望。

关键词 疫霉 热带地区 亚热带地区 分布 疫病 防治

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三种拮抗菌对苗木立枯病病原菌的影响 被引量：7

3

作者 周秀华 崔磊 +1 位作者 武术杰 刘菊秋 《北方园艺》 CAS 北大核心 2011年第24期167-169,共3页

采用PDA综合培养基对3种拮抗菌和2种苗木立枯病病原菌进行对峙培养,研究3种拮抗菌对苗木立枯病病原菌的抑制效果。结果表明:绿色木霉(Trichoderma viride)、桔绿木霉(Trichoderm citrinoviridevs)、球毛壳(Chaetomiumg lobosum)3种拮抗... 采用PDA综合培养基对3种拮抗菌和2种苗木立枯病病原菌进行对峙培养,研究3种拮抗菌对苗木立枯病病原菌的抑制效果。结果表明:绿色木霉(Trichoderma viride)、桔绿木霉(Trichoderm citrinoviridevs)、球毛壳(Chaetomiumg lobosum)3种拮抗菌对2种苗木立枯病病原菌尖镰孢菌(Fusarium oxysporum)、腐皮镰刀菌(Fusarium solani)均有抑制作用,对Fusarium oxysporum的抑制效果最好的为Trichoderma citrinoviridevs,对Fusariums olani抑制效果最好的为Trichoderma viride。 展开更多

关键词 木霉菌 球毛壳 尖镰孢菌 腐皮镰刀菌 拮抗作用

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苦楝丛枝病植原体海南株系SecY基因序列分析及亚组分类 被引量：3

4

作者 罗大全 车海彦 +2 位作者 刘先宝 符瑞益 叶莎冰 《热带作物学报》 CSCD 2008年第6期799-802,共4页

利用植原体16S rⅠ组通用引物对secYF1/secYR1,应用PCR技术从采自海南省儋州地区的表现典型丛枝症状的苦楝植株总DNA中扩增到约1.4 kb的特异片段,将此片段克隆后进行序列测定,序列分析及系统关系树构建的结果表明,该片段长1 358 bp,苦... 利用植原体16S rⅠ组通用引物对secYF1/secYR1,应用PCR技术从采自海南省儋州地区的表现典型丛枝症状的苦楝植株总DNA中扩增到约1.4 kb的特异片段,将此片段克隆后进行序列测定,序列分析及系统关系树构建的结果表明,该片段长1 358 bp,苦楝丛枝病海南株系(Chinaberry witches'-broom phytoplasma strain Hainan,CWB-Hn)与玉米丛矮(Maize bushy stunt,MBS)植原体聚类在同一条进化枝上;AluⅠ,MseⅠ和Tsp509Ⅰ这3种酶的电子酶切图谱表明,CWB-Hn与MBS的酶切图谱一致,故初步判定苦楝丛枝病植原体海南株系属于secY-L亚组,在亚组水平上进一步明确了苦楝丛枝病植原体海南株系的分类地位。 展开更多

关键词 苦楝丛枝病 植原体 海南株系 SECY 亚组分类

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海南苦楝丛枝病植原体的分子鉴定 被引量：2

5

作者 罗大全 车海彦 +2 位作者 刘先宝 符瑞益 叶莎冰 《热带作物学报》 CSCD 2008年第4期522-524,共3页

利用植原体16S rDNA通用引物对Rl6mF2/Rl6mR1,通过PCR技术从表现典型丛枝症状的苦楝植株总DNA扩增到约1.4 kb的特异片段,将此片段克隆后进行序列测定、分析及系统关系树构建。结果表明,该片段与16Sr I组中的各植原体同源率均达到99%以上... 利用植原体16S rDNA通用引物对Rl6mF2/Rl6mR1,通过PCR技术从表现典型丛枝症状的苦楝植株总DNA扩增到约1.4 kb的特异片段,将此片段克隆后进行序列测定、分析及系统关系树构建。结果表明,该片段与16Sr I组中的各植原体同源率均达到99%以上,其中与16Sr I中的白蜡树丛枝(Ash witches'-broom,AWB,AY566302),柳叶菜变叶(Epilobium phyllody,EP,AY101386)和苦楝丛枝江西株系(Chinaberry witches'-broom,CWB-JX,AY859543)的同源率最高,达到100%,而与其它组的植原体16S rDNA序列的同源率均低于97%。引起我国海南苦楝丛枝病的植原体应归属于16SrⅠ组,将其暂命名苦楝丛枝植原体海南株系。 展开更多

关键词 苦楝丛枝病 植原体 16S RDNA 序列分析

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海南长春花小叶病植原体16S rDNA基因片段的比较分析 被引量：2

6

作者 车海彦 刘先宝 +2 位作者 符瑞益 叶莎冰 罗大全 《热带作物学报》 CSCD 2008年第3期380-384,共5页

从海南儋州地区的长春花上采集了表现小叶症状,疑似植原体感染的病样,利用植原体16S rDNA通用引物对Rl6mF2/Rl6mR1,应用PCR技术从该样品的总DNA提取物中扩增到预期大小的特异片段(约1.4kb),该片段的序列分析及系统关系树构建的结果表明... 从海南儋州地区的长春花上采集了表现小叶症状,疑似植原体感染的病样,利用植原体16S rDNA通用引物对Rl6mF2/Rl6mR1,应用PCR技术从该样品的总DNA提取物中扩增到预期大小的特异片段(约1.4kb),该片段的序列分析及系统关系树构建的结果表明,该片段与16Sr I组中的植原体同源率均达到99%以上,而与其它组的植原体16S rDNA序列的同源率均低于96%,与16SrⅠ组植原体缬草黄化、翠菊黄化、桑萎缩和玉米丛矮等在同一条进化枝上。故初步认为引起海南长春花小叶病的植原体应归属于16Sr I组,将其暂命名为长春花小叶植原体海南株系(Periwinkle little leaf phytopla smastrain Hainan,PLL-Hn)。 展开更多

关键词 长春花小叶病 植原体 16S RDNA 序列分析

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海南苦楝丛枝病植原体核糖体蛋白基因片段序列分析 被引量：1

7

作者 车海彦 刘先宝 +2 位作者 符瑞益 叶莎冰 罗大全 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2008年第12期83-87,共5页

【目的】利用分子生物学方法分析采自海南儋州的苦楝丛枝病植原体核糖体蛋白(rp)基因,从亚组水平上确定苦楝丛枝病植原体的分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白基因通用引物对rpF1/rpR1,应用PCR技术对苦楝丛枝病植原体的核糖体蛋白... 【目的】利用分子生物学方法分析采自海南儋州的苦楝丛枝病植原体核糖体蛋白(rp)基因,从亚组水平上确定苦楝丛枝病植原体的分类地位。【方法】利用植原体核糖体蛋白基因通用引物对rpF1/rpR1,应用PCR技术对苦楝丛枝病植原体的核糖体蛋白基因进行扩增,对其核苷酸序列进行测定并分析。【结果】通过PCR扩增得到约1.2 kb的特异片段,测序结果表明该片段长1 240 bp,包括rps19基因的3′区域,rpl22和rps3基因的全部区域。进一步分析发现,该片段与苦楝丛枝病贵州株系(Chinaberry witches'-broom,CWB-GZh)的亲缘关系最近,核苷酸同源性达99.9%。基于核糖体蛋白基因核苷酸序列,构建了海南苦楝丛枝病植原体与其他18个已知分类地位植原体的系统分类树状图,结果表明,引起海南苦楝丛枝病的植原体与16SrⅠ-B亚组植原体越南苦楝黄化、苦楝丛枝贵州株系和苦楝丛枝云南株系在同一条进化枝上。【结论】报道了海南苦楝丛枝病植原体的核糖体蛋白基因序列,海南苦楝丛枝病植原体属于16SrⅠ-B。 展开更多

关键词 苦楝丛枝病 植原体 核糖体蛋白基因 序列分析

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黄单胞菌毒性因子调控的研究进展 被引量：1

8

作者 唐庆华 张世清 +3 位作者 牛晓庆 朱辉 余凤玉 覃伟权 《生物灾害科学》 2012年第2期134-141,共8页

黄单胞属植物病原细菌寄主非常广泛,能引起许多种重要经济作物发生病害。黄单胞菌在寄主组织内的侵染和繁殖取决于分泌的多糖、脂多糖、吸附素和III型分泌系统等毒性因子。细菌毒性因子的协调表达是通过群体感应途径、双组分系统和Clp、... 黄单胞属植物病原细菌寄主非常广泛,能引起许多种重要经济作物发生病害。黄单胞菌在寄主组织内的侵染和繁殖取决于分泌的多糖、脂多糖、吸附素和III型分泌系统等毒性因子。细菌毒性因子的协调表达是通过群体感应途径、双组分系统和Clp、Zur、FhrR、HrpX和HpaR等转录后调控因子精细调控的。此外,毒力基因表达还受RNA结合蛋白RsmA转录后控制。在本综述中,我们对黄单胞菌控制分泌毒性因子的调控网络的研究进展进行了概括。 展开更多

关键词 黄单胞菌 毒性因子 调控网络 群体效应 双组分系统 环鸟苷二磷酸信号 rna结合蛋白rsma

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苦楝丛枝植原体相关膜蛋白基因分析及结构预测

9

作者 吴德喜 袁恩平 +2 位作者 王连春 蔡红 陈海如 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期310-316,共7页

根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定。结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸... 根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定。结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸的SecY蛋白,序列同源性显示该片段与"Ca.Phytoplas-ma asteris"(16SrI组)中的株系最高,达94%～99%;构建16SrI组内基于secY序列的系统进化树,认为该株系为secY(I)-O亚组。扩增的免疫膜蛋白DNA片段长1 176 bp,编码1个包含233个氨基酸的免疫膜蛋白(Amp)。蛋白结构预测显示secY亚基蛋白是一个有9个跨膜区的整合跨膜蛋白,而Amp蛋白是一类两端具有明显跨膜区,且N-端有多肽切割位点的Ⅲ型膜蛋白。 展开更多

关键词 苦楝丛枝植原体 膜蛋白 SECY AMP 结构预测

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外生菌根合成的条件及形成机制 被引量：3

10

作者 卢丽君 白淑兰 +1 位作者 王静 王铁牛 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2005年第2期84-87,共4页

文章综述了生态、土壤生物等对外生菌根合成的影响,并且进一步论述了菌根合成的内在机制,提出菌根的形成是一个外部生态条件和内在机制的统一及各种因素综合作用的同步的动态过程。

关键词 外生菌根 合成条件 形成机制

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怎样鉴别有毒野生菇

11

作者 陈贵善 《农技服务》 2006年第3期75-75,共1页

关键词 有毒 野生菇 鉴别 表面光滑 棕褐色 异味 肉质 根部

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四孢麻孢壳研究初报

12

作者 刘国荣 何平勋 《吉林林业科技》 北大核心 1989年第4期26-27,共2页

笔者于1986年在吉林省延边黄泥河林业局采集的长白落叶松树干皮层上分离到该菌。四孢麻孢壳是一种类生菌,是真菌遗传的重要材料。该菌在国内首次报导。

关键词 四孢麻孢壳 类生菌

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怎样识别有毒野生菇

13

作者 王世东 《农业知识（瓜果菜）》 2005年第9期32-33,共2页

当前,正是山林地区野生菌大量发生的季节,每到这个时候,各种媒体都有因误食有毒野生菌导致中毒,甚至死亡的报道。如不久前,苍山县蘑山镇某村村民杨某一家三口就是因大意而食用了一锅蘑菇汤,导致了严重中毒事件。为普及对有毒野生菇的辨... 当前,正是山林地区野生菌大量发生的季节,每到这个时候,各种媒体都有因误食有毒野生菌导致中毒,甚至死亡的报道。如不久前,苍山县蘑山镇某村村民杨某一家三口就是因大意而食用了一锅蘑菇汤,导致了严重中毒事件。为普及对有毒野生菇的辨别常识,防止野生菇中毒事件的频繁发生,我们请有关专家对这方面的知识予以介绍。 展开更多

关键词 野生菇 有毒 识别 中毒事件 野生菌 山林地 蘑菇汤 苍山县 季节 误食

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6种野生菇菌出口前景乐观

14

作者 陈向全 《农家科技》 2010年第1期27-27,共1页

1．松茸。国际市场活跃，供不应求，每干克鲜品收购价60—160元不等。主要保鲜出口．成为国内外商贾主要竞购的奇珍之一．货缺价高。

关键词 出口前景 野生菇 国际市场 供不应求 收购价 松茸

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