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基于转录组测序的红掌营养生长期相关基因筛选
1
作者
罗思思
夏晴
+5 位作者
魏倩
周晓云
谢利
张志胜
刘丽丽
曾瑞珍
《南方农业学报》
北大核心
2025年第9期2919-2929,共11页
[目的]通过转录组测序挖掘调控红掌营养生长期长短的相关基因,为了解红掌从营养生长向生殖生长转变过程中的基因调控机制及短营养生长期的红掌分子育种提供理论依据。[方法]以进入生殖生长阶段的广花小天娇红掌和仍处于营养生长阶段的20...
[目的]通过转录组测序挖掘调控红掌营养生长期长短的相关基因,为了解红掌从营养生长向生殖生长转变过程中的基因调控机制及短营养生长期的红掌分子育种提供理论依据。[方法]以进入生殖生长阶段的广花小天娇红掌和仍处于营养生长阶段的2016-035-5红掌为研究对象,采集2个营养生长期长短不同的红掌种质的根、茎、叶、芽进行转录组测序分析,筛选差异表达基因(DEGs),对DEGs进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,筛选出参与调控红掌营养生长期长短的关键基因和信号通路,并通过实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性。[结果]转录组测序共获得203.18 Gb的有效数据(Clean data),从2个红掌种质中筛选出6151个DEGs,根、茎、叶、芽4个比较组共有550个DEGs。GO功能注释结果显示,DEGs被注释到的GO功能条目主要为生物过程中的代谢过程、细胞过程、单生物过程、应激响应、生物调控、生物过程调控和定位,细胞组分中的细胞部分和细胞,以及分子功能中的结合和催化活性。KEGG信号通路富集分析结果显示,DEGs富集最多的KEGG通路主要为代谢途径、次生代谢物的生物合成、植物—病原体互作、苯丙素生物合成、碳代谢和植物激素信号转导等。共筛选出42个调控红掌营养生长期长短的DEGs,其中光周期途径24个、赤霉素途径3个、温敏途径6个、年龄途径3个、自主途径2个及开花整合因子途径4个。转录组测序与实时荧光定量PCR验证结果的相关系数(R2)为0.7293,表明转录组测序数据可靠。[结论]红掌营养生长期长短受光周期、赤霉素、温敏、年龄、自主和开花整合因子等途径调控,红掌PRR5、PHL、COL5、BBX24、VIL2、PIF4、SPL10、FT和FD是造成红掌营养生长期及开花时间发生改变的关键基因。
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关键词
红掌
营养生长期
转录组
差异表达基因(DEGs)
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职称材料
虎眼万年青的直接体细胞胚胎发生和植株再生
被引量:
12
2
作者
尹东
黄百渠
李彦舫
《Acta Botanica Sinica》
CSCD
1997年第1期59-63,共5页
以虎眼万年青(Ornithogalum caudatum Jacq.)子鳞茎的鳞叶为外植体,不经过愈伤组织阶段,直接诱导体细胞胚胎发生并再生植株。组织切片和扫描电镜的观察结果表明:体细胞胚来自鳞叶表皮最外层的单个细胞。这个细胞经第一次平周分裂,成为2...
以虎眼万年青(Ornithogalum caudatum Jacq.)子鳞茎的鳞叶为外植体,不经过愈伤组织阶段,直接诱导体细胞胚胎发生并再生植株。组织切片和扫描电镜的观察结果表明:体细胞胚来自鳞叶表皮最外层的单个细胞。这个细胞经第一次平周分裂,成为2-细胞原胚,然后依次经过4-细胞原胚、球形胚、香蕉形胚等阶段发育成小植株,其形态学发育过程与合子胚相似。小植株移入土中,1周后即可成活。此外,还观察到直接体细胞胚只产生于鳞叶的近轴面,而远轴面无体细胞胚产生,这两个部位在细胞结构和形态上有显著差异。
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关键词
虎眼万年青
体细胞胚胎发生
植株再生
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职称材料
外源NO对低温胁迫下红掌耐寒性诱导的研究
被引量:
4
3
作者
梁丽建
邓衍明
+3 位作者
孙晓波
贾新平
瞿辉
苏家乐
《江苏农业科学》
2018年第1期82-85,共4页
以红掌品种阿拉巴马1年生植株为试验材料,研究不同浓度NO供体硝普钠(sodium nitroprusside,SNP)溶液,对低温12℃/5℃(白天/夜间)胁迫处理下红掌幼苗生长和生理特性的影响。结果表明,在低温胁迫下,外源SNP处理可以使红掌植株的株高、干...
以红掌品种阿拉巴马1年生植株为试验材料,研究不同浓度NO供体硝普钠(sodium nitroprusside,SNP)溶液,对低温12℃/5℃(白天/夜间)胁迫处理下红掌幼苗生长和生理特性的影响。结果表明,在低温胁迫下,外源SNP处理可以使红掌植株的株高、干质量、含水量和根冠比得到提高;同时,可以有效地抑制电导率和MDA含量的上升,显著提高叶绿素和脯氨酸含量,延缓SOD、POD和CAT等抗氧化酶活性的下降。此外,0.2 mmol/L SNP是缓解红掌寒害的最适浓度,过高浓度的外源SNP对低温胁迫下红掌幼苗生长的缓解作用不显著。
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关键词
低温胁迫
外源NO
红掌
抗寒性
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职称材料
2种不同耐热性的盆栽红掌品种抗性机制比较
被引量:
3
4
作者
王宏辉
顾俊杰
+2 位作者
房伟民
陈发棣
张栋梁
《江苏农业科学》
2020年第21期140-145,共6页
为研究盆栽红掌品种的耐热性机制,筛选出红掌不同品种耐热性鉴定指标,以强耐热品种阿拉巴马(Alabama)和弱耐热品种白冠军(White champion)为材料,在39℃高温处理不同时间后测定2个品种叶片的相对电导率(REC)"丙二醛含量(MDA)、相...
为研究盆栽红掌品种的耐热性机制,筛选出红掌不同品种耐热性鉴定指标,以强耐热品种阿拉巴马(Alabama)和弱耐热品种白冠军(White champion)为材料,在39℃高温处理不同时间后测定2个品种叶片的相对电导率(REC)"丙二醛含量(MDA)、相对含水量(RWC)和渗透调节物质含量等10个生理指标的变化。结果表明,随着高温处理时间的延长,2种盆栽红掌的相对电导率与MDA含量的动态变化趋势一致,且均呈上升趋势,耐热性强的阿拉巴马的相对电导率和MDA含量增幅比耐热性弱的白冠军小,且始终保持较低水平;RWC呈下降变化趋势,阿拉巴马的RWC降幅比白冠军的小,且最后趋于稳定并保持在较高水平;阿拉巴马叶绿素总含量和类胡萝卜素含量呈先升高后下降的变化趋势,且胁迫前后含量没有显著性差异,而白冠军均呈持续下降的趋势;脯氨酸含量和可溶性蛋白含量的动态变化趋势一致,均呈现为先升高后下降的变化趋势,阿拉巴马比白冠军出现峰值所需的时间长、增幅大、降幅小且始终显著高于对照;超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性的变化趋势一致,均先升高后降低,阿拉巴马的升高幅度大于白冠军并始终保持高于对照的活性,而胁迫后白冠军的SOD和POD活性低于对照,CAT活性高于对照。综合试验结果,耐热性强的阿拉巴马的抗性机制是具有较稳定的细胞膜系统、较强的渗透调节能力和较高的抗氧化能力。相对电导率、丙二醛含量、相对含水量、脯氨酸含量、可溶性蛋白含量、SOD活性和POD活性可以作为红掌不同品种耐热性评价的生理指标。
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关键词
高温胁迫
盆栽红掌
抗性机制
耐热性
评价指标
生理指标
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职称材料
虎眼万年青的快速繁殖
被引量:
2
5
作者
尹东
黄百渠
《植物生理学通讯》
CSCD
1995年第4期283-283,共1页
关键词
虎眼万年青
万年青
快速繁殖
繁殖
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职称材料
红掌花芽分化进程及其主要生理指标变化研究
被引量:
1
6
作者
李心
杨柳燕
+3 位作者
顾俊杰
张栋梁
张永春
任小平
《江苏农业科学》
2020年第24期140-143,共4页
通过石蜡切片对红掌品种潘多拉的花芽分化进程进行显微观测,并测定花芽分化进程及成熟期和衰老期对应叶片的可溶性蛋白、可溶性糖、淀粉和内源激素含量的变化。结果表明,红掌的花芽分化进程与苞片的形态变化有关,可以划分为花序原基形...
通过石蜡切片对红掌品种潘多拉的花芽分化进程进行显微观测,并测定花芽分化进程及成熟期和衰老期对应叶片的可溶性蛋白、可溶性糖、淀粉和内源激素含量的变化。结果表明,红掌的花芽分化进程与苞片的形态变化有关,可以划分为花序原基形成期、花原基形成期、花瓣原基形成期、雄蕊原基形成期和心皮原基形成期5个时期。在花序原基形成期、花瓣原基形成期及盛放期,对应叶片的可溶性蛋白含量较高;雄蕊原基形成期和盛放期对应叶片中的可溶性糖和淀粉含量均表现出下降趋势;花序原基产生时期,相应叶片表现出较高的ZT含量和GA3/IAA高比值;花原基和花瓣原基的产生时期则IAA含量和IAA/ABA升高;雄蕊原基的产生时期整体激素水平较低;心皮原基形成期,IAA含量和IAA/ABA比值再次表现出升高的趋势;盛放期和衰老期,GA3、ABA、GA3/IAA和GA3/ABA则急剧升高。
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关键词
红掌
花芽分化
花发育
生理变化
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职称材料
题名
基于转录组测序的红掌营养生长期相关基因筛选
1
作者
罗思思
夏晴
魏倩
周晓云
谢利
张志胜
刘丽丽
曾瑞珍
机构
华南农业大学林学与风景园林学院
广州花卉研究中心有限公司
出处
《南方农业学报》
北大核心
2025年第9期2919-2929,共11页
基金
广东省省级乡村振兴战略专项资金种业振兴行动项目(2024-NPY-01-005,2024-NPY-01-006)。
文摘
[目的]通过转录组测序挖掘调控红掌营养生长期长短的相关基因,为了解红掌从营养生长向生殖生长转变过程中的基因调控机制及短营养生长期的红掌分子育种提供理论依据。[方法]以进入生殖生长阶段的广花小天娇红掌和仍处于营养生长阶段的2016-035-5红掌为研究对象,采集2个营养生长期长短不同的红掌种质的根、茎、叶、芽进行转录组测序分析,筛选差异表达基因(DEGs),对DEGs进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,筛选出参与调控红掌营养生长期长短的关键基因和信号通路,并通过实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性。[结果]转录组测序共获得203.18 Gb的有效数据(Clean data),从2个红掌种质中筛选出6151个DEGs,根、茎、叶、芽4个比较组共有550个DEGs。GO功能注释结果显示,DEGs被注释到的GO功能条目主要为生物过程中的代谢过程、细胞过程、单生物过程、应激响应、生物调控、生物过程调控和定位,细胞组分中的细胞部分和细胞,以及分子功能中的结合和催化活性。KEGG信号通路富集分析结果显示,DEGs富集最多的KEGG通路主要为代谢途径、次生代谢物的生物合成、植物—病原体互作、苯丙素生物合成、碳代谢和植物激素信号转导等。共筛选出42个调控红掌营养生长期长短的DEGs,其中光周期途径24个、赤霉素途径3个、温敏途径6个、年龄途径3个、自主途径2个及开花整合因子途径4个。转录组测序与实时荧光定量PCR验证结果的相关系数(R2)为0.7293,表明转录组测序数据可靠。[结论]红掌营养生长期长短受光周期、赤霉素、温敏、年龄、自主和开花整合因子等途径调控,红掌PRR5、PHL、COL5、BBX24、VIL2、PIF4、SPL10、FT和FD是造成红掌营养生长期及开花时间发生改变的关键基因。
关键词
红掌
营养生长期
转录组
差异表达基因(DEGs)
Keywords
Anthurium andraeanum
vegetative growth stage
transcriptome
differentially expressed gene(DEGs)
分类号
S682.140.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
虎眼万年青的直接体细胞胚胎发生和植株再生
被引量:
12
2
作者
尹东
黄百渠
李彦舫
机构
东北师范大学遗传与细胞研究所
中国人民解放军农牧大学
出处
《Acta Botanica Sinica》
CSCD
1997年第1期59-63,共5页
基金
国家自然科学基金
文摘
以虎眼万年青(Ornithogalum caudatum Jacq.)子鳞茎的鳞叶为外植体,不经过愈伤组织阶段,直接诱导体细胞胚胎发生并再生植株。组织切片和扫描电镜的观察结果表明:体细胞胚来自鳞叶表皮最外层的单个细胞。这个细胞经第一次平周分裂,成为2-细胞原胚,然后依次经过4-细胞原胚、球形胚、香蕉形胚等阶段发育成小植株,其形态学发育过程与合子胚相似。小植株移入土中,1周后即可成活。此外,还观察到直接体细胞胚只产生于鳞叶的近轴面,而远轴面无体细胞胚产生,这两个部位在细胞结构和形态上有显著差异。
关键词
虎眼万年青
体细胞胚胎发生
植株再生
Keywords
Ornithogalum caudatum, Somatic embryogenesis, Histological study
分类号
S682.140.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
外源NO对低温胁迫下红掌耐寒性诱导的研究
被引量:
4
3
作者
梁丽建
邓衍明
孙晓波
贾新平
瞿辉
苏家乐
机构
江苏省农业科学院休闲农业研究所
江苏省园艺技术推广站
出处
《江苏农业科学》
2018年第1期82-85,共4页
基金
江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(14)5053]
江苏省农业三新项目[编号:SXGC(2015)290]
文摘
以红掌品种阿拉巴马1年生植株为试验材料,研究不同浓度NO供体硝普钠(sodium nitroprusside,SNP)溶液,对低温12℃/5℃(白天/夜间)胁迫处理下红掌幼苗生长和生理特性的影响。结果表明,在低温胁迫下,外源SNP处理可以使红掌植株的株高、干质量、含水量和根冠比得到提高;同时,可以有效地抑制电导率和MDA含量的上升,显著提高叶绿素和脯氨酸含量,延缓SOD、POD和CAT等抗氧化酶活性的下降。此外,0.2 mmol/L SNP是缓解红掌寒害的最适浓度,过高浓度的外源SNP对低温胁迫下红掌幼苗生长的缓解作用不显著。
关键词
低温胁迫
外源NO
红掌
抗寒性
分类号
S682.140.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
2种不同耐热性的盆栽红掌品种抗性机制比较
被引量:
3
4
作者
王宏辉
顾俊杰
房伟民
陈发棣
张栋梁
机构
南京农业大学园艺学院
上海鲜花港企业发展有限公司
内蒙古通辽市科尔沁区农业技术推广中心
出处
《江苏农业科学》
2020年第21期140-145,共6页
基金
国家科技支撑计划(编号:L0201300245)
上海市科技兴农重点攻关项目[编号:沪农科攻字(2011)第1-9号]。
文摘
为研究盆栽红掌品种的耐热性机制,筛选出红掌不同品种耐热性鉴定指标,以强耐热品种阿拉巴马(Alabama)和弱耐热品种白冠军(White champion)为材料,在39℃高温处理不同时间后测定2个品种叶片的相对电导率(REC)"丙二醛含量(MDA)、相对含水量(RWC)和渗透调节物质含量等10个生理指标的变化。结果表明,随着高温处理时间的延长,2种盆栽红掌的相对电导率与MDA含量的动态变化趋势一致,且均呈上升趋势,耐热性强的阿拉巴马的相对电导率和MDA含量增幅比耐热性弱的白冠军小,且始终保持较低水平;RWC呈下降变化趋势,阿拉巴马的RWC降幅比白冠军的小,且最后趋于稳定并保持在较高水平;阿拉巴马叶绿素总含量和类胡萝卜素含量呈先升高后下降的变化趋势,且胁迫前后含量没有显著性差异,而白冠军均呈持续下降的趋势;脯氨酸含量和可溶性蛋白含量的动态变化趋势一致,均呈现为先升高后下降的变化趋势,阿拉巴马比白冠军出现峰值所需的时间长、增幅大、降幅小且始终显著高于对照;超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性的变化趋势一致,均先升高后降低,阿拉巴马的升高幅度大于白冠军并始终保持高于对照的活性,而胁迫后白冠军的SOD和POD活性低于对照,CAT活性高于对照。综合试验结果,耐热性强的阿拉巴马的抗性机制是具有较稳定的细胞膜系统、较强的渗透调节能力和较高的抗氧化能力。相对电导率、丙二醛含量、相对含水量、脯氨酸含量、可溶性蛋白含量、SOD活性和POD活性可以作为红掌不同品种耐热性评价的生理指标。
关键词
高温胁迫
盆栽红掌
抗性机制
耐热性
评价指标
生理指标
分类号
S682.140.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
虎眼万年青的快速繁殖
被引量:
2
5
作者
尹东
黄百渠
机构
东北师范大学遗传与细胞研究所
出处
《植物生理学通讯》
CSCD
1995年第4期283-283,共1页
关键词
虎眼万年青
万年青
快速繁殖
繁殖
分类号
S682.140.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
红掌花芽分化进程及其主要生理指标变化研究
被引量:
1
6
作者
李心
杨柳燕
顾俊杰
张栋梁
张永春
任小平
机构
上海市农业科学院林木果树研究所
上海鲜花港企业发展有限公司
上海瀛庙果蔬专业合作社
出处
《江苏农业科学》
2020年第24期140-143,共4页
基金
上海市农业委员会农业基础研究项目(编号:沪农科攻字〔2014〕第7-2-3号)。
文摘
通过石蜡切片对红掌品种潘多拉的花芽分化进程进行显微观测,并测定花芽分化进程及成熟期和衰老期对应叶片的可溶性蛋白、可溶性糖、淀粉和内源激素含量的变化。结果表明,红掌的花芽分化进程与苞片的形态变化有关,可以划分为花序原基形成期、花原基形成期、花瓣原基形成期、雄蕊原基形成期和心皮原基形成期5个时期。在花序原基形成期、花瓣原基形成期及盛放期,对应叶片的可溶性蛋白含量较高;雄蕊原基形成期和盛放期对应叶片中的可溶性糖和淀粉含量均表现出下降趋势;花序原基产生时期,相应叶片表现出较高的ZT含量和GA3/IAA高比值;花原基和花瓣原基的产生时期则IAA含量和IAA/ABA升高;雄蕊原基的产生时期整体激素水平较低;心皮原基形成期,IAA含量和IAA/ABA比值再次表现出升高的趋势;盛放期和衰老期,GA3、ABA、GA3/IAA和GA3/ABA则急剧升高。
关键词
红掌
花芽分化
花发育
生理变化
分类号
S682.140.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序的红掌营养生长期相关基因筛选
罗思思
夏晴
魏倩
周晓云
谢利
张志胜
刘丽丽
曾瑞珍
《南方农业学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
虎眼万年青的直接体细胞胚胎发生和植株再生
尹东
黄百渠
李彦舫
《Acta Botanica Sinica》
CSCD
1997
12
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职称材料
3
外源NO对低温胁迫下红掌耐寒性诱导的研究
梁丽建
邓衍明
孙晓波
贾新平
瞿辉
苏家乐
《江苏农业科学》
2018
4
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职称材料
4
2种不同耐热性的盆栽红掌品种抗性机制比较
王宏辉
顾俊杰
房伟民
陈发棣
张栋梁
《江苏农业科学》
2020
3
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职称材料
5
虎眼万年青的快速繁殖
尹东
黄百渠
《植物生理学通讯》
CSCD
1995
2
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职称材料
6
红掌花芽分化进程及其主要生理指标变化研究
李心
杨柳燕
顾俊杰
张栋梁
张永春
任小平
《江苏农业科学》
2020
1
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职称材料
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