【目的】鉴定和分析甜瓜(Cucumis melo)suppressor of more axillary growth 2 like(SMXL)基因家族,为深入研究SMXL基因在甜瓜植株内的生物学功能提供依据。【方法】利用生物信息学方法对甜瓜SMXL基因家族进行鉴定,并分析该家族成员的...【目的】鉴定和分析甜瓜(Cucumis melo)suppressor of more axillary growth 2 like(SMXL)基因家族,为深入研究SMXL基因在甜瓜植株内的生物学功能提供依据。【方法】利用生物信息学方法对甜瓜SMXL基因家族进行鉴定,并分析该家族成员的理化性质、结构与功能、共线性关系、蛋白结构、启动子顺式作用元件及表达模式。【结果】在甜瓜中鉴定到15个CmSMXLs成员,将其聚类为5个亚族,其中亚族Ⅴ成员数量最多且具有物种特异性。CmSMXLs上游启动子区域含有多个与光信号、激素、干旱诱导等相关的顺式作用元件。SMXL蛋白主要定位于叶绿体中,其中,CmSMXL7、CmSMXL14和CmSMXL15在叶片中高表达,可能参与光合作用。在非生物(低温、盐、激素)胁迫下,CmSMXL1、CmSMXL3、CmSMXL6、CmSMXL8、CmSMXL10等基因的表达量发生显著变化。CmSMXL10和CmSMXL12在白粉病胁迫下的表达量发生显著变化,CmSMXL3和CmSMXL6在枯萎病胁迫下的表达与其抗病性相关。【结论】获得了甜瓜中参与胁迫反应的SMXL基因。展开更多
文摘【目的】鉴定和分析甜瓜(Cucumis melo)suppressor of more axillary growth 2 like(SMXL)基因家族,为深入研究SMXL基因在甜瓜植株内的生物学功能提供依据。【方法】利用生物信息学方法对甜瓜SMXL基因家族进行鉴定,并分析该家族成员的理化性质、结构与功能、共线性关系、蛋白结构、启动子顺式作用元件及表达模式。【结果】在甜瓜中鉴定到15个CmSMXLs成员,将其聚类为5个亚族,其中亚族Ⅴ成员数量最多且具有物种特异性。CmSMXLs上游启动子区域含有多个与光信号、激素、干旱诱导等相关的顺式作用元件。SMXL蛋白主要定位于叶绿体中,其中,CmSMXL7、CmSMXL14和CmSMXL15在叶片中高表达,可能参与光合作用。在非生物(低温、盐、激素)胁迫下,CmSMXL1、CmSMXL3、CmSMXL6、CmSMXL8、CmSMXL10等基因的表达量发生显著变化。CmSMXL10和CmSMXL12在白粉病胁迫下的表达量发生显著变化,CmSMXL3和CmSMXL6在枯萎病胁迫下的表达与其抗病性相关。【结论】获得了甜瓜中参与胁迫反应的SMXL基因。
