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上海市结核分枝杆菌利福平rpoB基因突变特征与耐药水平相关性的研究
1
作者 李静 张阳奕 +7 位作者 杨景卉 吴哲渊 李宁迪 郁晨蕾 王莉莉 沈旭辉 江渊 沈鑫 《中国防痨杂志》 北大核心 2026年第4期485-494,共10页
目的:了解上海市结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)利福平(rifampicin,RFP)rpoB基因突变特征,探索rpoB基因突变类型与利福平耐药水平的关联。方法:选取2020—2022年上海市新登记且培养阳性的肺结核患者菌株,采用简单随机抽... 目的:了解上海市结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)利福平(rifampicin,RFP)rpoB基因突变特征,探索rpoB基因突变类型与利福平耐药水平的关联。方法:选取2020—2022年上海市新登记且培养阳性的肺结核患者菌株,采用简单随机抽样法,对2766株MTB进行最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)法药物敏感性试验(简称“药敏试验”),排除重复及试验失败样本后2734株获得有效表型药敏试验结果。进一步从其中纳入462例肺结核患者(176例复治患者及286例初治患者)的菌株进行全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),排除12株不合格样本,最终450株MTB纳入RFP耐药基因突变分析。采用Wilcoxon秩和检验分析利福平rpoB基因突变特征与RFP耐药的相关性。结果:450株临床MTB菌株中,139株菌株(包括8株RFP敏感株、18株RFP低水平耐药株和113株RFP高水平耐药株)发生了RFP耐药基因突变,其中95.68%(133/139)的突变发生在利福平rpoB基因的耐药决定区(rifampin resistance-determining region,RRDR)。利福平rpoB基因突变主要位于450、445及435密码子,突变频率分别为60.43%(84/139)、21.58%(30/139)和7.91%(11/139)。Wilcoxon秩和检验结果显示,利福平rpoB基因突变中rpoB_p.Ser450Leu、rpoB_p.Ser450Trp、rpoB_p.His445Asp、rpoB_p.His445Tyr、rpoB_p.Asp435Gly、rpoB_p.Asp435Val、rpoB_p.Asp435Tyr和rpoB_p.Leu452Pro突变均与RFP耐药有显著相关性(P值均<0.05),其中rpoB_p.Ser450Leu、rpoB_p.Ser450Trp、rpoB_p.His445Asp、rpoB_p.His445Tyr和rpoB_p.Asp435Val突变株MIC值中位数均>16μg/ml,表现为高水平耐药;rpoB_p.Asp435Gly、rpoB_p.Asp435Tyr和rpoB_p.Leu452Pro突变株MIC值中位数分别为4μg/ml、1μg/ml和4μg/ml,表现为低水平耐药。在多重密码子突变的RFP耐药株中,70.59%(12/17)的rpoB RRDR突变同时伴有rpoA、rpoC补偿性突变或rpoB non-RRDR突变,所有多重密码子突变株均表现为高水平耐药(MIC>16μg/ml)。对450株MTB菌株的谱系分析结果显示以L2谱系为主,为占88.44%(398/450),L4谱系占10.90%(49/450),L1谱系最少仅0.44%(2/450),检出1株(0.22%)L2和L42种谱系混合株;在RFP耐药菌株中,L2谱系占比更高,92.09%(128/139),L4谱系占7.19%(10/139),未检出L1谱系耐药株。分析亚谱系分布发现,L2谱系以L2.2.1亚谱系为主(55.78%,251/450),而L4谱系则以L4.4.2和L4.5亚谱系为主,分别占4.00%(18/450)和3.56%(16/450)。结论:上海市MTB不同利福平rpoB基因突变类型可导致RFP耐药水平不同。rpoB_p.Ser450Leu、rpoB_p.Ser450Trp、rpoB_p.His445Asp、rpoB_p.His445Tyr和rpoB_p.Asp435Val突变类型均与RFP高水平耐药相关;rpoB_p.Asp435Gly、rpoB_p.Asp435Tyr和rpoB_p.Leu452Pro突变类型均与RFP低水平耐药相关;多重密码子突变尤其携带补偿性突变可能协同增强RFP耐药水平。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 利福平 突变 基因组 微生物敏感性试验
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基于全基因组测序的青海省结核分枝杆菌耐药基因突变特征分析
2
作者 王朝才 钱骏 +4 位作者 刘巧 徐莉立 蒋明霞 晁秀珍 刘燕 《中国热带医学》 北大核心 2026年第3期350-358,共9页
目的揭示青海省结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)的群体结构、耐药特征及传播动态,为该地区高负担结核病精准防控提供分子流行病学依据。方法纳入2015—2024年间青海省194例结核病患者临床分离菌株,采用全基因组测序(whole... 目的揭示青海省结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)的群体结构、耐药特征及传播动态,为该地区高负担结核病精准防控提供分子流行病学依据。方法纳入2015—2024年间青海省194例结核病患者临床分离菌株,采用全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术,通过核心基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分析,对菌株进行谱系分型、耐药基因突变检测,并构建系统发育树以评估遗传聚类和近期传播事件。结果青海省Mtb菌株总体耐药率为30.4%(59/194),其中单耐药、耐多药(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)和准广泛耐药(pre-extensively drug-resistant tuberculosis,Pre-XDR-TB)分别占21.6%、4.1%和0.5%,以链霉素耐药率最高(15.5%)。群体遗传结构分析显示,谱系2(L2)是绝对优势谱系(83.2%,159/191),其中L2.2.1亚谱系最为流行(66.5%)。WGS检测出启动子区突变、非同义突变(氨基酸改变)和同义突变(核苷酸改变),以rpsL、katG和rpoB基因突变为主。WGS耐药突变检测结果与临床治疗结局显著相关(P<0.05)。基于SNP遗传距离≤12的遗传聚类分析识别出16个传播簇,涵盖57株菌株,总聚类率为29.4%。多因素分析表明,Pre-XDR-TB菌株较敏感菌株更易形成传播簇(P<0.05),且2015—2017年的分离株成簇率显著高于2023—2024年。结论青海省Mtb流行以L2谱系克隆传播为主导,患者对常用抗结核药物耐药性高,突变类型多样。需重点关注菌株的近期传播特征,为制定“簇水平干预”精准防控策略提供依据。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 全基因组测序 耐药 基因聚类 进化树
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基于全基因组测序的20株皮疽诺卡菌β-内酰胺类药物耐药基因分析
3
作者 王璇 马瑜浩 +9 位作者 苏果 刘晓娜 孙丽君 张哲 孙倩 张琳 轩芸 李玉静 郑立恒 柳晓金 《中国热带医学》 北大核心 2026年第3期401-407,共7页
目的基于全基因组测序技术,解析皮疽诺卡菌对β-内酰胺类药物(头孢曲松、亚胺培南)耐药基因特征,探讨其耐药机制,为临床皮疽诺卡菌感染的精准用药提供依据。方法收集2018年10月—2024年12月河北医科大学第二医院、河北省胸科医院、北京... 目的基于全基因组测序技术,解析皮疽诺卡菌对β-内酰胺类药物(头孢曲松、亚胺培南)耐药基因特征,探讨其耐药机制,为临床皮疽诺卡菌感染的精准用药提供依据。方法收集2018年10月—2024年12月河北医科大学第二医院、河北省胸科医院、北京胸科医院临床分离的诺卡菌菌株,经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱及16S rRNA基因测序鉴定至种水平以筛选皮疽诺卡菌;采用微量肉汤稀释法进行头孢曲松、亚胺培南药敏试验,并分为耐药组与敏感组;对20株耐药菌株进行全基因组测序,通过SMRT Link v5.0.1软件组装基因组,利用GeneMarkS、Repeat Masker、tRNAscan-SE等工具分析基因组特征,结合ARDB、CARD等耐药数据库鉴定耐药基因,并通过PCR验证耐药基因的准确性。结果共分离鉴定诺卡菌菌株105株,其中皮疽诺卡菌58株(占比55.2%),主要来源于下呼吸道标本(82.8%,48/58)。药敏试验结果显示,58株皮疽诺卡菌对头孢曲松耐药率为65.5%(38/58),对亚胺培南耐药率为41.4%(24/58),最终筛选20株对2种药物均耐药的菌株用于测序。测序结果显示,基因组N50均值为125.6 kb,平均测序深度为50.2×,共预测编码基因均值为6320个,重复序列占比均值为3.2%,鉴定出ncRNA(tRNA、rRNA、sRNA)均值为128个,基因岛均值为18个。耐药基因分析显示,所有20株耐药菌株携带bla_(FAR-1)基因(编码A类β-内酰胺酶),18株携带RbpA、MtrA、vanR-O基因簇;PCR验证显示,bla_(FAR-1)基因与头孢曲松耐药表型符合率为100.00%(20/20),RbpA/MtrA/vanR-O基因簇与亚胺培南耐药表型符合率为90.00%(18/20)。结论皮疽诺卡菌对头孢曲松、亚胺培南耐药率较高,bla_(FAR-1)基因是其对头孢曲松耐药的关键基因,RbpA/MtrA/vanR-O基因簇可能参与亚胺培南耐药机制;全基因组测序可有效解析皮疽诺卡菌耐药基因特征,为临床精准选择β-内酰胺类药物提供分子依据。 展开更多
关键词 诺卡菌属(皮疽诺卡菌) Β-内酰胺酶 全基因组测序 亚胺培南 头孢曲松 细菌耐药
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严重多发伤患者早期救治感染病原谱构成及其对临床预后影响研究
4
作者 丁剑锋 薛建华 秦军 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第3期389-393,共5页
目的探究严重多发伤患者早期救治阶段感染病原谱的构成特征,明确主要致病菌的药敏特点及影响患者临床预后的关键因素。方法采用回顾性队列研究设计,选取2022年5月至2025年5月本院急诊科及创伤中心收治的182例严重多发伤患者。根据受伤... 目的探究严重多发伤患者早期救治阶段感染病原谱的构成特征,明确主要致病菌的药敏特点及影响患者临床预后的关键因素。方法采用回顾性队列研究设计,选取2022年5月至2025年5月本院急诊科及创伤中心收治的182例严重多发伤患者。根据受伤后7d内是否发生感染分为118例感染组与64非感染组,采集感染患者痰液、血液等标本进行病原学培养与鉴定,采用纸片扩散法或微量肉汤稀释法开展药敏试验,单因素分析筛选预后相关因素后纳入多因素Logistic回归模型分析独立危险因素。结果182例患者早期感染发生率为64.83%(118/182);感染患者的年龄、ISS评分、机械通气时间及住院时间均显著高于非感染患者(P<0.05)。在118例感染患者中,共检出病原菌179株,其中革兰阴性菌116株(64.80%),革兰阳性菌52株(29.05%),真菌11株(6.15%),全部为念珠菌属。药敏结果显示,鲍曼不动杆菌仅对替加环素、多黏菌素B敏感率>60%,铜绿假单胞菌对哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦敏感率>70%,亚胺培南、美罗培南对肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌敏感率>85%;万古霉素、利奈唑胺对所有革兰阳性菌敏感率>90%。多因素Logistic回归分析显示,多重耐药菌感染(OR=3.185,95%CI:1.762~5.753,P<0.01)、ISS评分≥25分(OR=2.471,95%CI:1.328~4.598,P<0.01)、感染发生时间≤3d(OR=1.987,95%CI:1.054~3.746,P 0.05)是影响预后的独立危险因素。179株病原菌中多重耐药菌58株(32.40%),多重耐药菌感染组28d病死率(34.48%)明显高于非多重耐药菌感染组(15.22%),差异有统计学意义(χ^(2)=8.320,P<0.01)。结论严重多发伤患者早期感染发生率高,病原谱以革兰阴性菌为主,耐药形势严峻;且多重耐药菌感染、高损伤严重程度评分及伤后极早期感染是导致患者不良预后的关键危险因素,临床需针对性加强早期感染监测与病原学检测,合理选用抗菌药物并强化高风险患者干预,以降低感染危害、改善预后。 展开更多
关键词 严重多发伤 早期救治 感染 病原谱 预后 回顾性研究
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宏基因组纳米孔测序在结核浆液性积液诊断及合并感染筛查中的应用价值
5
作者 朱庆东 赵春艳 +5 位作者 黄雪雯 黄爱春 曾春梅 许超艳 兰艳群 宋畅 《中国防痨杂志》 北大核心 2026年第3期335-341,共7页
目的:探究宏基因组纳米孔测序(简称“纳米孔测序”)技术在结核浆液性积液诊断中的应用价值,并评估其在快速、精准鉴定结核分枝杆菌及筛查合并感染病原体方面的优势。方法:纳入2021年10月至2025年5月在南宁市第四人民医院就诊的疑似结核... 目的:探究宏基因组纳米孔测序(简称“纳米孔测序”)技术在结核浆液性积液诊断中的应用价值,并评估其在快速、精准鉴定结核分枝杆菌及筛查合并感染病原体方面的优势。方法:纳入2021年10月至2025年5月在南宁市第四人民医院就诊的疑似结核浆液性积液患者,采集其积液样本进行纳米孔测序,以最终临床诊断结果为参考标准,与传统检测方法(包括抗酸染色、TB-DNA检测、GeneXpert MTB/RIF和分枝杆菌固体培养)进行对比分析。结果:纳米孔测序技术的敏感度(73.1%,19/26)、特异度(100.0%,27/27)、阳性预测值(100.0%,19/19)、阴性预测值(79.4%,27/34)、Kappa值(0.734)的总体诊断效能优于抗酸染色[敏感度为11.5%(3/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为3/3、阴性预测值为54.0%(27/50)、Kappa值为0.117]、培养[敏感度为30.8%(8/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为8/8、阴性预测值为60.0%(27/45)、Kappa值为0.312]、TB-DNA检测[敏感度为34.6%(9/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为9/9、阴性预测值为61.4%(27/44)、Kappa值为0.350]、GeneXpert MTB/RIF[敏感度为34.6%(9/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为9/9、阴性预测值为61.4%(27/44)、Kappa值为0.350]、结核抗体检测[敏感度为46.2%(12/26)、特异度为81.5%(22/27)、阳性预测值为70.6%(12/17)、阴性预测值为61.1%(22/36)、Kappa值为0.278]。纳米孔测序技术还显示,结核病患者合并非结核分枝杆菌、病毒、真菌、细菌感染等的比例(42.1%,8/19)较高。结论:纳米孔测序技术在结核浆液性积液的诊断中展现出优异的性能,其诊断效能优于传统病原学检测方法,能够有效提高结核病的早期诊断率,并为合并感染的筛查提供新的解决方案。 展开更多
关键词 纳米技术 结核 心包积液 胸腔积液 敏感性与特异性
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跟骨骨折术后切口感染的病原菌耐药性及感染因素分析
6
作者 姜洪涛 薛鑫鑫 +3 位作者 聂明洋 王佳宁 王丽颖 李小东 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第1期13-16,共4页
目的探讨跟骨骨折术后切口感染的病原菌分布、耐药性、炎性反应指标变化及相关原因。方法选取2019年6月~2024年7月于本院行手术治疗的跟骨骨折患者796例作为研究对象,根据术后是否出现切口感染分为感染组(n=56)和非感染组(n=740),观察... 目的探讨跟骨骨折术后切口感染的病原菌分布、耐药性、炎性反应指标变化及相关原因。方法选取2019年6月~2024年7月于本院行手术治疗的跟骨骨折患者796例作为研究对象,根据术后是否出现切口感染分为感染组(n=56)和非感染组(n=740),观察病原菌分布特征和耐药率;采用Logistic回归分析影响跟骨骨折患者术后切口感染的危险因素。结果796例跟骨骨折患者术后经病原菌检出切口感染56例,分离出病原菌共83株,其中革兰阳性菌、革兰阴性菌、真菌分别为34株(40.96%)、46株(55.42%)、4株(4.82%)。药敏结果显示,金黄色葡萄球菌对青霉素耐药率(81.25%)最高,其次为红霉素(68.75%)、左氧氟沙星(56.25%);表皮葡萄球菌对青霉素耐药率(92.86%)最高,其次为红霉素(64.29%)、复方新诺明(50.00%);大肠埃希菌对氨苄西林耐药率(100.00%)最高,其次为头孢唑啉(86.36%);阴沟肠杆菌对头孢唑啉耐药率(100.00%)最高,其次氨苄西林为(93.33%)。感染组的糖尿病史、术后引流管未放置占比和手术时间、IL-2、CRP、PCT水平均高于非感染组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,糖尿病史、术后未放置引流管及IL-2、CRP、PCT水平升高是影响跟骨骨折患者术后切口感染的独立危险因素(P<0.05)。结论跟骨骨折术后切口感染以金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌等病原菌多见,并对青霉素、红霉素、复方新诺明、氨苄西林、头孢唑啉等抗菌药物具有较高的耐药性;且糖尿病史、术后未放置引流管及IL-2、CRP、PCT水平升高是影响术后继发切口感染的危险因素,临床应提高警惕。 展开更多
关键词 跟骨骨折 切口感染 病原菌 耐药性 炎性反应
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人工智能在临床微生物检测中的应用进展
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作者 李惠 宋珍 +1 位作者 赵亚楠 李敏 《四川大学学报(医学版)》 北大核心 2026年第2期313-318,共6页
传统微生物检测技术在检测速度、灵敏度和特异性等方面存在固有局限,已难以应对日益增长的临床需求。近年来,人工智能(artificial intelligence,AI)正加速融入临床微生物检测领域,多项研究证实其在提升病原体识别、预测抗菌药物敏感性... 传统微生物检测技术在检测速度、灵敏度和特异性等方面存在固有局限,已难以应对日益增长的临床需求。近年来,人工智能(artificial intelligence,AI)正加速融入临床微生物检测领域,多项研究证实其在提升病原体识别、预测抗菌药物敏感性以及推动实验室自动化方面展现出巨大潜力。本文系统回顾了经典AI算法及其在该领域的最新应用进展。在视觉数据应用方面,基于深度学习的模型被用于显微镜图像和菌落形态的自动化分析,显著提高了识别效率与判读准确性。在非视觉数据领域,AI在基因组学、转录组学及宏基因组学等多组学数据的解析中取得了突破性进展,广泛应用于病原体的快速鉴定和抗生素耐药性的预测。尽管AI应用前景广阔,但目前在临床微生物检测中的应用仍处于从科研探索向临床转化的初期阶段。本文进一步探讨了AI技术转化过程中面临的关键挑战与机遇,旨在帮助临床专业人员全面了解AI在该领域的发展现状、未来趋势及其潜在影响,以推动其向可靠、可推广的常规检测方法迈进。 展开更多
关键词 人工智能 机器学习 临床微生物检测 抗生素耐药性 综述
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胃癌患者免疫治疗相关血流感染的病原谱分布及其影响因素调查
8
作者 宋磊 赵琴 刘瑞 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第2期216-221,共6页
目的探讨胃癌患者免疫治疗相关血流感染(bloodstream infection,BSI)的病原谱分布及其影响因素,为临床感染防控及经验性抗菌药物选择提供循证依据。方法回顾性分析2024年本院收治并经病理确诊的胃癌患者120例,其中接受免疫治疗者62例(... 目的探讨胃癌患者免疫治疗相关血流感染(bloodstream infection,BSI)的病原谱分布及其影响因素,为临床感染防控及经验性抗菌药物选择提供循证依据。方法回顾性分析2024年本院收治并经病理确诊的胃癌患者120例,其中接受免疫治疗者62例(免疫治疗组),未接受者58例(对照组)。依据美国疾病控制与预防中心(CDC/NHSN 2023版)标准判定实验室确证BSI事件。收集患者一般资料、基础疾病、治疗方案、导管留置情况、抗菌药物及激素使用史、实验室指标等临床信息。血标本经MALDI-TOF质谱(VITEK MS)鉴定病原体,药敏试验依据CLSI M100(2024版)标准判定。组间比较采用χ^(2)检验、t检验及非参数检验;经LASSO回归筛选后纳入多因素Logistic回归模型,计算校正比值比(adjusted odds ratio,aOR)及95%置信区间(CI)。结果共确诊BSI病例24例(总发生率20.00%),其中免疫治疗组16例(25.81%),对照组8例(13.79%),差异有统计学意义(P=0.045)。共分离病原菌24株,其中革兰阴性菌15株(62.50%)、革兰阳性菌7株(29.17%)、真菌2株(8.33%)。主要病原为大肠埃希菌7株(29.17%)、鲍曼不动杆菌3株(12.50%)、铜绿假单胞菌3株(12.50%)、金黄色葡萄球菌3株(12.50%)、凝固酶阴性葡萄球菌2株(8.33%)及白假丝酵母2株(8.33%)。ESBL阳性率为35.71%,CRE检出率15.00%,MRSA检出率30.00%,VRE检出率22.22%,真菌氟康唑耐药率12.50%。免疫治疗组中鲍曼不动杆菌(18.75%vs.6.25%,P=0.042)及真菌(12.50%vs.4.17%,P=0.048)检出率显著升高。多因素Logistic回归分析显示,导管在位时间≥14 d(β=0.82,SE=0.33,Waldχ^(2)=6.11,aOR=2.27,95%CI:1.13~4.56,P=0.017)、既往广谱抗菌药物使用>7 d(β=0.86,SE=0.38,Waldχ^(2)=4.97,aOR=2.36,95%CI:1.09~5.12,P=0.028)及激素治疗≥10 d(β=0.63,SE=0.31,Waldχ^(2)=4.10,aOR=1.88,95%CI:1.01~3.59,P=0.042)为独立危险因素。模型拟合优度良好(AUC=0.809,Hosmer-Lemeshow检验P=0.658)。感染患者28 d病死率为12.50%(3/24),免疫治疗组显著高于对照组(15.63%vs.8.33%,P=0.049)。结论胃癌患者在免疫治疗期间血流感染发生率较高,病原谱以革兰阴性菌为主,其中鲍曼不动杆菌及真菌感染比例升高,耐药菌检出率居高不下。导管长期留置、广谱抗菌药物及激素使用是BSI发生的独立危险因素。临床应加强免疫治疗患者感染风险评估,规范导管管理与抗菌药物应用,以降低感染相关不良结局。 展开更多
关键词 胃癌 免疫治疗 血流感染 病原谱 耐药性
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产褥期链球菌感染病原菌特点及感染影响因素调查
9
作者 孙兰云 茆亚东 +1 位作者 朱巧谋 李晓晨 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第4期518-522,共5页
目的探讨产褥期链球菌感染的临床特征、病原菌分布特点及其耐药性,并分析产褥期链球菌感染的独立危险因素。方法本研究采用回顾性病例对照研究设计,纳入2022年12月至2024年12月期间在本院确诊为产褥期链球菌感染的120例患者作为病例组,... 目的探讨产褥期链球菌感染的临床特征、病原菌分布特点及其耐药性,并分析产褥期链球菌感染的独立危险因素。方法本研究采用回顾性病例对照研究设计,纳入2022年12月至2024年12月期间在本院确诊为产褥期链球菌感染的120例患者作为病例组,并纳入同一时期未发生感染的120例产妇作为正常对照组。所有数据均通过医院电子病例管理系统中提取。描述性统计分析患者的临床表现、实验室检查结果及治疗方案。使用多因素Logistic回归模型评估产褥期链球菌感染的独立危险因素。结果共纳入120例产褥期链球菌感染患者与120例正常对照组。病例组患者临床表现以发热(85%)、腹痛(60%)和伤口感染(45%)为主。链球菌分布以B组链球菌(GBS)为主,占60%,其次为A组链球菌(GAS),占25%。耐药性分析显示,链球菌对青霉素敏感性较高(95%),但对红霉素和克林霉素的耐药性分别为20%和12.5%。多因素Logistic回归分析结果显示,患者剖宫产史(OR=1.91,95%CI:1.06-3.43,P=0.031)、糖尿病史(OR=2.35,95%CI:1.12-4.97,P=0.025)和胎膜早破(OR=2.24,95%CI:1.15-4.35,P=0.018)被确认为GBS感染的独立危险因素。此外,产次与GBS感染呈负相关(OR=0.52,95%CI:0.30-0.91,P=0.023),表明经产妇的感染风险较低。结论产褥期链球菌感染以GBS为主,临床表现多样,抗生素耐药性问题日益突出。青霉素仍为首选治疗药物,但需关注红霉素和克林霉素的耐药性。本研究患者的剖宫产史、糖尿病史、产次和胎膜早破是GBS感染的重要危险因素,提示在这些高危人群中需加强产前筛查和合理使用抗生素,以减少感染发生并提高治疗效果。 展开更多
关键词 产褥期感染 链球菌 临床特征 病原菌分布 耐药性
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山西省某医院纹带棒杆菌感染的耐药性及基因分析
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作者 李霞 侯辰蕊 +1 位作者 李玉串 姚红 《中国热带医学》 北大核心 2026年第1期107-111,共5页
目的分析山西白求恩医院分离纹带棒杆菌临床菌株的流行病学和分子生物学特点,为临床抗感染治疗提供参考。方法收集山西白求恩医院2021年2月—2023年12月纹带棒杆菌感染患者中分离的纹带棒杆菌菌株,进行抗菌药物敏感性试验,并对血流感染... 目的分析山西白求恩医院分离纹带棒杆菌临床菌株的流行病学和分子生物学特点,为临床抗感染治疗提供参考。方法收集山西白求恩医院2021年2月—2023年12月纹带棒杆菌感染患者中分离的纹带棒杆菌菌株,进行抗菌药物敏感性试验,并对血流感染菌株进行二代测序并分析。结果共收集分离自临床标本的纹带棒杆菌487株,感染部位以肺部为主,共408例(占83.78%),神经科患者占比最高,共266例(占54.62%),抗菌药物敏感性试验结果显示所有菌株均对青霉素、美罗培南、头孢曲松和环丙沙星具有耐药性,对万古霉素和利奈唑胺保持敏感。部分分离株对四环素、克林霉素、庆大霉素和红霉素具有一定敏感性,敏感率分别为34.50%、7.19%、36.34%和16.43%。12株血流感染菌株二代测序及基因组分析,共鉴定出11种抗菌药物耐药基因,所有菌株均携带耐药基因ermX,10株菌株同时携带5种以上耐药基因,并且在菌株中检测到spa和srt毒力基因。进化分析显示,12株纹带棒杆菌的序列类型(se⁃quence types,ST)呈现多样性,但部分菌株在不同科室中检测到相同的ST。结论纹带棒杆菌感染菌均为多重耐药菌,万古霉素及利奈唑胺仍具有较好的抗菌活性,基因组分析携带多种耐药基因。进一步加强纹带棒杆菌感染的筛检与控制措施,对于预防感染传播和优化抗感染治疗至关重要。 展开更多
关键词 纹带棒杆菌 耐药性 耐药基因 二代测序 基因组
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基于全基因组测序的大肠埃希菌配对分离株分子特征分析
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作者 郑礼杰 钱费楠 +3 位作者 许金凤 姚淳 刘海冰 杜鸿 《临床检验杂志》 2026年第2期143-148,共6页
目的回顾性分析13对26株大肠埃希菌的分子特征改变。方法选取2021年6—12月期间江苏大学附属人民医院13例长期住院患者,将每例患者同一病程内前后分离的2株大肠埃希菌进行配对,采用全基因组二代测序及生物信息学方法对菌株的多位点序列... 目的回顾性分析13对26株大肠埃希菌的分子特征改变。方法选取2021年6—12月期间江苏大学附属人民医院13例长期住院患者,将每例患者同一病程内前后分离的2株大肠埃希菌进行配对,采用全基因组二代测序及生物信息学方法对菌株的多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、耐药基因及毒力基因等分子特征进行分析。结果4对(4/13,30.7%)大肠埃希菌发生了ST型的改变,且ST与cgMLST分型的改变符合率100%一致;7对(7/13,53.8%)大肠埃希菌的耐药基因发生改变,主要涉及氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、β-内酰胺类耐药基因;7对(7/13,53.8%)的毒力基因发生改变。结论短期内同一患者前后分离自相同或不同感染部位的大肠埃希菌的分子分型、耐药基因和毒力基因显示出动态变化,应加强监测,为精准诊疗提供依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 全基因组测序 序列分型 耐药基因 毒力基因
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大连市2023年7株百日咳鲍特菌临床分离株全基因特征分析
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作者 侯君 郎兴莹 +2 位作者 陈玉凤 周林 栾明春 《华南预防医学》 2026年第1期74-78,共5页
目的 研究大连市2023年分离的的7株百日咳鲍特菌的全基因组序列特征以及对大环内酯类抗生素的敏感性,为防控百日咳提供科学依据。方法 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和荧光定量PCR技术鉴定菌株。应用全基因组测序... 目的 研究大连市2023年分离的的7株百日咳鲍特菌的全基因组序列特征以及对大环内酯类抗生素的敏感性,为防控百日咳提供科学依据。方法 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和荧光定量PCR技术鉴定菌株。应用全基因组测序和E-test法分别测定基因组序列和对大环内酯类抗生素的敏感性。通过BLASTn比对分析主要毒力基因、疫苗相关基因及23S rRNA基因突变,并进行多位点序列分型(MLST)。利用IQ-TREE软件,将分离株与来自NCBI和NMDC数据库的97株国内外菌株(含疫苗株CS、标准株Tohama I)构建系统进化树。结果 7株临床分离株均对红霉素、阿奇霉素和克拉霉素表现为耐药,且其23S rRNA基因均携带A2047G突变。所有菌株均为ptxA1/ptxC2/ptxP3/prn2/fhaB1/fim2-1/fim3A*/tcfA-2/cyaA-2/vag8-2/opmQ-2/brkA-1/bapC-1型别,MLST分型为ST2型。与疫苗株CS相比,分离株在ptxA、ptxC、ptxP、prn及fim3这5个毒力基因的等位基因型上存在差异。系统进化分析显示,7株分离株亲缘关系相近,形成一独立进化分支;与疫苗株CS和标准株Tohama I遗传距离较远。结论 2023年大连地区百日咳鲍特菌临床分离株呈现出对大环内酯类抗生素高水平耐药,疫苗相关基因显著变异,以及由ptxP3基因型所预示的毒力增强等多重特征。未来应加强相关监测,为百日咳防控及新型疫苗开发提供更多理论支撑。 展开更多
关键词 百日咳鲍特菌 全基因组测序 序列特征 大环内酯耐药性
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贵州省14株猪链球菌毒力基因及脉冲场凝胶电泳分型研究
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作者 马青 彭添碧 +3 位作者 刘英 王月 韦小瑜 李世军 《国际检验医学杂志》 2026年第6期674-677,682,共5页
目的 了解贵州省2010-2020年猪链球菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)带型分布和分子流行病学特征。方法 采用PCR实验技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对14株猪链球菌(猪源4株,人源10株)进行毒力基因检测和PFGE分子分型分析。结果 所有菌株毒力基因sl... 目的 了解贵州省2010-2020年猪链球菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)带型分布和分子流行病学特征。方法 采用PCR实验技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对14株猪链球菌(猪源4株,人源10株)进行毒力基因检测和PFGE分子分型分析。结果 所有菌株毒力基因sly和epf基因检出率为100.0%,而在10株猪链球菌中未检出mrp基因。PFGE结果显示,14株菌经SmaⅠ酶酶切后产生9~10条DNA条带,聚类分析显示14株猪链球菌呈现出9种PFGE带型,菌株间的相似度在74.5%~100.0%;2013年与2016年的菌株PFGE带型相同,其他各年的菌株PFGE带型均不相同;丹寨县一株菌株与兴义市菌株PFGE带型相同,其余各地区PFGE带型均各不相同。结论 贵州省猪链球菌优势毒力基因型为mrp-sly+epf+。贵州省猪链球菌基因组DNA呈多样性,暂未发现PFGE带型分布与菌株分离的时间、地域和致病血清型有明显相关性。 展开更多
关键词 猪链球菌 脉冲场凝胶电泳 毒力基因 分子分型
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腰大肌脓肿的病原学特征分析
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作者 唐恺 兰汀隆 +4 位作者 范俊 王恒 李永超 朱乾坤 董伟杰 《北京医学》 2026年第1期14-20,共7页
目的分析腰大肌脓肿(psoas abscess,PA)的病原学特征。方法选取2021年1月至2023年11月首都医科大学附属北京胸科医院骨科的PA患者42例,均经CT引导穿刺获取脓液,并行常规细菌培养、固体罗氏培养、结核分枝杆菌/利福平耐药基因检测(GeneXp... 目的分析腰大肌脓肿(psoas abscess,PA)的病原学特征。方法选取2021年1月至2023年11月首都医科大学附属北京胸科医院骨科的PA患者42例,均经CT引导穿刺获取脓液,并行常规细菌培养、固体罗氏培养、结核分枝杆菌/利福平耐药基因检测(GeneXpert Mycobacterium tuberculosis/resistance to rifampicin,GeneXpert)或宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)检测,根据病原学结果将患者分为结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染组与化脓性感染组,收集患者一般资料和临床资料,比较2组患者临床特征和病原学,以及不同检测方法的阳性率。结果42例患者中,男21例、女21例;年龄23~81岁,平均(59.0±16.4)岁;MTB感染19例(45.2%),化脓性感染23例(54.8%);病变部位以腰椎为主,占83.3%。与MTB感染组相比,化脓性感染组患者合并高血压的比例(56.5%比15.8%)和病变部位为腰椎的比例(95.7%比68.4%)更高,差异均有统计学意义(P<0.05)。在MTB组中,GeneXpert检出率为100.0%(19/19),高于固体罗氏培养的73.7%(14/19)。在化脓性感染组中,mNGS检出率为82.6%(19/23),高于细菌培养的56.5%(13/23);mNGS额外检出3例布鲁氏菌及1例混合感染(大肠埃希菌与布鲁氏菌)。病原谱显示,除MTB外,以金黄色葡萄球菌(6例,含2例耐甲氧西林金黄色葡萄球菌)和大肠埃希菌(5例)最常见。结论mNGS对化脓性感染,尤其是对培养困难或特殊病原体(如布鲁氏菌)的检测具有优势;GeneXpert对MTB检测高度敏感,是快速诊断的关键。本地区PA病原谱呈多样性,化脓性感染比例略高于结核感染。临床诊断需结合流行病学、影像学及多种检测技术,mNGS可作为传统细菌培养的有效补充,助力病因明确与精准治疗。 展开更多
关键词 腰大肌脓肿 诊断 宏基因组二代测序 结核分枝杆菌 细菌 真菌
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2016—2024年我院性病门诊患者1142例解脲支原体、沙眼衣原体及淋病奈瑟球菌的感染特征分析
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作者 林美丽 陈伟 王华斌 《中国乡村医药》 2026年第6期66-68,共3页
目的了解该院性病门诊患者解脲支原体、沙眼衣原体及淋病奈瑟球菌的感染情况及人群特征,为防治工作提供参考。方法收集该院性病门诊2016年1月1日至2024年10月11日疑似泌尿生殖道感染的就诊者1142例临床资料,统计分析患者所采集标本中解... 目的了解该院性病门诊患者解脲支原体、沙眼衣原体及淋病奈瑟球菌的感染情况及人群特征,为防治工作提供参考。方法收集该院性病门诊2016年1月1日至2024年10月11日疑似泌尿生殖道感染的就诊者1142例临床资料,统计分析患者所采集标本中解脲支原体、沙眼衣原体及淋病奈瑟球菌的核酸检测结果,并对阳性病例的流行病学和临床资料进行回顾性分析。结果1142例就诊者解脲支原体、沙眼衣原体及淋病奈瑟球菌病原体阳性检出率分别为35.2%(402/1142)、13.2%(151/1142)和9.6%(110/1142),其中女性解脲支原体、沙眼衣原体阳性率(65.2%,167/256;20.3%,52/256),显著高于男性(26.5%,235/886;11.2%,99/886);而淋病奈瑟球菌阳性检出率显示无明显性别差异。1142例就诊者3种病原体的混合感染总体阳性率为9.2%(105/1142),男性和女性混合感染阳性率分别为6.2%(55/886)和19.5%(50/256)。总体上以“解脲支原体+沙眼衣原体”为主(4.1%),女性以“解脲支原体+沙眼衣原体”为主,而男性患者以“沙眼衣原体+淋病奈瑟球菌”为主。1142例就诊者中15~20岁者相对最少(8.0%,91/1142),但其解脲支原体、沙眼衣原体和淋病奈瑟球菌病原体的阳性检出率均为最高(48.8%、22.2%、34.4%)。随着年龄增加,解脲支原体和沙眼衣原体的阳性检出率整体呈降低趋势。结论该院性病门诊患者解脲支原体、沙眼衣原体及淋病奈瑟球菌病原体检出率较高,15~20岁年龄段就诊者的三种病原体的检出率均最高,应引起重视。 展开更多
关键词 解脲支原体 沙眼衣原体 淋病奈瑟球菌 检出率 性传播疾病 流行病学 感染特征
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FMEA结合RCA在多重耐药菌医院感染防控中的应用研究
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作者 刘燕 于晓强 +5 位作者 薛凌波 姜萍 沈姣姣 李沁夏 陈瑶 彭潇 《南通大学学报(医学版)》 2026年第1期18-23,共6页
目的:探讨失效模式与效应分析(failure mode and effect analysis,FMEA)结合根本原因分析法(root cause analysis,RCA)在多重耐药菌(multidrug-resistant organisms,MDROs)医院感染防控风险防控中的应用,为临床MDROs医院感染防控提供科... 目的:探讨失效模式与效应分析(failure mode and effect analysis,FMEA)结合根本原因分析法(root cause analysis,RCA)在多重耐药菌(multidrug-resistant organisms,MDROs)医院感染防控风险防控中的应用,为临床MDROs医院感染防控提供科学有力的依据。方法:应用FMEA风险评估管理工具筛选出MDROs医院感染的高风险失效模式,联合RCA查找高风险失效模式的具体原因,制定针对性的措施规范MDROs管理的各个环节,比较风险管理前后的效果。结果:计算风险优先系数(risk priority number,RPN)值,得到5项需要采取防控措施的高风险失效模式,对高风险失效模式进行根本原因分析并实施切实有效的干预措施。干预措施实施后RPN值下降(P<0.05),MDROs医院感染率从12.48%降至7.58%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:FMEA结合RCA风险管理模式可以明确MDROs医院感染防控中各阶段的高风险流程,从而进行针对性的干预和标准化的管理,减少MDROs在医院的感染扩散,保障医疗安全。 展开更多
关键词 多重耐药菌 失效模式与效应分析 根本原因分析法
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肾移植术后肾周感染病原学特征及预后影响因素
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作者 张祎 贺侠琴 +1 位作者 王文静 李雯 《实用器官移植电子杂志》 2026年第1期50-56,共7页
目的探讨肾移植术后移植肾周感染的病原菌分布、耐药情况及预后影响因素。方法回顾性收集2018年1月至2025年1月西安交通大学第一附属医院进行肾脏移植术后移植肾周感染患者的临床资料,统计分析感染部位病原菌分布及药敏结果,依据14 d预... 目的探讨肾移植术后移植肾周感染的病原菌分布、耐药情况及预后影响因素。方法回顾性收集2018年1月至2025年1月西安交通大学第一附属医院进行肾脏移植术后移植肾周感染患者的临床资料,统计分析感染部位病原菌分布及药敏结果,依据14 d预后情况,分为预后好转组和预后不良组,比较两组患者临床资料的差异,分析影响移植肾周感染患者预后的因素。结果共纳入移植肾周感染患者148例,分离获得病原菌208株,其中革兰氏阴性菌为108株(51.92%),革兰氏阳性菌为66株(31.73%),人型支原体为20株(9.62%),真菌为14株(6.73%)。主要革兰氏阴性菌铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌对头孢菌素类、碳青霉烯类、氨基糖苷类以及喹诺酮类药物的耐药率均大于50%,检出多重耐药的革兰氏阴性菌为52株(25.00%)。屎肠球菌对青霉素、左氧氟沙星的耐药率为100%,对氨苄西林和红霉素的耐药率分别为91.84%、87.76%,粪肠球菌对青霉素和红霉素耐药率为64.71%。多因素显示移植肾周感染碳青霉烯类耐药铜绿假单胞菌(carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa,CRPA)(OR=5.257,95%Cl=2.097~13.177)、移植肾周感染碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)(OR=10.711,95%Cl=2.942~38.993)是患者预后不良的影响因素(P<0.05)。结论肾移植术后移植肾周感染以革兰氏阴性菌为主,且多重耐药的革兰氏阴性菌检出率高。移植肾周感染CRPA和CRKP是患者预后不良的独立危险因素,临床应合理规范使用抗菌药物、加强院感监测及移植术前供体肾源多重耐药菌筛查。 展开更多
关键词 肾移植 肾周感染 多重耐药菌 真菌 预后不良 影响因素
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某二甲医院2019—2024年住院患者血培养病原菌分布及耐药趋势分析
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作者 李静 李天贺 张婷婷 《实验室检测》 2026年第5期54-60,共7页
目的分析近6年住院患者血培养病原菌种类分布及抗菌药物敏感性趋势变化。方法本研究采用VITEK全自动微生物分析仪对秦皇岛市海港医院2019年1月—2024年12月住院患者血培养分离菌进行鉴定及药物敏感性试验。结果的解读依据2022年美国临... 目的分析近6年住院患者血培养病原菌种类分布及抗菌药物敏感性趋势变化。方法本研究采用VITEK全自动微生物分析仪对秦皇岛市海港医院2019年1月—2024年12月住院患者血培养分离菌进行鉴定及药物敏感性试验。结果的解读依据2022年美国临床和实验室标准协会的相关标准,并利用WHONET 5.6软件进行数据分析。结果6年中血标本培养分离出细菌和真菌共652株,革兰阴性杆菌数量最多为487株占总分离菌株的74.7%。血培养分离菌检出前五位的科室分别为重症医学科、肾病内科、血液免疫科、消化科、感染科,未发现大肠埃希菌对亚胺培南和美罗培南耐药菌株。肺炎克雷伯菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率均低于2.9%。结论革兰阴性杆菌(尤其是肠杆菌科)是该二甲医院血流感染的主要致病菌,需重点关注其防控与耐药问题。 展开更多
关键词 血培养 病原菌 耐药性 药敏试验 VITEK全自动微生物分析系统 WHONET软件
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基于重组酶聚合酶扩增与CRISPR/Cas12a基因编辑技术的铜绿假单胞菌快速检测方法的建立
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作者 刘冰 崔玉华 +5 位作者 宁元元 王洪雷 邵倩 苏海龙 吕贯廷 刘畅 《感染、炎症、修复》 2026年第1期62-68,共7页
目的建立并评价一种新型的结合重组酶聚合酶扩增(RPA)与CRISPR/Cas12a技术的检测平台,用于铜绿假单胞菌的快速、高敏感性和特异性检测。方法以铜绿假单胞菌高度保守的毒力基因lasB为靶标,设计特异性RPA引物和CRISPR RNA(crRNA)。通过对1... 目的建立并评价一种新型的结合重组酶聚合酶扩增(RPA)与CRISPR/Cas12a技术的检测平台,用于铜绿假单胞菌的快速、高敏感性和特异性检测。方法以铜绿假单胞菌高度保守的毒力基因lasB为靶标,设计特异性RPA引物和CRISPR RNA(crRNA)。通过对15株菌株(包括5株铜绿假单胞菌和10株非目标菌)的检测评估该方法的特异性。铜绿假单胞菌基因组DNA连续稀释(10^(0)~10^(6) copies/μL)后进行检测以确定其最低检测限。最后,使用52份实际样品对该方法进行实用性验证,并与定量聚合酶链反应法进行比较。结果本研究成功筛选出高效crRNA,最佳CRISPR/Cas12a反应时间为15 min。RPA/CRISPR/Cas12a检测平台特异性高,检测15株不同的细菌菌株,仅对5株铜绿假单胞菌产生阳性信号,与非目标菌株无交叉反应。其敏感性高,该检测平台的荧光检测下限为10^(0) copies/μL。在实际样品检测中,52份临床样品经该方法检测,阳性检出率为100.00%(52/52),与定量聚合酶链反应的94.23%(49/52)检出率高度一致(P>0.05),但总检测时间显著缩短至约30 min,且设备要求更低。结论本研究建立的RPA/CRISPR/Cas12a检测平台具有快速、高敏感性和特异性、操作简便等优点,在临床诊断、食品安全及环境监测等领域对铜绿假单胞菌的快速筛查和早期干预具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 CRISPR/Cas12a 重组酶聚合酶扩增 lasB基因 快速检测
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上海市1例波摩那沙门菌感染病例调查
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作者 肖建伟 曹健 +3 位作者 张子豪 王熙 陈双燕 韩雪 《医学动物防制》 2026年第3期310-312,F0003,F0004,共5页
目的追踪调查2023年11月上海市杨浦区1例波摩那沙门菌感染病例的传染源和传播途径,为波摩那沙门菌感染控制提供理论依据。方法于2023年11月收集病例临床资料,对病例粪便、密切接触者及病例家庭环境进行采样,针对检出病原菌(沙门菌)进行... 目的追踪调查2023年11月上海市杨浦区1例波摩那沙门菌感染病例的传染源和传播途径,为波摩那沙门菌感染控制提供理论依据。方法于2023年11月收集病例临床资料,对病例粪便、密切接触者及病例家庭环境进行采样,针对检出病原菌(沙门菌)进行血清分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、药敏试验以及全基因组二代测序。结果波摩那沙门菌感染病例临床表现为不明原因发热,体温最高达40℃,伴恶心、呕吐3次/d、水样便8次/d,无腹痛。该病例手部、粪便以及病例密切接触人员手部和家庭环境采样共检测出6株波摩那沙门菌。PFGE试验显示6株采样分离菌电泳图条带一致,均为波摩那沙门菌。药敏试验显示除1株来源于宠物龟清洗浴缸拭子分离株(对氨苄西林、氨苄西林-舒巴坦、头孢唑林、头孢噻肟、头孢吡肟、头孢呋辛、头孢噻呋表现为耐药)外,其余菌株对抗菌药物的耐药谱一致。对上述菌株进行全基因组二代测序,结果显示各菌株携带的毒力基因基本一致。结论接触携带波摩那沙门菌的宠物龟是波摩那沙门菌感染的重要途经,且菌株在传播过程中可发生耐药性的改变。建议强化对宠物龟商业销售的监管,进而降低因沙门菌感染导致的公共卫生问题的发生风险。 展开更多
关键词 波摩那沙门菌 宠物龟 耐药株 幼儿 公共卫生 调查
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