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湖南省南方水稻黑条矮缩病毒分离物组分S10编码的ORF序列克隆与分析 被引量：1
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作者 李兴华 凌晓曦 +2 位作者 张松柏 张德咏 刘勇 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期135-138,141,共5页
采用RT-PCR方法扩增并克隆了2013年湖南省水稻上发生的南方水稻黑条矮缩病毒（Southern rice blackstreaked dwarf virus,SRBSDV）S10片段的近全长序列,采用生物信息学软件Mega、RDP和DnaSP分析其编码的开放阅读框（open reading fragme... 采用RT-PCR方法扩增并克隆了2013年湖南省水稻上发生的南方水稻黑条矮缩病毒（Southern rice blackstreaked dwarf virus,SRBSDV）S10片段的近全长序列,采用生物信息学软件Mega、RDP和DnaSP分析其编码的开放阅读框（open reading fragment,ORF）遗传多样性。结果表明：2013年湖南省15个SRBSDV分离物S10编码的ORF序列同源性在99.5%以上,不同分离物中存在3~30个突变位点,绝大部分的核酸突变为无义突变,没有发现可能的重组。在系统发育树上,15个分离物聚类为2个分支,其中湖南汉寿的10个分离物和永州的2个分离物（HuNyz12和HuNyz29）与我国浙江分离物聚为1个亚组、湖南永州的其他3个分离物与我国南部的云南、海南等及越南的分离物聚为1个亚组。系统发育结果表明,SRBSDV随传毒介体白背飞虱迁飞从我国南部向北部扩散。 展开更多
关键词 南方水稻黑条矮缩病毒 湖南分离物 组分S10 克隆与分析
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