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2009-2017年烟台地区甲型(H1N1)pdm09流感病毒神经氨酸酶基因进化分析
被引量:
7
1
作者
刘娟
高巧
+4 位作者
徐迎春
孙振璐
董兆静
徐小雯
宫连凤
《中华疾病控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1032-1036,共5页
目的分析2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒流行情况及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征。方法收集2009年8月~2017年8月烟台地区两家哨点医院流感样病例咽试子标本10 236份,狗肾细胞(Madin-Darby canine kidney cel...
目的分析2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒流行情况及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征。方法收集2009年8月~2017年8月烟台地区两家哨点医院流感样病例咽试子标本10 236份,狗肾细胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)分离流感病毒,血凝抑制实验进行病毒分型。选取甲型(H1N1) pdm09流感毒株43株,扩增NA基因全序列并测序,应用分子生物学软件分析其遗传变异特征。结果系统发生分析表明大部分烟台分离株属于2、7、6C、6B. 1和6B. 2基因型; NA蛋白分子多个氨基酸位点发生变异,与疫苗株相比,6、7基因型增加了44位糖基化位点; 6B. 1和6B. 2基因亚型,减少了386位糖基化位点;运用固定效应似然比模型和内部固定效应似然比模型发现34和386两个正向选择压力位点,NA蛋白酶活性中心位点及周围辅助位点均未发生变异。结论 2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒NA基因持续发生变异,仍对神经氨酸酶抑制剂敏感,未来仍应加强流感流行状况和病原基因特征监测。
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关键词
甲型(HlNl)pdm09
神经氨酸酶
耐药
基因进化
原文传递
题名
2009-2017年烟台地区甲型(H1N1)pdm09流感病毒神经氨酸酶基因进化分析
被引量:
7
1
作者
刘娟
高巧
徐迎春
孙振璐
董兆静
徐小雯
宫连凤
机构
烟台市疾病预防控制中心微生物检验科
出处
《中华疾病控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期1032-1036,共5页
文摘
目的分析2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒流行情况及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进化特征。方法收集2009年8月~2017年8月烟台地区两家哨点医院流感样病例咽试子标本10 236份,狗肾细胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)分离流感病毒,血凝抑制实验进行病毒分型。选取甲型(H1N1) pdm09流感毒株43株,扩增NA基因全序列并测序,应用分子生物学软件分析其遗传变异特征。结果系统发生分析表明大部分烟台分离株属于2、7、6C、6B. 1和6B. 2基因型; NA蛋白分子多个氨基酸位点发生变异,与疫苗株相比,6、7基因型增加了44位糖基化位点; 6B. 1和6B. 2基因亚型,减少了386位糖基化位点;运用固定效应似然比模型和内部固定效应似然比模型发现34和386两个正向选择压力位点,NA蛋白酶活性中心位点及周围辅助位点均未发生变异。结论 2009-2017年烟台地区甲型(H1N1) pdm09流感病毒NA基因持续发生变异,仍对神经氨酸酶抑制剂敏感,未来仍应加强流感流行状况和病原基因特征监测。
关键词
甲型(HlNl)pdm09
神经氨酸酶
耐药
基因进化
Keywords
Influenza A(H1N1) pdm09
Neuraminidase
Drug resistance
Gene evolution
分类号
R551.7 [医药卫生—血液循环系统疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2009-2017年烟台地区甲型(H1N1)pdm09流感病毒神经氨酸酶基因进化分析
刘娟
高巧
徐迎春
孙振璐
董兆静
徐小雯
宫连凤
《中华疾病控制杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
7
原文传递
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参考文献
引证文献
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