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题名猪Ⅱ型圆环病毒豫A株的全基因组克隆与序列分析
被引量:14
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作者
曹胜波
陈焕春
肖少波
赵俊龙
吕建强
钱平
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机构
华中农业大学畜牧兽医学院病毒室
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出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第2期137-141,共5页
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基金
国家自然科学基金项目 (3 6170 70 1)
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文摘
参照国外发表的猪Ⅱ型圆环病毒 (porcinecircovirustype 2 ,PCV - 2 )全基因组序列 ,设计一对PCV - 2特异性引物 ,用该室分离的PCV - 2豫A株感染PK - 15细胞 ,从中提取PCV - 2复制型基因组DNA ,并以之为模板进行PCR扩增。回收PCR产物 ,构建重组测序质粒T -PCV - 2。测序结果表明 ,猪Ⅱ型圆环病毒豫A株的全基因组为 176 7bp ,与GenBank收录的PCV - 2国外分离株核苷酸的同源性可高达 97%。序列分析表明 ,复制型豫A株的基因组包含 10个读码框架 ,其中ORF1、ORF2是其两个最主要的读码框架 ,分别编码 314、2 34个氨基酸。豫A株和PCV - 1间的ORF1、ORF2的氨基酸序列同源性分别为 85 %、6 6 % ,与其它PCV - 2毒株间的ORF1氨基酸同源性均在 98%以上 ,而ORF2的氨基酸同源性为 92 %~ 97%。
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关键词
猪Ⅱ型圆环病毒豫A株
全基因组克隆
序列分析
PCV-2
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Keywords
porcine circovirus type 2(PCV-2)
genome
cloning
sequence analysis
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分类号
S858.285.3
[农业科学—临床兽医学]
R852.659.2
[医药卫生—航空、航天与航海医学]
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