目的:利用网络药理学方法和分子对接技术,分析“黄连-黄芩-黄柏”(简称“三黄”)治疗细菌性痢疾的潜在活性成分和作用机制,为后续的新药开发研究提供依据。方法:利用中药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacol...目的:利用网络药理学方法和分子对接技术,分析“黄连-黄芩-黄柏”(简称“三黄”)治疗细菌性痢疾的潜在活性成分和作用机制,为后续的新药开发研究提供依据。方法:利用中药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP)获取“三黄”的活性化合物及其潜在作用靶点,再从GeneCards、CTD、TTD和drugbank等数据库获取细菌性痢疾的疾病靶点,然后确定“三黄”治疗细菌性痢疾的潜在作用靶点,随后进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,以筛选出核心靶点,进而通过GO功能分析和KEGG通路富集分析筛选“三黄”治疗细菌性痢疾的生物过程和相关通路,最后通过分子对接处理分析受体与配体间的亲和力。结果:借助TCMSP,共从“三黄”中筛选出87个关键活性成分,而其对应的作用靶点有228个,而在相关数据库中获取到细菌性痢疾的疾病靶点共313个,通过比较分析得到交集靶点34个;通过PPI分析,又从34个交集靶点中筛选得到14个核心靶点;通过KEGG通路富集分析发现,有14条治疗细菌性痢疾的重要信号通路;利用Cytoscape软件,根据34个交集靶点和14条重要信号通路,筛选得到度值最大的前5个活性成分依次为槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱;而分子对接结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)和环氧合酶2(PTGS2)与槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱具有较好的亲和力(结合能<-5 kJ/mol)。结论:槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱可能是“三黄”治疗细菌性痢疾的主要潜在活性成分,而TNF、IL-6和PTGS2可能是其主要作用靶点。展开更多
文摘目的:利用网络药理学方法和分子对接技术,分析“黄连-黄芩-黄柏”(简称“三黄”)治疗细菌性痢疾的潜在活性成分和作用机制,为后续的新药开发研究提供依据。方法:利用中药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP)获取“三黄”的活性化合物及其潜在作用靶点,再从GeneCards、CTD、TTD和drugbank等数据库获取细菌性痢疾的疾病靶点,然后确定“三黄”治疗细菌性痢疾的潜在作用靶点,随后进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,以筛选出核心靶点,进而通过GO功能分析和KEGG通路富集分析筛选“三黄”治疗细菌性痢疾的生物过程和相关通路,最后通过分子对接处理分析受体与配体间的亲和力。结果:借助TCMSP,共从“三黄”中筛选出87个关键活性成分,而其对应的作用靶点有228个,而在相关数据库中获取到细菌性痢疾的疾病靶点共313个,通过比较分析得到交集靶点34个;通过PPI分析,又从34个交集靶点中筛选得到14个核心靶点;通过KEGG通路富集分析发现,有14条治疗细菌性痢疾的重要信号通路;利用Cytoscape软件,根据34个交集靶点和14条重要信号通路,筛选得到度值最大的前5个活性成分依次为槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱;而分子对接结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)和环氧合酶2(PTGS2)与槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱具有较好的亲和力(结合能<-5 kJ/mol)。结论:槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、β-谷甾醇、异延胡索单酚碱可能是“三黄”治疗细菌性痢疾的主要潜在活性成分,而TNF、IL-6和PTGS2可能是其主要作用靶点。
