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不同林分类型下花榈木根系细菌群落多样性分析及其功能预测 被引量：1
1
作者 周洁尘 肖亚琴 +6 位作者 段翔 朱天才 吴小丽 彭皎 王昌 刘康 钟红艳 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第2期112-121,共10页
【目的】探究花榈木不同根系分区细菌群落结构和多样性的差异以及与林分类型的相关性,挖掘影响花榈木相关的功能基因。【方法】以樟树林和国外松林下套种的花榈木非根系土壤、根系土壤和根为研究对象,进行高通量测序和生物信息学分析。... 【目的】探究花榈木不同根系分区细菌群落结构和多样性的差异以及与林分类型的相关性,挖掘影响花榈木相关的功能基因。【方法】以樟树林和国外松林下套种的花榈木非根系土壤、根系土壤和根为研究对象,进行高通量测序和生物信息学分析。【结果】花榈木根系细菌隶属于29个门、72个纲、171个目、303个科、625个属、1118个种和2570个OTU。2个林分中花榈木根系细菌群落多样性和均匀度差异较小,丰富度具有显著差异。3个根系分区中,花榈木根内分区的细菌群落多样性、丰富度最低,与其他2个根系分区具有极显著差异。在门分类水平上,根系细菌群落主要由变形菌门Proteobacteria、绿弯菌门Chloroflex和放线菌门Actinobacteria组成。在属分类水平上,各样品的根系细菌群落的优势菌群的组成及相对丰度具有较大差异,主要以变形菌门和放线菌门为主。花榈木不同根系分区的细菌群落结构上具有极显著差异,根内与其他2个分区的根系细菌群落之间存在明显分离,在群落结构具有极显著影响。Tax4Fun功能预测显示花榈木根系细菌包含大量关于膜运输、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、翻译、复制和修复、能量代谢、辅因子和维生素的代谢等基因信息,其中功能基因丰度较大的为碳水化合物代谢、膜运输和氨基酸代谢。【结论】花榈木不同根系分区的细菌群落组成、结构和多样性均具有显著差异,并且林分影响根系细菌群落的组成,本研究可为后期深入研究花榈木功能基因挖掘、病害防治以及提高花榈木品质提供理论基础。 展开更多
关键词 花榈木 根系 微生物多样性 高通量测序 功能基因
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西双版纳和海南橡胶林叶际细菌群落多样性及其影响因素
2
作者 张柠 舒常庆 +1 位作者 兰国玉 魏亚情 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第4期107-115,共9页
为了解热带橡胶林叶际微生物群落的多样性,利用高通量测序技术,分析两地叶际细菌群落组成及多样性,探讨叶际细菌群落与环境因子间的相互作用。结果表明:在物种组成方面,海南和西双版纳的优势菌门分别为厚壁菌门和变形菌门;芽孢杆菌属和... 为了解热带橡胶林叶际微生物群落的多样性,利用高通量测序技术,分析两地叶际细菌群落组成及多样性,探讨叶际细菌群落与环境因子间的相互作用。结果表明:在物种组成方面,海南和西双版纳的优势菌门分别为厚壁菌门和变形菌门;芽孢杆菌属和甲基杆菌属为海南和西双版纳的优势菌属;主坐标分析(基于Bray-Curtis距离指数)表明,不同地理位置叶际细菌群落相似性低,物种组成结构差异显著,置换多因素方差分析验证了此结果。在多样性方面,西双版纳叶际细菌的Shannon指数显著高于海南;在影响因素方面,通过冗余分析可知,采样点对叶际细菌群落β多样性的影响最大,是影响叶际细菌β多样性的最主要影响因子。相关性分析表明,橡胶林中的优势菌属和优势菌门均与叶片氮呈显著正相关关系;线性回归分析发现,多样性指数与叶片磷、年均温度呈显著相关性。综上所述,海南和西双版纳的橡胶林叶际细菌群落在组成和多样性上存在显著差异。年均温度和叶片氮是影响叶际细菌群落组成的主要环境因素,而年均温度和叶片磷则是影响叶际细菌群落多样性的关键因素。 展开更多
关键词 橡胶林 叶际细菌 多样性 西双版纳 海南
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秋茄内生细菌群落结构特征与多样性研究
3
作者 林文波 陈有先 +3 位作者 郭萍萍 王思凡 刘芳 袁宗胜 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第4期116-123,共8页
为探究内生细菌与秋茄的互作关系,通过采集秋茄根、枝、叶组织样本,提取样本基因组DNA,采用16S rDNA高通量测序技术分析秋茄内生细菌群落结构与多样性,分析秋茄不同部位内生细菌群落的结构特征。结果表明:检测到26门、45纲、107目、186... 为探究内生细菌与秋茄的互作关系,通过采集秋茄根、枝、叶组织样本,提取样本基因组DNA,采用16S rDNA高通量测序技术分析秋茄内生细菌群落结构与多样性,分析秋茄不同部位内生细菌群落的结构特征。结果表明:检测到26门、45纲、107目、186科、391属的内生细菌,共1 893个OTUs。变形菌门在秋茄内生细菌群落中占据主体地位,甲基杆菌属是秋茄根、枝中的优势菌属,在秋茄叶中的相对丰度低于蓝细菌属。内生细菌群落丰富度呈现根>枝>叶,均匀度呈现枝>根>叶。优势菌群落与秋茄的新陈代谢、环境适应与遗传信息等功能显著相关。因此,秋茄根、枝、叶组织内生细菌群落的结构特征、多样性、优势菌属存在显著差异,内生细菌可能是秋茄具有优异适应性与抗逆性的重要因素。 展开更多
关键词 秋茄 内生细菌 生理功能 群落结构 多样性
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关帝山针叶林土壤细菌群落结构特征 被引量：40
4
作者 乔沙沙 周永娜 +5 位作者 刘晋仙 景炬辉 贾彤 李毳 杨欣 柴宝峰 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第2期89-99,共11页
【目的】分析环境与空间因素在寒温性针叶林土壤细菌群落构建中的作用,为区域森林生态系统管理措施的制定提供理论依据。【方法】利用Illumina高通量测序技术分析关帝山庞泉沟自然保护区华北落叶松林(Lp)、青杄林(Pw)以及油松林(Pt)4个... 【目的】分析环境与空间因素在寒温性针叶林土壤细菌群落构建中的作用,为区域森林生态系统管理措施的制定提供理论依据。【方法】利用Illumina高通量测序技术分析关帝山庞泉沟自然保护区华北落叶松林(Lp)、青杄林(Pw)以及油松林(Pt)4个土壤细菌群落(LpMC1、LpMC2、PwMC和PtMC)的结构,同时测定土壤理化性质和土壤酶活性,探讨细菌群落结构与森林类型和土壤环境因子的相关性。【结果】1)在该区域的森林土壤细菌群落中,变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、疣微菌门、浮霉菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、芽单胞菌门、绿弯菌门、衣原体门和硝化螺旋菌门为优势细菌群。2)优势细菌类群相对丰度和土壤环境因子的RDA分析表明,土壤含水率、碳氮比、pH以及土壤酶活性是影响土壤细菌群落结构的重要因子。其中,变形菌门中的大部分类群和拟杆菌门更适于生活在酸性、湿度大、营养状况良好的土壤中,主要碳源是易分解性碳;放线菌门、浮霉菌门和绿弯菌门则在碱性、干旱、营养贫瘠的土壤中更占优势,主要分解顽固性碳。3)Alpha多样性分析结果表明,土壤细菌群落多样性在4个样地间存在差异,在营养贫瘠的油松林样地土壤中细菌群落(PtMC)丰富度低,多样性高;而在营养丰富的高海拔华北落叶松样地中细菌群落(LpMC1)丰富度高,多样性低。4)细菌群落Beta多样性分析结果表明,青杄林和油松林的土壤细菌群落(PwMC与PtMC)、高海拔华北落叶松林和低海拔华北落叶松林的土壤细菌群落(LpMC1与LpMC2)结构分别具有相似性。【结论】受环境选择和扩散限制的共同影响,不同针叶林土壤细菌群落结构和物种多样性具有显著差异。据此,可通过制定不同的育林措施,改变林下土壤环境,进而优化土壤细菌群落结构;提高土壤碳汇,促进土壤氮、硫、磷等营养物质的循环,提高土壤肥力。 展开更多
关键词 环境选择 扩散限制 关帝山 针叶林 高通量测序 细菌群落结构
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西藏东南高寒森林大型真菌多样性与植被及环境的关系 被引量：18
5
作者 王术荣 王德利 +2 位作者 王琦 常明昌 李玉 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期279-289,共11页
通过对西藏东南高寒森林地区3个样地的9个样方两年内较为系统的调查,研究了大型真菌多样性及其与植被类型和大型真菌发生的其他诸多因素之间的关系。基于不同样方物种种类的样方层序聚类分析表明大型真菌的物种发生受植被类型影响较大... 通过对西藏东南高寒森林地区3个样地的9个样方两年内较为系统的调查,研究了大型真菌多样性及其与植被类型和大型真菌发生的其他诸多因素之间的关系。基于不同样方物种种类的样方层序聚类分析表明大型真菌的物种发生受植被类型影响较大。多样性指数分析表明急尖长苞冷杉林内的物种丰富度指数和多样性指数大于青冈树和落叶松混交林,后者大于青冈林。应用典范对应分析研究不同植被类型大型真菌物种发生和环境因素的关系,结果表明大型真菌物种的发生受不同环境因子的驱动,其发生是植被类型和环境因素共同作用的结果。 展开更多
关键词 大型真菌 植物群落 环境因素 物种发生
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相思根瘤菌和解磷菌培养基优化及解磷能力研究 被引量：11
6
作者 尚军红 康丽华 +2 位作者 罗玉萍 江业根 马海宾 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2005年第2期177-182,共6页
研究绘制了相思根瘤菌MZ菌株和解磷菌217菌株在4种培养基中的OD值生长曲线,结果表明:它们都能在BSE培养基中较好的生长;对MZ根瘤菌和217解磷菌的常规培养基进行优化,获得了它们的优化培养基,进一步绘制的生长曲线证明了优化培养基更利... 研究绘制了相思根瘤菌MZ菌株和解磷菌217菌株在4种培养基中的OD值生长曲线,结果表明:它们都能在BSE培养基中较好的生长;对MZ根瘤菌和217解磷菌的常规培养基进行优化,获得了它们的优化培养基,进一步绘制的生长曲线证明了优化培养基更利于菌株的生长,且活菌数更多。217解磷能力的研究也表明:菌体数量与pH值、解磷强度之间有着密切的关系。 展开更多
关键词 相思 根瘤菌 解磷细菌 培养基优化 解磷能力
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我国森林土壤中苏云金芽孢杆菌生态分布的研究 被引量：16
7
作者 戴莲韵 王学聘 +1 位作者 杨光滢 张万儒 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第6期449-456,共8页
从我国8个森林立地带(寒温带、中温带、暖温带、北亚热带、中亚热带、南亚热带、高原亚热带、热带)所属的13个自然保护区,采集了0—5cm土层林下土壤样品384个.测定了土壤pH、水分和养分.从中分离观察芽孢杆菌菌落1873个,分离出苏云金芽... 从我国8个森林立地带(寒温带、中温带、暖温带、北亚热带、中亚热带、南亚热带、高原亚热带、热带)所属的13个自然保护区,采集了0—5cm土层林下土壤样品384个.测定了土壤pH、水分和养分.从中分离观察芽孢杆菌菌落1873个,分离出苏云金芽孢杆菌79株,并对其所属亚种进行了初步鉴定.其平均出土率和分离率分别为14.32%和4.21%.研究了芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌在森林土壤中生态分布的规律及苏云金芽孢杆菌对6种昆虫的室内毒力测定,从中筛选出不少的高效菌株.为研究苏云金芽孢杆菌在我国森林生态系中资源的保护、开发和利用,具有重要意义. 展开更多
关键词 芽孢杆菌 苏云金芽孢杆菌 生态分布 森林土壤
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根癌农杆菌对感染植原体的泡桐组培苗症状的影响 被引量：6
8
作者 田国忠 朱水芳 +2 位作者 罗飞 李怀方 裘维蕃 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2001年第3期258-264,共7页
采用含有激素合成相关基因的根癌农杆菌 ,伤口接种已感染植原体的泡桐丛枝组培苗和健康组培苗 ,结果发现对丛枝苗的致瘤能力明显低于健康对照苗 ,且被接种病苗的丛枝症状缓解。从健苗获得的 T- DNA转化泡桐瘤组织细胞能在无激素培养基... 采用含有激素合成相关基因的根癌农杆菌 ,伤口接种已感染植原体的泡桐丛枝组培苗和健康组培苗 ,结果发现对丛枝苗的致瘤能力明显低于健康对照苗 ,且被接种病苗的丛枝症状缓解。从健苗获得的 T- DNA转化泡桐瘤组织细胞能在无激素培养基上稳定生长和连续继代培养 2年以上 ,说明瘤组织细胞自身已获得了细胞分裂素和生长素合成能力。根据已报道的根癌农杆菌株系p Til5955T- DNA的异戊烯基转移酶基因 ( ipt)的保守序列 ,设计了一对引物 ( CYT和 CYT′) ,用多聚酶链式反应 ( PCR)扩增了我国杨树致瘤农杆菌 ipt基因部分序列 ( 4 2 7bp片段 ) ,也从遗传转化的两个泡桐无性系瘤组织 At- ZH和 At- T35扩增出此特异片段 ,从而进一步肯定了 T- DNA已被整合到泡桐的染色体上 ,表明泡桐易于通过 Ti质粒载体途径进行基因转移操作 ,但用此引物未能从泡桐、甘薯健株和感染植原体的组培病苗扩增出相应的 4 2 7bp特异片段。当用此遗传转化瘤组织嫁接病苗时 ,可减轻丛枝症状的严重度 ,延长病苗的存活时间和诱导病株生根 。 展开更多
关键词 根癌农杆菌 泡桐丛枝病植原体 病害症状 异戊烯基转移酶基因 组培苗 PCR
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几种丛生竹根际联合固氮研究 被引量：12
9
作者 顾小平 吴晓丽 汪阳东 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2001年第1期28-34,共7页
对几种丛生竹种麻竹、吊丝球竹、青皮竹、粉丹竹、马甲竹、绿竹等进行根系固氮能力调查测定 ,用直接法测定 (干根样品 )前 5个种竹种的根系最高固氮酶活性分别为 2 0 .50、2 4 .81、10 .83、7.4 9、2 .4 6nmol(C2 H4 )·g- 1·h... 对几种丛生竹种麻竹、吊丝球竹、青皮竹、粉丹竹、马甲竹、绿竹等进行根系固氮能力调查测定 ,用直接法测定 (干根样品 )前 5个种竹种的根系最高固氮酶活性分别为 2 0 .50、2 4 .81、10 .83、7.4 9、2 .4 6nmol(C2 H4 )·g- 1·h- 1,用富集培养法测定 (鲜根样品 )前 5个种竹种的根系平均固氮酶活性分别为 2 75、4 31、169、188、79nmol(C2 H4 )·g- 1·h- 1。不同生境和不同季节丛生竹根系固氮能力的调查显示 ,充足的水分供应、较高的温度及适当施用有机肥有利于竹子固氮。对几种丛生竹种根际不同部位固氮菌数调查测定显示 ,根际固氮菌数最多的竹种是吊丝球竹 ,在根际不同部位固氮菌数由非根际土→根际土→根表→根内依次急剧递增 ,越往内部根际效应越明显。用 2 #、12 #、14#、7#菌及混合菌液对麻竹组培苗进行接种显示 ,接种固氮菌可提高苗木成活率和植株含氮量 ,14#、7#菌和混合菌接种可显著提高麻竹组培苗生物量。 展开更多
关键词 丛生竹 根际 联合固氮作用 固氮菌接种 生物固氮 苗木成活率
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Frankia菌侵染木麻黄与其共生结瘤程序 被引量：6
10
作者 张昕 沈爱华 +2 位作者 林永敬 王秋芹 林海萍 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期669-673,共5页
通过回接结瘤后定期制作半薄、超薄切片,在光学和电子显微镜下观察研究了分离自浙江省短枝木麻黄Casuarina equisetifolia根瘤的2株Frankia菌的侵染过程。结果表明:Frankia菌从根毛细胞侵入后向内部的皮层细胞延伸,受Frankia菌侵入的刺... 通过回接结瘤后定期制作半薄、超薄切片,在光学和电子显微镜下观察研究了分离自浙江省短枝木麻黄Casuarina equisetifolia根瘤的2株Frankia菌的侵染过程。结果表明:Frankia菌从根毛细胞侵入后向内部的皮层细胞延伸,受Frankia菌侵入的刺激,侵染的根毛细胞产生大量电子云密度不等的沉积物。沉积物包裹Frankia菌继续向内侵染,形成"侵染线"穿越细胞壁进入邻近细胞,最终到达根瘤。根瘤产生的时间程序为:接种6 d后Frankia菌已侵染根部细胞;接种12 d后形成了根瘤原基;15 d后根瘤原基的部分薄壁细胞被Frankia菌侵染后,转变为前根瘤;接种24 d后前根瘤进一步生长发育伸长,突出皮层后形成新根瘤并最终发育成成熟瘤。Frankia菌的整个侵染过程为:Frankia菌侵染→形成"侵染线"→形成"界面质"→穿壁→繁殖→泡囊→孢子。根瘤的发育可概括为:根瘤原基→前根瘤→成熟瘤。 展开更多
关键词 森林保护学 木麻黄 FRANKIA菌 侵染 结瘤程序
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大兴安岭笃斯越橘内生真菌及矿质养分特性分析 被引量：6
11
作者 白永超 陈露 +4 位作者 卫旭芳 蒋润迪 李彬彬 宫中志 侯智霞 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第10期50-59,共10页
【目的】分析笃斯越橘根系内生真菌的多样性、侵染率、侵染结构及宿主矿质元素含量,明确内生真菌侵染对笃斯越橘矿质元素的影响。【方法】以大兴安岭山地、水湿地冻土、水湿地有土壤3种立地类型的笃斯越橘为研究对象,应用现代生物学高... 【目的】分析笃斯越橘根系内生真菌的多样性、侵染率、侵染结构及宿主矿质元素含量,明确内生真菌侵染对笃斯越橘矿质元素的影响。【方法】以大兴安岭山地、水湿地冻土、水湿地有土壤3种立地类型的笃斯越橘为研究对象,应用现代生物学高通量测序技术(ITS)分析笃斯越橘根系内生真菌多样性,使用多元统计分析法,研究内生真菌侵染率与宿主矿质元素间的相互关系。【结果】1)大兴安岭地区笃斯越橘根系内生真菌多样性(H'=3.58~4.36)及侵染结构(根外菌丝、胞间有隔菌丝、胞间无隔菌丝、胞内菌丝团、表皮细胞缺失)较丰富,侵染率较高(54.98%~68.09%);笃斯越橘根系内生真菌具有立地类型特异性,其中水湿地有土壤类型和山地类型以Phialocephala为优势菌属,而水湿地冻土类型的优势菌属为Meliniomyces。2)3种立地类型中,笃斯越橘根系内生真菌多样性、侵染率均以水湿地冻土类型最高,山地类型次之,水湿地有土壤类型最低,笃斯越橘N、K、Ca、Fe元素的丰度与根系内生真菌多样性及侵染率呈现相同的趋势。3)根系内生真菌侵染率与宿主植物N、P、K、Ca、Fe元素呈显著或极显著正相关,而与Zn元素呈极显著负相关(r=-0.944^(**))。【结论】内生真菌对笃斯越橘矿质养分的积累有显著的促进或抑制作用,推测内生真菌侵染是影响笃斯越橘矿质元素含量的重要因子,环境条件是影响笃斯越橘根系内生真菌多样性和丰度的重要因素。 展开更多
关键词 笃斯越橘 内生真菌 多样性 侵染状况 矿质养分
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黑松—黄色须腹菌共生体根际菌根辅助细菌的筛选及鉴定 被引量：8
12
作者 盛江梅 吴小芹 侯亮亮 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期110-114,共5页
采用干皿对抗法和双接种盆栽试验,从黑松-黄色须腹菌(Rhizopogen luteous,Rl)菌根根际土壤中分离筛选获得2株菌根辅助细菌HR10和HR15菌株。离体互作结果表明,菌株HR10和HR15的菌体及胞外代谢产物均可有效提高Rl菌丝的生长,其菌体对Rl菌... 采用干皿对抗法和双接种盆栽试验,从黑松-黄色须腹菌(Rhizopogen luteous,Rl)菌根根际土壤中分离筛选获得2株菌根辅助细菌HR10和HR15菌株。离体互作结果表明,菌株HR10和HR15的菌体及胞外代谢产物均可有效提高Rl菌丝的生长,其菌体对Rl菌丝生长的增长率分别达到13.1%和33.6%。盆栽试验表明,HR10和HR15菌株分别与Rl双接种黑松幼苗后对松苗生长有显著的促进作用,同时还有效提高了根系的菌根侵染率,单接Rl处理的菌根侵染率为40.83%,Rl+HR10和Rl+HR15处理的分别为71.54%和60.97%。单接种HR10和HR15也可促进黑松生长,其中单接种HR10处理松苗长势好于双接种。这说明HR10和HR15既是黑松-黄色须腹菌的菌根辅助细菌,也是植物促生细菌,对黑松的生长具有直接的促进作用。经形态学观察、Biolog微生物系统鉴定及16S rRNA分析,菌株HR10和HR15分别被鉴定为短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)和藤黄微球菌(Micrococcus luteus),两者在GenBank数据库中的登录号分别为FJ040808和FJ040810。 展开更多
关键词 黄色须腹菌 黑松 菌根辅助细菌 短小芽孢杆菌 藤黄微球菌
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1株磷细菌基本培养条件的研究 被引量：9
13
作者 梁锦锋 陈欣 唐建军 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期342-345,共4页
以磷细菌菌株巨大芽孢杆菌为对象,采用液体培养研究了各种理化因素对其生长的影响。结果表明:①适宜的pH值为5 5～9 5,最适pH范围为8 5～9 0。②在100mL三角瓶中,其最适装量为15～20mL;在装量大于25mL时,菌体生长明显受抑制。③菌体最... 以磷细菌菌株巨大芽孢杆菌为对象,采用液体培养研究了各种理化因素对其生长的影响。结果表明:①适宜的pH值为5 5～9 5,最适pH范围为8 5～9 0。②在100mL三角瓶中,其最适装量为15～20mL;在装量大于25mL时,菌体生长明显受抑制。③菌体最大生长量时的温度为30℃左右。④作为菌体生长的碳源,葡萄糖最佳,半乳糖和甘露糖次之;单糖对于菌体生长的促进优于二糖,多糖最差。⑤Mg2+,Mn2+,Ca2+可以明显提高磷细菌在液体培养基中的初始生长量,Fe2+,Al3+等离子特别是Fe2+却对菌体的初始生长量有明显抑制作用。K+,Zn2+对于菌体初始生长影响不明显。 展开更多
关键词 磷细菌 培养条件 生态学 资源学 生长量
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原位微宇宙法研究温带森林土壤真菌群落构建的驱动机制 被引量：7
14
作者 李毳 马转转 +2 位作者 乔沙沙 刘晋仙 柴宝峰 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期811-817,共7页
群落构建机制是生态学研究的核心问题之一。区域过程与局域过程对群落构建的相对重要性是微生物群落构建研究最具争议性的问题。为了研究温带森林真菌群落多样性及其维持机制,设计了原位微宇宙试验,将区域土壤微生物作为"源群落&qu... 群落构建机制是生态学研究的核心问题之一。区域过程与局域过程对群落构建的相对重要性是微生物群落构建研究最具争议性的问题。为了研究温带森林真菌群落多样性及其维持机制,设计了原位微宇宙试验,将区域土壤微生物作为"源群落",置于庞泉沟自然保护区内华北落叶松(Larix principis-rupprechtii)林、青杄(Picea wilsonii)林、白杄(Picea meyeri)林、油松(Pinus tabulaeformis)林以及桦树(Betula platyphylla)林土壤中进行1年期培养,分析真菌群落结构与土壤因子、植被和群落历史的相关性。Mantel分析和偏Mantel分析结果均显示,无论是样地土壤真菌群落还是微宇宙土壤真菌群落结构,土壤因子都是主要的驱动力(R=0.465 4,R=0.464;R_m=0.493 6;Rm=0.486 2,P<0.01),其中土壤有机质和有效磷与土壤真菌群落结构的相关性最强(R_m=0.590 8,R_m=0.476;R=0.629 2,R=0.613,P=0.001)。此外,土壤含水量和植被优势度对样地土壤真菌群落具有显著影响。与样地土壤真菌群落多样性相比,微宇宙土壤真菌群落的α多样性显著提高(P<0.05),而β多样性减小(P<0.05),在一定程度上表现出趋同效应。源群落丰富的物种多样性对微宇宙土壤真菌群落的结构产生显著影响。总之,在局域尺度下环境选择对温带森林土壤真菌群落结构和动态发挥主导作用,扩散限制对群落结构的差异具有显著的影响,即局域过程和区域过程决定局域森林土壤真菌群落结构,且前者占主导地位。 展开更多
关键词 温带森林 土壤真菌群落 局域过程 区域过程 微宇宙实验
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马尾松幼树根系固氮细菌的发现及其初步研究 被引量：13
15
作者 谢莉华 周建 周政贤 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第2期152-160,共9页
对六类不同岩性发育的土壤中马尾松幼树根系的固氮细菌进行了初步研究，结果发现，在马尾松幼树的根系上能普遍分离到固氮细菌，但在不同岩性的土壤中分离的效果有差异；主、侧根及树势等的不同都影响分离效果。采用根段法和富集法共分... 对六类不同岩性发育的土壤中马尾松幼树根系的固氮细菌进行了初步研究，结果发现，在马尾松幼树的根系上能普遍分离到固氮细菌，但在不同岩性的土壤中分离的效果有差异；主、侧根及树势等的不同都影响分离效果。采用根段法和富集法共分离到１４２个菌株。其中一株经鉴定为争论产碱菌（Ａｌｃａｌｉｇｅｎｅｓｐａｒａｄｏｘｕｓ）。并对其中２６个菌株进行了回接实验，有９个菌株回接成功。固氮效能的测定结果表明其中Ａ｀１０、Ａ｀１３、Ｇ１、ｇ２ｗ四株菌的固氮效能为每消耗１ｇ葡萄糖分别固定氮２．１０—３．５０ｍｇ、４．２０—５．１３ｍｇ、３．６６—６．８３ｍｇ和１．９３—２．６０ｍｇ。 展开更多
关键词 马尾松 固氮细菌 固氮效能
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2个欧美杨品种树皮内生真菌多样性及优势种群动态变化 被引量：5
16
作者 李永 朴春根 +5 位作者 贺伟 常聚普 王海明 郭立民 谢守江 郭民伟 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第6期90-96,共7页
利用组织分离法从欧美杨2品种欧美杨107杨、中林46杨中(996块组织)分离内生真菌1252株,107杨和中林46杨分别分离出645株和607株。利用形态特征和分子生物学方法鉴定为17个属、32个分类单元,包括担子菌2个分类单元,子囊菌30个分类单元均... 利用组织分离法从欧美杨2品种欧美杨107杨、中林46杨中(996块组织)分离内生真菌1252株,107杨和中林46杨分别分离出645株和607株。利用形态特征和分子生物学方法鉴定为17个属、32个分类单元,包括担子菌2个分类单元,子囊菌30个分类单元均为子囊菌。在基于ITS构建的系统进代树上、2杨树品种内生菌均形成5个稳定的分支,包括在囊菌纲2个分支,包括散囊菌纲、类壳菌纲等。2个杨树品种内生真菌优势种群包括链格孢、葡萄座腔菌、镰孢菌、间座壳菌等,其中链格孢、葡萄座腔菌是最为常见的优势种群,2品种内生菌的优势种群会随季节变化而发生变化。 展开更多
关键词 内生真菌 欧美杨 树皮 多样性
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杨树人工林土壤细菌DNA的提取与扩增 被引量：5
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作者 倪桂萍 王延平 +2 位作者 王华田 韩亚飞 桑亚林 《山东大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期23-28,共6页
土壤微生物多样性反映土壤生态系统健康程度,对土壤养分循环发挥决定作用,并在很大程度上影响林地生产力。为研究人工林长期经营对土壤微生物多样性的影响,本研究以杨树人工林为研究对象,取连作林地根际和非根际土壤,采用MOBIO PowerSoi... 土壤微生物多样性反映土壤生态系统健康程度,对土壤养分循环发挥决定作用,并在很大程度上影响林地生产力。为研究人工林长期经营对土壤微生物多样性的影响,本研究以杨树人工林为研究对象,取连作林地根际和非根际土壤,采用MOBIO PowerSoil DNA Isolation kit试剂盒提取土壤中微生物基因组DNA,并进行16S rDNAV3区扩增。结果表明:6种杨树人工林土壤中均能提取出微生物基因组DNA,基因组DNA片段大于2 000 bp,且DNA带型清晰完整,无明显降解,为后续土壤细菌的PCR扩增提供了良好模板;6种土壤基因组DNA在电泳图中的亮度不一,其中Ⅰ代林根际土壤(B3)微生物DNA条带最亮,Ⅲ代林非根际土壤(FB18)微生物DNA条带亮度最弱,经检测,B3样品DNA含量约为6.9 ng.cm-3,而FB18仅有2.0 ng.cm-3左右;选用27F/1492R和F338-GC/R518两对引物,采用巢式PCR策略,成功扩增出杨树人工林土壤细菌16S rDNA V3区DNA,片段大小为220 bp左右。 展开更多
关键词 杨树人工林 土壤细菌DNA 巢式PCR
原文传递
基于支持向量机的细菌基因组水平转移基因预测 被引量：3
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作者 吴建盛 谢建明 +2 位作者 周童 翁建洪 孙啸 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第7期724-731,共8页
随着各种生物基因组序列测定工作的完成,大量的DNA序列数据涌现出来,为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利.将基因序列特征分析和支持向量机技术结合起来,通过分析基因序列的特征差异发现水平转移基因.依据以前研究工作的... 随着各种生物基因组序列测定工作的完成,大量的DNA序列数据涌现出来,为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利.将基因序列特征分析和支持向量机技术结合起来,通过分析基因序列的特征差异发现水平转移基因.依据以前研究工作的基础,选取了绝对密码子使用频率(FCU)作为序列特征,主要因为它既包含了基因密码子使用偏性的信息,也包含了基因所编码蛋白的氨基酸组成信息,支持向量机利用这些信息进行水平转移基因分析和预测,可以提高预测的准确性.另外,提出了基于分链的水平转移基因预测新方法,即将细菌基因组前导链和滞后链上的基因区别对待,分别进行水平转移基因预测.结果显示,基本预测方法要优于目前预测结果最好的Tsirigos等提出的基于八联核苷酸频率的打分算法,命中率的相对提高率最高达31.47%,而基于分链的方法对水平转移基因的预测取得了更好的结果. 展开更多
关键词 细菌基因组 水平转移基因 支持向量机 绝对密码子使用频率
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木麻黄根瘤内生菌的分离、培养和回接 被引量：6
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作者 康丽华 曹月华 吴英标 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 1990年第5期483-486,共4页
从福建、广东、海南岛的木麻黄根瘤中分离到16株内生菌,它们都具有Frankia菌的典型形态特征。回接鉴定表明,除4株不侵染原寄主植物外,其余12株均具有侵染能力。但各菌株的侵染能力不同,这些菌株在培养基上的培养特征有一定的差异,实验... 从福建、广东、海南岛的木麻黄根瘤中分离到16株内生菌,它们都具有Frankia菌的典型形态特征。回接鉴定表明,除4株不侵染原寄主植物外,其余12株均具有侵染能力。但各菌株的侵染能力不同,这些菌株在培养基上的培养特征有一定的差异,实验菌株在BAP培养基上生长最好,在Jan Blom、Qmod等培养基上生长较差。 展开更多
关键词 木麻黄 内生菌 根瘤 分离 培养 回接 弗兰克氏菌 生物固氮
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毛竹根际分离的多粘芽孢杆菌固氮特性的研究 被引量：9
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作者 顾小平 吴晓丽 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 1998年第4期377-381,共5页
对从毛竹根际分离到的菌号为ＧＷ－１、ＧＷ－５、ＧＷ－１０、ＧＷ－１６的４株菌进行鉴定和固氮特性研究，从其菌体形态及生理生化特性确定为多粘芽孢杆菌。它们固氮的最适温度：ＧＷ－１为３０～３５℃，ＧＷ－５、ＧＷ－１６为３０... 对从毛竹根际分离到的菌号为ＧＷ－１、ＧＷ－５、ＧＷ－１０、ＧＷ－１６的４株菌进行鉴定和固氮特性研究，从其菌体形态及生理生化特性确定为多粘芽孢杆菌。它们固氮的最适温度：ＧＷ－１为３０～３５℃，ＧＷ－５、ＧＷ－１６为３０℃，ＧＷ－１０为３５℃，最适固氮ｐＨＧＷ－１、ＧＷ－１０为７．５左右，ＧＷ－５为７．０左右，ＧＷ－１６为６．０～７．５之间。４株菌都可利用多种碳源固氮，但以葡萄糖、蔗糖、苹果酸３种碳源混合时固氮活性最大。４株菌的最高固氮能力ＧＷ－１、ＧＷ－５培养９６ｈ时分别为１５６．９０、８９．３７ｎｍｏｌ（Ｃ２Ｈ４）／（ｈ·瓶），ＧＷ－１０、ＧＷ－６培养７２ｈ时分别为５６．６３、８３．６４ｎｍｏｌ（Ｃ２Ｈ４）／（ｈ·瓶）。 展开更多
关键词 毛竹 多粘芽孢杆菌 联合固氮 固氮活性
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