为研究14-3-3基因家族在藏药多刺绿绒蒿毛状体的形成及生物碱积累中的作用,本研究基于全长转录组测序数据,鉴定了多刺绿绒蒿14-3-3基因家族,并对编码蛋白的理化性质、保守结构域、高级结构和进化关系等进行生物信息学分析。结果表明:多...为研究14-3-3基因家族在藏药多刺绿绒蒿毛状体的形成及生物碱积累中的作用,本研究基于全长转录组测序数据,鉴定了多刺绿绒蒿14-3-3基因家族,并对编码蛋白的理化性质、保守结构域、高级结构和进化关系等进行生物信息学分析。结果表明:多刺绿绒蒿植物中具有完整蛋白编码区(coding sequence,CDS)的14-3-3家族成员共24个,这些蛋白的氨基酸数目在113~263之间,等电点在4.70~5.22之间,分子量分布在12.81~29.74 k D,二级结构主要以α-螺旋为主,三级结构高度保守;亚细胞定位预测显示该家族成员主要分布在细胞质上;系统进化树分析表明,多刺绿绒蒿14-3-3蛋白与罂粟科植物中罂粟、博落回进化关系最近。启动子顺式作用元件分析表明多刺绿绒蒿14-3-3可能受到激素信号、光信号和逆境信号途径的调节。蛋白互作预测发现多刺绿绒蒿14-3-3蛋白能够与HSF和ADF蛋白家族成员互作。本研究可为进一步从分子遗传学方面深入研究这些基因的详细功能和发挥功能的机制提供基础。展开更多
文摘为研究14-3-3基因家族在藏药多刺绿绒蒿毛状体的形成及生物碱积累中的作用,本研究基于全长转录组测序数据,鉴定了多刺绿绒蒿14-3-3基因家族,并对编码蛋白的理化性质、保守结构域、高级结构和进化关系等进行生物信息学分析。结果表明:多刺绿绒蒿植物中具有完整蛋白编码区(coding sequence,CDS)的14-3-3家族成员共24个,这些蛋白的氨基酸数目在113~263之间,等电点在4.70~5.22之间,分子量分布在12.81~29.74 k D,二级结构主要以α-螺旋为主,三级结构高度保守;亚细胞定位预测显示该家族成员主要分布在细胞质上;系统进化树分析表明,多刺绿绒蒿14-3-3蛋白与罂粟科植物中罂粟、博落回进化关系最近。启动子顺式作用元件分析表明多刺绿绒蒿14-3-3可能受到激素信号、光信号和逆境信号途径的调节。蛋白互作预测发现多刺绿绒蒿14-3-3蛋白能够与HSF和ADF蛋白家族成员互作。本研究可为进一步从分子遗传学方面深入研究这些基因的详细功能和发挥功能的机制提供基础。
