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库尔勒香梨基因组DNA提取及RAPD体系建立
被引量:
24
1
作者
马兵钢
NIU Jian-xin
+3 位作者
牛建新
马连营
田新莉
赵宗胜
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
2001年第1期18-22,共5页
通过比较试验 ,使用 SDS-氯仿 -异戊醇法 ,添加 BME及 Vc,简便、快速地从库尔勒香梨成熟叶中提取大分子量 DNA,有效地去除了梨属植物组织中所含的多酚类、单宁、色素及多糖类物质 ,该 DNA能很好地被酶切并用于
关键词
库尔勒香梨
RAPD
基因组DNA
提取方法
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职称材料
库尔勒香梨mRNA差异显示技术体系的建立
被引量:
3
2
作者
张飞
牛建新
+3 位作者
叶春秀
刘娜
高静涛
朱天丁
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2011年第2期173-178,共6页
为了研究库尔勒香梨萼片脱落与宿存的本质,试验以库尔勒香梨盛花前期的同一时间同一棵树同一花序的第2位序花和第4序位花为试验材料,采用mRNA差异显示的方法进行研究。扩增体系为20μL:cDNA 2.0μL,10μmol/L锚定引物2.0μL,10μmol/L...
为了研究库尔勒香梨萼片脱落与宿存的本质,试验以库尔勒香梨盛花前期的同一时间同一棵树同一花序的第2位序花和第4序位花为试验材料,采用mRNA差异显示的方法进行研究。扩增体系为20μL:cDNA 2.0μL,10μmol/L锚定引物2.0μL,10μmol/L随机引物2.0μL,2.5 mmol/L dNTPs 2.0μL,5 U/μL Taq 0.25μL,10×PCR buffer 2.5μL,ddH2O 9.25μL。结果显示,扩增产物经6%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染,获得了比较清晰的差异条带,回收并克隆差异条带,分离得到一些差异表达的片段,优化了库尔勒香梨mRNA差异显示技术,为克隆差异表达基因的全长cDNA奠定了良好基础。
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关键词
库尔勒香梨
萼片
体系
MRNA差异显示
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职称材料
软儿梨无性系选优试验研究
3
作者
于柱英
李先元
俞天泉
《现代农业科学》
2008年第9期43-44,50,共3页
通过调查武威软儿梨资源,在实地初选、2次复选的基础上,嫁接后系统观察分析,筛选出新华1号、新华2号、金塔2号、高坝2号四个优良单株系,可作为良种基因资源大力推广。
关键词
软儿梨
资源
选优
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职称材料
高寒阴湿区皮胎果林下羊肚菌栽培技术
被引量:
1
4
作者
范桃会
冯坤蓉
+3 位作者
金刚
唐建俊
丁云鹤
许英
《林业科技通讯》
2021年第3期82-82,共1页
总结了高寒阴湿地区皮胎果(Pyrus ussuriensis Maxim)林下羊肚菌(Morchella esculenta)栽培技术要点,为今后发展皮胎果林下经济提供参考。
关键词
羊肚菌
Morchella
esculenta
皮胎果
Pyrus
ussuriensis
Maxim
林下栽培
原文传递
梨PucACO、PucACS基因家族鉴定及其生物信息学分析
5
作者
刘亚龙
欧春青
+5 位作者
张艳杰
李舒然
王晨
吝茹雪
姜淑苓
王斐
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2024年第12期105-122,共18页
【目的】对梨PucACO、PucACS基因家族进行生物信息学分析,为进一步研究PucACO、PucACS基因家族在梨生长发育过程中的功能奠定基础。【方法】在‘中矮1号’基因组中鉴定出梨PucACO、PucACS基因家族,利用ExPASy、Plant-mPLo、NetPhos等软...
【目的】对梨PucACO、PucACS基因家族进行生物信息学分析,为进一步研究PucACO、PucACS基因家族在梨生长发育过程中的功能奠定基础。【方法】在‘中矮1号’基因组中鉴定出梨PucACO、PucACS基因家族,利用ExPASy、Plant-mPLo、NetPhos等软件分析PucACO、PucACS蛋白的理化性质,使用TBtools分析PucACO、PucACS基因家族的基因结构、构建进化树及共线性分析,使用Swiss-Model、I-TASSER、ROBETTA预测PucACS、PucACO蛋白的3D模型,并使用SAVEs6.0对其进行质量评估,再使用VMD对PucACO、PucACS蛋白的三级结构进行美化。【结果】共鉴定出8个梨PucACO基因和8个梨PucACS基因,其中梨PucACO基因编码蛋白长度为226~322个氨基酸,核苷酸序列一致性及氨基酸序列同源性分别为38.05%~99.78%和29.39%~99.70%,相对分子质量为25.75~36.54 ku,等电点为5.07~5.84;所有PucACO基因编码的蛋白质均为亲水性蛋白质,部分为不稳定蛋白,亚细胞均位于细胞质中,脂肪系数为76.13~89.25,热稳定性比较好。梨PucACS基因编码的蛋白长度为432~794个氨基酸,核苷酸序列一致性及氨基酸序列同源性分别为31.79%~100%和30.00%~100%,相对分子质量为48.41~89.77 ku,等电点为5.48~8.41;不稳定系数均大于40,为不稳定蛋白质;PucACS2位于细胞质中,其余均位于叶绿体中;脂肪系数为77.17~84.40,热稳定性较好,均为亲水性蛋白质。PucACS和PucACO蛋白生物学功能主要以丝氨酸磷酸化修饰为主,均不含信号肽位点,无跨膜结构,且不含GPI锚定蛋白位点。二级结构预测结果表明,PucACS、PucACO蛋白质结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主,PucACS中包含多个保守的脯氨酸,PucACO中包含多个保守的组氨酸。梨PucACS基因家族分为3类,PucACO基因家族可以分为2类,PucACS、PucACO家族各成员的基因结构和保守基序差异较小,内含子数量和所包含的基序大致相同。梨PucACS、PucACO基因家族启动子顺式作用元件分析结果表明,该启动子中存在多种与植物生长调控、植物激素调节、逆境诱导等相关的作用元件。拟南芥与梨共存在24对共线性关系,其中PucACS家族与拟南芥构建了16对共线性关系,PucACO家族与拟南芥构建了8对共线性关系。梨物种内部的共线性分析结果表明,PucACO家族之间存在3对共线性关系,PucACS家族之间存在4对共线性关系。【结论】鉴定出8个梨PucACS基因和8个梨PucACO基因,其生物信息学分析结果丰富了梨PucACS和PucACO基因的分子生物学理论。
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关键词
梨遗传育种
PucACS
PucACO
生物信息学
基因结构
蛋白质结构
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职称材料
题名
库尔勒香梨基因组DNA提取及RAPD体系建立
被引量:
24
1
作者
马兵钢
NIU Jian-xin
牛建新
马连营
田新莉
赵宗胜
机构
石河子大学农学院园艺园林工程系
Department of Horticulture Forestry Engineering
乌鲁木齐天物科技发展有限公司
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
2001年第1期18-22,共5页
基金
新疆生产建设兵团科委重点项目
文摘
通过比较试验 ,使用 SDS-氯仿 -异戊醇法 ,添加 BME及 Vc,简便、快速地从库尔勒香梨成熟叶中提取大分子量 DNA,有效地去除了梨属植物组织中所含的多酚类、单宁、色素及多糖类物质 ,该 DNA能很好地被酶切并用于
关键词
库尔勒香梨
RAPD
基因组DNA
提取方法
Keywords
Kuele pear
DNA-isolation
RAPD
分类号
S661.23 [农业科学—果树学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
库尔勒香梨mRNA差异显示技术体系的建立
被引量:
3
2
作者
张飞
牛建新
叶春秀
刘娜
高静涛
朱天丁
机构
石河子大学农学院园艺系
出处
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2011年第2期173-178,共6页
基金
国家科技攻关计划引导项目(2003BA546C)
国际科技合作(2009YD32)
新疆兵团"科技人员服务南疆专项"(2010GG59)
文摘
为了研究库尔勒香梨萼片脱落与宿存的本质,试验以库尔勒香梨盛花前期的同一时间同一棵树同一花序的第2位序花和第4序位花为试验材料,采用mRNA差异显示的方法进行研究。扩增体系为20μL:cDNA 2.0μL,10μmol/L锚定引物2.0μL,10μmol/L随机引物2.0μL,2.5 mmol/L dNTPs 2.0μL,5 U/μL Taq 0.25μL,10×PCR buffer 2.5μL,ddH2O 9.25μL。结果显示,扩增产物经6%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染,获得了比较清晰的差异条带,回收并克隆差异条带,分离得到一些差异表达的片段,优化了库尔勒香梨mRNA差异显示技术,为克隆差异表达基因的全长cDNA奠定了良好基础。
关键词
库尔勒香梨
萼片
体系
MRNA差异显示
Keywords
Korla fragrant pear
calyx
system
DDRT-PCR
分类号
S661.23 [农业科学—果树学]
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
软儿梨无性系选优试验研究
3
作者
于柱英
李先元
俞天泉
机构
武威市林业技术服务中心
出处
《现代农业科学》
2008年第9期43-44,50,共3页
文摘
通过调查武威软儿梨资源,在实地初选、2次复选的基础上,嫁接后系统观察分析,筛选出新华1号、新华2号、金塔2号、高坝2号四个优良单株系,可作为良种基因资源大力推广。
关键词
软儿梨
资源
选优
Keywords
ruan-er pear
resource
excellent selection
分类号
S661.233 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
高寒阴湿区皮胎果林下羊肚菌栽培技术
被引量:
1
4
作者
范桃会
冯坤蓉
金刚
唐建俊
丁云鹤
许英
机构
临夏州农业科学院
出处
《林业科技通讯》
2021年第3期82-82,共1页
基金
临夏州科技计划项目(项目编号:2018-N-2-042)
文摘
总结了高寒阴湿地区皮胎果(Pyrus ussuriensis Maxim)林下羊肚菌(Morchella esculenta)栽培技术要点,为今后发展皮胎果林下经济提供参考。
关键词
羊肚菌
Morchella
esculenta
皮胎果
Pyrus
ussuriensis
Maxim
林下栽培
分类号
S661.23 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
梨PucACO、PucACS基因家族鉴定及其生物信息学分析
5
作者
刘亚龙
欧春青
张艳杰
李舒然
王晨
吝茹雪
姜淑苓
王斐
机构
中国农业科学院果树研究所农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室
沈阳农业大学园艺学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2024年第12期105-122,共18页
基金
中国农业科学院创新工程项目(CAAS-ASTIP)
国家重点研发计划项目(2019YFD1001404)。
文摘
【目的】对梨PucACO、PucACS基因家族进行生物信息学分析,为进一步研究PucACO、PucACS基因家族在梨生长发育过程中的功能奠定基础。【方法】在‘中矮1号’基因组中鉴定出梨PucACO、PucACS基因家族,利用ExPASy、Plant-mPLo、NetPhos等软件分析PucACO、PucACS蛋白的理化性质,使用TBtools分析PucACO、PucACS基因家族的基因结构、构建进化树及共线性分析,使用Swiss-Model、I-TASSER、ROBETTA预测PucACS、PucACO蛋白的3D模型,并使用SAVEs6.0对其进行质量评估,再使用VMD对PucACO、PucACS蛋白的三级结构进行美化。【结果】共鉴定出8个梨PucACO基因和8个梨PucACS基因,其中梨PucACO基因编码蛋白长度为226~322个氨基酸,核苷酸序列一致性及氨基酸序列同源性分别为38.05%~99.78%和29.39%~99.70%,相对分子质量为25.75~36.54 ku,等电点为5.07~5.84;所有PucACO基因编码的蛋白质均为亲水性蛋白质,部分为不稳定蛋白,亚细胞均位于细胞质中,脂肪系数为76.13~89.25,热稳定性比较好。梨PucACS基因编码的蛋白长度为432~794个氨基酸,核苷酸序列一致性及氨基酸序列同源性分别为31.79%~100%和30.00%~100%,相对分子质量为48.41~89.77 ku,等电点为5.48~8.41;不稳定系数均大于40,为不稳定蛋白质;PucACS2位于细胞质中,其余均位于叶绿体中;脂肪系数为77.17~84.40,热稳定性较好,均为亲水性蛋白质。PucACS和PucACO蛋白生物学功能主要以丝氨酸磷酸化修饰为主,均不含信号肽位点,无跨膜结构,且不含GPI锚定蛋白位点。二级结构预测结果表明,PucACS、PucACO蛋白质结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主,PucACS中包含多个保守的脯氨酸,PucACO中包含多个保守的组氨酸。梨PucACS基因家族分为3类,PucACO基因家族可以分为2类,PucACS、PucACO家族各成员的基因结构和保守基序差异较小,内含子数量和所包含的基序大致相同。梨PucACS、PucACO基因家族启动子顺式作用元件分析结果表明,该启动子中存在多种与植物生长调控、植物激素调节、逆境诱导等相关的作用元件。拟南芥与梨共存在24对共线性关系,其中PucACS家族与拟南芥构建了16对共线性关系,PucACO家族与拟南芥构建了8对共线性关系。梨物种内部的共线性分析结果表明,PucACO家族之间存在3对共线性关系,PucACS家族之间存在4对共线性关系。【结论】鉴定出8个梨PucACS基因和8个梨PucACO基因,其生物信息学分析结果丰富了梨PucACS和PucACO基因的分子生物学理论。
关键词
梨遗传育种
PucACS
PucACO
生物信息学
基因结构
蛋白质结构
Keywords
genetic breeding of pear
PucACS
PucACO
bioinformatics
gene structure
protein structure
分类号
S661.232 [农业科学—果树学]
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职称材料
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1
库尔勒香梨基因组DNA提取及RAPD体系建立
马兵钢
NIU Jian-xin
牛建新
马连营
田新莉
赵宗胜
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
2001
24
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2
库尔勒香梨mRNA差异显示技术体系的建立
张飞
牛建新
叶春秀
刘娜
高静涛
朱天丁
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2011
3
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3
软儿梨无性系选优试验研究
于柱英
李先元
俞天泉
《现代农业科学》
2008
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职称材料
4
高寒阴湿区皮胎果林下羊肚菌栽培技术
范桃会
冯坤蓉
金刚
唐建俊
丁云鹤
许英
《林业科技通讯》
2021
1
原文传递
5
梨PucACO、PucACS基因家族鉴定及其生物信息学分析
刘亚龙
欧春青
张艳杰
李舒然
王晨
吝茹雪
姜淑苓
王斐
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
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