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牡丹开花相关SWEET家族基因生物信息学与表达模式分析
被引量:
5
1
作者
王锐
徐娟娟
+2 位作者
刘鑫
逯久幸
栗燕
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期2145-2153,共9页
为了揭示SWEET家族基因在牡丹开花过程中的作用,该研究以‘洛阳红’牡丹花瓣转录组数据库为基础,利用生物信息学方法对SWEET家族基因进行鉴定和分析。结果表明:(1)实验共得到10个具有完整开放阅读框的牡丹SWEET基因。(2)牡丹SWEET家族...
为了揭示SWEET家族基因在牡丹开花过程中的作用,该研究以‘洛阳红’牡丹花瓣转录组数据库为基础,利用生物信息学方法对SWEET家族基因进行鉴定和分析。结果表明:(1)实验共得到10个具有完整开放阅读框的牡丹SWEET基因。(2)牡丹SWEET家族成员蛋白等电点、消光系数等差别不大,其中5个牡丹SWEET基因编码的蛋白为不稳定蛋白;亚细胞定位预测这10个牡丹SWEET基因编码的蛋白均定位在细胞膜;进化树分析显示,牡丹SWEET基因与拟南芥亲缘关系更近;结构分析表明,牡丹SWEET蛋白结构在进化过程中非常保守,这10个牡丹SWEET蛋白同时具有5个相同的Motif且均含2个MtN3 saliva结构域。(3)可溶性糖含量分析显示,从小风铃期到盛花期,牡丹花瓣中蔗糖含量不断降低,果糖和葡萄糖含量不断升高,均在盛花期达到峰值。(4)qRT-PCR分析显示,PsSWEET4盛花期表达量是小风铃期的34倍,PsSWEET8盛花期表达量是小风铃期的60倍。结合这2个基因表达与进化关系及可溶性糖变化值,初步推测PsSWEET4和PsSWEET8在开花过程中可能通过调控果糖、葡萄糖的转运而间接调控开花过程;该结果为进一步研究PsSWEET基因在牡丹生长发育过程中的功能奠定了基础。
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关键词
牡丹
SWEET基因
生物信息学
表达分析
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职称材料
牡丹病害研究现状及展望
被引量:
23
2
作者
杨瑞先
刘萍
+1 位作者
方站民
李健恒
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2010年第11期138-143,共6页
介绍了牡丹病害的种类及防治技术的现状,并对目前国内牡丹病害研究方面存在的问题进行了总结。针对这些问题,对牡丹病害今后的研究方向提出了建议。
关键词
牡丹
病害种类
防治技术
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职称材料
题名
牡丹开花相关SWEET家族基因生物信息学与表达模式分析
被引量:
5
1
作者
王锐
徐娟娟
刘鑫
逯久幸
栗燕
机构
河南农业大学林学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期2145-2153,共9页
基金
河南省科技攻关(192102110062)
河南农业大学科技创新基金(KJCX2019A05)
河南省高等学校重点科研项目(19A220003)
文摘
为了揭示SWEET家族基因在牡丹开花过程中的作用,该研究以‘洛阳红’牡丹花瓣转录组数据库为基础,利用生物信息学方法对SWEET家族基因进行鉴定和分析。结果表明:(1)实验共得到10个具有完整开放阅读框的牡丹SWEET基因。(2)牡丹SWEET家族成员蛋白等电点、消光系数等差别不大,其中5个牡丹SWEET基因编码的蛋白为不稳定蛋白;亚细胞定位预测这10个牡丹SWEET基因编码的蛋白均定位在细胞膜;进化树分析显示,牡丹SWEET基因与拟南芥亲缘关系更近;结构分析表明,牡丹SWEET蛋白结构在进化过程中非常保守,这10个牡丹SWEET蛋白同时具有5个相同的Motif且均含2个MtN3 saliva结构域。(3)可溶性糖含量分析显示,从小风铃期到盛花期,牡丹花瓣中蔗糖含量不断降低,果糖和葡萄糖含量不断升高,均在盛花期达到峰值。(4)qRT-PCR分析显示,PsSWEET4盛花期表达量是小风铃期的34倍,PsSWEET8盛花期表达量是小风铃期的60倍。结合这2个基因表达与进化关系及可溶性糖变化值,初步推测PsSWEET4和PsSWEET8在开花过程中可能通过调控果糖、葡萄糖的转运而间接调控开花过程;该结果为进一步研究PsSWEET基因在牡丹生长发育过程中的功能奠定了基础。
关键词
牡丹
SWEET基因
生物信息学
表达分析
Keywords
tree peony
SWEET genes
bioinformatics
expression analysis
分类号
S658.11 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
牡丹病害研究现状及展望
被引量:
23
2
作者
杨瑞先
刘萍
方站民
李健恒
机构
洛阳理工学院环境工程与化学系
新安县职业高中
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2010年第11期138-143,共6页
基金
洛阳理工学院青年基金资助项目(2008QZ25)
文摘
介绍了牡丹病害的种类及防治技术的现状,并对目前国内牡丹病害研究方面存在的问题进行了总结。针对这些问题,对牡丹病害今后的研究方向提出了建议。
关键词
牡丹
病害种类
防治技术
分类号
S658.11 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牡丹开花相关SWEET家族基因生物信息学与表达模式分析
王锐
徐娟娟
刘鑫
逯久幸
栗燕
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
5
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职称材料
2
牡丹病害研究现状及展望
杨瑞先
刘萍
方站民
李健恒
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2010
23
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