以马铃薯、甘薯和木薯为代表的薯类作物是重要的粮食作物和工业原料,因其高产广适的特点,在国家粮食安全和国民经济发展中发挥了重要作用。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)通过对研究对象大规模数据的分析,能够...以马铃薯、甘薯和木薯为代表的薯类作物是重要的粮食作物和工业原料,因其高产广适的特点,在国家粮食安全和国民经济发展中发挥了重要作用。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)通过对研究对象大规模数据的分析,能够快速地建立遗传变异与表型之间的潜在联系,是正向遗传学挖掘基因的主要手段之一,已经广泛应用于主要农作物当中。薯类作物遗传背景相对复杂,其GWAS研究起步较晚,但是近些年发展迅速。研究人员通过GWAS研究了马铃薯、甘薯和木薯的抗病虫、耐逆、优质、高产等重要农艺性状,挖掘到了一些新的QTL、基因和有益的自然变异,这为薯类作物的分子设计育种打下了良好的基础。但是鉴于马铃薯、甘薯和木薯的倍性和生理特性,其GWAS又有着各自的特点。本研究从群体构建、群体结构分析、连锁不平衡的衰减分析、基因分型以及性状的选择和遗传位点的关联等多方面综述了马铃薯、甘薯和木薯的GWAS研究进展,比较了它们存在的差异和共同之处,以期为薯类作物的优异基因挖掘和遗传改良提供参考。展开更多
文摘以马铃薯、甘薯和木薯为代表的薯类作物是重要的粮食作物和工业原料,因其高产广适的特点,在国家粮食安全和国民经济发展中发挥了重要作用。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)通过对研究对象大规模数据的分析,能够快速地建立遗传变异与表型之间的潜在联系,是正向遗传学挖掘基因的主要手段之一,已经广泛应用于主要农作物当中。薯类作物遗传背景相对复杂,其GWAS研究起步较晚,但是近些年发展迅速。研究人员通过GWAS研究了马铃薯、甘薯和木薯的抗病虫、耐逆、优质、高产等重要农艺性状,挖掘到了一些新的QTL、基因和有益的自然变异,这为薯类作物的分子设计育种打下了良好的基础。但是鉴于马铃薯、甘薯和木薯的倍性和生理特性,其GWAS又有着各自的特点。本研究从群体构建、群体结构分析、连锁不平衡的衰减分析、基因分型以及性状的选择和遗传位点的关联等多方面综述了马铃薯、甘薯和木薯的GWAS研究进展,比较了它们存在的差异和共同之处,以期为薯类作物的优异基因挖掘和遗传改良提供参考。
