为探讨不同轮作模式对稻田土壤微生物的影响,设置水稻-小麦、水稻-油菜、水稻-绿肥、水稻-冬闲4个处理,于水稻收获后采集土壤样品,提取基因组DNA,构建文库,利用Illumina Mi Seq高通量测序技术研究土壤细菌和真菌的丰富度、多样性指数以...为探讨不同轮作模式对稻田土壤微生物的影响,设置水稻-小麦、水稻-油菜、水稻-绿肥、水稻-冬闲4个处理,于水稻收获后采集土壤样品,提取基因组DNA,构建文库,利用Illumina Mi Seq高通量测序技术研究土壤细菌和真菌的丰富度、多样性指数以及门和属水平上的群落结构变化。从12个土壤样品中共获得24 537个细菌OUT和5 882个真菌OTU,其中,变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、放线菌门、芽单胞菌门为土壤优势细菌门,子囊菌门和担子菌门为优势真菌门。从门的分类水平看,不同轮作模式土壤中细菌和真菌群落各门类组成的比例发生改变。属水平的分析结果也表明,不同轮作模式土壤中细菌前20个优势属的丰度和真菌前10优势属的丰度同样发生明显改变。不同轮作作物改变了土壤中有益微生物的比例,水稻-绿肥和水稻-冬闲处理有益微生物比例高于其他处理。随着轮作作物的改变,土壤生态系统中细菌和真菌群落的组成比例发生了变化。展开更多
[目的]利用黄芩药渣制备微生物菌剂,探究添加淡紫拟青霉发酵黄芩药渣(处理组,jd)与未添加淡紫拟青霉的黄芩药渣(对照组,ckj)的代谢差异,揭示淡紫拟青霉与黄芩药渣的互作发酵机制,为后续在大田中的推广应用提供理论依据。[方法]以未接种...[目的]利用黄芩药渣制备微生物菌剂,探究添加淡紫拟青霉发酵黄芩药渣(处理组,jd)与未添加淡紫拟青霉的黄芩药渣(对照组,ckj)的代谢差异,揭示淡紫拟青霉与黄芩药渣的互作发酵机制,为后续在大田中的推广应用提供理论依据。[方法]以未接种淡紫拟青霉菌株的黄芩药渣为对照,采用代谢组学技术分析淡紫拟青霉发酵黄芩药渣后的差异代谢产物和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集通路。[结果]对照组和处理组样本间的正负离子主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)均有良好区分,ckj和jd的代谢产物具有差异性,鉴定出429个上调代谢物和246个下调代谢物,KEGG代谢通路富集到29条差异显著的代谢通路。差异代谢产物主要为黄酮类、萜类、有机酸、生物碱、氨基酸和糖类,涉及到黄酮和黄酮醇生物合成,类黄酮生物合成,甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和色氨酸代谢,赖氨酸降解,苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸生物合成,半乳糖代谢,乙醛酸和二羧酸代谢及托烷、哌啶和吡啶生物碱的生物合成等8条差异富集通路。[结论]黄芩药渣经过淡紫拟青霉发酵后,萜类、有机酸、生物碱、氨基酸和糖类代谢物显著提高(P<0.05),这些物质为土壤养分含量的改善和植株免疫力的提高提供一定的营养基础。展开更多
文摘为探讨不同轮作模式对稻田土壤微生物的影响,设置水稻-小麦、水稻-油菜、水稻-绿肥、水稻-冬闲4个处理,于水稻收获后采集土壤样品,提取基因组DNA,构建文库,利用Illumina Mi Seq高通量测序技术研究土壤细菌和真菌的丰富度、多样性指数以及门和属水平上的群落结构变化。从12个土壤样品中共获得24 537个细菌OUT和5 882个真菌OTU,其中,变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、放线菌门、芽单胞菌门为土壤优势细菌门,子囊菌门和担子菌门为优势真菌门。从门的分类水平看,不同轮作模式土壤中细菌和真菌群落各门类组成的比例发生改变。属水平的分析结果也表明,不同轮作模式土壤中细菌前20个优势属的丰度和真菌前10优势属的丰度同样发生明显改变。不同轮作作物改变了土壤中有益微生物的比例,水稻-绿肥和水稻-冬闲处理有益微生物比例高于其他处理。随着轮作作物的改变,土壤生态系统中细菌和真菌群落的组成比例发生了变化。
文摘[目的]利用黄芩药渣制备微生物菌剂,探究添加淡紫拟青霉发酵黄芩药渣(处理组,jd)与未添加淡紫拟青霉的黄芩药渣(对照组,ckj)的代谢差异,揭示淡紫拟青霉与黄芩药渣的互作发酵机制,为后续在大田中的推广应用提供理论依据。[方法]以未接种淡紫拟青霉菌株的黄芩药渣为对照,采用代谢组学技术分析淡紫拟青霉发酵黄芩药渣后的差异代谢产物和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集通路。[结果]对照组和处理组样本间的正负离子主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)均有良好区分,ckj和jd的代谢产物具有差异性,鉴定出429个上调代谢物和246个下调代谢物,KEGG代谢通路富集到29条差异显著的代谢通路。差异代谢产物主要为黄酮类、萜类、有机酸、生物碱、氨基酸和糖类,涉及到黄酮和黄酮醇生物合成,类黄酮生物合成,甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和色氨酸代谢,赖氨酸降解,苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸生物合成,半乳糖代谢,乙醛酸和二羧酸代谢及托烷、哌啶和吡啶生物碱的生物合成等8条差异富集通路。[结论]黄芩药渣经过淡紫拟青霉发酵后,萜类、有机酸、生物碱、氨基酸和糖类代谢物显著提高(P<0.05),这些物质为土壤养分含量的改善和植株免疫力的提高提供一定的营养基础。
