Platz(plant AT-rich protein and zinc-binding protein)转录因子是Zn2+依赖的富含A/T序列的转录因子,主要作为转录因子在胁迫应答过程和生长发育调控中发挥重要作用。为系统探究高粱Platz转录因子的生物学功能及其在胁迫应答中的作用...Platz(plant AT-rich protein and zinc-binding protein)转录因子是Zn2+依赖的富含A/T序列的转录因子,主要作为转录因子在胁迫应答过程和生长发育调控中发挥重要作用。为系统探究高粱Platz转录因子的生物学功能及其在胁迫应答中的作用,本研究应用生物信息与分子生物学技术,对高粱中Platz转录因子理化性质、蛋白质二级结构、亚细胞定位、基因结构、系统进化树、启动子区顺式作用元件、表达模式、蛋白互作以及DNA变异进行了分析。结果表明在高粱中鉴定出了17个platz基因,不均匀地分布在除SBI-02、SBI-03、SBI-05、SBI-09外的6条染色体上,编码蛋白均为不稳定亲水性蛋白,流动性较好;基因结构差异较大,其启动子区含有较多与脱落酸、茉莉酸甲酯相关的顺式作用元件,高粱platz基因家族可分为5个亚族;在不同发育时期高粱组织中的RNA表达模式存在差异,platz基因在苗期表达水平高;在种子发育过程中SbPlatz7表达最高,另外SbPlatz5、SbPlatz3、SbFl1a、SbFl1b、SbGl6a和SbGl6b也均有表达,干旱胁迫下叶片中SbRHT25/Platz16表达上调,低氮和丝黑穗病菌侵染均会诱导SbPlatz3和SbPlatz7表达上调。自然等位变异分析显示SbPlatz存在较多的移码突变和密码子插入。本研究为解析platz在高粱中的功能提供了新的思路,为进一步了解高粱platz基因家族的进化机制和功能特征提供了有价值的信息,为提高抗逆性分子育种提供了参考和基因资源。展开更多
文摘Platz(plant AT-rich protein and zinc-binding protein)转录因子是Zn2+依赖的富含A/T序列的转录因子,主要作为转录因子在胁迫应答过程和生长发育调控中发挥重要作用。为系统探究高粱Platz转录因子的生物学功能及其在胁迫应答中的作用,本研究应用生物信息与分子生物学技术,对高粱中Platz转录因子理化性质、蛋白质二级结构、亚细胞定位、基因结构、系统进化树、启动子区顺式作用元件、表达模式、蛋白互作以及DNA变异进行了分析。结果表明在高粱中鉴定出了17个platz基因,不均匀地分布在除SBI-02、SBI-03、SBI-05、SBI-09外的6条染色体上,编码蛋白均为不稳定亲水性蛋白,流动性较好;基因结构差异较大,其启动子区含有较多与脱落酸、茉莉酸甲酯相关的顺式作用元件,高粱platz基因家族可分为5个亚族;在不同发育时期高粱组织中的RNA表达模式存在差异,platz基因在苗期表达水平高;在种子发育过程中SbPlatz7表达最高,另外SbPlatz5、SbPlatz3、SbFl1a、SbFl1b、SbGl6a和SbGl6b也均有表达,干旱胁迫下叶片中SbRHT25/Platz16表达上调,低氮和丝黑穗病菌侵染均会诱导SbPlatz3和SbPlatz7表达上调。自然等位变异分析显示SbPlatz存在较多的移码突变和密码子插入。本研究为解析platz在高粱中的功能提供了新的思路,为进一步了解高粱platz基因家族的进化机制和功能特征提供了有价值的信息,为提高抗逆性分子育种提供了参考和基因资源。
